Protein

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Genbank accession
AIX26599.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSPWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFSAGTVTATLIGNASTAARLASSRQITLGGDLDGSAIFDGSTNITISADLDLVPTLPHYDGTNTSSATYTKVVVDSKGRITNASSPTSLSEYGLDGTVEGQSAQAYDLDLAAIAGLTTTGIISRTSGGNMQTRTITGTATRISISQGAGISGNPTIDMITTAVTAGDYNTESLTSVSGAGSNSEPFGTETVNATKFTVDAYGRLTSSTNVPIATATEGSKYAAYAGGTTYVRYDIIEDSSRVYQSITGIAAGGGAPTHTDASDAGGWRYLGAAATEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTVENFELDQELTATTGYRGFNYLNYFKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGDVNQTLDKTGDGNLFLQLTQNSATARTFSILSTNSGSGAANIVVAATDLVDIQASDAAGKVYVEDARFQDNYIATANATLNLDPGDDRAVAGTVRVWGNLQVDGTTTTVNSSTLQVDDPIITLGGDTAPVADDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLAGHGGGYSFLHAATNTAEVFTGTASGIIAGNVKLTSGTASSSNTTGDLVVAGGVGIAGAVNIGGLLDVDSTFRANSTSRFDDNMVIQGASKTLQINNGSGTTKIEFQSTTGNAIIGGVTDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTSIAGTLGVTNIATFSNNIDANGDVAIAGNIHSESTNDITTAKNSETGVWEIQSSDYGSLRVDGGAYVAGSALIDGTLHVNGAIEVKDSATEAESRLNWLRVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTLRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRYNSDTVKFSVLGASGDTEIQGTLLVEDNVNFNGTLDVDADFAVRNGTTDKFFVDNLTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQVNDTLGVSDVVTFTRNTEQTLTGSYAADGAFRLTGGAGIARNLAVGGDARVYGATELTGALDLNNNANISGTLLQGGGATFLSNVEILAGVGGATKFQVVSATGNTDIRGTLDIGGDVTAESNLTITGNLTVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPTTNDGKDRGVEFRYYDGSAKIGFFGYDRSANQFAFLTSASNSSEVLSGTDGPLRAGSLNLTGSGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVASGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASAATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNATTADALRTARTITVDGVVDGSVSFNGSADVTISTTYNDADITALAAMTGTGLVTRTADNTYARRTLAVTASSGITLTNADGVSGNPTINVASTASNSANNLVLRDASGDFAAGTITAALVGNVTGQTSDISNHDTDALSEGSTNLYFTNERVDDRIDALVQASTGITKVYDDTAGTYTLSVTQADVNTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGVGVELSGAGALSVTQADIDTDNVTEGSTNVFYTEARFDASLAGKNTANLAEGTNLYYTDARADARIAAADTDDLSEGSTNLYHTSARADARVNLQTGANLDLSSKSTSDLSEGTNQYYTEARVQTKLDNAFAQLQAMLTNLATTTTLTLNLSGDPTPGAAVTTSVTNGGGGGFVAGTAVATTGGTGSSLTVNTTVVNGIITAAAVNAGGSGFLVNETVTVANANAGKVLSLNLASLAGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVDITASAGAITNVTINDGGTGYVVGETITIVQPTGLDGSNPGAGGTVNVATVATDATLQLTDVTTMEIGATVTGATSGTTGVITALAASAITVDTVDGFFKVGEVVSANDVTTLTVQSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2007 AA
molecular weight: 204331,41590 Da
isoelectric point:4,18894
aromaticity:0,05780
hydropathy:-0,09048

Domains

Domains [InterPro]
DC_1619
ATT
1–449
DC_1619 DC_1607 DC_0029 DC_0029
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352
AIX26599.1
1 2007
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 1-449 | STR 450-1559 | RBD 1575-2007
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014a
[NCBI] 		1493507 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Acionnavirus > Acionnavirus monteraybay
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX26599.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019081 [NCBI]
CDS location
range 84616 -> 90639
