Protein

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Genbank accession
QBO61841.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MYSIKTDLDITGAGTVGKDLLVKGNAVFNNNLTVNGTVTFANATFTAIESSTANITSTLDVGGKATLSGGLGVEGNTTIGSAVVGSDTATINSNATFNGTVSVGSDFTQTAGTTTLQATKVKNLEVAETTAFKGNITADVGTTAAFDKITANTAEITNVSTTDISSTGTATFNDVTISGTLGGEFNLSDLNAVTLNVTGASNQQGAVTFGANVTGINSTATFKDIRIGSNSESQTFRLSFPYTAPGKRPTVILQNEIQSELMSPANLTVLTSASFGNASLSSYGITGNGLNKLDYLTVSGNNTQSPDTPLLEVQKGKTKVADFEVTGTATIPNIESTGTANFNNINVSGLLGGTFQLDDINAVSLNVTGVTSLVGGVTLGSNITGYNSTASFKAISLGQNSQDAAVKLGFGYTAPGQRPTVILPNEVQSEVVSPSTLNVLKTATFGNASLSTYGITGNGLNKLDYLTITGNETQAPGTPFLQVGGKAILNDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPNSVVAAANIKGATLESTGNTTVGAKLTVTGDIAGTTATLSGALSAGSVSSGSITGTTSVSAPTISASTEVTAPTITASGTVSGQTINGTNISATTLTAPTISGNTNFTENVDITGSLTVGSLDLSTTDINAKSITTTAGATIGGDLVVQGSFDLSAADLNVKSLTTSGIVKSNDLVNANVLPVLNSTTITATTVNADDITVTGSANLGTIYSSSSVLVGSTLTVTGETTTASLVTPTISNASGVTISNNTNVTGDLTVTGAVIPGSIDLATTDVNAKSITTTAGATIGGNLTVNGTVDLTTADVTVKSLTSTGAIVSNESTISSVLPKLQSTDATIATLGSTTANITNLNVTGASTVADVTSSGKVKAVSVETPTISNVDGVSISNNTSITGDLTVSGTVTPGAIDLSTTDVSAKSITTTAGANIGGDLVVSGTVDLSGADVSVKSLTSTGIITVSSAEGINVLPKVQSTEVTVSALNATNAVVSGDVSAATASISGAITGGSATLSGVGTALNVTNNATVGGVLTVGSITSAAENVSITKNTAITGNLAVSGTLTAGVIDLSTTDVSVKTLTSLGDATVQGNLTVDGTINLSSANIVGVTLESTGSTTVGTDLILTTGNITGSPSISGNLGVTGTTTLTGATTVSNTLNTAGKLTVNAGGIQVVAGGIQVDSGTITASSANISGSSTLNSATVTTTLGVTGAASMNGGLTASTLDVTGDSTVQKLTVKGVFVPEGGLDLSGADLSVNSVTAATTLSVTGASTLTGGVSTSTVTASGKVTAQELSTGTLDVTTNGTVGGTLGVTGKATVGSLDSGAISATSGTFSTTLDVTGAATFGNNVNITGTLTPGALDLASTDVVANSLSVATTLHSDGNATIGGTLGVTGAVSAPSIALNGEGAALAVTNNATIGGTLGVTGATTLGSLTTSGAVKTGADVIIGTKIGDQPETVQIFPNTYIAGSLRVDGGINADIDVSGQTIEPYAVVAADTISAAGNITSGAELISKSATIGDVGSQNNNLTINGNVVNNGNFTVTGLLNATLNQANSDVAVKSLTATNSVAAGTSITAGTSITATGLLKGNTLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITSGNLTVGGDISATGTATLAATSVTTITTSGAATLASASVTGAATIGGTLTVTGLMTANGSVVLGDAAADTLTVNATSSFKENAVFDKDVTVTGQLTTTNADLTTTTVTTKKYDVIPNQVTSSVIAPTGTWTPDGTSNVYFITLDQDTTLAPITGLIGGGKASSVYIYVKQDATGNRNFTTDGTYAVVDGTLNKTANSVTIYQVIYDGVSPVTDMFIAQRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:1841 AA
molecular weight: 180375,94810 Da
isoelectric point:4,14859
aromaticity:0,02933
