Protein

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Genbank accession
WAX22228.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MASDTYDLDWDDDPFGGDIDFDMDFDMDPYAKKGFVGGMASGFLSGIVDETVGSGEARMRSLRTILPKSFSTALDRVSWAGRRFDELKTEFKEENASSVKSLQSIAGHLSKKMGERMPSSITNELENFSQKDFSSWEKLGSYETGGLSIEETSEYDVTAALDRSLEAQEGMFSALGETLNTMSAHVGGMITASISSGNRQLVNIESGMRDLVNYQRNVQLRMDQAKLSLLAKTYVSNVKYYKFMEKGIHTEIAELKKIQKASMMSDYQKTSNFTASKEFMRNKLFNTVGKRVGGLTGLIKDKFGKSARQEGYQGGNFALEQIADMLDMSDGMPMSKGMIGDLIGKQLGGMFVSNIPYFFERGKGKDWINKLAAKNPKEAKQFQEMFGKLTNFGNKASYASTSGVGLINYLAEDYEAMDEMQYLDYQDYLDQLPPGKKPIPKAIWVAKNTASNKAKASVNSFMSEITKSRGTQYTLNKRNVKDLNNPGIWKETNNITLNEVIPGLISRTNQILENIRTGSNDAEAVSYNYMRGQFQTDSEKRISVKADLMPYGDFSRYAQAALEMVDGLDPERTLSPGARKALAQQIAKDVDQEKGFNPFYYLGDIPNVSGSHQKEIHAVMKRHFGLNDQDVSEFKSAKGFDKLKRMTDMRSNEGNERLNVASATAANMKDLFPNVAERIDMLRSTGNEQLLRDLGVIYTEAGVEKVNMNIFHERLGQFMENPNNPQLKGMFDNTSKKPVSDGKGGFIVPKSPTGSSSTNNTFNELNSSISDLSAQLGRLIDNTSKVDTERSSGPQAYFDTHTGEVVSNIDKIATSTSNMDLLFTELLSIVKDGKLFSKQAKSQTEERQADRYNFDVVNRLKKILPTNILGKGFEMVMQNQPLILGSILGGVSSHFIQNPILAAAAGAGGIALGALVQHWGKTDYAEGVGDEPSDDEDILDENGNKILTSAKLKAGDYYDAVKRRVIKTWRDIKGPLFDAGNKVTITIKELGGKIFGADGRAVVLSGITKIKDAAVGAYNFIDPLTRIKSVMEMGKNLIYQQDVFVKGEKTPRLRAIKFKEGEYSIEDSTGSIKPIWGWNEINGPVYDSEGNEVISQAEFDQGLITATGQKVRAVGSAASGLAGTAAGLARSGLDNILGKFGYNRPQGDTEGSGIGKSGQSSNRGVERRLDRIYAILSQKFGIDIPDNFDGESDPIGSPIAKGLRLNSLEDKIRQAKAEKQEKVQDSIIDIAEGMKEPKEGEKTEKQGIFGKLFSLMGGMGDFAMRLIKNPIGTLGGLIMGSLANSGKRLASIGTMLFSGVLGVASPIFKLMKWGFTALTKATMAKTAGSGLGDALGGTGRGGMRGKIGGVLSKLGGRGKMLAALLGTGAVVGGGMYAADAFGSEAEPTDGDVYEDGKDDNGPKLTTMEKVVDTASDFFLPTLALKTAKEFLLPKAATDFIENKGVFWAPDGTFFTDRREAQAYIDGTGGVSAKEIPDSLQRRIRYAQYGIKSIDGNLAKRVSKLEQALIPHLAIANNRASFSQSAPVAQILQQFAKGGDSVPFDQVHTWFNARFKPVFLLYAVAVSIGRHGDINEFDRKESYEVTLLCERVRTSMGTLDPFPYEVQVQIDPREGILNRVMTENLVSSLLSELRKKYPTPEEEFKLETDVERRNRVLNEKTPDGLAGWFSNSYGDRANKLAQEEVDRKFQTPQAVREIDISDLHKDANTAIDAFTMVRLGVYGNIDNMPWRVDAVLRLERYCEDLINTLGTEAVFSGNPTRVFNLFKAQFRIETTNGETNWHLWFQNRFLPVLQQYVKEMKRLRNQLPKQGWRSLSDTNKAKLARFLSETRVIYQQEEVSVWDVKVSPFENSNSGSWPDRVEKYLKSLDAKATKARLKEPELEDERSLTYDEKLSGSKVNYSQVQANTNALFDKVYGKNRNVSAGNVGIYGGGTGNSFTADGRNNNGLGYGTNYNLQGGNVNLGWSDTFNPEFQKLAGDDKGIKMDPAQGEQLLLNHLLKAGVTDKKMLALALAMAKKETGNYSATVENTNWSAPTLKKYFRNIPDMATAEKVAALSPAERAMYVYGRAPKGPTLGNTKPEDGWLYRGRGLFQLTGKANYEKFKQETGIDVVSNPRIVSEDPNVMAESAVRFLLNSKAMRSIAQTGDFETAMRGINGGNPVPGSDERRQYYQEYLDRLNRGDISVPDTGEQGAVQISNEQAQLPSVPDSNVPPDHIDGNKAVNPDAKKDINSLMNAADTSKVSNKPVSPTSTPTASPASKPKAPTPPPSIAAPQQPANTATNTPAVNPSSVMKTPTKEVPVELKLPDGPLAVNDEANTAAMARLITSVDTLNEGINRLAKQQSGVRMN
Physico‐chemical
properties
protein length:2347 AA
molecular weight: 257426,63610 Da
isoelectric point:6,88311
aromaticity:0,07840
hydropathy:-0,49118

Domains

Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–2240
DC_0124
Coil
Unmapped
1205–1225
Coil G3DSA:1.10.530.10
IPR023346
STR
2000–2178
IPR023346
WAX22228.1
1 2347
Architecture
STR
STR 1-2240 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Aeromonas phage AVP1
[NCBI] 		3003735 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Aeromonas veronii
[NCBI] 		654 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Aeromonadales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WAX22228.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP889247.1 [NCBI]
CDS location
range 105003 -> 112046
strand -
CDS
ATGGCAAGTGATACTTATGATCTAGACTGGGATGATGATCCTTTTGGTGGAGATATCGACTTTGATATGGATTTCGATATGGATCCATATGCAAAGAAAGGGTTTGTCGGAGGTATGGCCTCTGGATTCCTTTCTGGGATTGTCGATGAAACAGTTGGAAGTGGCGAAGCAAGAATGCGTTCACTTCGAACTATTCTCCCTAAATCATTCTCCACAGCGTTAGATCGGGTCAGCTGGGCTGGCCGTAGATTTGACGAATTAAAAACAGAATTTAAGGAAGAAAATGCTTCTTCTGTTAAATCGTTACAAAGCATTGCGGGTCATCTGTCAAAGAAAATGGGCGAAAGAATGCCCAGTTCAATTACAAATGAACTCGAGAATTTCTCTCAGAAAGACTTTTCTAGTTGGGAGAAATTAGGTAGTTATGAAACCGGTGGTTTGTCTATTGAAGAGACAAGTGAGTATGACGTCACTGCTGCTTTAGATCGTTCCCTAGAAGCTCAAGAAGGGATGTTCTCGGCATTAGGTGAAACACTCAATACCATGTCCGCTCATGTTGGCGGAATGATCACTGCGAGTATCTCATCTGGTAATAGACAGCTTGTTAATATCGAATCTGGAATGCGTGATTTGGTTAACTACCAACGCAACGTCCAACTTCGAATGGATCAGGCTAAACTTTCTTTATTAGCTAAGACTTACGTTTCTAACGTTAAGTACTATAAGTTCATGGAGAAAGGAATTCATACTGAAATTGCTGAATTGAAGAAGATTCAAAAAGCCAGTATGATGAGTGATTACCAAAAGACTTCTAACTTTACTGCTTCTAAAGAGTTTATGAGAAATAAGCTTTTTAACACAGTAGGTAAACGAGTAGGTGGTCTGACTGGTTTAATTAAAGACAAGTTTGGTAAATCAGCTAGACAGGAAGGTTATCAGGGTGGTAACTTTGCTTTAGAACAAATTGCCGACATGTTGGATATGTCAGATGGAATGCCGATGTCCAAAGGGATGATTGGTGATCTAATTGGCAAACAACTCGGTGGTATGTTTGTTTCTAATATTCCTTACTTCTTTGAACGTGGTAAAGGTAAAGATTGGATTAATAAGTTAGCAGCTAAAAATCCCAAAGAAGCTAAACAGTTCCAAGAGATGTTTGGTAAACTGACTAACTTTGGTAATAAAGCTTCTTACGCTTCTACTTCTGGTGTTGGGTTAATTAACTACCTTGCTGAAGATTACGAAGCTATGGATGAGATGCAGTATCTTGATTATCAAGATTACTTAGATCAACTTCCTCCAGGTAAGAAGCCGATTCCAAAGGCTATTTGGGTTGCTAAGAACACGGCCAGCAACAAAGCTAAAGCCTCTGTTAACAGTTTCATGTCTGAGATTACTAAATCTCGTGGGACTCAATATACGCTCAATAAGCGCAATGTGAAAGATCTCAATAACCCAGGTATCTGGAAAGAGACCAATAACATTACCCTTAATGAAGTTATCCCTGGACTCATATCTAGAACCAACCAGATTCTTGAAAATATCAGAACTGGAAGTAATGATGCAGAAGCTGTTAGTTATAACTATATGCGTGGTCAGTTCCAAACTGATTCAGAAAAACGCATTTCTGTTAAAGCCGATTTAATGCCTTACGGTGACTTTAGTCGTTATGCTCAAGCTGCTTTGGAAATGGTCGATGGATTAGATCCAGAACGTACTCTTAGTCCTGGTGCTAGGAAAGCTCTTGCACAGCAGATCGCTAAAGATGTTGATCAAGAGAAAGGGTTTAACCCATTCTATTATCTTGGTGATATCCCTAACGTATCTGGTTCTCATCAAAAAGAAATTCACGCTGTAATGAAACGTCACTTTGGTCTTAATGATCAAGATGTTTCTGAGTTTAAGTCCGCTAAGGGTTTTGATAAACTCAAACGCATGACTGACATGCGTAGTAATGAGGGTAACGAGCGTCTTAACGTAGCTTCCGCTACTGCTGCTAACATGAAGGATCTTTTCCCCAATGTAGCAGAACGCATCGATATGCTACGTTCTACCGGTAATGAACAACTCCTTAGAGATCTTGGTGTTATCTACACTGAAGCTGGGGTAGAGAAAGTTAACATGAACATTTTCCATGAAAGACTGGGACAGTTCATGGAGAACCCAAATAACCCGCAGCTAAAGGGGATGTTTGATAATACATCTAAGAAACCAGTAAGTGATGGCAAAGGCGGGTTTATAGTACCTAAGTCACCAACTGGATCTTCGTCAACTAACAATACGTTTAACGAACTAAACAGTTCTATAAGCGATTTGTCAGCACAGCTTGGTAGATTGATTGATAATACTTCCAAAGTTGATACAGAACGTTCCAGTGGACCTCAGGCTTATTTTGACACTCATACCGGTGAAGTTGTTTCAAACATCGATAAGATAGCTACTTCAACATCTAATATGGATCTTCTCTTTACTGAATTACTCAGTATTGTAAAAGATGGGAAACTCTTTAGTAAGCAAGCTAAGTCGCAAACTGAAGAACGTCAAGCCGATCGTTACAACTTTGATGTAGTAAATAGACTCAAGAAAATCCTTCCGACTAATATTCTCGGAAAAGGGTTTGAAATGGTTATGCAAAATCAACCATTGATCCTTGGTTCTATTTTAGGTGGTGTAAGTTCACACTTTATCCAAAATCCTATTCTTGCAGCGGCAGCTGGTGCGGGTGGTATTGCGCTAGGAGCTTTAGTTCAACATTGGGGTAAAACGGATTATGCAGAAGGTGTAGGTGACGAACCGTCTGATGATGAAGACATCCTCGATGAGAACGGAAACAAGATCTTAACTTCCGCTAAACTTAAAGCTGGCGATTATTACGATGCTGTAAAACGTCGTGTGATAAAAACTTGGCGTGATATCAAAGGTCCTTTGTTTGATGCTGGTAATAAAGTTACCATTACCATTAAAGAGTTGGGTGGTAAGATCTTTGGCGCTGACGGACGAGCTGTAGTTCTATCAGGAATTACCAAGATCAAAGATGCGGCAGTGGGAGCTTATAACTTCATTGATCCCTTAACACGCATTAAGTCGGTTATGGAAATGGGTAAGAACCTCATTTACCAACAAGACGTATTTGTAAAAGGTGAGAAGACACCTAGACTGAGAGCTATTAAGTTCAAAGAAGGTGAGTACTCCATTGAGGACAGTACTGGGTCTATTAAGCCTATTTGGGGATGGAATGAGATTAATGGCCCTGTCTACGACAGTGAAGGTAACGAAGTTATCTCCCAAGCAGAATTTGATCAAGGTCTTATTACTGCAACTGGTCAAAAAGTAAGAGCGGTGGGTAGTGCTGCTTCAGGATTAGCTGGAACAGCAGCAGGACTCGCTAGATCAGGTTTAGATAACATCCTAGGGAAGTTCGGTTACAATCGTCCACAAGGCGATACAGAAGGTTCTGGGATAGGTAAATCAGGACAAAGTAGTAACCGTGGTGTAGAACGTCGTTTAGATCGTATTTATGCCATACTCTCCCAGAAGTTTGGTATTGATATTCCTGATAACTTTGACGGAGAAAGTGATCCAATTGGTTCACCTATCGCTAAAGGGCTAAGACTGAACTCTTTAGAAGATAAGATCAGACAAGCTAAAGCAGAGAAGCAAGAGAAGGTTCAGGATTCCATCATCGATATTGCTGAAGGAATGAAAGAACCTAAAGAGGGAGAGAAAACCGAAAAGCAAGGTATCTTCGGTAAACTCTTTAGCTTAATGGGAGGTATGGGTGATTTTGCTATGCGTCTTATTAAGAACCCTATTGGAACCTTAGGTGGTTTAATCATGGGTTCTCTGGCTAACTCTGGAAAACGTTTAGCTTCTATTGGTACGATGTTGTTCTCAGGTGTGTTAGGAGTCGCTTCTCCCATCTTCAAATTAATGAAGTGGGGTTTCACCGCTCTAACTAAAGCTACTATGGCTAAAACAGCAGGAAGTGGTTTAGGTGACGCATTGGGTGGCACTGGTAGAGGAGGGATGAGAGGTAAGATCGGTGGAGTGCTTAGTAAGTTGGGTGGTCGAGGTAAGATGTTGGCTGCTTTGCTAGGCACTGGTGCTGTAGTAGGTGGCGGTATGTACGCGGCTGATGCTTTTGGTAGTGAAGCTGAACCCACTGATGGAGATGTGTATGAAGATGGTAAAGATGACAATGGTCCAAAGTTAACTACTATGGAGAAAGTTGTTGATACAGCTTCTGATTTCTTCTTACCTACACTTGCCTTGAAAACCGCTAAGGAATTCCTGTTACCAAAAGCTGCTACTGATTTTATCGAGAACAAGGGTGTATTCTGGGCTCCTGATGGAACCTTCTTTACTGACCGTCGTGAAGCACAAGCTTACATTGATGGGACTGGTGGAGTTAGTGCTAAAGAGATTCCCGATTCACTGCAACGTCGTATTCGTTATGCTCAGTACGGCATTAAGAGTATTGACGGTAATTTGGCTAAACGTGTTTCTAAGCTGGAACAAGCGTTAATTCCTCATTTGGCTATCGCTAATAACAGAGCAAGTTTCTCTCAAAGTGCTCCTGTTGCTCAGATTCTACAACAGTTTGCTAAAGGTGGAGATAGTGTTCCGTTTGATCAAGTTCACACTTGGTTTAATGCTCGCTTCAAACCTGTGTTTTTGCTATACGCTGTAGCAGTATCTATCGGTAGACACGGTGACATCAACGAGTTTGATCGTAAAGAGAGTTATGAAGTTACACTACTCTGTGAACGTGTGAGAACTTCTATGGGTACTTTGGATCCATTCCCTTATGAAGTACAAGTACAGATAGATCCGAGGGAAGGTATACTTAATCGAGTGATGACTGAGAACTTGGTTAGTTCTTTACTGTCAGAACTTCGTAAGAAATACCCTACTCCTGAAGAAGAGTTCAAACTAGAAACAGATGTAGAACGTCGTAACCGAGTATTAAACGAAAAGACACCAGATGGACTGGCGGGGTG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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6f54512f3eb8c4b35b94a79f517fca3f7f2f6f0b02c06891d5e80fa2ee063611
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5067
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Aeromonas veronii bacteriophage AVP1 Rai,S., Kaur,B., Nagar,V. and Tyagi,A. 2022-05 — GenBank