Protein

Genbank accession
QYC50995.1 [GenBank]
Protein name
glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MTDRPRTQASLGSQWQRVNSDNLKFDNLILAKVIKVYYQYQTVELQSLSGKMRIAQGLGTSGKFSAPYPKEFTGMTPENNPYGHIPVIVPGTLVLVAFVDGNPSNPIIVNSYGYNDLNTKLVRTPMISGDMRDNEQFKFNSSSYTLKPSLTYEYFDGEGNVVKTWNGKSLLSVTSDHNEQESSTDFMYGTLYDDLFTSRYADNSLIEPRIQRAPNMLFKHQGEFDMYGEPDNHITMFYLSSDGTFRRSTLNKEEQFRTTVEQDNKGNYRVQYQADSVIIDEGQDYVEFGIDTEKQEFYVKNLDHSFRFNDDGILVDGKPLLANIDDGINDAFEKLDKLEKSMERINDIIQDLGDRNLRELINATNKAISDVSDLTNALATTNKNVSDNKTKIDNSIIKYDKFMQDIGDYQITNNEIVNSHTTSINKINNTELPSIKLDISNIKNKVKTQYVIGDDSPTSNFTTRFQNILNEIRDNGGGTLYVLPGNYEIKSRIKIYDNTTIIMTNQTKLLRCHNGGFFDNGDPYNNVGGYDGVSNITIIGGILDNNYENIDKYPTKQINMIALRHAKNITIKDLTFRNGITVHCVDMNGSKDVLFDGCRFEGYVNLNNASDKEALQISEYVTGGIDGGIFDGTPCKNITIKNCTFSSSDILGGYNVCIGNHISANNVFNSNIKIYNNTFKDCNIAIRDWKWNDLDIHGNTFINNKECLRASSIGSSYDSAKNIDGTPSNQSQATRNLIFNENKIYNFTSVAIGIYGIQDNDTALIENVKVRDNYIKGSGQGIISSLVKDIVIEGNDIEDTYRAIKYSATKNIRVLNNTISNSKTEAIYGDVSNYGEVHSINYNSIIKHNIIDNTQKNGVFISTGDIINITDNVITNSNMINEENNKRGSIKVDYSDKCIINNNSLYGQTERFAIQATTSTNVISNNNNTNIQE
Physico‐chemical
properties
protein length:933 AA
molecular weight: 104819,24970 Da
isoelectric point:5,11371
aromaticity:0,09003
hydropathy:-0,54866

