Protein

Genbank accession
XHY53443.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
Protein sequence
MADLSRIQFKRTSTKGRRPDAGTMNPGELAINLADQYLLTKNDSGAIINLSCPPVYDRQVRFAGKVDGDNYILGKTANYMDDSTARDLDKFGAFRTNNADGWSNLILNIPHSNGKAHGRGFEFQYGSSSSQVKTYGFDKDGNKRFSYRMYHEGDKPTPGELNVYSKQEVDRMFVKNVKLATVPVDTVEGYFKLATAMIPQNGRSVFFRIHGGNGYNVTAYDQVDIVEIVIRSGNNRPKGVNVIAYRRNTNKSFDVLAVNTSGDNYDIYVKYQRYTDNVIVEFGKSVDVNLTVHDVPDFVAERPAGDNVIGGRAVTLFNTENKRGVLSFDDNTQNSYDIVHLSNDRGTGRKYIRKFRSNYNEMVWHETVQGAVYRLATGVTDSTEVLRVDSNSAIPGSYKGYVITGKMELHGSGNAMTLHRQTDQAAYMAWWDRRDGKNQRSGYIGHADGTSDGFVWRNDVGANSFDLEGSGQVNLTTGKTKIVYTNGQYYSANSDAYRMIFGNYGAFWRNDGTKIYLLSTEENDRFGGWNGNRPFIYDLTNGKVTLGGDGNEGALVLERDSRAARFSNNVFLEKGLLTFSAGGNQSMDSFTINHWGNSNAGRYNVLQFEDTKGTHFTTERNADGGLLAHFRGDLTTEGKLTWGKGTATSGFNIRAWGNSGSRKQVFECVDESGWHWYTQRPGGPGTSAIEFAINGTVKPQAIHTGGNILLNGADIEFRRTGNKHIWFRDPDGLELGLMYSDDAGVIRFRGQKQAQTWKFADKMIQLEAGTVTGGGNGLIRGEVAGGSWASWRDRAAGLMVGCPQSVDSAHNVWKATHWGKYHIAAMGVHVPSGTITNALARLNVHDANFDFNASGDMSVGRNGSFNDVYIRSDARLKINKEEYKENATDKVNRLTVYTYDKVKSLTDRTVIAHEVGIIAQDLEKELPEAVTTSKVGDPDKPEEILTISNSAVNALLIKAFQEMSEELKAVKAELAELKKN
Physico‐chemical
properties
protein length:980 AA
molecular weight: 108515,32620 Da
isoelectric point:7,69938
aromaticity:0,10204
hydropathy:-0,56082

