Protein

Genbank accession
XYM58576.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADRFPLIVNASSRKIEELVAGDNLDLTGNGVAISGSTGLSDQYLKSNGSTLEWAYPGDVYTTASQVVSNKTFQDCTISGATNIMSAIPNAALVNSSISINGAQVALGGSTTISNTDTTYSISAQDGSTGGQKIIRLTDSSSNTDDVTLEAGTNMSVARIGDVITFSSSFTDTDTVTTIESAVGGSAVSGSVIIDAAGFASVSQSGNTITITGSNVDTVTEVRAGTGQTLKSGKFTFLQGGATTLTQSLNVGTGEEEITVSSVDTITRLKGGNTGSLTSGDITVTGGNNVTVSQSGATIEVSSTDTNTITQLASGSNSLSSGNFRFTTAGAASIAQNTVGGVTTFEITSANDDTGASFTANGGVLKNNFNFELKNNNNFGANTLLKWDSGNSQLANSIITDDGSTVTVTGDLVVSGSQTTLDTTTLRVEDNIIELRKGSSIVGADGGIQVNRTTNADESVTSFIQLAWYEAGGYWRSFDGSITNRLVTETETQTLTNKSLTSPTLTSPILGNATCTTINGIALSQSANSTLTIADTKQVEFKRDLQFTSDNNSQQININFRLGGEVAYKSDTLASFSSTTSTQLRGLITDTTGTGSVVFQQSPIFLTSIVTTSTAFDCLVSGVTNLNFGTAATTLNMGNSSGTTTINGDLVVEKDLTVGTSVADTITINGILNSENSDISIRGGDTVPMIVGRGGGSVATNTAMGNKALQANNAGGNCTAFGYEALFVNDSDNNTAFGYQALKINSDGEKNVAIGAGSMTLNEDGLRNCALGMNSLQNNTVGNDNVCIGHYAGFNCLGSGNVLIGASPDENATNATYAPPNLSGNNQLVIGSSTEAWIRGNSSFNVTVPNDLTVDGDTILNGSLVVNGTTTTINSNVISVDDKAVELAAVSTVTVTATTTTGSTTITNITPTAGLIPGMEVTSITDGIELGTNCTIVSISGNQAVLSNTVTGNGTASIVANGPSDLAATGGGLILKGTTDKSMIYDGTRSIKYWTFSESLELQAGKQISIANQLLISSTDLGTSVVNSSLTSVGTLTGLDVDGAIRLGGRVKEKVFFSYNTSLTPSSNTLTINTAGANTILGTPASTAINKWAFTSVSLSNGESITLSLILAGNTAATYGDDCSVDGVDISTGVQWSGGSPPTATSNTDILTFIIVKDNSGVTKVFGQGNTDFS
Physico‐chemical
properties
protein length:1174 AA
molecular weight: 119984,30610 Da
isoelectric point:4,22322
aromaticity:0,05026
hydropathy:-0,02394

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-FP1
[NCBI] 		3413217 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM58576.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340854 [NCBI]
CDS location
range 186048 -> 189572
strand -
CDS
ATGGCAGATCGTTTTCCACTTATCGTTAATGCATCTTCCAGGAAGATCGAAGAACTGGTAGCAGGTGACAACCTAGACTTAACAGGAAATGGCGTAGCAATTTCAGGAAGTACAGGTCTATCTGATCAGTACCTGAAGAGCAACGGCAGTACACTAGAGTGGGCGTACCCAGGTGATGTGTACACCACCGCTTCACAGGTTGTATCGAACAAAACATTCCAGGACTGTACCATTTCTGGCGCGACGAACATTATGTCCGCCATCCCGAATGCTGCACTGGTTAATAGTAGCATATCCATCAACGGAGCGCAAGTGGCTCTTGGTGGATCGACTACTATCTCCAACACGGATACAACATACAGCATTTCAGCACAAGACGGAAGCACTGGTGGACAGAAAATCATCCGTCTGACTGACTCCTCTTCCAACACTGATGATGTTACACTGGAAGCAGGAACAAACATGAGCGTTGCCAGGATCGGTGACGTTATCACTTTCTCCTCCAGCTTTACTGATACAGACACTGTTACCACCATTGAATCTGCCGTAGGTGGTTCTGCAGTAAGTGGATCTGTCATCATTGATGCTGCTGGATTTGCATCTGTCAGTCAGTCTGGCAACACAATTACAATCACAGGTTCTAACGTTGACACGGTAACAGAAGTTCGTGCTGGTACTGGTCAGACTCTCAAGTCAGGTAAGTTTACCTTCCTCCAGGGTGGTGCTACTACACTTACACAATCATTAAATGTTGGAACAGGTGAAGAAGAGATCACTGTTAGCTCTGTGGATACTATCACCAGACTGAAAGGTGGTAACACTGGATCACTAACTTCAGGCGACATCACTGTCACTGGTGGTAACAACGTAACTGTATCTCAAAGCGGTGCAACCATCGAGGTTTCATCAACTGATACTAATACTATTACTCAACTAGCATCTGGTAGTAACTCCCTATCATCAGGTAACTTTAGATTTACTACAGCAGGTGCTGCAAGTATTGCACAGAACACCGTAGGTGGTGTTACCACATTTGAAATTACATCTGCTAACGATGACACAGGTGCATCATTTACTGCTAACGGTGGTGTTCTGAAGAACAACTTCAACTTTGAACTCAAGAATAATAATAACTTTGGTGCCAACACCCTACTCAAGTGGGACTCTGGTAACTCTCAACTAGCAAACAGCATCATCACTGACGACGGTTCTACTGTTACTGTTACTGGTGACCTCGTAGTATCTGGTTCCCAGACTACTCTGGACACCACCACTCTACGTGTAGAAGACAACATCATCGAACTAAGAAAAGGTTCTAGTATCGTTGGTGCTGACGGTGGTATTCAAGTCAACAGAACAACCAATGCTGATGAATCTGTAACCAGCTTTATTCAACTAGCATGGTATGAAGCAGGTGGTTACTGGAGATCCTTCGACGGTTCGATTACAAACAGACTGGTCACAGAGACAGAGACACAGACTCTAACTAACAAGAGTCTAACATCACCCACACTGACTTCACCTATACTAGGTAATGCAACTTGCACTACCATTAATGGTATCGCACTATCTCAATCTGCTAACTCCACACTAACGATTGCAGATACAAAACAGGTTGAATTCAAACGTGACCTTCAGTTCACTAGTGATAACAACTCCCAGCAGATTAATATTAACTTCAGACTGGGTGGTGAGGTTGCATATAAGTCTGACACTCTGGCATCATTCTCATCTACAACCTCTACTCAGTTGCGTGGTCTTATCACAGACACAACTGGTACTGGTAGTGTAGTATTCCAACAGTCTCCTATCTTCCTGACCAGTATTGTCACCACGTCCACAGCATTTGATTGCTTGGTAAGTGGTGTAACAAACCTGAACTTTGGTACTGCTGCTACTACCCTGAATATGGGTAACTCCAGTGGTACTACCACAATCAATGGTGATTTGGTTGTAGAAAAAGATCTGACCGTTGGTACTTCTGTTGCTGATACTATTACTATCAACGGTATTCTTAACTCCGAAAATTCTGACATCTCTATCCGTGGCGGTGACACTGTACCGATGATTGTCGGTCGTGGTGGTGGTTCTGTTGCAACTAACACTGCGATGGGTAACAAGGCACTACAAGCAAACAATGCTGGTGGTAACTGTACTGCGTTTGGTTATGAAGCACTATTTGTTAACGACTCAGACAACAACACTGCATTTGGTTACCAGGCACTGAAGATCAACAGTGATGGTGAGAAGAACGTTGCGATCGGTGCTGGTTCCATGACTCTCAATGAGGATGGACTACGTAACTGTGCATTGGGTATGAACTCATTGCAAAATAATACTGTAGGTAATGACAACGTTTGTATCGGTCACTATGCAGGTTTCAACTGCCTTGGTTCTGGTAACGTCCTGATCGGTGCTTCTCCTGATGAGAACGCAACCAACGCTACCTATGCACCACCTAACCTGTCTGGTAACAACCAGTTGGTAATTGGTTCTTCTACTGAGGCATGGATTAGAGGTAATAGCAGCTTCAATGTTACTGTACCAAATGATCTTACTGTTGACGGTGATACTATCCTGAACGGATCGTTGGTAGTCAACGGTACGACCACAACTATTAACTCCAACGTCATATCGGTCGATGACAAAGCAGTCGAACTTGCTGCTGTCTCTACTGTAACTGTCACAGCAACAACCACAACTGGTTCTACAACCATCACAAACATCACACCTACTGCTGGTCTGATTCCTGGCATGGAAGTAACTTCCATCACTGATGGTATTGAACTAGGAACCAATTGTACTATCGTTTCTATTAGTGGCAACCAAGCAGTCCTTTCTAACACTGTAACTGGTAACGGTACTGCATCCATTGTTGCTAATGGTCCTTCTGACCTGGCAGCAACTGGTGGTGGTTTGATCCTGAAGGGAACCACTGATAAGAGCATGATTTATGATGGAACTAGATCCATCAAATACTGGACTTTCTCCGAGAGTTTGGAACTGCAAGCAGGTAAGCAGATCTCTATTGCTAACCAACTACTAATCAGCAGCACAGACCTAGGTACATCAGTTGTCAACTCTTCGCTGACATCTGTTGGTACACTAACTGGATTGGATGTTGATGGTGCCATCAGACTAGGTGGTAGAGTCAAAGAAAAAGTATTCTTTAGTTACAATACTTCCCTCACTCCTTCATCTAATACACTAACTATTAATACTGCTGGTGCTAACACCATTCTGGGTACACCTGCTTCTACTGCTATTAATAAGTGGGCGTTCACTAGTGTAAGTTTGAGCAACGGCGAATCGATTACACTGTCTCTGATTCTTGCAGGTAATACTGCTGCTACATATGGTGATGATTGTAGTGTTGATGGAGTAGACATCAGCACTGGCGTACAATGGTCTGGTGGTTCACCACCAACTGCTACATCTAACACTGACATCTTAACCTTTATCATCGTTAAGGATAACTCTGGTGTAACCAAAGTATTCGGACAAGGCAACACAGACTTCAGCTGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.