Protein
- Genbank accession
- QYC50995.1 [GenBank]
- Protein name
- glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MTDRPRTQASLGSQWQRVNSDNLKFDNLILAKVIKVYYQYQTVELQSLSGKMRIAQGLGTSGKFSAPYPKEFTGMTPENNPYGHIPVIVPGTLVLVAFVDGNPSNPIIVNSYGYNDLNTKLVRTPMISGDMRDNEQFKFNSSSYTLKPSLTYEYFDGEGNVVKTWNGKSLLSVTSDHNEQESSTDFMYGTLYDDLFTSRYADNSLIEPRIQRAPNMLFKHQGEFDMYGEPDNHITMFYLSSDGTFRRSTLNKEEQFRTTVEQDNKGNYRVQYQADSVIIDEGQDYVEFGIDTEKQEFYVKNLDHSFRFNDDGILVDGKPLLANIDDGINDAFEKLDKLEKSMERINDIIQDLGDRNLRELINATNKAISDVSDLTNALATTNKNVSDNKTKIDNSIIKYDKFMQDIGDYQITNNEIVNSHTTSINKINNTELPSIKLDISNIKNKVKTQYVIGDDSPTSNFTTRFQNILNEIRDNGGGTLYVLPGNYEIKSRIKIYDNTTIIMTNQTKLLRCHNGGFFDNGDPYNNVGGYDGVSNITIIGGILDNNYENIDKYPTKQINMIALRHAKNITIKDLTFRNGITVHCVDMNGSKDVLFDGCRFEGYVNLNNASDKEALQISEYVTGGIDGGIFDGTPCKNITIKNCTFSSSDILGGYNVCIGNHISANNVFNSNIKIYNNTFKDCNIAIRDWKWNDLDIHGNTFINNKECLRASSIGSSYDSAKNIDGTPSNQSQATRNLIFNENKIYNFTSVAIGIYGIQDNDTALIENVKVRDNYIKGSGQGIISSLVKDIVIEGNDIEDTYRAIKYSATKNIRVLNNTISNSKTEAIYGDVSNYGEVHSINYNSIIKHNIIDNTQKNGVFISTGDIINITDNVITNSNMINEENNKRGSIKVDYSDKCIINNNSLYGQTERFAIQATTSTNVISNNNNTNIQE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 933 AA molecular weight: 104819,24970 Da isoelectric point: 5,11371 aromaticity: 0,09003 hydropathy: -0,54866
Domains
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Mammaliicoccus phage vB_MscM-PMS3 [NCBI] |
2861056 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QYC50995.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ573780
[NCBI]
CDS location
range 68407 -> 71208
strand +
strand +
CDS
ATGACAGATAGACCAAGAACACAGGCAAGTTTAGGTTCTCAATGGCAACGAGTAAATTCAGATAATTTAAAATTTGATAACTTAATATTGGCTAAAGTCATAAAAGTTTACTACCAATACCAAACGGTAGAGTTACAATCCCTAAGTGGTAAAATGAGAATAGCACAAGGATTAGGTACAAGTGGTAAGTTCTCTGCACCATACCCTAAAGAATTTACGGGAATGACACCGGAAAATAATCCTTACGGACATATACCGGTTATCGTACCCGGAACATTAGTATTAGTTGCTTTTGTTGACGGTAATCCTAGTAATCCTATTATTGTCAATAGTTATGGATATAATGACTTAAACACTAAACTAGTAAGAACACCTATGATTAGTGGGGATATGAGAGACAATGAGCAATTTAAATTTAACAGTTCATCTTACACATTAAAACCAAGTCTTACATATGAATACTTTGACGGTGAGGGTAATGTAGTTAAGACATGGAATGGTAAGTCTCTGCTATCGGTAACTAGCGACCACAACGAGCAAGAAAGCTCTACCGACTTTATGTATGGAACTCTTTATGACGACCTATTTACGAGCCGTTACGCCGATAACTCACTAATAGAGCCGAGGATACAAAGGGCACCTAACATGTTATTTAAACACCAAGGTGAATTTGACATGTATGGTGAGCCGGATAATCATATTACAATGTTTTATTTGAGTTCCGATGGTACATTTAGACGTTCTACATTAAATAAAGAAGAACAATTTAGAACAACGGTAGAGCAAGATAATAAAGGTAACTATAGAGTACAATATCAAGCAGATAGTGTTATTATAGATGAGGGTCAAGATTACGTAGAGTTTGGTATAGATACGGAAAAACAAGAGTTCTATGTTAAAAACTTAGACCACTCATTTAGATTTAATGATGATGGTATATTGGTAGACGGTAAACCTTTATTAGCTAATATTGATGACGGTATTAATGATGCATTTGAGAAACTAGATAAGCTAGAAAAATCTATGGAAAGAATAAATGACATTATCCAAGATTTAGGAGATAGAAATTTAAGGGAACTTATTAATGCAACAAATAAAGCTATTAGTGATGTTAGTGACTTAACTAATGCCTTAGCTACAACTAATAAAAATGTTTCCGATAATAAAACTAAAATAGATAATTCCATAATCAAGTATGATAAGTTCATGCAAGATATAGGTGATTACCAAATTACTAATAATGAGATTGTTAATAGTCATACTACTAGTATAAATAAGATAAATAATACGGAATTACCTAGTATAAAATTAGATATAAGTAATATAAAAAATAAAGTTAAAACCCAATATGTAATAGGTGACGATAGTCCTACTAGTAATTTCACAACAAGATTTCAAAATATATTGAATGAAATTAGAGATAATGGTGGGGGTACGCTATATGTGTTACCGGGAAATTATGAAATTAAAAGTAGAATTAAGATATATGATAACACTACAATAATAATGACTAACCAAACAAAGCTATTAAGATGTCATAATGGTGGTTTCTTTGATAATGGAGACCCATATAACAATGTAGGTGGTTATGATGGTGTGTCTAACATTACTATTATAGGTGGCATATTAGATAATAATTATGAAAATATAGACAAATATCCTACTAAACAAATAAATATGATAGCTCTAAGACATGCTAAAAATATAACAATTAAAGACTTGACATTCAGAAATGGTATAACGGTTCATTGTGTAGATATGAATGGTAGTAAAGATGTTCTATTTGATGGGTGTAGGTTTGAGGGTTATGTTAATCTTAATAATGCATCAGATAAAGAGGCTCTACAAATATCTGAATATGTTACAGGTGGTATAGATGGTGGAATATTTGATGGTACACCATGTAAGAATATAACTATTAAGAATTGTACATTTAGTAGTTCTGATATTTTAGGTGGATATAATGTATGTATAGGTAATCACATATCAGCTAATAATGTGTTTAATAGTAACATTAAAATATACAATAATACTTTTAAGGATTGTAATATCGCTATACGAGATTGGAAGTGGAATGACTTAGATATTCATGGTAATACTTTTATTAACAACAAAGAATGTCTAAGAGCATCGTCTATAGGTAGTAGTTATGATAGTGCTAAAAATATAGACGGAACACCAAGTAACCAATCTCAAGCTACTAGAAATTTGATATTTAATGAAAACAAAATATATAATTTTACTAGTGTAGCTATAGGTATCTATGGCATACAGGATAATGATACAGCTCTTATAGAGAATGTTAAGGTAAGAGATAATTATATTAAAGGTTCAGGACAAGGTATTATAAGTAGTTTAGTTAAAGATATAGTTATAGAAGGTAATGACATAGAGGATACTTATAGAGCTATTAAATACAGTGCAACTAAGAATATTAGAGTACTAAATAATACAATAAGTAATTCTAAGACTGAAGCTATATATGGAGATGTATCAAATTATGGAGAAGTACACTCTATAAACTATAATTCTATTATAAAACATAATATTATAGATAATACACAAAAAAATGGTGTATTTATTTCTACAGGAGATATTATTAATATTACAGATAATGTAATAACTAACTCTAATATGATTAATGAGGAAAACAATAAGAGGGGTAGTATTAAAGTAGACTATAGTGATAAGTGCATTATAAATAATAACTCTCTATATGGTCAAACAGAAAGATTTGCTATACAAGCAACAACAAGCACTAATGTAATCTCAAATAATAATAATACAAATATACAAGAGTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
494ba4cfe3da264aff429ceefd9c6dd48e7e36010b1e076bf5e1db033bfddc7f
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genome sequence of Mammalicoccus virus vB_MscM-PMS3 infecting Mammalicoccus sciuri | Kwon,H., Park,S.Y. and Kim,J.H. | 2023-12-11 | — | GenBank |