Phage RBP Database

Genbank accession

XYR95743.1 [GenBank]

Protein name

tail fiber protein

RBP type

TF

Evidence Phold

Probability 1,00

Protein sequence

MAVDRVKFQEIVASQLPRYVREDFPLLSDFLEQYYVSQEYQSGPVDIINNIDQYVKVEELYDIVESTTLAEILDYNDRFVTVVSTEGFSETNGIIQIDNEIIFYETKTDTEFQNCRRGFSGITTYVTTGAPDELTFSQTEADTHLLGTEVVNLNVLFLKQFFKKIKGQFTPGFADRNFYSGLNSKNFIYNSDSFYSSKGTDQSFEILFRALYGEDVEILKPSQFLLTPSNANYRVTQDFVVEKLQGDPLDLQNLTIFQKRTNARGSVTNVQQIPYDDYQFYQISIDAGFARDTDVTGSIFGEFEPNPLTKLLTSVSFGSTVLDVDSTVDFPEYGKLVVNDVDGNAIGVAYSGKTTNQFFNVSGLTNSLNKKSDVKLDSFSYAYVGIDTSQEIRVRFTSTLKDFVQNDPTYYFKKNDTIEIKSFGYEAPGKKANNYVLNVQTKFKIAESSVIDADAFVYNFKLYNDHFFQEGYELRYENEDGTVSNLGTVTRIVSENEINVRFGQQINLSGTFYLENQLLKGSSTSHSYIKNFVANVQNTYAKFNGDVLISSNSLPKYNDIETNTYDKKVTFSASLLSTDILPLPTNPTSLPDHGFYTGDSVYFQSAGNGFDGVTTGSYFVYRVNESEIKLARSNADLTRESYITFNGSVVNASLSYLDFYGKTIQPQGIYRKILSPTNRKRIEKTTSGYTGIFVNGLELLNYKSSSSVYYGDILDFTMTSGGTGYDIINPPVVKIVDEVGTGATGVANVKGQLVKLDVTDPGMGYYAPPTITIKGGNGSGAQAEPRMTSIKLENSFVANFPSDVNLTTNEITFETDHKFLDGESVIYEPRNTSGIVGLNTGGEYFVFVTGQKSIQLHTTKGDVFAGINTVDLAGYGDGVQYLVAKELKQVVSSVVVTNPGVGYENKKRTISTVGINTVSDRVEILNHGYKSKEVVRYTRGTPRVEGLSEDKDYFVKKINDDAFALTEVGTGSVERDYYYDRGICINFTKQGVGSFNYPPITVEVEGAAASFDKTFVEDFQELYIIESPIEENIITPVSVLAWTDTEAEITNPYYVLVSADANWLISDDPFIGNILLYEAKLQPVFRGEILSIDLTNGGVGYGASTIVDFRRQPEITFESGSKAKLTPIINNGKIVEVIVNSGGSGYNAPPDLNIVSETGNFAILVPIINNGEIESVYVQKGGAGYVTGKTTIDVIPAGSGAKTQANIRGWNINLFERNFSNFKDDDCIIEENISNKSLQYAAVYAPRPLRESLNSLNGFGEDNIKYGIFDLTLSVGGEEIDSLYHSPIVGWAYDGNPIYGPYGFDNIDGTGNIRRMVTSYKLKNTPVNRPSYNAFPNGFFVDDYIYAGDGDLDEHNGRFCVTPDYPNGVYAYFCTISDTVDSSGPFNNYRRPLFPYVIGNDYNSLPIPFNFKSASNQTHYNIVGDGWFRNTKNYFTNGGNSQYDYIYNSDKLRNQSLDITATSSGSVDGMAILDPGDGYKIGDRVELNSTNTGGRNANFRVSQLKGKNVNSVSLATTSYENVEFTSTGSANGFVGITSAPHNFLPLDTIFIDGLSSYYKGFAGSYSVGVSSERWYVSLGIGTDTVTGIVTYVYMNGPFGEDSIRANDILRIEREKLKVLNIDEKSGRVRVLRGVDGTLAVAHSAGTIVRDDPRKLRFLSTGINTQRNLTINKQLYFTPNEAVGVGTSTVGTATTITFSNPGVGLTQVRVDQQQIYLPDHKLSLNTPMTYYTNGGTSIACWSGITSTPTFNLDETRNIFAVPLSKDIIGIATQRVGVNSVGQYVGINTEKGGLLYFESAVGLGSYHSFNTNITSVIKGRVSKNVVTVSTAQTHGMKRGDIITIDVNPTTTTTIQVKYDDFNRRIVFDPDTIEPAGINTNNNTFIVPENKYFTGDKVIYTSGDPSENLTASGMYYVYSYMNNKIKLVEYLSELSSENPTFVNVGSATTGTLSKINPGVRAQKNQYIKFDLSDTSLSFVDKGITYSAFDMFIYSDSQEVNEFWTTRTDRNFEVTKSGVVGVDTTANLTLFMSDNIPNNLYYGFSPDNLDIIPPVKLRLFKDDTVINNNSINLTKNKFDGIYNVVGVTSDTFEYNIPFDYDTVVSYGTTNATMKYDTSSLTANGPINKINALNKGVGYKSLPGFSSVTSKNGTGALIQPSSTTIGSVLGTKFNYIGFGYPSDKTLNVVGNLPQVLRVDPLGSFESIGISSGGVNYSQAPDLIVIDGFTNQVITDIELDYELGDNEVNIIENTKSLNNVPPTFIPTQNTNGFSISSVSYNSTNKIVRLTFSKQFSEVKDWPFKVGEKVIVENVAIGFNTTGRGYNSEDYNYSLFEVTALDSQIGGANAYIEYNLTDYLAPGEFPGQVTSSISGSVTPESFFPIFDSKLVTTNFFEGERVTNIGYVGRVERFDATSGYLFVSSEDDFEVGTILESQSSGNKANIISNIDFDSTIRLGVGATFVDGWQTNSGFLNDNLQVIPNNEYYQNFSYSLKSRVPYETWDDAVSSLNHTAGFEKFADLVIDNNAAGIASAVDFQIETVVDLIGEGMLNCFPDFDGATELTLDINGGKTISNEIVFENKILVDYFESRGNRVLKIDDFSGEFNSNPRETKYSIVDFFDNKYAWNKFFTLVQDRELRSRKQFGVVTVLQDGTTGYVNQYGTIDTGKSLGSFDYIGAGTSEWGLTFFPNLFEYNNYDISYFTFSGVESLTSVGSTQVGDIVSIASSSVTVPVSTTTTLVKVPTVSRSAKLHVQLEDAEDNYFYTELNVLHDGTNVQLLQYGDVDSTEGISSGFGTYTANISGGFIDVNIVPTVGTAVTANIISIETNITAVGVNTTEMSVTNLSSYYKSISASGSPVANEIAAYEDPFAGEYFMVTVHDTTNNEYEMFECHVLDSNNQNIVKYGRIGTNSGLGTVGAVTSGTSVSLVFTPNPSIDVAVRTFGIGLKNFNNIVGIASISALQNNILFSDYGTYTGTEFDKKRAFNLKHNTLPIFQRAFLGNDSSIVNLSTNQVTIPDHFFVTGEKVNYSYENSQLSTANAIGIATTTVSGVSTDKLPSELYIIKYSNKSVGFAKSATDALAGSPIALDLTSVGVGTFHKLTATNQNARALVAVDNMIQAPVTEVNVSTRLDQNVVFDVDFDVVGIQSFKANDIIKIDSEIMLLQDVGVGATNKFRVLRGQMGTGVATHNIGTSVELLGGNYNIVDNTLHFVEAPFGATPLSTTTQGPDNIDWSGITTYSTFQGRTFMRSGITDDSVDTYSTNYTFDNIQSQFNGQTKFFSLVQNGNNVTGFATNQAIILNSNILQEPQGAQNTTGDFTLLETAGITSITYLGDSVSSESDPNMATIPRGGTIISVASTPGLGYQPLISAGASCFVSGGGTITSVEIGNPGSGYRVGVQTVNVGYAVSSTGITTVVNIGTATVQNGQVVAITTSYFGANLDQNNPPLIVIDAPLPYSNIPLVYADGQTGMGTGARVDITVGQGSSVVNFDIVSGGFGYGDGEVLRLSIGGTTGIQTDTSYTYDEFQLTVSTTYRDTFNGFTVGELDVFDKLDTLFDGVEKRFPLTIAGAGFAIETADGSDINIAQCLIVTINDILQVPNQSYKFNGGSIIEFTEAPKKGDTSKIIFYKGTPDVDVVLVDILETVKVGDSLQLKNDSSKGQGFGLYQEPRTVVGITTLDTVRTFPYDGPGITTNQALVRPLTWCKQTDDITINGDFVTKDRVEYEPSIYPAAYLTSYVGTSSAVAYTDTVRPFFNSTNETSLLDYQDRIVIIDQSPIASAIATASTGSGVDPEYNNGPIINLVGDGSDLFKREVTVNGVRIVSAGTTGGQIAVPDVWVEKVARMVELFTDVNGAGINETSQRNLIKTLSGDSGTYHAGKPTIQRVARGAGADYTPNFLTDQGIIDWNLTNLFDTTVQNDMVWYLNSTGSGYGDGDQDAQEVIEHVFHTLHMHGLPADTIKLYSYLASDWQTGDLYAAMEEAYDGGFWDSSGYGGNTWKTDADAFEVAAKEYLYLLNFCMFEYTSLWENGSLSPEWSDSMRTQAGIQANNPLGYAFHNTYIAPVISKPSLVTIRSIFQDGNTPAQDDPSLAGASGYVVDNDYGGIITSFTVSNVGAGYSYLTTPSVSVSLPDNPNGTRATGIASVTGDGVVSISVSNAGTGYTQAPSVLIQQPSVRREQIGVSSYFGDLGQIVGYAQSTGALGTLELYIPENSYMRDPNIVGTAVTISQLNTGDYFVVNLSNFGLSTSTSDNIYQVSAAYNSTVDLTSVGLGTTAIRRVEVANVGFGTTVAGFIRGRNLGEYTWGKIQFLNRATTDALEFTPNSYTGITSSPLVQRFRPLKFNNYQT

