Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAB4152436.1 [GenBank]
- Protein name
- tail spike protein
- RBP type
-
TFTSPTF
- Protein sequence
-
MSTLYGNNISQTYQGLIKLANSTTGVTATTQSLQDGLGNNIPIQVSTNVVNISGSLLVNGLPIEFTNTGSFATTGSNTFIGNQTITGSVLISGSAPFDLVVTGSARLVSQDALSQLTMSPSSFNVNSTKTISGGAEGFIFGSTGSNAQFYLGVYDEPNFTTDVELNIKVDSNGISFNDWDNVTAGAYIPFMNIAPNLGDNPTPQMLRGLDITGSLGVTNIQGTGSLFLQPNQSDARFVEIYNTSPTDTHITASGGQIFLGDDVTYVKVDNYGSVKHIDIVADNGVNISGSVQVTGSLDITDNITANSASFNYLHTIYETASIIYSSGSNQLGDELTDTQTLSGSVQVQGELLVNGVPVVTGSVNRDGLITTGSLYGVTEQSITGSLYVSGSGGISIGTGNGNDDTFNGVNLSSNDVASFLIVKSKEYAQFIFGVNDSPAYNYDNQFNIVQSTGSTQFTEYNQNTDYNYRPWLQVQASTSGTSGIKPIQLLRNTEITGSLTEVGNVYMLSPAFNSGSIKLNITGSANFVSQSNLIFGSVAGATSAVNTGSIILSGSNNILLVGVRTNTTPQGTFGYISGNSNIMNIVPTIATGSLGVNTVSNILYGAVILDAPITSSFGSGVTTSTFNGNITTQQNTTTFRHKSGSFSHIGNLTMGNFTSFATSSWFDDNLSVIQYNANILQGSNTAILNVSSSVLLTRNIINSNSTTINNQFTNPNNYLTQGSGSLSLTNNIFGGTTHTILSSGSNLTSRAVVNNLVVGSTHLLNQISSGSNNTIISNTAVLGASLIVSGSNTSQASGGSTFVGRFNATGSLQEGTNEAVFVVGTGTAAGSRRNALHIDSNNNTRITGSVTISGSLTVNGVTVSSDRNGLITTGSAGGGTIQSITGSLSISQQTILTGSVTIGGGNSNLNIQSGSINLNNNGQSQISNQGSGRNVMYVDNLYSNFFFGNVPKGQNNRFSGDTNNFILSPTYSDFQTGSNNLIFAVNNSFFNSGSRNIFIGDGQPFGNSVDDSLYIGMNGGNNQSIITKRGGGSSNPIQLGFPTQVTGSLTVVGNTTISGSLIVTDKINNLKIWTGSYNGESIGIGNYTLNLQTGSSLFNIAIGNSALANNVTGSNNVAIGYNSLGNSVAGFNVALGGSALSANTTGQWNIGIGQSSFQANTTGDYNTAIGWNSAVNNITGSTNTAIGAQALQNNISGSGNVAIGRAAGYYSTSSNEFFVANQLYGGGVDGERSGSLFYGKFDSTTANQTLQINAQTNIVGSLLVNGLPITGSAGGDRNGLINTGSIAETQSITGSLIISGSQTITGSLLLNNNNSTIISNTQTIPSGSGNVIIGSGSILPNNLTNNIVIGAGGNSVFTYNGSVDRITLQKATTLVNGLNVTGSVNISGSAIGPIPALQLTGVQFFNATYADNTCAGSFNGGLLEISRNGAQAGLTINGNNDHYIKMNEGVSSTTTLIRNFKSTSAVTGLRGGTWFGNNDLLNGLFVSSSISTGVGNYMGFGADRNGYTLGNYVFSNTDGSSTKVFISGSLSAIGDVKFASGSNKTMGTVTLDGGNPGTITVSNSLVTTGSMIFLTKQTLTNAHSVGISSKGSGTFTITSTGNGDNDVVAYQIINPI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1616 AA molecular weight: 166490,78340 Da isoelectric point: 4,76688 aromaticity: 0,07364 hydropathy: -0,02970
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1616
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 923 | 923 | 0,3853 |
| Central domain | 924 | 1232 | 310 | 0,8647 |
| C-terminal | 1233 | 1616 | 383 | 0,6422 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Fixed 94 C-terminal predictions appearing before Central domain
Fixed 94 C-terminal predictions appearing before Central domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-923
1-923
Central
924-1232
924-1232
C-terminal
1233-1616
1233-1616
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > Peduoviridae > Maltschvirus maltsch > |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4152436.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796589.1
