Protein

Genbank accession
AIX41059.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MNQETGEVSFTDTVTDLTALSSLTITDGTNSSIITPTSGRFGNVLISGQSVESVTGDLNIKTGGSGEINIFGNTNVIGILTAQIIEINAIQKGDTAIALDDTGTDGTIRFITDGQEAQRITNQQRVGINTTTPVTQLEVKGGTQLENLNVTGIATLNGVGIATIGGDPDFRNLNITGLSTFAGVGTFLSDLYVGGNLSVLGDIKFDEVDARNANITGIATVGFASITDARVGSALTNLGHTQLNTLNVSGVSTLSLLEVSGNSVFTGISTFNNNVTINGDLTINGSQNVDSFGTGDLIVSGIASINQAKIATGIVTTLTATRTESAELKVTGLSTFVGVATFANDVFVAGNLNVLGDIAYDEVTGRNLNISGIATIGFASITDAKIGVATITKLDVTEINVDGGTGIDDNSVTTENLVVSGIATINSGILTTLQAEVGSITNLTAGVSTFTGIVTTTEDLYVGGNLYVFNDIFYDEITGRNLSISGVSTLGFASVRDLRVSGVATFLGDVEISGSQIVDSLITGDLEVTGVTTTKELRFTDAVGVGLTLTNLVVTGNAELNGSGIVTAGQDINFRNLEVAGLSTFVGLQSFRSAVGTALTVYNLRVPENGIVSLPGIPVQGGDAEFRNVNVTGVSSFSGVSTFGSDLYVDGNLFVSGLDFRETLAGENLLVAGVGTVNNLNSNIGIITHLQAGISTFTGITTFQSDASFLSDVYVDGNLNVTGDIRYDEVNGRNLNISGIATIGYSSITDAKIGVATISTLSFGDGVGTALTLTDLTVTGDANLNGSGIVTAGSDVAFRNLEVTGLSTFTGVGTFLSDLYVGGDLFVFNDIKYDEINGRNLNISGISTLGFTSISDIRVSGGSTFLGNVEIDGNLDVTGDLTFDEFDATNANITGIATIGNLLAGVGTITTLSSTDGEITTLTSTDTVVGTLTATDATITTLGVTDSIVGTSTITTLSVTDSVVGTSTITTLNFTDGVGVALTLTDLNVLGEANLNGSGIATAGSDIEFRNLSITGLSTFVGVATFQDDLYVAGNLNVLGDLTYDEVNGRNLNISGIATIGFASITDLRVSGVTTFLGPVNIDGGQQTDFIQTTDLIVTGVATIGYATVTKLIADHSDMRNLNVSGIATIGSLVSDGNGGIIVDGAVSISGIVTIGENSIILDGRKDVEAIYLGDTGRAIVSGITTDGKRTYVKFDDGRFDRLNVSGISTFNDVVSTSSTITNLDVTTATVGFLTATQGYVGVLTVGTFTNDGGGSVIGDDITTRNLNVTGVSTFAGIVTTTGDLYVGGDLFVFNDIFYDEINGRNLNITGVATIGYSSITDVRVAGVATFLGDVNISGVTSVTTLEATDIDAYRVTTQRLIVPDDGFVQLPGIPVSGGSAEFSELLITGISSFVGVATFKDDVYIDGDFIVGGSQVIDNVATENIIISGIATIRTGEITELNVGIATVGFLTATDGYIGVLTAQNYTSLSDERLKSNIETIDDALAGVLRLDGVMFQWNNTGKTDMGVIAQQVEAVFPEIVHGDDTKGVNYNGLIGVLIEAVKELKVENDSLRERLDRLE
Physico‐chemical
properties
protein length:1561 AA
molecular weight: 160993,05880 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06086
hydropathy:0,29193

Domains

Domains [InterPro]
IPR036388
1460–1540
IPR036388
IPR030392
1471–1557
IPR030392
IPR030392
1471–1522
IPR030392 Coil
AIX41059.1
1 1561
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX41059.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019141 [NCBI]
CDS location
range 199561 -> 204246
strand +
CDS