hydropathy:0,24264

Domains

Domains [InterPro]
DC_0092
STR
123–331
DC_0092 DC_0092 DC_0062 DC_0092 IPR058970
DC_0092
STR
307–595
DC_0092 DC_0092 DC_0931
QBO61841.1
1 1841
Architecture
STR
STR
STR
RBD
STR 123-857 | STR 876-1195 | STR 1263-1511 | RBD 1512-1841
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_G17
[NCBI] 		2502408 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBO61841.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK327931 [NCBI]
CDS location
range 214366 -> 219891
strand +
CDS
ATGTACTCAATAAAAACTGACTTAGATATTACTGGTGCTGGTACGGTTGGTAAGGATCTTTTAGTCAAAGGAAATGCTGTTTTCAACAATAACCTAACTGTAAATGGTACTGTAACTTTTGCAAATGCAACTTTTACTGCCATTGAATCATCAACTGCCAACATTACATCTACTTTAGATGTAGGTGGCAAAGCAACACTTTCTGGTGGTCTTGGTGTTGAGGGTAATACTACAATCGGTAGTGCAGTTGTCGGGTCTGATACAGCAACAATTAATTCAAACGCTACCTTTAACGGTACTGTATCAGTTGGTTCTGATTTTACACAAACTGCTGGTACAACCACTCTACAAGCAACTAAAGTTAAAAACTTAGAAGTTGCTGAAACAACAGCATTTAAAGGTAATATTACTGCTGATGTTGGGACTACTGCTGCATTTGATAAAATTACTGCTAATACCGCAGAAATTACTAATGTAAGTACAACAGATATTAGTAGTACTGGTACTGCTACATTTAACGATGTGACAATTAGTGGTACACTTGGTGGTGAGTTTAATCTATCTGACTTAAATGCAGTAACATTGAACGTTACTGGTGCATCTAACCAACAAGGTGCAGTAACTTTCGGTGCTAACGTAACTGGTATTAACAGTACTGCTACTTTTAAAGACATTCGTATTGGTTCTAACTCTGAATCACAAACCTTCAGATTAAGCTTCCCTTACACTGCTCCTGGTAAACGCCCAACTGTTATTCTACAAAACGAAATTCAGTCCGAGCTAATGTCACCTGCAAACTTGACAGTATTGACCTCTGCTTCTTTTGGTAATGCGTCATTATCTTCTTATGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAATTAGATTATCTAACAGTTTCTGGTAACAATACACAATCACCAGACACACCACTATTAGAAGTTCAAAAAGGAAAAACTAAAGTTGCTGACTTTGAAGTAACCGGAACTGCAACTATTCCAAATATCGAAAGTACTGGTACTGCTAATTTTAATAACATTAATGTTTCTGGTCTTCTTGGTGGAACGTTCCAACTAGACGATATTAATGCAGTATCTTTGAACGTTACTGGTGTAACTTCATTAGTTGGTGGTGTTACTCTTGGTTCTAATATTACTGGTTATAACAGTACTGCATCCTTTAAAGCTATCAGCTTAGGTCAAAATAGTCAAGATGCGGCAGTGAAACTAGGTTTTGGATATACTGCACCAGGTCAACGCCCAACAGTTATTCTACCTAACGAAGTTCAATCAGAAGTCGTTTCTCCTTCTACATTGAACGTTCTTAAAACAGCAACTTTCGGTAACGCTTCTCTTTCCACTTATGGTATTACTGGTAACGGTCTAAACAAACTAGATTACCTAACTATTACTGGTAACGAAACACAAGCTCCAGGTACACCATTCCTACAAGTTGGTGGTAAAGCAATTCTTAATGATGTTGAATTTACTGGAACAGTAACTGGACTAACTGTTGATGTTAGTGGGCAGGATCTAACACCTAATTCTGTTGTCGCGGCAGCAAATATTAAAGGTGCAACACTTGAAAGTACTGGTAACACTACCGTGGGTGCTAAACTAACTGTTACTGGTGATATTGCTGGTACAACTGCAACTCTTTCTGGTGCATTATCCGCTGGTTCAGTAAGTTCTGGTTCTATTACTGGTACAACTTCTGTATCTGCACCAACAATTAGTGCATCTACTGAAGTAACGGCCCCTACTATCACTGCGAGTGGAACTGTAAGTGGGCAAACAATTAACGGTACTAATATTAGTGCAACAACTCTGACTGCACCAACTATTAGTGGTAATACTAACTTTACAGAAAATGTTGATATTACTGGTAGCTTAACTGTTGGTTCTCTAGACTTGAGCACTACCGATATTAATGCTAAATCAATCACTACTACTGCTGGTGCAACTATTGGTGGTGATTTAGTAGTTCAAGGCTCTTTTGATTTATCAGCAGCCGACCTTAATGTTAAATCATTAACTACTTCTGGTATTGTTAAAAGTAATGATCTTGTTAATGCTAACGTACTTCCAGTACTTAATAGTACTACCATAACGGCAACTACTGTTAATGCTGATGATATAACTGTTACCGGATCTGCTAATTTGGGTACAATTTACTCAAGCTCATCTGTTCTAGTTGGGTCAACTTTAACTGTAACTGGTGAAACTACAACTGCATCGTTGGTTACCCCAACCATTTCAAATGCAAGTGGTGTCACTATTTCCAATAATACAAATGTAACTGGTGACCTAACTGTTACTGGTGCAGTTATTCCAGGCTCTATCGATCTAGCAACAACTGATGTTAATGCTAAATCCATTACTACTACTGCTGGTGCAACTATTGGTGGTAACCTAACTGTTAATGGTACAGTAGATCTTACTACGGCTGATGTTACTGTCAAATCTTTAACTAGTACTGGTGCAATTGTTAGTAATGAATCCACAATTAGTAGTGTTCTACCTAAACTTCAAAGTACTGATGCAACTATTGCAACCCTTGGTTCAACAACTGCAAATATTACTAATTTGAATGTTACTGGTGCATCTACCGTAGCTGACGTAACTTCTTCAGGTAAAGTTAAAGCAGTTTCTGTAGAAACCCCAACAATTAGTAACGTTGATGGTGTATCTATTTCCAATAATACATCTATTACTGGTGACCTAACAGTTTCTGGTACAGTAACACCAGGTGCAATTGATTTGAGCACAACTGATGTAAGTGCAAAATCCATTACTACTACCGCTGGAGCAAATATTGGTGGAGATCTTGTTGTTTCTGGTACAGTTGATTTAAGTGGTGCTGATGTATCTGTTAAATCTCTAACAAGTACTGGTATTATTACAGTTAGTAGTGCAGAAGGTATCAACGTTCTACCTAAAGTTCAAAGTACTGAAGTTACAGTGTCTGCTCTAAATGCAACAAATGCAGTAGTTTCTGGTGATGTTTCAGCAGCAACAGCTTCAATCTCAGGTGCAATTACTGGTGGGTCAGCAACACTATCTGGTGTTGGAACTGCTCTAAATGTAACTAATAACGCAACTGTTGGTGGTGTACTTACTGTTGGTTCTATTACTTCAGCGGCAGAAAATGTATCCATTACTAAAAATACCGCGATTACTGGTAATTTAGCAGTATCTGGAACACTAACTGCGGGTGTTATTGATCTTAGCACAACTGATGTGTCTGTGAAGACATTAACTTCTCTAGGTGATGCAACCGTTCAAGGTAACTTAACTGTTGATGGTACTATTAACCTAAGTTCTGCAAACATCGTCGGTGTAACACTAGAAAGTACTGGCTCCACTACCGTAGGTACTGATTTGATACTAACTACTGGTAACATTACAGGTAGTCCATCTATTTCTGGTAACTTAGGTGTAACTGGCACTACAACTTTAACTGGTGCAACAACAGTTTCAAATACATTGAATACTGCTGGTAAACTAACAGTTAATGCTGGTGGAATTCAGGTTGTTGCTGGTGGTATACAAGTTGATTCTGGAACTATTACTGCTTCTAGTGCTAATATTTCTGGTAGCTCAACACTTAATAGTGCTACTGTAACCACTACACTAGGTGTTACTGGTGCAGCAAGTATGAATGGTGGTTTAACTGCTTCTACATTGGATGTAACAGGTGATAGTACAGTACAAAAACTAACTGTTAAGGGTGTATTTGTTCCTGAAGGTGGTTTGGACTTATCCGGTGCTGATCTTAGTGTGAATAGCGTAACTGCGGCAACCACATTAAGTGTTACTGGTGCTAGTACTCTAACTGGTGGTGTTTCCACTTCAACTGTTACTGCATCCGGTAAGGTAACCGCACAAGAACTAAGTACTGGTACATTGGATGTAACCACAAATGGAACTGTTGGTGGAACTTTAGGTGTAACTGGTAAAGCAACTGTTGGATCACTAGATTCAGGTGCAATCTCTGCAACATCTGGTACATTTAGTACTACACTAGATGTGACTGGTGCAGCGACCTTTGGTAATAATGTTAACATTACTGGTACATTAACCCCAGGTGCATTGGATTTAGCTAGTACTGATGTAGTTGCTAACAGTCTTTCTGTAGCTACAACTCTACATTCAGATGGCAACGCAACAATTGGTGGCACATTAGGCGTAACTGGTGCAGTATCTGCTCCATCAATCGCTCTTAATGGTGAAGGTGCTGCGTTAGCAGTTACTAATAACGCAACAATTGGTGGTACATTAGGTGTAACTGGTGCTACAACTTTAGGTTCTCTAACAACCTCTGGTGCAGTTAAAACTGGTGCTGATGTTATTATCGGTACTAAAATTGGCGATCAACCAGAGACAGTTCAGATTTTCCCTAATACTTACATTGCTGGCTCCTTGCGTGTAGATGGTGGTATCAACGCTGATATTGACGTTAGTGGTCAAACAATTGAACCTTATGCAGTTGTTGCGGCGGACACTATTAGTGCAGCGGGTAATATTACTTCTGGTGCAGAGTTGATTTCCAAATCAGCAACTATTGGTGATGTTGGTTCACAAAACAACAACTTAACAATCAATGGTAACGTAGTTAACAACGGTAACTTTACAGTAACTGGTCTACTTAACGCAACACTAAACCAAGCAAACTCTGACGTGGCTGTTAAATCATTAACTGCAACCAACAGTGTTGCTGCTGGTACTAGTATTACCGCAGGTACAAGTATTACTGCAACTGGTCTACTAAAAGGGAACACCCTTGAAGTAACTACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACAATGTCAAGTGGTGCTAACATTACTGGAACCGTTGGAATTACTTCTGGTAACCTAACTGTTGGTGGTGATATTTCTGCAACAGGTACTGCAACCCTAGCAGCAACTTCAGTAACTACCATTACTACTTCTGGTGCAGCAACACTTGCTAGTGCATCTGTTACTGGAGCAGCAACAATCGGTGGTACTTTAACTGTTACTGGTTTAATGACTGCAAATGGTAGTGTTGTTTTAGGTGACGCTGCTGCTGATACATTAACTGTCAATGCAACATCTTCTTTCAAAGAAAATGCAGTATTTGATAAAGATGTAACTGTAACTGGTCAATTAACAACTACTAATGCTGACCTAACTACTACAACAGTAACTACTAAAAAATATGATGTTATTCCTAATCAAGTAACTTCTTCTGTTATCGCACCAACTGGTACTTGGACCCCAGACGGTACTAGCAACGTATACTTTATCACTCTAGATCAAGATACCACTCTAGCACCAATCACTGGTCTAATCGGTGGTGGTAAAGCATCTTCAGTATACATTTATGTGAAACAAGATGCAACAGGTAATAGAAACTTTACTACTGATGGTACTTATGCGGTTGTTGATGGCACACTGAACAAAACTGCAAACTCTGTAACTATCTACCAAGTCATTTATGACGGTGTGAGTCCAGTAACAGATATGTTTATTGCACAACGTACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
dfe2ffdaeda48d8ada6dbc37e02023c54476cbf0f52c17c5ffd23d229edbb924
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5210
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Still something new to discover - new insights into E. coli phage diversity and taxonomy Korf,I.H.E., Adriaennsens,E., Dreiseikelmann,B., Kropinski,A., Nimtz,M., Meier-Kolthoff,J.P., Rohde,M., van Raaij,M. and Wittmann,J. 2019-05-17 — GenBank