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGGAGGGGTGGTGCTCAGGAATGGGCGAACGCGAACCCAACTCTCGCTCAAGGCGAATTGGGAATCGAACTTGATACTGGACGTTTCAAGATTGGTGATGGCGTTTCTCCCTGGAATACATTACGATATGAACGTCCTGTTGAATCTACTTCAAACACAGCAAACACTCTTGTGCAAAGAGATGCTGATGGTAATTTTTCAGCAGGTACAGTTACTGCAACATTAATTGGTAATGCTTCAACTGCTGCTCGTCTTGCATCATCTAGACAGATTACTCTTGGTGGTGACCTTGACGGATCTGCTATCTTTGATGGTTCAACAAACATCACGATTTCAGCAGATTTAGATTTAGTACCAACACTTCCACATTATGATGGTACTAACACGTCAAGTGCAACATATACAAAAGTTGTAGTTGATTCTAAAGGTAGAATTACTAATGCATCTTCACCAACCAGTCTTTCAGAATATGGTCTGGATGGAACAGTAGAAGGTCAATCAGCACAGGCATATGATCTTGACCTGGCAGCAATTGCAGGTCTTACCACTACGGGTATTATTTCCAGAACTTCTGGCGGTAATATGCAAACCAGAACTATTACTGGTACTGCAACTAGAATTTCTATCAGTCAAGGTGCTGGTATTAGTGGCAACCCAACCATTGATATGATCACTACAGCAGTAACTGCTGGAGATTATAATACAGAATCACTAACATCAGTTTCTGGTGCTGGATCTAACTCAGAACCATTTGGTACAGAAACTGTAAATGCTACAAAATTTACAGTAGATGCCTATGGCAGACTGACAAGTTCAACAAACGTACCTATTGCTACTGCTACCGAAGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGGAGGTACAACATATGTTAGATATGATATTATTGAAGATAGTAGTAGAGTATATCAATCAATTACAGGAATCGCTGCAGGTGGTGGTGCTCCAACTCACACTGATGCTTCAGATGCTGGTGGGTGGAGATATCTCGGTGCAGCAGCAACAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTAGATAATACACAATTACAAAATAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCGTAGAAAATTTTGAACTGGATCAGGAACTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATTTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTATTTCTCTGACCCTGATATTACTCTTGACGGCGATGTTAATCAGACACTGGATAAAACTGGGGATGGTAACCTTTTCCTTCAACTAACTCAGAATAGTGCAACTGCTAGAACCTTCAGCATTCTTTCTACAAATTCTGGTTCTGGTGCAGCAAACATTGTTGTTGCTGCAACTGATTTAGTTGATATTCAGGCAAGCGATGCAGCAGGTAAGGTATATGTAGAAGATGCAAGATTTCAAGATAACTATATTGCTACAGCAAACGCGACATTAAACCTTGATCCTGGTGATGACCGTGCTGTAGCTGGTACTGTTCGTGTCTGGGGTAACCTCCAGGTTGATGGAACTACTACAACAGTAAATTCATCGACTCTACAAGTTGATGACCCTATCATTACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCAGTTGCTGACGATAATCTAGATCGTGGTATTGAATTTAGATATTACGATACCGAAGCACGTCTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTATACCGACTTAGCTGGTCATGGTGGTGGTTATAGTTTCCTCCATGCTGCTACAAATACTGCTGAAGTTTTTACTGGTACTGCTTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACATCTGGCACTGCATCTTCTTCCAATACAACTGGCGATCTGGTTGTTGCTGGTGGTGTTGGAATCGCGGGTGCAGTTAATATTGGTGGTCTATTAGATGTAGATAGTACATTCCGAGCAAACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAACATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACTTTACAAATTAATAATGGTTCTGGAACTACGAAGATTGAGTTTCAATCAACAACTGGTAATGCAATTATCGGTGGTGTAACTGATGTAACTGGCAACTTCAACGTCAATACTAACAAGTTCAACGTTGTTGCTGCTTCTGGTAACACTTCTATTGCTGGCACATTAGGTGTTACAAACATCGCTACCTTCTCTAATAATATTGATGCTAACGGTGATGTTGCAATTGCAGGTAACATTCACTCTGAAAGCACTAACGATATTACCACTGCTAAGAACTCAGAAACAGGTGTATGGGAGATTCAGTCTAGTGACTATGGATCTCTGAGAGTTGATGGTGGTGCATATGTTGCAGGATCTGCTCTAATTGATGGCACACTACACGTTAATGGTGCGATTGAAGTTAAGGATAGCGCGACAGAGGCAGAATCAAGACTGAACTGGTTGCGTGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGATTCTTATCAGGCAACTCCCTCCTATGCATCTCACAACACTACAACTCTGAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACCCTTCATGTTGGTGGTACGGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACAATAGTGATACTGTTAAGTTCTCTGTTCTGGGTGCATCTGGTGATACAGAAATCCAAGGTACGTTGCTTGTCGAAGATAATGTAAATTTCAACGGCACTCTGGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACGACGGATAAATTCTTCGTTGATAATTTAACTGGTAATACCGATATCCAAGGCACACTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTCAGCAACGCTGTCACATTCGATCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGCACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTTAGAAGTGGTAGCACGGACAAGATGACCGTTGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGATGGCACACTGGTTGTTCAAGGTCAAACAACTATCAATGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAATGGCAACACAAATATTATCGGTACATTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGGTTAATGACACCTTGGGTGTATCTGATGTTGTAACCTTTACTAGAAATACCGAGCAAACTCTGACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGGTATTGCTAGAAATCTTGCTGTTGGCGGTGATGCTAGAGTTTATGGTGCTACCGAACTTACAGGTGCTCTCGACCTCAATAATAATGCCAATATTTCAGGAACACTCCTACAAGGTGGTGGTGCCACATTCCTTTCTAACGTTGAGATTTTAGCAGGCGTTGGTGGTGCTACTAAGTTCCAGGTAGTTTCTGCAACTGGCAATACTGATATTCGTGGCACTCTAGATATCGGTGGTGATGTAACTGCCGAGTCCAACCTTACTATTACAGGAAATCTAACAGTCAATGGAACAACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAACAACTAACGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAATTGGTTTCTTCGGATACGACAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCTTAACAAGTGCAAGTAACTCATCAGAAGTTCTTTCTGGAACTGATGGTCCTCTTCGTGCTGGCAGTCTGAATCTTACTGGTTCTGGTACATCACTCGATGTTGATGCTAACGCCAACATTGACGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCCCAGGTTGCTTCTGGTGCTGCTCTGGTTATTCCTAACACGACTAAGATTAACAACCTCAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCTGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCAACAACTGCAGATGCACTGAGGACTGCAAGAACAATCACTGTTGATGGTGTTGTTGATGGCAGTGTATCATTCAATGGTTCTGCCGATGTAACTATCAGCACTACTTACAATGATGCAGACATCACTGCACTTGCTGCAATGACGGGCACTGGTCTGGTAACAAGGACTGCCGATAACACTTATGCACGACGCACACTTGCTGTCACAGCATCCTCTGGTATTACACTGACGAATGCTGATGGTGTTTCTGGTAACCCAACAATTAACGTTGCTTCCACAGCAAGTAACTCAGCAAATAACCTTGTTCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCTGGAACTATTACTGCAGCATTAGTTGGTAATGTCACTGGTCAAACATCTGATATTAGTAATCATGATACCGATGCTCTTTCAGAAGGTTCTACCAATCTTTACTTCACTAATGAGCGTGTTGATGACAGAATCGACGCACTGGTACAAGCAAGCACTGGTATTACTAAGGTATATGATGACACAGCAGGCACCTATACACTCTCTGTAACGCAGGCAGACGTTAATACTGACAATGTAACAGAAGGTTCCACAAACCTCTTTACAACCGCTGCTAGGACCCGCACACACTTCACATACGGAGTAGGCGTAGAACTTAGTGGTGCAGGCGCTCTGAGTGTCACTCAGGCAGACATTGATACCGACAATGTAACTGAAGGTTCTACGAATGTCTTCTATACTGAGGCACGCTTTGATGCAAGTCTTGCAGGTAAGAATACTGCTAATTTGGCAGAAGGTACTAACCTCTACTATACGGATGCAAGAGCAGACGCAAGAATTGCAGCAGCAGATACTGATGATCTAAGCGAAGGTTCTACCAATCTCTATCACACAAGTGCTCGTGCTGATGCAAGAGTCAATTTACAGACTGGTGCAAACCTGGATCTTTCTAGTAAGTCGACTTCTGATCTTTCAGAAGGTACTAATCAGTATTACACTGAAGCAAGAGTACAGACAAAACTGGATAATGCATTTGCTCAACTACAAGCAATGCTCACCAACCTTGCAACTACTACAACTCTAACCTTGAATCTCTCTGGTGATCCTACACCTGGTGCTGCTGTTACTACTTCCGTCACAAACGGTGGTGGTGGTGGATTTGTTGCTGGAACTGCGGTTGCAACAACAGGTGGTACAGGTTCTTCCCTGACAGTTAATACTACTGTTGTTAATGGTATTATCACTGCTGCTGCAGTTAATGCAGGTGGTTCTGGTTTCCTTGTAAATGAGACTGTAACAGTCGCCAATGCTAATGCTGGTAAAGTATTGTCACTGAACCTAGCATCTCTTGCAGGCGGTTCTAACTATGTTACAGGAACTGCTCTTGCAACAACAGGTGGATCTGGTTCTGCCTCACTGACTGTTGATATCACTGCCTCTGCTGGTGCAATCACTAACGTTACTATTAACGACGGTGGCACTGGATACGTCGTTGGTGAGACAATCACTATTGTTCAACCCACTGGATTGGATGGTAGCAACCCTGGTGCAGGTGGTACAGTTAATGTTGCCACTGTTGCTACTGATGCAACTCTGCAACTGACCGACGTTACTACAATGGAAATTGGTGCAACTGTAACAGGTGCTACCAGTGGCACCACTGGAGTTATTACTGCTCTTGCTGCTAGTGCAATTACTGTCGATACCGTTGATGGATTCTTCAAAGTTGGAGAAGTCGTCAGTGCTAATGATGTTACTACTTTGACTGTCCAATCATTCGCTTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a38acf47aafe4e1650ac6d01c7ca3804a94e417af0b0b6bf1c0b1e9532167b7a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5486
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank