Protein

Genbank accession
AGO49696.1 [GenBank]
Protein name
pectate lyase
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MKKTIYILSILLLTISGVSAQTVIKIKQPNPQQITIADDSIKLNGSTSVPLSDIIKPITLAEYNAMDAATKLKNAGRQIIDPTGVPTAISIVDGSVSTAKIANSAVSGIKILDEAITESKIADASITDAKINADTYNKLYYAVPDGYISPRDYGAVLDGVTDDRAAFVATLAAANTLGKRIRIDADKMFLDVEETGTKSIFIPDNTWIEGSNKDVQIVVNNILSPAFYLALVDNVTIKDITFTYDQTYDPTYGEDATNFAADFTINQQQVRDYLRDNKAIDFSGVFPVDNGFVSYYYMFLLEAAENVTFDNVTFKSKGETADTFITGVIKMKEQYQPSQTVSNTSAPRTQCKNISLSNIVIDGALMGIQGLVDGFTVNNLKSYRYSDMQDASGNYLGGFDGVDYDFPPPHLFYLNNSSSSTFNTKNVNINDVYDYGKYVGTASVRGTSGINIGYCNSLKLVETQDNVHVSNYKSFRRDGMADIGILSNSSFSNMYSESTTDIFSSTSSYPALRFLGNLTNVVFDNIIIKDNSTTSAIYPIDYGEGNFVTWNNVHVFVKTLNTIDVGTFGIWGSNNKITNSSFNIENHTSTQTLRGIVLNNSTTRDSGANNYYDVTLNGWRDISSDPLNRKSRMLFATAVNTNNNYARVHDTRNNFVIEQVNEIETDTWTRTETVSLGSGTQQALTMTIPSGFAVKKATAIVTSALDAGVTASIGTVSGVATNLIASISNTANSINSNDLNEISNGSLRQIFIRTSTGTFASTGTVKVTLVLTRTSLN
Physico‐chemical
properties
protein length:777 AA
molecular weight: 84546,32630 Da
isoelectric point:4,89761
aromaticity:0,09138
hydropathy:-0,15624

Domains

Domains [InterPro]
IPR012334
137–396
IPR012334
IPR011050
158–384
IPR011050
AGO49696.1
1 777
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cellulophaga phage phi13:2
[NCBI] 		1328030 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Cellulophaga baltica
[NCBI] 		76594 Bacteria > Bacteroidetes > Flavobacteriia > Flavobacteriales > Flavobacteriaceae > Cellulophaga
Host Cellulophaga baltica 13
[NCBI] 		1348583 Bacteria > Bacteroidetes > Flavobacteriia > Flavobacteriales > Flavobacteriaceae > Cellulophaga