Domains

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Mammaliicoccus phage vB_MscM-PMS3
[NCBI]
2861056 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QYC50995.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ573780 [NCBI]
CDS location
range 68407 -> 71208
strand +
CDS
ATGACAGATAGACCAAGAACACAGGCAAGTTTAGGTTCTCAATGGCAACGAGTAAATTCAGATAATTTAAAATTTGATAACTTAATATTGGCTAAAGTCATAAAAGTTTACTACCAATACCAAACGGTAGAGTTACAATCCCTAAGTGGTAAAATGAGAATAGCACAAGGATTAGGTACAAGTGGTAAGTTCTCTGCACCATACCCTAAAGAATTTACGGGAATGACACCGGAAAATAATCCTTACGGACATATACCGGTTATCGTACCCGGAACATTAGTATTAGTTGCTTTTGTTGACGGTAATCCTAGTAATCCTATTATTGTCAATAGTTATGGATATAATGACTTAAACACTAAACTAGTAAGAACACCTATGATTAGTGGGGATATGAGAGACAATGAGCAATTTAAATTTAACAGTTCATCTTACACATTAAAACCAAGTCTTACATATGAATACTTTGACGGTGAGGGTAATGTAGTTAAGACATGGAATGGTAAGTCTCTGCTATCGGTAACTAGCGACCACAACGAGCAAGAAAGCTCTACCGACTTTATGTATGGAACTCTTTATGACGACCTATTTACGAGCCGTTACGCCGATAACTCACTAATAGAGCCGAGGATACAAAGGGCACCTAACATGTTATTTAAACACCAAGGTGAATTTGACATGTATGGTGAGCCGGATAATCATATTACAATGTTTTATTTGAGTTCCGATGGTACATTTAGACGTTCTACATTAAATAAAGAAGAACAATTTAGAACAACGGTAGAGCAAGATAATAAAGGTAACTATAGAGTACAATATCAAGCAGATAGTGTTATTATAGATGAGGGTCAAGATTACGTAGAGTTTGGTATAGATACGGAAAAACAAGAGTTCTATGTTAAAAACTTAGACCACTCATTTAGATTTAATGATGATGGTATATTGGTAGACGGTAAACCTTTATTAGCTAATATTGATGACGGTATTAATGATGCATTTGAGAAACTAGATAAGCTAGAAAAATCTATGGAAAGAATAAATGACATTATCCAAGATTTAGGAGATAGAAATTTAAGGGAACTTATTAATGCAACAAATAAAGCTATTAGTGATGTTAGTGACTTAACTAATGCCTTAGCTACAACTAATAAAAATGTTTCCGATAATAAAACTAAAATAGATAATTCCATAATCAAGTATGATAAGTTCATGCAAGATATAGGTGATTACCAAATTACTAATAATGAGATTGTTAATAGTCATACTACTAGTATAAATAAGATAAATAATACGGAATTACCTAGTATAAAATTAGATATAAGTAATATAAAAAATAAAGTTAAAACCCAATATGTAATAGGTGACGATAGTCCTACTAGTAATTTCACAACAAGATTTCAAAATATATTGAATGAAATTAGAGATAATGGTGGGGGTACGCTATATGTGTTACCGGGAAATTATGAAATTAAAAGTAGAATTAAGATATATGATAACACTACAATAATAATGACTAACCAAACAAAGCTATTAAGATGTCATAATGGTGGTTTCTTTGATAATGGAGACCCATATAACAATGTAGGTGGTTATGATGGTGTGTCTAACATTACTATTATAGGTGGCATATTAGATAATAATTATGAAAATATAGACAAATATCCTACTAAACAAATAAATATGATAGCTCTAAGACATGCTAAAAATATAACAATTAAAGACTTGACATTCAGAAATGGTATAACGGTTCATTGTGTAGATATGAATGGTAGTAAAGATGTTCTATTTGATGGGTGTAGGTTTGAGGGTTATGTTAATCTTAATAATGCATCAGATAAAGAGGCTCTACAAATATCTGAATATGTTACAGGTGGTATAGATGGTGGAATATTTGATGGTACACCATGTAAGAATATAACTATTAAGAATTGTACATTTAGTAGTTCTGATATTTTAGGTGGATATAATGTATGTATAGGTAATCACATATCAGCTAATAATGTGTTTAATAGTAACATTAAAATATACAATAATACTTTTAAGGATTGTAATATCGCTATACGAGATTGGAAGTGGAATGACTTAGATATTCATGGTAATACTTTTATTAACAACAAAGAATGTCTAAGAGCATCGTCTATAGGTAGTAGTTATGATAGTGCTAAAAATATAGACGGAACACCAAGTAACCAATCTCAAGCTACTAGAAATTTGATATTTAATGAAAACAAAATATATAATTTTACTAGTGTAGCTATAGGTATCTATGGCATACAGGATAATGATACAGCTCTTATAGAGAATGTTAAGGTAAGAGATAATTATATTAAAGGTTCAGGACAAGGTATTATAAGTAGTTTAGTTAAAGATATAGTTATAGAAGGTAATGACATAGAGGATACTTATAGAGCTATTAAATACAGTGCAACTAAGAATATTAGAGTACTAAATAATACAATAAGTAATTCTAAGACTGAAGCTATATATGGAGATGTATCAAATTATGGAGAAGTACACTCTATAAACTATAATTCTATTATAAAACATAATATTATAGATAATACACAAAAAAATGGTGTATTTATTTCTACAGGAGATATTATTAATATTACAGATAATGTAATAACTAACTCTAATATGATTAATGAGGAAAACAATAAGAGGGGTAGTATTAAAGTAGACTATAGTGATAAGTGCATTATAAATAATAACTCTCTATATGGTCAAACAGAAAGATTTGCTATACAAGCAACAACAAGCACTAATGTAATCTCAAATAATAATAATACAAATATACAAGAGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
494ba4cfe3da264aff429ceefd9c6dd48e7e36010b1e076bf5e1db033bfddc7f
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7057
Evidence 0,7057

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Mammalicoccus virus vB_MscM-PMS3 infecting Mammalicoccus sciuri Kwon,H., Park,S.Y. and Kim,J.H. 2023-12-11 GenBank