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
454–535
IPR048390 IPR030392 Coil
IPR030392
872–974
IPR030392
XHY53443.1
1 980
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage SFHK24
[NCBI] 		3350103 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XHY53443.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ351812 [NCBI]
CDS location
range 106102 -> 109044
strand -
CDS
ATGGCAGATTTAAGCAGAATCCAATTTAAACGCACTAGCACTAAAGGTCGTCGACCTGATGCTGGTACGATGAATCCGGGGGAATTGGCAATCAACCTTGCGGATCAATATCTTCTTACTAAAAATGATTCCGGTGCTATTATCAATTTAAGTTGTCCTCCGGTTTATGACCGACAAGTTAGATTCGCTGGTAAGGTTGACGGCGACAACTATATTTTAGGTAAAACCGCTAACTATATGGACGATTCAACCGCTCGCGACCTTGACAAATTTGGTGCGTTTCGAACGAATAATGCTGATGGTTGGTCTAACTTGATTCTGAACATTCCTCATTCTAACGGTAAAGCACACGGTCGCGGGTTTGAATTTCAATATGGTTCTAGTTCCTCTCAGGTTAAAACCTATGGTTTTGATAAGGATGGCAACAAGAGATTCAGTTACCGCATGTATCACGAAGGTGATAAGCCAACTCCAGGAGAATTGAACGTTTATAGCAAACAAGAAGTAGATAGAATGTTTGTTAAGAACGTTAAACTTGCTACAGTTCCTGTTGATACCGTTGAAGGCTATTTTAAATTAGCAACTGCAATGATTCCACAAAATGGGCGTAGCGTATTTTTCCGTATTCATGGCGGCAACGGATATAACGTTACTGCATACGATCAAGTTGATATTGTAGAAATTGTTATTCGTAGTGGAAATAATCGCCCTAAAGGTGTTAACGTTATTGCATATCGCCGAAATACAAACAAATCATTTGATGTTTTGGCTGTTAACACTTCTGGCGATAACTATGATATCTATGTGAAATATCAGCGTTATACTGATAACGTTATTGTTGAATTTGGTAAAAGTGTTGATGTTAATTTAACAGTGCATGACGTTCCAGATTTTGTTGCTGAACGTCCTGCTGGCGATAATGTTATTGGCGGTCGCGCTGTAACTCTTTTCAACACCGAAAACAAACGAGGTGTGTTGAGTTTTGACGACAACACACAAAATAGCTATGATATTGTTCACTTGAGTAATGATAGAGGTACTGGTAGGAAATATATTCGTAAATTCCGTAGTAACTATAATGAAATGGTTTGGCATGAAACCGTTCAGGGTGCTGTATATCGTCTTGCTACTGGTGTTACAGATTCTACGGAAGTTCTTAGAGTTGATTCTAATAGTGCTATACCTGGTAGCTATAAAGGATATGTAATTACTGGTAAAATGGAATTGCACGGTAGTGGTAATGCGATGACTTTACATCGCCAGACTGATCAAGCTGCCTATATGGCGTGGTGGGATCGTCGTGATGGTAAAAACCAACGTAGTGGTTATATCGGTCATGCGGATGGTACTAGTGATGGTTTTGTGTGGCGTAATGATGTTGGTGCTAACTCATTTGATTTGGAAGGTAGTGGACAAGTAAATTTGACTACAGGAAAAACAAAAATTGTATATACCAACGGACAATACTATTCCGCTAACTCAGATGCATATCGCATGATCTTTGGTAATTACGGTGCATTCTGGCGTAATGACGGTACGAAAATTTATCTTCTTTCCACAGAAGAAAATGACCGTTTTGGTGGATGGAACGGCAACCGACCATTCATCTACGATTTGACAAATGGTAAAGTTACTTTAGGTGGTGATGGTAACGAAGGCGCATTAGTTCTCGAAAGAGATAGCCGTGCTGCTCGTTTTAGCAACAATGTATTCTTAGAAAAAGGATTGCTTACTTTCTCTGCGGGTGGGAATCAGTCGATGGATTCTTTCACTATTAACCATTGGGGGAATAGTAACGCTGGACGATATAATGTTTTACAATTTGAAGACACGAAAGGAACACATTTTACAACCGAACGTAATGCTGATGGTGGATTGCTTGCTCACTTCCGAGGGGATTTAACCACAGAAGGGAAATTAACGTGGGGCAAGGGTACAGCCACATCTGGCTTTAACATTCGTGCATGGGGTAATAGTGGTTCCCGTAAACAGGTTTTCGAGTGTGTAGATGAAAGTGGTTGGCATTGGTATACTCAACGGCCTGGCGGTCCGGGTACTTCTGCAATTGAGTTTGCCATCAACGGTACTGTTAAGCCTCAAGCAATTCACACTGGCGGCAATATTCTTTTGAACGGTGCTGATATTGAATTTCGTCGCACTGGTAATAAGCATATCTGGTTTAGAGATCCAGACGGTTTAGAACTAGGTTTGATGTATTCCGATGATGCTGGTGTTATTCGCTTCCGTGGTCAGAAACAAGCCCAGACGTGGAAATTTGCAGATAAAATGATCCAATTGGAAGCTGGTACTGTAACTGGTGGCGGTAATGGCCTGATTCGTGGTGAAGTTGCTGGCGGTAGTTGGGCTAGCTGGCGTGACCGTGCTGCTGGCCTTATGGTTGGGTGTCCTCAATCCGTTGACTCGGCACATAACGTATGGAAAGCGACGCATTGGGGTAAATATCATATCGCAGCAATGGGTGTACATGTTCCTAGTGGTACTATTACCAATGCTTTAGCTCGCCTAAACGTTCATGACGCCAACTTTGACTTTAACGCCTCCGGTGATATGTCGGTAGGTCGTAACGGTTCGTTTAACGATGTGTATATTCGTTCTGATGCTCGCCTTAAAATCAACAAGGAAGAGTATAAAGAGAATGCCACCGATAAAGTTAATCGCTTGACTGTATACACCTACGATAAGGTTAAATCTTTAACTGACCGTACTGTCATTGCTCATGAAGTTGGTATTATTGCACAGGATCTTGAAAAAGAATTGCCGGAAGCCGTAACAACTTCTAAGGTCGGCGATCCAGATAAACCAGAAGAGATATTAACAATTTCTAACTCTGCTGTCAACGCTCTTTTAATTAAGGCGTTTCAGGAAATGAGCGAAGAATTGAAAGCCGTTAAAGCTGAACTAGCGGAACTTAAAAAGAATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
f4e381c086fc400e532eebe561827cc926e778a2fe7d76d423dd4d4d4c2aaeed
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2585
Evidence 0,2585
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Literature

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