Protein

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Genbank accession
XLL21595.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,86
Protein sequence
MATKTLQGKLGSKKKPGKFQSIPQKQSADPVLDAISENISQLTGQRGTGGKKAVLWEDLEELGVASLNGGNSQLKPGFGSSSGGSGSGGDITAPEYVQPSKPRGVVGSAGFGMATITWDTALYKGHAYTEVFQGDVDVFSQAIRIGTTPADIFTVSTDLDAEKYYWIRFVNIVGERGPINDTSGIHLTAVKDPQYLLDLIRTQIPDLDDYVTGPELQEDLQLYVDKQEIDAYLKLDDFVDVAINTPELVKREELDTLITVDEMVNYATKVDLETLVNFSDLGEYATKAELTPFLTDADISNLAKREELERFVDVDVVDRLQNMIAEGVLENSITVDQQVSEVKAGAATLRATLKSEYHTAVTTNEAIAAAVQTAKSEIEDPEGSSLAATVKNTYVTSTTFTTAQSQLKQELQSNIDGVSSTLVDDYYTKAESDLALSQAKTTLTSDLNDVKANITDNYLTKVETNAAVAQAKTDLTSTIDGLEAQVYQDIYTKVETGGEIDAAISQLDTKLQSNIDGVTNELHESYYTKTETNGQVTTAVSNASQALTGEIDGVKSDLATNYFTKTEVGSEVSSAITQASTALSSEIDDVKADLTTNYYTKVQSDGEIESAISQSETKLQTNIDDLATSVGTNFYTKAQTDEGISTAVGQIETNLSSDIDGVKADLNQNYYTEAETDGAIATSTSQLKTDLQNGIDGVNAQLAQNYYTKTQTDGEISTAVTHAQTELTSEISGVKADLDQNYLTSVETNSAISQLETTFNSTLDDKVSAVLGTSYYTKTQTDGEIDTAIAQSETKLQTNIDDLAASVGTNFYTKAQTDDNISTALSQIDTSLSSEIDGVKADLNQNYYTETETDDAIATSTSQLKTELQSDIDGVSAGLAQNYYTKTQTDGEISSAVSSAKTLLQSEIDGLESDVNATIDSQYQTLTEQQIIDRNALDNLELLTSEAALESSTTTDTVATSLSRYRLELKSEIDDTKATLTQDYITKVQSGDDLELAISQLKTEMTSDIDGLSSNLSQNYYTKAQADGEIDTAIAQSENKLQSNIDSLSSTVSSSYYTKTQTDGEISTAISQLETNLNSEIDGVESNLSQNYYTKTAADGKISTAISSLSTSLTSDLDTAKQELEGDISDVDTKVTGVASDLSQHYYTKTETNGAITTATSSLDTKLSSEIASVEGRADSIESDLSTHYFTKTETNGQITTAISALDTRLSSSIDDVEGKADKVASDLQTKYFTKTETNGEITSAVSSAKTLLQSEIDGLESAVNATIDSQYQTLTEQQVIDRNALDNLELLTSEAALESSTTTDTVATSLSRYRLELKSEIDDTKATLTQDYITKVQSGDDLELAISQLKTEMTSDIDGISSNLKNNYYTGAVVDGNIRKAVTEISTELGASLDDLESNLDQRYYTKTQTDGQVTTAVSNASQTLQSSIDGVDSRVTTVSNTAVNTKGEFEALWGVKTSVGDTAASVGLVAKSDGSGVDDAYFFVKDADFKVLYSDGAADKQAAIFGTVVDPEDPTKRVLSIDTTYINAANIKDIVAGDIVADSIVAGSEIHTPVLRSPVINQEGANFHVNESGIASMKGANINGTLNGVDGVFSGSLNVRSASSGSRIEILTDRINVYNGSSLRVRIGKL
Physico‐chemical
properties
protein length:1632 AA
molecular weight: 174727,54140 Da
isoelectric point:4,19906
aromaticity:0,05453
hydropathy:-0,38370

Domains

Domains [InterPro]
DC_0871
ATT
61–430
DC_0871 DC_0515
XLL21595.1
1 1632
Architecture
ATT
RBD
ATT 61-430 | RBD 1271-1632
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage 1F273_PE002
[NCBI] 		3385364 No lineage information
Host Vibrio cyclitrophicus
[NCBI] 		47951 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Vibrionales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLL21595.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ189384.1 [NCBI]
CDS location
range 33812 -> 38710
strand +
CDS
ATGGCGACTAAAACACTTCAAGGGAAGCTTGGCAGCAAAAAAAAGCCCGGTAAGTTCCAGTCAATACCGCAAAAGCAAAGCGCCGATCCGGTGCTCGATGCGATATCAGAAAACATTTCTCAACTGACAGGTCAAAGGGGAACAGGTGGTAAGAAGGCGGTACTTTGGGAGGATCTTGAAGAGTTAGGGGTCGCAAGTCTTAATGGCGGCAATTCACAACTTAAACCTGGCTTTGGTAGCAGTTCTGGTGGTTCAGGGAGTGGTGGCGATATTACTGCGCCAGAATACGTGCAACCTTCGAAACCGAGGGGGGTAGTTGGTAGTGCTGGATTTGGTATGGCCACGATTACTTGGGATACGGCTCTTTATAAAGGCCATGCTTACACTGAAGTATTCCAAGGTGATGTGGATGTTTTTTCACAAGCTATTCGCATTGGCACAACGCCAGCTGATATTTTCACCGTATCAACTGACTTAGATGCTGAAAAATATTACTGGATAAGGTTTGTCAATATTGTTGGTGAGCGAGGTCCAATTAATGATACAAGCGGGATTCACCTAACCGCAGTTAAGGATCCGCAATACTTACTAGATTTGATTAGAACTCAAATCCCAGACCTTGATGATTATGTTACAGGCCCAGAGCTGCAAGAAGACCTTCAACTATATGTTGATAAGCAAGAGATCGATGCGTACCTAAAGCTTGACGATTTTGTTGATGTGGCTATTAACACGCCGGAGCTCGTCAAAAGAGAAGAGCTTGATACATTAATCACAGTCGATGAAATGGTTAACTATGCGACCAAGGTTGACTTGGAGACTTTGGTCAATTTTTCTGATTTGGGAGAGTATGCGACTAAGGCAGAGTTAACCCCTTTTTTAACCGATGCTGATATTTCAAACTTAGCTAAGAGAGAAGAATTAGAGCGGTTTGTAGATGTAGATGTAGTTGATCGACTTCAGAATATGATTGCTGAAGGAGTTCTTGAAAACTCCATAACGGTTGATCAGCAAGTTAGCGAGGTTAAGGCGGGAGCGGCGACATTACGGGCTACGTTAAAAAGTGAGTACCATACCGCAGTAACGACCAATGAGGCGATCGCCGCCGCTGTTCAAACGGCAAAGTCAGAAATTGAAGATCCTGAAGGCTCAAGCTTGGCGGCTACCGTCAAGAATACCTATGTAACTTCAACGACATTCACTACGGCCCAATCGCAACTTAAGCAAGAGTTACAGAGTAACATTGATGGAGTGAGCTCCACTTTGGTTGATGATTACTATACTAAGGCTGAATCCGATTTGGCTTTATCTCAAGCTAAGACCACGTTAACTAGTGATCTTAATGATGTTAAGGCGAATATTACTGACAACTACTTAACAAAAGTAGAAACGAACGCCGCCGTTGCACAAGCAAAAACCGACCTTACCAGCACCATTGATGGTCTAGAGGCTCAGGTCTACCAAGATATTTATACTAAGGTTGAAACGGGTGGAGAGATTGACGCAGCGATCAGCCAGTTAGATACAAAGCTTCAATCTAATATTGACGGCGTAACTAACGAACTGCATGAAAGCTATTACACCAAAACCGAGACGAACGGCCAAGTTACAACGGCGGTATCGAACGCTAGCCAAGCGTTAACGGGCGAGATTGACGGCGTAAAAAGCGACTTAGCAACAAACTATTTCACCAAAACCGAAGTTGGATCTGAAGTTTCAAGCGCTATCACTCAGGCGTCTACGGCATTATCCAGCGAGATTGATGACGTTAAAGCTGATTTAACAACGAACTACTACACGAAAGTGCAAAGTGATGGTGAGATAGAGAGCGCTATTTCACAATCTGAAACCAAGTTGCAAACGAACATTGATGATTTGGCGACAAGTGTAGGCACCAATTTTTACACTAAAGCACAAACAGATGAGGGTATTAGCACAGCGGTAGGCCAAATCGAAACTAATCTTTCGAGTGATATTGATGGTGTTAAGGCCGATCTGAATCAGAACTATTACACCGAAGCGGAAACCGATGGTGCGATCGCCACATCGACCAGTCAATTAAAGACTGATCTACAAAATGGCATCGATGGTGTTAATGCTCAATTGGCCCAAAATTATTACACCAAGACCCAGACGGATGGTGAAATATCTACAGCGGTCACGCATGCTCAAACAGAGCTAACAAGCGAGATTAGCGGGGTTAAAGCTGATTTAGATCAAAACTACTTAACCAGCGTAGAAACAAATAGCGCTATTAGTCAGTTAGAAACGACCTTTAATTCCACACTTGACGATAAAGTAAGTGCGGTTCTTGGGACTAGCTACTACACGAAAACTCAAACTGACGGTGAGATTGACACTGCGATCGCTCAGTCTGAAACTAAATTGCAAACGAACATAGATGATTTGGCGGCAAGTGTAGGCACCAACTTCTACACCAAAGCGCAGACAGACGACAATATCAGCACAGCATTAAGCCAAATCGACACCAGCCTTTCAAGTGAGATTGATGGTGTTAAGGCTGATTTGAATCAAAACTATTACACAGAAACAGAAACCGATGATGCGATCGCCACATCGACCAGTCAATTAAAGACTGAGCTGCAAAGTGATATAGATGGAGTCAGCGCCGGGTTAGCCCAAAATTATTACACTAAGACCCAAACAGATGGTGAAATTAGCAGCGCGGTTAGTTCTGCTAAGACATTGCTGCAAAGTGAGATTGATGGGCTTGAAAGCGATGTAAATGCGACCATTGATAGCCAGTATCAAACGCTGACAGAGCAACAAATCATAGATCGTAATGCACTGGATAACCTTGAGCTATTAACCTCAGAAGCCGCTCTTGAAAGTTCAACTACGACTGATACGGTTGCGACCTCTTTATCTAGATATCGATTGGAATTGAAGTCTGAAATTGATGATACAAAGGCGACACTGACGCAGGATTACATCACCAAAGTGCAATCTGGTGATGATCTTGAATTGGCAATATCTCAGCTTAAAACCGAAATGACTTCAGATATTGATGGTCTTTCATCAAACCTTTCCCAAAACTATTACACCAAGGCTCAAGCCGATGGTGAAATTGATACTGCGATCGCTCAGTCTGAAAACAAGCTGCAATCTAACATTGATTCACTATCCAGCACCGTGTCTTCAAGTTATTACACCAAGACCCAAACAGACGGCGAAATCAGCACGGCCATATCGCAATTAGAAACCAATCTAAATAGCGAGATTGATGGTGTTGAATCTAACCTTTCCCAAAACTATTACACCAAAACAGCCGCAGACGGAAAGATATCAACAGCTATCAGTTCTTTATCGACCTCTCTTACAAGTGATCTTGATACTGCAAAGCAAGAGCTTGAGGGTGATATTTCTGATGTTGATACGAAGGTGACCGGGGTTGCTTCAGATCTGTCTCAGCATTACTACACGAAAACCGAAACGAACGGCGCTATCACAACAGCCACTAGTTCACTGGATACCAAATTAAGCTCAGAGATTGCCAGTGTAGAGGGGCGAGCGGATAGCATTGAATCTGACTTATCGACTCACTATTTCACTAAGACGGAAACCAACGGACAGATCACCACTGCGATTAGTGCGTTAGATACTAGGTTAAGTTCAAGCATTGATGATGTTGAAGGTAAGGCCGACAAAGTTGCGTCCGACTTACAAACGAAATACTTCACTAAAACTGAAACCAATGGAGAGATAACGAGTGCGGTTAGTTCTGCTAAGACATTGCTGCAAAGTGAGATTGACGGGCTTGAAAGTGCTGTAAATGCGACCATTGACAGCCAGTATCAAACGCTGACAGAGCAACAAGTCATTGATCGTAATGCGCTGGATAACCTTGAGCTATTAACCTCAGAAGCCGCTCTTGAAAGTTCAACTACGACTGATACGGTTGCGACCTCTTTGTCTAGATATCGATTGGAATTGAAGTCTGAAATTGATGATACAAAGGCGACACTGACGCAGGATTACATCACCAAAGTGCAATCTGGTGATGATCTTGAATTGGCAATATCTCAGCTTAAAACCGAAATGACTTCAGATATTGATGGTATTTCATCAAACCTGAAAAATAACTATTACACTGGTGCAGTCGTTGACGGGAATATCAGAAAGGCCGTTACCGAAATTTCTACGGAATTGGGTGCGTCACTAGACGATCTTGAATCAAACTTAGATCAGCGTTATTACACGAAAACCCAAACTGACGGCCAAGTTACAACGGCGGTATCGAATGCCAGTCAAACGCTGCAAAGTAGTATCGATGGTGTTGATTCTAGAGTGACAACCGTAAGTAATACGGCAGTTAATACAAAAGGTGAGTTCGAAGCGTTATGGGGAGTAAAAACCAGTGTTGGTGACACTGCCGCCAGCGTGGGTCTAGTGGCTAAGTCTGATGGTTCAGGAGTGGATGACGCTTACTTTTTTGTCAAAGATGCCGACTTTAAGGTGTTGTATTCTGATGGTGCGGCAGATAAGCAGGCCGCTATTTTTGGCACAGTAGTCGATCCAGAAGATCCAACAAAGCGCGTACTATCCATTGATACCACTTACATTAATGCGGCGAACATAAAGGATATTGTTGCTGGTGATATAGTTGCGGATTCTATTGTTGCTGGTTCAGAGATTCATACACCAGTGTTACGCTCGCCAGTGATTAACCAAGAAGGCGCTAATTTTCACGTTAATGAGTCTGGAATTGCCTCAATGAAAGGGGCAAATATTAATGGGACTTTAAACGGCGTTGACGGTGTGTTTTCTGGCTCTTTAAATGTCAGGTCGGCGTCGTCAGGATCTCGCATTGAAATACTAACGGATAGAATAAATGTATATAACGGTAGTAGTTTAAGAGTTCGCATAGGTAAATTGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1af4c43e6313d14e36185a20eecf6cfdc1df5b65782152243f58f8134a1f39a7
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4214
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50