GTGAATCAGGAGACTGGTGAAGTATCCTTTACAGATACTGTAACAGACCTAACTGCCCTATCCTCACTCACTATTACTGATGGCACTAACAGTAGTATCATTACTCCTACTTCCGGTAGGTTTGGTAATGTTCTTATCAGTGGTCAGAGTGTAGAGAGTGTAACCGGAGACCTCAACATTAAGACTGGTGGTTCCGGTGAGATCAATATCTTTGGTAACACCAATGTTATTGGTATTCTAACCGCTCAGATCATTGAGATTAATGCTATTCAGAAGGGCGATACAGCAATCGCTCTAGATGATACTGGAACTGATGGGACTATCCGTTTCATCACAGACGGACAAGAAGCACAACGTATTACAAACCAACAGAGAGTTGGTATTAACACCACCACCCCAGTTACTCAGTTAGAAGTTAAGGGTGGAACACAACTAGAGAACTTAAATGTAACTGGTATTGCCACACTTAATGGTGTTGGTATTGCTACTATCGGTGGTGATCCTGACTTCAGAAACTTAAATATCACTGGACTATCGACGTTCGCTGGTGTTGGTACTTTCCTCAGTGACTTGTATGTTGGTGGTAACCTCAGTGTCCTAGGTGATATCAAGTTTGATGAAGTTGATGCGAGAAACGCCAACATCACTGGTATTGCCACAGTTGGTTTCGCCTCTATCACAGATGCCAGAGTTGGAAGTGCCCTCACTAACTTGGGTCACACTCAACTCAATACTCTGAATGTAAGTGGAGTATCTACACTATCACTACTAGAAGTCAGTGGTAACTCAGTATTTACTGGTATCTCTACCTTCAATAACAATGTAACTATCAATGGTGACCTCACCATTAATGGTTCTCAGAATGTAGATAGTTTTGGAACTGGTGATTTAATAGTTAGTGGTATTGCTAGTATCAACCAGGCGAAGATCGCCACTGGTATTGTTACCACACTAACTGCCACTAGAACAGAGTCAGCAGAACTAAAAGTAACTGGTCTCTCCACCTTTGTTGGTGTTGCTACCTTTGCTAACGATGTATTCGTGGCAGGTAACCTCAATGTTCTAGGAGATATTGCATATGATGAAGTCACTGGTAGAAACCTAAACATCTCCGGTATCGCAACCATCGGGTTCGCCTCTATCACAGACGCCAAGATTGGTGTCGCCACTATTACAAAACTTGATGTCACTGAGATCAATGTAGATGGTGGAACAGGTATTGATGATAACTCAGTAACTACAGAGAACCTAGTTGTTAGTGGTATCGCTACCATCAACTCAGGTATCCTCACAACCCTCCAGGCGGAGGTAGGAAGTATCACAAACCTCACCGCTGGTGTTTCTACCTTTACTGGTATTGTAACCACTACAGAGGATCTATACGTTGGTGGAAACCTCTACGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAAATCACTGGTAGGAACCTTTCTATCTCTGGAGTATCTACATTAGGTTTCGCTTCTGTTAGAGATCTAAGAGTATCTGGTGTCGCTACATTCCTTGGTGATGTGGAGATCAGTGGATCACAGATTGTTGACTCACTAATAACTGGTGACTTGGAAGTTACTGGTGTTACTACAACTAAGGAACTAAGATTTACAGACGCTGTTGGTGTAGGACTCACACTCACCAATCTAGTTGTAACTGGTAACGCGGAACTCAATGGTTCTGGTATTGTTACCGCTGGTCAAGACATCAACTTCAGAAACCTAGAAGTTGCTGGTCTATCAACCTTTGTTGGTCTCCAGTCCTTCAGGTCAGCAGTTGGAACGGCACTCACAGTTTATAACCTAAGAGTTCCTGAAAATGGTATTGTTTCACTACCTGGTATTCCTGTTCAGGGTGGGGACGCTGAGTTTAGAAACGTCAATGTAACTGGTGTATCTTCCTTCAGTGGAGTATCAACTTTCGGTAGTGACCTCTATGTGGATGGAAACCTATTTGTTTCTGGTCTAGACTTCAGAGAGACACTTGCTGGTGAAAACCTATTAGTTGCTGGTGTTGGTACTGTTAATAATCTCAATAGTAATATTGGTATTATCACTCATCTACAGGCAGGTATATCAACCTTCACTGGTATCACCACCTTCCAGAGTGATGCCTCCTTCTTGAGTGATGTATATGTAGATGGAAACCTTAATGTTACGGGTGACATTAGATATGATGAGGTGAATGGTAGGAACTTGAATATCAGTGGTATCGCTACCATTGGTTACTCCTCTATCACAGACGCCAAGATTGGTGTTGCTACTATCTCCACACTATCCTTTGGTGATGGTGTTGGAACAGCACTCACACTTACAGACCTCACGGTAACAGGTGACGCCAACCTCAATGGTTCTGGTATTGTAACCGCTGGTTCTGATGTAGCGTTTAGAAATCTAGAAGTAACTGGACTATCTACCTTCACTGGTGTTGGTACTTTCCTCAGTGACTTGTATGTTGGTGGTGACCTCTTTGTATTCAATGATATCAAGTATGATGAGATTAATGGTAGAAACCTAAACATCTCTGGTATCTCCACACTTGGTTTCACTTCTATCTCCGACATCAGAGTATCTGGTGGTTCTACCTTCTTAGGTAATGTAGAGATTGATGGAAACCTAGATGTAACTGGTGACCTAACCTTTGATGAGTTTGATGCCACTAACGCTAACATCACTGGTATTGCCACTATTGGTAACCTACTAGCGGGTGTGGGAACTATCACCACACTATCATCTACTGATGGTGAGATTACAACACTAACCTCTACTGATACTGTTGTTGGTACTCTAACCGCCACTGATGCCACTATCACTACACTAGGTGTTACTGATAGTATAGTTGGAACCTCTACCATTACAACACTCAGTGTTACTGATAGTGTAGTTGGAACTTCTACTATCACAACACTCAACTTCACTGATGGTGTTGGAGTAGCACTCACACTCACTGACCTCAATGTTCTAGGTGAAGCTAACCTCAATGGTTCTGGTATCGCAACCGCTGGTTCTGATATAGAGTTTAGGAACCTCAGTATTACTGGTCTCTCCACCTTTGTTGGTGTAGCAACCTTCCAAGATGACTTGTATGTGGCAGGTAACCTGAATGTATTGGGTGACCTAACCTATGATGAAGTGAATGGTAGAAACCTTAACATCTCTGGTATCGCTACCATTGGTTTCGCCTCTATCACAGACCTAAGAGTATCTGGTGTAACTACCTTCCTCGGTCCTGTTAATATCGATGGTGGTCAGCAAACCGACTTCATTCAAACCACAGACTTGATTGTCACTGGTGTTGCCACTATTGGTTACGCAACTGTCACTAAGTTGATCGCTGATCACAGTGATATGAGGAACCTGAATGTATCAGGTATCGCCACTATTGGTAGTCTCGTATCAGATGGTAATGGTGGAATCATTGTAGATGGTGCTGTATCCATTAGTGGTATTGTTACTATTGGTGAAAACTCTATCATTCTCGATGGTAGAAAGGATGTAGAAGCGATCTACTTGGGTGATACTGGAAGAGCAATCGTCTCTGGTATTACTACTGATGGTAAGAGAACTTATGTCAAATTTGATGATGGTAGATTTGATAGACTAAATGTATCTGGTATCTCTACCTTCAATGATGTAGTATCCACATCATCTACTATCACTAACCTAGATGTAACCACAGCAACTGTTGGTTTCCTAACCGCAACTCAGGGTTATGTTGGAGTTCTAACTGTAGGAACATTCACCAATGATGGTGGTGGTTCTGTTATTGGTGACGATATCACAACCAGAAACCTGAATGTAACTGGTGTATCTACCTTCGCAGGTATTGTTACTACTACTGGTGACCTCTATGTGGGTGGTGACCTCTTTGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAGATCAATGGTAGAAACCTGAATATCACGGGTGTCGCCACCATCGGTTACTCCTCTATCACTGATGTAAGAGTTGCCGGTGTGGCAACATTCCTAGGTGATGTGAATATCTCTGGTGTTACTTCTGTAACCACACTGGAGGCAACTGACATTGATGCCTATCGGGTTACTACTCAGAGATTGATCGTACCTGATGATGGTTTCGTACAACTACCTGGTATCCCAGTTAGTGGTGGTTCCGCTGAGTTCTCAGAACTATTAATAACTGGTATATCTAGTTTCGTTGGAGTCGCCACCTTCAAGGATGATGTGTATATCGATGGTGACTTTATTGTTGGTGGATCTCAGGTTATTGATAATGTTGCTACTGAGAACATTATCATCAGTGGTATTGCTACAATAAGAACAGGTGAGATCACTGAACTAAATGTAGGAATTGCTACAGTTGGATTCCTCACAGCCACTGATGGATACATTGGAGTTCTAACAGCTCAGAACTACACTTCACTCTCTGATGAGAGACTCAAGTCTAACATTGAAACTATTGATGATGCTCTAGCGGGTGTTCTCAGACTCGATGGTGTAATGTTCCAGTGGAATAATACTGGCAAAACTGATATGGGTGTTATCGCCCAACAGGTGGAGGCGGTATTCCCCGAGATCGTACATGGGGATGATACAAAGGGAGTCAATTATAACGGTCTTATTGGTGTACTGATCGAAGCAGTCAAGGAACTCAAAGTAGAAAACGATAGTCTCAGAGAGAGACTAGACAGACTGGAGTGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
73319240de73ebdd731cf264ecc4caa31c66cf578bf6883a205473815a6a24f4
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5097
Evidence 0,5097
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank