Protein

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Genbank accession
XYL32843.1 [GenBank]
Protein name
lateral tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
Protein sequence
MYPIPLFMSTTSASVVTATSITTSSIGIAIVGSKKQLTYTVTPEDGALFDIAFSSSDDTKMVIDNNGMMEFVAEGGFDAIMTAKNNLGAVLTDQSGGYASELSVYTESLSAMDVGTTQQLVATISPEGAKDLPDMVITYTTTDPEVATVSPTGLITALKDGNCRIGCTATYQGTVVASDSSYLGVNAIPVISNVTAVANSYGDVRVAWDVTDPLDGDTYTVEVLDLSNNSVQWTTTTTNTHAYFDISDSIPLYGFAPTYLKISVKSTKAAPVIFNNSIATDDSFIKEVVVFAGQDNVNAHFTELSGANKAAMSSTTARNAYATQRGLANAEVLPLNTASGSSAADKYADDKAGTGTPDNYWYDLDNTADGPCLTNFITKVTPYASKVKAIIWGQGENDAVSASSTVAGRYSNTTRYHDATIAIFDKMRTIVPASQAKIVWQILGRSYLYGVEVNGVDWQKYRNVQRTISTARDDVIIGSWVDGAERYSGYVYEEGIDGRIHYISSVYQTAATKLAKSAADGTDLTSTSPVWVDMAVPTGATATSQPNQDTILAWDAQGYSKHYFRNINVLTASVLTEQTLNTNSYTFTYADQVEQYGFAAGTTIFDVAYYDEANDVLSPLVRFNVNVTAGTVEDKPVVMDYDLTQETLPSDVKVNGGNSFARASGDILVATKAPAGIAPLEYVGTTPVGRRVVTANSTQIFVNNALTSASPWVKTNLTVAASSINSPAGTTANTYKLTPSTNPGQHILSAVNTASDITAGKQWAASVFLKPDGITKVKLKLTSGDEVNEGTYDLEAGTFTGTDANMIDMGNGWYRVILHKVTIAKQASMTYEIIALNASGSDTFAGDGTGGLIAWVPQLEMGDMTNPVWAGTPFVCTYARDTDSAATFTIPKNGHTGVDIYHTDGTVQREIFTGTATTWMLSFNAASADWGSKFISGLKYYD
Physico‐chemical
properties
protein length:942 AA
molecular weight: 100378,41320 Da
isoelectric point:4,54794
aromaticity:0,09342
hydropathy:-0,09533

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.60.40.1080
STR
13–93
G3DSA:2.60.40.1080 G3DSA:2.60.40.1080 IPR036514
IPR003343
STR
15–93
IPR003343 IPR003343 IPR036514
DC_1711
RBD
20–92
DC_1711 IPR008964 SSF52266
DC_1711
RBD
88–204
DC_1711 DC_0353
IPR003343
STR
112–170
IPR003343
XYL32843.1
1 942
Architecture
STR
RBD
STR
STR 13-186 | RBD 187-204 | STR 224-941 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_PL/4
[NCBI] 		3444375 Viruses >
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYL32843.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV808484.1 [NCBI]
CDS location
range 32747 -> 35575
strand +
CDS
ATGTATCCTATTCCTTTATTTATGTCAACAACATCAGCTTCAGTAGTAACAGCTACATCTATAACTACTTCCTCTATTGGTATTGCAATAGTTGGTAGTAAAAAACAACTGACATACACAGTTACACCCGAAGATGGTGCGTTATTTGATATAGCTTTTTCATCTTCAGATGATACCAAAATGGTTATAGATAATAATGGTATGATGGAGTTTGTTGCCGAAGGTGGTTTTGATGCAATAATGACAGCTAAAAATAATTTAGGTGCTGTCTTAACTGATCAATCTGGTGGTTATGCTTCAGAATTAAGCGTGTACACTGAAAGTCTATCGGCTATGGATGTAGGCACTACTCAACAGTTGGTTGCTACAATCAGCCCAGAAGGTGCTAAAGACCTTCCAGACATGGTAATTACATACACCACAACAGATCCAGAAGTAGCTACTGTAAGCCCTACAGGATTAATAACTGCTCTTAAAGATGGCAATTGCCGTATAGGTTGTACTGCAACGTATCAAGGAACAGTTGTGGCCTCTGATAGTTCTTATTTAGGTGTTAATGCTATTCCTGTTATTTCTAATGTAACAGCCGTGGCAAACAGTTATGGAGACGTTCGTGTTGCTTGGGATGTAACTGATCCGCTAGACGGTGATACTTATACTGTAGAAGTATTAGATTTAAGTAATAACAGTGTCCAGTGGACTACAACAACCACGAATACTCATGCTTACTTTGATATCTCTGACTCTATTCCTCTTTATGGGTTTGCTCCAACATACCTTAAAATTAGCGTTAAGAGCACCAAAGCAGCACCCGTTATCTTTAATAACTCAATAGCTACAGATGATTCGTTCATTAAAGAAGTTGTTGTCTTTGCTGGACAAGATAACGTAAATGCACACTTTACAGAATTATCTGGTGCAAATAAAGCAGCAATGAGTAGCACAACAGCCCGTAATGCATATGCTACGCAACGTGGTTTAGCAAATGCTGAAGTTCTTCCGTTAAATACAGCTTCTGGATCATCAGCAGCAGATAAATATGCTGACGATAAAGCTGGAACAGGTACACCAGACAACTACTGGTATGATCTGGATAACACAGCAGATGGGCCATGCTTAACTAACTTTATCACTAAAGTCACACCTTATGCAAGTAAGGTTAAAGCCATTATTTGGGGACAAGGTGAAAATGATGCTGTATCAGCATCTTCAACTGTTGCAGGTAGATACAGTAACACTACACGTTACCATGATGCTACGATAGCTATCTTTGATAAGATGCGTACAATAGTTCCTGCTTCTCAAGCAAAAATTGTTTGGCAGATCCTAGGACGTTCTTATTTATATGGTGTAGAAGTTAATGGTGTGGATTGGCAGAAGTACAGAAATGTACAAAGAACCATCTCTACAGCACGTGATGATGTTATCATTGGTTCTTGGGTAGATGGTGCTGAACGTTACAGTGGTTATGTTTATGAAGAAGGTATTGATGGTCGTATCCATTATATTTCTTCTGTATACCAAACAGCAGCTACAAAACTTGCTAAATCAGCAGCAGACGGTACAGACTTAACATCAACGTCACCTGTTTGGGTTGATATGGCTGTTCCAACTGGAGCAACAGCTACTTCCCAACCTAATCAAGATACAATTTTAGCATGGGATGCTCAAGGCTATAGTAAACACTACTTCCGTAATATTAACGTCTTAACCGCATCTGTATTAACTGAACAAACGCTTAATACGAACAGTTATACGTTTACCTATGCAGATCAAGTAGAACAATATGGTTTTGCAGCAGGAACTACTATATTTGATGTTGCATATTATGATGAAGCAAATGATGTGTTATCTCCTTTAGTACGTTTTAATGTTAACGTTACAGCAGGAACCGTAGAAGATAAACCTGTCGTGATGGATTATGATTTGACGCAAGAAACTCTCCCATCAGATGTTAAGGTTAATGGTGGGAACTCTTTTGCTCGTGCCTCTGGAGATATACTTGTAGCCACTAAGGCACCTGCTGGTATAGCTCCGTTGGAGTATGTTGGTACTACCCCTGTAGGTAGACGTGTTGTAACAGCAAACAGTACACAAATTTTTGTCAACAACGCCTTAACAAGTGCAAGCCCGTGGGTAAAGACCAACTTAACTGTTGCAGCTTCATCGATCAACTCTCCGGCTGGAACTACAGCTAACACTTACAAGTTAACACCTTCTACAAATCCAGGACAACATATTTTATCAGCGGTGAATACAGCTTCTGATATTACAGCAGGTAAACAATGGGCTGCATCTGTATTCTTGAAGCCAGATGGGATCACTAAAGTCAAGCTCAAATTGACTTCAGGAGATGAGGTTAACGAAGGGACTTATGATCTTGAAGCTGGAACATTTACAGGCACAGATGCAAATATGATCGACATGGGGAATGGTTGGTATCGTGTAATCTTACATAAAGTAACGATTGCTAAACAAGCCTCTATGACTTATGAGATTATAGCTTTGAATGCCAGTGGATCAGACACTTTTGCAGGAGATGGCACTGGAGGTCTTATTGCTTGGGTTCCACAACTTGAAATGGGTGATATGACAAACCCAGTTTGGGCGGGGACACCATTTGTTTGTACTTATGCACGAGACACAGATAGTGCTGCCACCTTCACTATTCCTAAGAACGGACACACTGGCGTGGATATTTACCACACAGATGGAACTGTGCAAAGAGAGATTTTCACTGGCACAGCTACTACTTGGATGTTGTCATTCAACGCCGCAAGTGCGGATTGGGGATCGAAATTCATTTCTGGTTTGAAATATTACGACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
47d22e282edd41650633b282cf009816f0371d144c748a64cfb3688349471363
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8206
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50