Physico‐chemical properties

protein length:	4337 AA
molecular weight:	472777,82730 Da
isoelectric point:	4,56380
aromaticity:	0,11137
hydropathy:	-0,18992

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_1555	ATT	DC_1555	7	224	Novel HMM	DC_1555	N-terminal	Low	Positional only	41 proteins / 41 hits
DC_0695	ATT	DC_0695	593	1056	Novel HMM	DC_0695	N-terminal	Low	Positional only	54 proteins / 54 hits
DC_0146	STR	DC_0146	1105	1462	Novel HMM	DC_0146	Central	Low	Positional only	81 proteins / 81 hits
IPR025924	STR	DC_0819	1280	1377	InterPro cluster	YHYH domain	Central	Low	Positional only	112 proteins / 112 hits
DC_2171	RBD	DC_2171	1484	1864	Novel HMM	DC_2171	C-terminal	Low	Positional only	10 proteins / 10 hits
DC_2014	ATT	DC_2014	3094	3205	Novel HMM	DC_2014	N-terminal	Low	Positional only	17 proteins / 17 hits
DC_0146	STR	DC_0146	3251	4083	Novel HMM	DC_0146	Central	Low	Positional only	81 proteins / 81 hits
DC_0695	ATT	DC_0695	4011	4336	Novel HMM	DC_0695	N-terminal	Low	Positional only	54 proteins / 54 hits

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Synechococcus phage RN05-S [NCBI]	3412547	Viruses >
Host	Synechococcus sp. MW02 [NCBI]	1620844	Cyanobacteriota > Cyanophyceae > Synechococcales > Synechococcaceae > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

XYR95743.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

PV261924.1 [NCBI]

CDS location

range 187903 -> 200916
strand -

CDS

ATGGCAGTAGATAGAGTCAAATTCCAGGAAATTGTAGCTAGTCAACTTCCCAGATACGTTAGAGAAGACTTTCCTCTCCTATCGGATTTTTTAGAGCAGTATTACGTATCACAAGAATACCAAAGTGGTCCTGTTGATATCATCAACAATATTGACCAGTATGTAAAGGTAGAAGAATTATACGATATTGTCGAATCAACGACTCTTGCCGAAATTTTAGATTATAATGATAGATTTGTTACTGTAGTATCGACAGAAGGTTTCTCTGAGACTAACGGTATCATTCAGATTGATAATGAAATTATATTCTACGAAACAAAGACTGACACTGAGTTTCAGAACTGTAGAAGAGGATTCAGTGGTATCACCACCTATGTCACCACAGGTGCACCAGATGAATTAACATTCTCTCAGACTGAAGCAGATACTCATTTACTTGGAACAGAAGTTGTCAACCTGAACGTTCTTTTCCTCAAACAGTTCTTTAAGAAGATTAAGGGACAGTTTACTCCTGGTTTTGCTGATCGCAACTTTTATAGTGGATTAAACTCCAAAAACTTTATCTACAACTCAGATAGTTTTTATTCTTCAAAGGGTACTGATCAGTCCTTTGAAATCTTGTTTAGAGCACTGTATGGTGAAGATGTAGAGATTCTCAAACCATCACAGTTCCTTCTGACTCCCTCTAATGCAAACTATAGAGTAACTCAAGACTTTGTAGTTGAGAAACTTCAGGGTGATCCATTAGATCTTCAGAACCTTACAATCTTCCAAAAGAGAACGAATGCAAGAGGATCTGTAACTAATGTACAACAGATTCCTTATGATGATTATCAATTCTATCAGATTAGTATTGATGCTGGATTTGCAAGAGATACTGACGTAACAGGTTCTATTTTTGGTGAGTTTGAACCTAACCCCCTTACAAAACTCCTTACCTCTGTAAGTTTTGGTTCAACGGTTCTTGATGTTGATTCAACCGTTGACTTTCCTGAATATGGTAAATTAGTCGTCAATGATGTTGATGGTAATGCGATTGGTGTTGCATATAGTGGAAAGACCACAAACCAGTTCTTTAACGTATCTGGTCTGACCAATTCATTGAATAAGAAGTCTGACGTTAAGTTAGATTCTTTCTCATATGCCTATGTTGGTATTGATACCTCACAAGAAATCAGGGTTAGATTTACATCTACCCTGAAGGATTTTGTACAGAACGATCCAACATATTACTTCAAAAAGAATGACACTATTGAGATTAAATCATTTGGATATGAGGCACCTGGAAAGAAAGCAAATAACTATGTCCTTAACGTCCAAACAAAATTTAAAATTGCTGAAAGTTCTGTAATTGATGCTGATGCATTCGTATATAACTTTAAACTTTATAATGATCACTTCTTCCAAGAGGGGTATGAACTCAGATATGAAAACGAAGATGGCACTGTATCAAACCTCGGAACAGTCACTAGAATTGTATCAGAGAATGAGATTAATGTAAGGTTCGGACAACAGATCAATCTTTCAGGTACATTCTATCTTGAGAATCAATTACTCAAGGGTTCGTCTACAAGTCATTCTTATATCAAGAATTTTGTTGCCAATGTACAGAATACATATGCAAAGTTTAATGGTGATGTTCTTATATCATCTAACTCATTACCAAAATATAATGACATTGAGACAAATACTTACGATAAGAAAGTAACTTTCTCTGCATCATTACTGAGCACCGACATTTTACCATTACCAACTAACCCAACATCATTACCCGATCACGGTTTCTACACAGGTGACTCAGTATATTTCCAATCTGCAGGTAATGGTTTTGATGGAGTTACCACTGGTTCTTACTTTGTCTACAGAGTAAATGAAAGTGAAATCAAACTTGCAAGAAGTAATGCAGACCTTACAAGAGAATCATATATTACATTTAATGGGTCTGTAGTAAATGCTTCTTTAAGTTACCTTGATTTTTATGGTAAAACGATTCAACCACAGGGTATCTACAGAAAGATTCTAAGTCCTACTAATAGAAAGAGAATAGAGAAAACAACTTCAGGATATACAGGTATTTTTGTTAATGGTCTTGAGTTGTTAAACTATAAGTCATCCAGTAGTGTTTATTATGGTGATATTCTTGACTTCACTATGACAAGTGGTGGAACTGGATACGATATTATCAATCCACCAGTAGTAAAGATTGTCGATGAGGTAGGAACTGGTGCAACAGGTGTTGCTAACGTAAAAGGTCAACTTGTAAAGCTTGATGTTACTGACCCTGGTATGGGTTATTATGCACCACCAACGATTACAATCAAGGGTGGTAATGGTTCTGGTGCACAGGCAGAACCAAGAATGACTTCAATCAAACTTGAAAATTCTTTCGTCGCCAATTTCCCAAGTGATGTAAATCTCACAACAAATGAGATTACATTTGAGACCGATCACAAATTCTTAGATGGTGAAAGTGTAATCTATGAACCAAGAAATACATCTGGTATTGTTGGACTGAATACTGGTGGTGAGTATTTTGTATTTGTAACTGGCCAAAAGAGTATTCAACTTCATACCACAAAAGGAGATGTATTTGCAGGTATCAACACTGTTGATTTAGCAGGTTATGGTGATGGTGTGCAATATCTTGTTGCAAAAGAACTTAAGCAGGTTGTATCAAGTGTTGTAGTTACTAATCCTGGTGTAGGTTACGAAAACAAAAAGAGAACTATTTCAACAGTTGGTATCAATACAGTATCAGATAGAGTTGAAATTTTAAATCACGGTTATAAATCGAAAGAAGTTGTAAGATATACAAGAGGAACTCCAAGAGTTGAGGGTCTGAGTGAAGATAAAGATTATTTTGTTAAAAAGATTAATGATGATGCATTTGCACTGACAGAAGTTGGTACTGGATCTGTAGAAAGAGACTATTATTATGATAGAGGAATCTGTATTAACTTCACAAAACAGGGCGTAGGTTCATTTAACTATCCACCAATCACTGTTGAAGTAGAAGGTGCAGCAGCATCGTTCGATAAGACCTTTGTCGAGGACTTCCAAGAACTTTATATTATTGAATCACCAATTGAAGAGAATATTATCACTCCTGTATCAGTACTTGCATGGACTGATACTGAAGCAGAGATCACAAATCCATACTATGTTTTGGTTAGTGCTGATGCAAACTGGTTGATTAGTGATGATCCATTCATCGGTAATATTCTTCTTTATGAAGCAAAACTACAACCTGTCTTTAGAGGAGAGATCTTAAGTATTGACTTGACCAATGGTGGTGTTGGTTATGGTGCATCAACTATTGTTGATTTTAGAAGACAACCCGAAATCACCTTTGAGTCTGGTTCAAAAGCAAAACTAACACCAATTATCAACAATGGTAAGATTGTTGAGGTTATTGTAAACTCAGGTGGTTCTGGTTACAATGCACCACCTGATCTCAACATTGTAAGTGAGACAGGTAATTTTGCAATCTTAGTGCCAATCATTAATAATGGTGAGATAGAAAGTGTCTATGTTCAAAAAGGTGGTGCAGGATATGTTACTGGTAAGACCACAATTGATGTAATACCTGCTGGATCTGGTGCAAAAACTCAGGCAAATATTAGAGGATGGAATATCAACCTATTTGAAAGAAACTTTTCCAACTTTAAAGATGATGACTGCATTATTGAGGAGAACATTTCAAACAAGTCACTTCAGTATGCAGCAGTTTATGCACCTAGACCATTAAGAGAGTCACTAAACTCATTAAATGGTTTTGGGGAGGACAATATCAAATATGGTATTTTTGACTTAACTTTAAGTGTTGGTGGAGAAGAAATTGATAGTTTGTATCACTCACCAATCGTAGGTTGGGCGTACGATGGTAATCCAATCTATGGTCCATACGGTTTCGATAATATCGATGGAACTGGTAACATTCGTAGAATGGTTACAAGTTACAAACTCAAGAATACTCCTGTCAATAGACCTTCATACAATGCATTCCCTAACGGATTCTTTGTAGATGACTATATCTATGCTGGTGACGGTGATCTTGATGAACACAATGGTCGTTTCTGTGTAACACCAGATTATCCAAACGGTGTATATGCATACTTCTGTACTATCTCTGATACTGTAGATTCTTCTGGTCCATTTAATAACTACAGAAGACCATTGTTCCCATATGTAATTGGAAACGATTATAATTCCTTACCAATTCCATTCAACTTCAAGTCAGCGTCTAATCAAACTCATTACAATATTGTGGGAGATGGGTGGTTTAGAAATACTAAGAACTATTTCACAAATGGCGGAAATAGTCAATATGATTACATTTACAATTCAGACAAACTTAGAAATCAGTCTTTAGACATTACTGCAACATCATCAGGTAGTGTTGATGGTATGGCTATTTTGGATCCAGGTGATGGATACAAGATTGGTGATAGGGTTGAACTCAATTCAACTAATACTGGCGGTAGAAATGCAAACTTTAGAGTATCTCAACTTAAGGGTAAGAATGTAAACAGTGTAAGTCTTGCCACTACATCTTATGAAAATGTGGAGTTTACAAGTACAGGAAGTGCTAATGGGTTTGTTGGTATTACTTCAGCTCCACACAACTTCTTACCATTAGATACAATTTTCATTGATGGGTTATCTTCATACTACAAAGGATTCGCTGGGTCGTATTCGGTCGGTGTATCAAGTGAAAGATGGTATGTATCACTAGGAATAGGAACTGATACTGTCACTGGTATTGTGACCTACGTTTATATGAATGGTCCTTTCGGTGAGGATTCGATTAGAGCAAATGATATTCTCAGAATTGAAAGAGAAAAATTAAAAGTTCTCAACATTGATGAAAAATCTGGTAGAGTCAGAGTTCTTAGAGGTGTTGATGGAACACTTGCAGTTGCCCACTCTGCAGGTACTATTGTTAGAGATGATCCTAGAAAACTCAGATTCCTCTCAACAGGTATCAATACTCAGAGAAA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Protein

Domains

Domains [InterPro]

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Taxonomy

Coding sequence (CDS)

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Genome Context

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Tertiary structure