Protein

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Genbank accession
QMV33882.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,62
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,63
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVGFFIEENTIQQYDATRGYKKNFAVINDNRIWVAQRDIPAPAGAFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLSSGEFIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGNTGYNEIKVQSSNVPGQGNQKIVRFGNQYSEVLITKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRVEPSTGRFHAQAGDFIMRRYTTGAPITFILPKYANQGDIVKSVDIDGMGPTFHLMVETFDTSSSLDKAGQHQMEFRTTGDGFFVYDAAEKLWHVWDGDFKTRLRVIRDSVKLLPNESVIVFGEDNSTPATINIDLPTNVLQGDIVKIALNYLRKSQTVNIRAAVGDKIATDIKLLQFPKRSEYPPDTTWVMVDSLTFNGNISYTPVIELSYAEDAVSGTSYWVVAQNVPTVERVDSLNDSTRTRLGVIALANQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVAKENQRGIARIATTAQVNQNSDFAFVDDVIISPKKLNERTATETRRGLAELATQQETNAGVDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYVSTTGATPAASRELNGTNVYNKNTVNLVVSPKALDQYKATYTQQGAVILAVESEVIAGTSQSGWANAVVTPEMLQRKTALDSRIGLIEIATQVETDAGTDYTRAVTPKTLNDRKASETLTGIAEIATQSEFDTGTDDTRISTPLKIKTRFNNTARTSVNALSGLVETGTLWDHYSLNILEANETQRGTARLATQGEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATENAEGIVRIATNAEATAGTSKVLAISPSALKYIAQTETTWESSETLRGFVRLSSGTATSAATTTTGAGFTYANGVYTPDPSKLVSYSKSGYAVSPYELNRVLQNFLPINAMAVNAEKLDNLDSTQFIRRDIAQTVEGVLTLTKQTNISAPVVSTSTAVFTDVTAGTSTFGTVNVVNGTNKWKITAPSAGTTMTIGDTTNVLTLNTASGNAAVLNNLSAGNDVQAKNNYVLNGRTIATTTGEASGATLALGDNSQNLVLKTLDAGNIIANGGGAFKVLTEKNAVEIVDRNFVNQAGDTMSGVLRVNAPVRVFGTKPSLIAQAPTADTVGFWSVDINDEPTYSQFPGYWTMKLKRQVNIDTVQTKPAGVTDEVWNASGWLTENGTFASPVIRYRNDDGTLGDEVLGSSGQKLRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKSAWTTFAMVYTADNPPSAEDVGALPADNTTMGNLTILDWLRIGNVRIIPDPTTKSVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1318 AA
molecular weight: 143049,16930 Da
isoelectric point:5,22944
aromaticity:0,07891
hydropathy:-0,29476

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–209
DC_1946 DC_1209
IPR048391
ATT
1112–1145
IPR048391 IPR048391
QMV33882.1
1 1318
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-209 | STR 349-1111 | ATT 1112-1145 | STR 1146-1204 | ATT 1205-1266 | STR 1267-1299 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage DK-13
[NCBI] 		2746075 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QMV33882.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT611523 [NCBI]
CDS location
range 68862 -> 72818
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCAAAAGCTGATTACTCAGTTTTATCAGACGGCGTTAACGTAGGTTTCTTTATAGAAGAAAACACAATTCAACAATATGATGCGACGCGCGGATACAAAAAGAACTTTGCGGTTATTAATGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATTCCGGCACCAGCTGGAGCATTTACCCCTCAGTATTGGTTAGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCAACTCGTCAGCTTAGCTCCGGGGAATTTATCGCAGTCGACTCAGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTGCCTCCGAACCCGACTGATGGTGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGCGGTAATACCGGTTATAATGAAATTAAAGTTCAATCGAGCAATGTGCCTGGTCAAGGTAACCAAAAGATTGTTCGCTTTGGTAATCAGTATTCAGAAGTTTTAATTACCAAACCATTCTCTTATAACATGCTTATCTTTTCAAACCGCTTATGGCAATTTTGGGAAGCAGGTAACGAAGAACGTGGTATCAGAGTAGAACCGTCGACCGGACGTTTCCATGCACAAGCTGGCGACTTTATTATGCGTCGTTATACAACTGGTGCACCGATTACTTTCATTCTTCCTAAGTATGCAAACCAGGGTGATATTGTCAAATCTGTTGATATCGATGGTATGGGACCAACGTTCCACCTGATGGTTGAAACCTTTGACACTAGTTCCAGTCTTGATAAAGCTGGTCAGCATCAAATGGAATTCCGCACCACAGGTGATGGTTTCTTCGTTTATGATGCTGCCGAAAAACTCTGGCATGTTTGGGACGGTGATTTTAAAACTCGTCTTCGCGTTATTCGCGACAGCGTTAAACTTTTACCAAACGAAAGTGTCATTGTATTTGGCGAAGATAACTCAACTCCGGCAACGATTAATATCGATTTGCCAACTAATGTTTTGCAAGGCGATATTGTTAAGATTGCGCTGAACTATCTCCGTAAATCGCAGACTGTTAATATAAGAGCTGCTGTTGGCGATAAGATTGCAACTGACATTAAATTGCTGCAATTCCCTAAACGTTCCGAGTATCCACCAGATACAACTTGGGTGATGGTTGATTCATTGACCTTTAATGGCAACATCAGTTATACTCCGGTTATTGAATTATCATATGCAGAAGATGCAGTGTCTGGAACAAGTTATTGGGTTGTCGCTCAGAACGTCCCGACTGTCGAACGAGTTGACTCATTAAATGATTCCACGCGTACACGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCAAACCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCAGAAAAAGAACTCGCAATTACCCCTCAGACTTTAGCCAACCGTGTTGCTAAAGAGAACCAACGAGGCATTGCCAGAATCGCAACGACTGCCCAAGTAAATCAGAACAGTGATTTTGCATTTGTTGATGATGTAATTATTTCTCCGAAAAAACTCAATGAACGTACGGCAACAGAAACGAGACGCGGGCTCGCAGAACTCGCCACACAGCAAGAAACCAATGCGGGTGTAGATGATACCACAATTATAACTCCAAAGAAACTGCAAGCTCGCCAGGGCTCAGAATCGCTATCCGGTATTGTAACTTACGTTTCAACAACCGGTGCAACTCCTGCTGCTTCGCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAATACGGTTAATCTGGTTGTTTCTCCGAAAGCTCTTGACCAGTACAAAGCTACTTACACCCAACAAGGTGCGGTTATTCTTGCGGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGTACTTCTCAATCTGGCTGGGCAAACGCAGTCGTTACTCCAGAAATGTTGCAGCGCAAAACTGCTCTTGATTCCCGTATCGGTTTAATCGAGATTGCAACTCAAGTAGAAACAGATGCAGGAACCGATTATACCAGAGCTGTGACTCCTAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCATCAGAAACGTTAACCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACTCCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAATACTGCTCGCACTTCTGTTAATGCATTAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATAGCCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACTCAACGCGGTACGGCAAGATTAGCAACTCAGGGTGAAGTCAATACCGGCACTGACGATAAAACAATCGTTACTCCGCTTAAATTGATGTCGAAAAAAGCCACTGAAAATGCCGAAGGTATTGTTCGCATCGCGACAAACGCAGAAGCAACAGCAGGCACATCAAAAGTCTTGGCCATCAGTCCGTCGGCGCTGAAATATATTGCACAAACGGAAACAACCTGGGAATCATCTGAAACACTGCGTGGATTTGTTCGTTTATCTTCTGGTACAGCTACTTCGGCCGCAACTACAACGACTGGTGCAGGATTTACATATGCAAATGGTGTGTATACTCCGGACCCAAGTAAACTGGTTAGCTATTCAAAATCTGGTTATGCAGTTTCACCTTACGAATTAAACCGCGTATTGCAAAACTTCTTACCGATAAATGCGATGGCTGTTAATGCTGAAAAACTGGATAACCTTGATTCGACCCAGTTTATTCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTTGAAGGTGTGTTAACTCTTACTAAACAGACAAATATATCTGCTCCGGTTGTATCGACGAGCACTGCAGTGTTTACTGATGTAACGGCTGGCACTTCGACGTTCGGAACTGTGAATGTTGTTAACGGAACTAACAAGTGGAAAATCACCGCTCCTTCCGCCGGAACGACAATGACTATTGGCGATACGACTAACGTATTGACATTAAACACCGCCTCGGGTAATGCTGCTGTATTGAACAACCTTAGTGCCGGAAATGATGTTCAAGCCAAAAATAATTACGTTCTAAATGGTCGTACTATCGCAACCACAACGGGTGAAGCTTCTGGCGCAACTCTGGCTCTGGGTGATAACTCGCAGAATTTAGTGCTTAAAACTCTTGATGCTGGCAATATCATAGCAAATGGTGGCGGCGCATTTAAAGTCCTGACCGAGAAAAACGCTGTTGAGATTGTAGATAGAAACTTTGTTAACCAAGCCGGTGATACAATGTCTGGTGTGCTCCGTGTGAATGCTCCGGTCCGTGTATTCGGTACGAAACCAAGTCTTATCGCACAAGCTCCGACTGCAGATACTGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATGAACCGACTTATAGCCAGTTCCCTGGTTATTGGACAATGAAGTTAAAACGTCAGGTAAACATTGATACAGTTCAAACTAAACCTGCTGGGGTAACTGATGAAGTTTGGAATGCTTCTGGTTGGTTAACTGAAAATGGAACTTTCGCCTCGCCTGTTATTCGTTATCGTAATGACGATGGTACACTCGGTGATGAAGTATTAGGTAGCTCTGGCCAAAAACTGCGCGGAACCTGGTTTGACTATTCGGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATACCCTGGTACGTTAACTCAGTTTGGTAATACATTGGATTCATGTTATCAGGATTGGGTGTGTTATCCAACTGGATTGAACGGTGGTACTATTCGTTATACTCGTACATGGCAGAAAAATAAATCTGCATGGACGACTTTTGCAATGGTTTACACCGCGGATAACCCTCCGTCTGCAGAGGATGTTGGTGCATTACCGGCCGACAACACAACAATGGGGAACTTAACCATTCTCGATTGGTTGCGTATCGGTAACGTGCGCATCATCCCAGACCCGACCACTAAATCCGTTAAGTTTGAATGGGTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6025daf033b72aebac971e8427bcdd213f6d8ec6cab1c9e75e7e31e8dfeb0dda
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5415
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50