[NCBI]
CDS location
range 18448 -> 23298
strand +
strand +
CDS
ATGAGCACATTATACGGAAATAATATTAGTCAAACCTACCAAGGTTTAATAAAATTGGCGAACAGCACAACTGGTGTAACCGCAACAACACAATCATTACAAGATGGATTGGGAAATAATATTCCTATTCAGGTTTCAACTAATGTTGTTAATATATCTGGTTCATTATTAGTTAATGGACTACCGATTGAATTTACTAATACAGGTTCATTCGCAACAACAGGTTCAAATACATTTATTGGAAACCAAACAATTACAGGGTCAGTATTAATAAGTGGTTCAGCACCATTTGATTTAGTTGTAACAGGTTCGGCGAGATTAGTTTCACAAGACGCCTTATCACAATTAACTATGTCTCCTTCTTCTTTTAATGTTAATTCAACTAAAACAATTTCAGGTGGAGCAGAAGGATTTATATTTGGTTCAACTGGTAGCAACGCACAATTTTATTTAGGAGTATATGACGAACCTAATTTTACCACAGATGTTGAATTAAATATAAAAGTAGATAGTAATGGTATATCATTTAACGATTGGGATAATGTAACAGCAGGTGCTTATATACCATTTATGAATATAGCACCAAATCTTGGTGATAATCCAACACCACAAATGTTAAGAGGATTAGATATAACAGGTTCATTAGGAGTAACTAATATACAAGGAACAGGTAGTTTATTCTTACAACCAAATCAATCAGACGCAAGATTTGTAGAAATATATAACACATCACCAACTGACACACACATTACAGCAAGTGGAGGACAAATATTTTTAGGTGATGATGTTACTTATGTTAAGGTTGATAATTATGGTTCGGTTAAACATATTGATATTGTAGCAGACAATGGTGTTAATATATCAGGTTCGGTTCAAGTTACAGGTTCATTAGATATTACAGATAATATTACAGCAAATAGTGCTTCGTTCAATTATCTTCATACAATATATGAAACGGCATCAATTATATATTCAAGTGGTTCAAACCAATTAGGAGACGAATTAACGGACACACAAACATTATCAGGTTCAGTTCAAGTTCAAGGTGAATTGTTGGTTAATGGGGTTCCTGTGGTTACTGGTAGTGTTAATAGAGATGGTTTAATAACCACAGGTTCATTATATGGTGTAACAGAACAATCTATAACAGGTTCATTATATGTGTCAGGTAGTGGTGGAATAAGTATTGGAACAGGTAATGGTAATGACGACACTTTTAATGGAGTTAATTTATCATCAAATGATGTAGCATCTTTTTTAATTGTTAAAAGTAAAGAATATGCTCAATTTATATTTGGTGTAAATGATAGTCCCGCTTATAATTATGATAATCAATTTAATATAGTTCAATCAACCGGTTCAACTCAATTTACAGAATATAACCAAAATACAGATTATAATTATAGACCTTGGTTACAAGTTCAAGCAAGCACATCTGGAACATCGGGTATTAAACCAATTCAATTATTAAGAAATACAGAAATTACAGGTTCATTAACGGAGGTTGGTAATGTGTATATGTTAAGTCCCGCTTTTAATAGTGGTTCAATTAAATTAAACATAACAGGTTCAGCTAATTTTGTTTCACAATCAAACTTAATATTTGGTAGTGTAGCAGGTGCAACATCGGCAGTTAATACAGGTTCAATAATTTTATCAGGTTCAAATAATATTTTATTAGTAGGTGTTAGAACTAATACAACACCACAAGGAACATTTGGTTATATTAGTGGTAATAGTAATATAATGAATATTGTTCCAACAATAGCAACAGGTTCATTAGGTGTTAATACCGTATCAAATATATTATACGGAGCAGTAATATTAGATGCTCCAATAACAAGTAGTTTTGGTAGTGGTGTTACTACTTCAACTTTTAATGGTAATATTACAACACAACAAAATACAACAACATTTAGACATAAAAGCGGTTCATTTTCTCATATAGGTAATTTAACAATGGGTAATTTTACTTCATTCGCAACCAGTTCTTGGTTTGATGATAATTTATCTGTTATTCAATATAACGCTAATATTTTACAAGGAAGTAATACAGCAATATTAAATGTAAGTAGTTCAGTTTTATTAACAAGAAATATTATTAACTCCAATAGCACAACAATTAATAATCAATTTACCAATCCAAATAATTATTTAACACAAGGTAGTGGTTCATTATCATTAACTAATAATATATTTGGTGGAACAACACATACAATTTTATCAAGTGGTAGTAATTTAACAAGTAGGGCAGTAGTAAATAATTTAGTTGTAGGTTCAACTCATTTATTAAATCAAATATCAAGTGGTTCAAATAATACTATAATATCTAATACAGCAGTGTTAGGAGCAAGTTTAATTGTTTCAGGAAGTAATACATCACAAGCGTCAGGTGGTTCAACATTTGTTGGAAGATTTAACGCAACGGGTTCATTACAAGAAGGAACAAATGAAGCAGTATTTGTTGTGGGAACAGGAACAGCAGCAGGTTCAAGAAGAAACGCTTTACACATTGATAGTAATAATAATACAAGAATAACAGGTTCAGTTACAATATCAGGTTCATTAACAGTTAATGGTGTTACAGTTAGTAGTGATAGAAATGGTTTAATAACCACAGGTTCAGCGGGTGGTGGAACAATACAATCAATTACAGGTTCATTAAGTATAAGTCAGCAGACAATTTTAACAGGTTCAGTAACTATTGGTGGTGGTAATTCTAATTTGAATATACAATCAGGTTCAATTAATTTGAATAATAACGGACAATCACAAATAAGCAATCAAGGTTCAGGAAGAAATGTAATGTATGTTGATAATCTATATTCAAATTTCTTCTTCGGTAATGTTCCAAAAGGACAGAATAATAGATTTTCAGGAGACACAAATAACTTTATCTTATCACCAACATATAGTGACTTTCAAACAGGTAGTAATAACTTAATATTTGCGGTAAATAATAGTTTCTTTAATTCAGGTAGTCGTAATATTTTTATTGGTGACGGACAACCATTTGGTAATAGTGTAGATGATAGTTTATATATTGGTATGAATGGTGGTAATAACCAATCTATTATTACCAAAAGAGGTGGTGGTTCATCTAATCCAATTCAATTAGGTTTCCCAACACAAGTTACAGGTTCATTAACAGTTGTTGGAAACACAACAATATCAGGTTCATTAATTGTAACAGATAAAATAAATAATCTAAAAATATGGACGGGTAGTTATAATGGTGAAAGTATTGGTATTGGAAATTATACATTAAACTTACAAACAGGTTCATCATTATTTAATATCGCAATAGGTAATAGTGCGTTGGCTAATAATGTAACTGGTTCTAATAATGTAGCAATAGGTTATAACTCATTAGGTAATAGTGTAGCAGGATTTAATGTAGCGTTAGGTGGTTCGGCTTTATCAGCAAACACAACAGGGCAATGGAATATTGGTATAGGACAATCTTCTTTTCAAGCAAATACAACAGGAGATTATAATACAGCGATTGGTTGGAATAGTGCTGTTAATAATATAACAGGTTCAACTAATACAGCAATAGGAGCACAAGCGTTACAAAATAATATTAGTGGTTCAGGTAATGTGGCAATTGGAAGGGCTGCTGGTTATTACTCAACAAGTTCAAATGAGTTTTTTGTTGCTAACCAACTTTACGGTGGAGGTGTTGATGGTGAAAGAAGTGGTTCGTTATTTTATGGTAAGTTTGATAGCACCACAGCGAACCAAACATTACAGATTAACGCACAAACAAATATAGTAGGTTCATTATTAGTTAATGGTCTTCCAATTACAGGTTCAGCAGGTGGAGATAGAAATGGTTTAATAAACACAGGTTCAATTGCGGAAACACAATCAATAACAGGTAGTTTAATTATATCGGGTAGTCAAACCATTACAGGTTCATTATTATTAAATAATAATAATAGCACAATTATATCTAATACACAAACAATACCGAGTGGTAGTGGTAATGTTATTATAGGTTCAGGTAGTATATTACCAAATAATTTAACAAACAATATTGTAATTGGTGCTGGTGGTAATTCAGTTTTTACATATAATGGTAGTGTTGATAGAATTACTTTACAAAAAGCAACAACATTAGTTAATGGATTAAATGTTACAGGTTCGGTAAATATAAGTGGTTCAGCGATAGGACCTATACCTGCTTTACAACTTACGGGGGTTCAATTTTTTAACGCAACATACGCTGATAATACTTGTGCTGGAAGTTTTAATGGTGGATTATTAGAAATATCAAGAAATGGTGCGCAAGCAGGATTAACTATTAATGGTAATAACGACCACTATATTAAAATGAACGAAGGTGTCTCAAGCACTACAACATTAATTAGAAACTTTAAAAGTACATCAGCAGTAACAGGATTAAGAGGAGGAACTTGGTTTGGAAATAATGACCTTCTTAATGGATTATTTGTTTCATCATCAATTAGCACTGGTGTAGGAAACTATATGGGATTTGGTGCTGATAGAAATGGTTATACATTAGGTAATTATGTATTTTCTAATACTGATGGTTCATCTACAAAAGTATTTATAAGCGGTTCATTATCGGCAATAGGTGATGTTAAGTTCGCGTCAGGTTCAAATAAGACGATGGGAACGGTTACACTTGATGGTGGAAACCCTGGAACTATAACAGTTTCAAATAGTTTAGTAACAACAGGTAGTATGATATTCTTAACCAAACAAACATTAACTAACGCACATAGCGTAGGTATAAGTTCAAAAGGTTCAGGAACATTTACAATAACATCAACAGGAAATGGTGATAATGATGTAGTTGCTTATCAAATCATAAATCCTATATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
9aa63ba1a8875b93d12da6a5dca795a1253b01d7cf15674d43ac941a63aa9380
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50