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGO49696.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC821633 [NCBI]
CDS location
range 33529 -> 35862
strand +
CDS
ATGAAAAAAACAATTTACATATTATCGATTTTATTGCTCACTATTTCAGGAGTAAGCGCACAGACTGTTATTAAAATAAAACAGCCTAATCCGCAACAGATAACAATAGCAGACGATTCAATAAAACTGAATGGTTCAACTTCTGTTCCTTTGTCTGATATAATTAAGCCTATCACATTAGCGGAGTACAACGCAATGGATGCGGCTACTAAATTAAAGAATGCAGGACGTCAAATTATAGACCCTACAGGAGTTCCTACAGCTATAAGTATTGTTGATGGTAGTGTTAGTACTGCTAAGATTGCAAATAGCGCTGTGAGTGGAATTAAAATACTTGATGAAGCGATAACAGAAAGTAAAATAGCTGATGCAAGTATAACGGATGCAAAAATAAACGCTGATACATATAATAAATTATATTATGCTGTTCCTGATGGATACATTTCGCCAAGAGATTACGGAGCAGTTTTAGATGGAGTAACCGATGACCGTGCGGCTTTTGTTGCTACATTAGCGGCTGCTAATACTTTAGGTAAGAGAATTAGGATTGATGCTGATAAAATGTTTTTAGATGTTGAAGAAACTGGAACTAAATCGATATTCATACCAGATAACACATGGATAGAAGGTAGCAATAAGGATGTTCAAATCGTAGTTAACAACATATTAAGTCCTGCTTTTTACTTGGCTCTAGTTGATAATGTAACTATAAAAGATATCACTTTCACTTATGACCAAACATATGATCCTACATATGGAGAAGACGCAACTAATTTTGCGGCAGACTTTACTATTAATCAGCAACAAGTAAGAGACTACTTAAGAGATAATAAAGCGATTGATTTTTCAGGTGTTTTTCCTGTAGATAACGGCTTTGTTAGTTACTATTATATGTTTTTATTAGAGGCTGCCGAAAACGTAACTTTTGATAATGTAACATTTAAGTCTAAAGGTGAAACGGCTGATACTTTCATTACCGGAGTTATAAAAATGAAAGAACAATACCAACCAAGTCAAACAGTTTCAAATACTTCGGCTCCAAGAACTCAATGTAAAAACATATCATTAAGCAATATAGTTATAGATGGTGCTTTAATGGGAATACAAGGATTAGTTGATGGTTTTACTGTTAACAATCTAAAATCATATCGTTATTCAGATATGCAAGATGCAAGCGGCAACTATCTAGGTGGTTTTGATGGTGTTGATTATGATTTTCCTCCACCTCATTTATTCTATTTAAACAATAGCTCATCATCTACATTCAACACAAAAAACGTTAACATAAATGATGTTTACGATTATGGTAAGTATGTAGGAACAGCAAGTGTGAGAGGAACAAGCGGTATCAATATAGGATATTGTAATTCTCTTAAATTAGTTGAGACACAAGATAACGTTCATGTTAGCAATTATAAATCTTTTCGCAGGGATGGAATGGCGGATATAGGAATACTTTCTAATAGCTCTTTTTCTAATATGTATTCAGAGTCTACTACGGATATTTTTAGTTCAACATCTAGTTATCCTGCTTTAAGGTTTTTAGGGAACTTAACAAATGTTGTTTTTGATAATATCATAATAAAAGACAACTCAACTACATCGGCAATATACCCAATAGATTACGGTGAGGGTAATTTCGTCACATGGAACAATGTACATGTATTTGTAAAGACACTTAACACTATAGACGTAGGTACTTTTGGAATTTGGGGTTCAAATAACAAGATAACAAACTCTAGCTTTAATATAGAAAATCATACGTCTACACAAACTTTAAGAGGTATAGTTTTAAATAATTCAACAACTAGAGACTCTGGAGCAAACAATTACTACGATGTAACATTAAACGGTTGGAGAGATATATCTAGTGATCCTTTAAATAGGAAATCAAGAATGCTTTTTGCTACGGCTGTTAATACAAATAACAACTATGCTAGAGTTCATGACACTAGAAATAATTTTGTAATTGAGCAAGTAAACGAGATAGAAACAGATACATGGACTAGAACAGAAACAGTATCACTAGGTAGCGGAACACAGCAAGCGTTGACAATGACAATACCTAGTGGATTTGCCGTAAAAAAAGCAACTGCAATAGTGACAAGTGCTTTAGATGCAGGTGTTACAGCTTCAATAGGAACAGTTTCGGGTGTTGCGACTAACTTAATAGCGTCAATATCTAACACAGCGAACTCAATAAACTCTAATGATTTAAACGAGATTTCTAATGGTAGTTTGAGGCAGATATTTATAAGAACAAGTACAGGAACTTTCGCAAGTACAGGAACGGTTAAGGTGACTTTAGTATTAACACGTACATCATTAAATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
f6f78477b125090441ddd90b53e8e1269d87dc40904fe10e20ea5c636e61c1cb
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6995
Evidence 0,6995
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Literature

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