Protein

Genbank accession
YP_010089845.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,58
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MADLIKASFRATNGLDAAGEKVINVATADKTKLTDGVNVDFFFKENTIQLYDTTRGYDSGFAIIYNNRLWVSNRIIPEPAGAFQETFWTAIRTDPKWTYVDVGPVTMQSGDYISANTSVNDLVLTLPNTPNDGETIFVRDVGGNLGYKSLKINTSNQRINFRNSQITSFTATRPYSQLMFVFSNRLWQLYVGENESIGTIITPSTGVFRSQASDIIIRRYTTSAPCQIGLPKNAVTGDIIRTIDLDGLSPQNHLIVTTFDNTSSIGTIGTHSAEFRTAGDGFLVYDASDSIWRVYDADLRTRISVVTETTDLSPNQSVIVFGDNNATSKDITLNLPTDVAFGDTVEICLSYIRHGQTVTIKANAPDLIASTKLLLQFPRRSDYPPDVSWYTSEELIFNGYDDYAPTLELAFLQDPITLDKYWVVSENIPTIERVDATNNTTRKRLGVIALASQEQANVDLENNPEKSLAITPELLANRTSTESRRGIARLASTAEVNQDSTSTFLDTVIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETNTGTDDTTIVTPKKFAARKATTSMDGIITLVSSGAIAASDRDNPGTLVYNYNDAVKAITPATLHEARATKTTLGQVYQATETEVISAPVDNPLVPLAVSPEMLHKKTATTTRIGFTQTATQVEVNTGTDNFKYVTPNTLNGRISSETLTGIARIATQVEFDAGLLNTVISTPLKIATHFSDINRTEVISSSGLTQSGNLWNHYTLNILEATSVQRGTARLATQVEVDAGVEAKSIVTAATLSGKKATETTEGIIRVATQAESVAGTSSILAISPKNLKYIAQTESTWESTPLRRGFVKMTEGALTWVGNNTVGNTQDVELYAKNGYAISPYELNLTLAHYLPIEATAVNSTKFDNLASTQFIRRDINQTVDGILTLTKQLNTSAPVLSSSTGTFVDVVGTNTVNAGNSLGTSSISILGKANNWKFNAVADGTTLLVNDVLTLNQNGNASIKQTLNIGNRADSVNGYSVGGIVVLQNNALTTEVGNVVRPLVLKSPDASNIIADDGTQYKVLTEKNAVSVIGNSFVKKIGDTMTGRLTVNSAITVQLAEASISVIPTETTKGMWTAEVTTPAQYNLLPGYAVPVFGTNPDGSDNAVIVSYNLVKGPGTLVQNGVGTNYAYQVWNPRPTATAPNHFARTQWIRNFNPLISGWDEWARVFTSQTPPTASDIGAVSSTGSAFNNMTVRDWLQIGNVRITPNVATRTVEFEWID
Physico‐chemical
properties
protein length:1245 AA
molecular weight: 134757,20350 Da
isoelectric point:5,17845
aromaticity:0,07309
hydropathy:-0,17357

Domains

Domains [InterPro]
IPR048391
1091–1193
IPR048391
YP_010089845.1
1 1245
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Yersinia phage fHe-Yen9-01
[NCBI] 		1965363 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010089845.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_055716 [NCBI]
CDS location
range 154824 -> 158561
strand +
CDS
ATGGCTGATTTGATAAAAGCCAGTTTTCGAGCTACAAATGGTCTCGATGCAGCTGGTGAAAAAGTAATTAACGTGGCAACAGCCGATAAGACCAAATTAACTGATGGCGTTAACGTTGATTTCTTCTTTAAAGAAAATACTATTCAACTTTATGATACAACTCGTGGATATGATTCAGGATTTGCTATCATTTATAATAACCGTTTATGGGTTTCTAACCGTATTATTCCTGAACCTGCTGGGGCCTTCCAGGAAACTTTTTGGACTGCTATAAGAACAGACCCAAAATGGACTTATGTTGATGTAGGTCCTGTTACAATGCAATCTGGTGATTATATTAGTGCAAATACCTCAGTTAATGATTTAGTATTAACTTTGCCTAATACGCCAAATGATGGGGAAACAATTTTTGTTCGAGATGTTGGTGGTAATTTAGGATATAAATCACTAAAAATTAATACATCTAACCAACGAATCAATTTCCGTAATAGCCAAATAACATCATTTACCGCAACTCGCCCTTATTCACAATTGATGTTTGTTTTCAGTAATAGATTATGGCAGCTTTATGTTGGTGAAAACGAATCGATTGGAACAATTATCACTCCTTCAACAGGCGTGTTTCGTTCTCAAGCCAGTGATATAATTATTCGTCGTTACACAACGAGTGCGCCATGTCAGATAGGTTTGCCAAAGAATGCTGTAACAGGCGATATAATTCGTACAATAGATTTAGATGGATTAAGCCCTCAAAACCATTTAATTGTTACTACATTTGACAATACATCATCTATAGGAACAATTGGAACTCATAGCGCTGAATTCAGAACAGCCGGCGATGGTTTCTTAGTATATGATGCTTCTGATTCTATCTGGCGTGTATATGATGCAGATTTAAGAACACGCATCAGTGTAGTAACTGAAACTACCGATTTATCTCCGAACCAATCAGTTATAGTTTTTGGCGATAATAATGCTACATCTAAAGATATAACATTAAATCTTCCAACTGATGTTGCATTTGGAGATACAGTTGAAATTTGTTTAAGTTATATTCGCCATGGCCAAACTGTTACTATTAAGGCTAATGCTCCTGATTTAATAGCTTCTACTAAATTATTACTTCAGTTCCCACGTCGTTCAGATTATCCACCAGATGTTAGTTGGTATACTTCTGAAGAATTGATATTCAATGGGTACGATGATTATGCTCCGACTTTAGAATTAGCTTTCTTACAAGACCCTATTACTTTAGATAAGTATTGGGTAGTTTCAGAAAATATTCCTACAATTGAACGTGTTGATGCTACTAATAATACAACACGTAAACGTTTAGGTGTTATTGCACTAGCTTCTCAAGAACAAGCAAACGTTGATTTGGAAAATAACCCAGAAAAATCTTTGGCTATTACACCTGAATTGTTAGCTAATAGAACTTCGACTGAATCTCGACGTGGTATTGCTCGTTTAGCATCTACCGCTGAAGTTAACCAAGATTCTACTTCTACTTTCTTAGATACAGTTATTGTTACGCCTAAGAAATTAAATGAAAGAACCGCAACTGAAACACGTCGTGGTTTGGCTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACAAATACTGGAACTGACGATACAACAATTGTAACTCCTAAGAAATTTGCTGCTCGTAAAGCGACAACTTCTATGGATGGTATTATTACATTAGTTAGTTCAGGCGCTATTGCTGCTTCTGATCGTGATAACCCAGGTACATTAGTTTATAATTATAACGATGCTGTTAAAGCTATCACTCCAGCTACGCTTCACGAAGCGCGTGCAACGAAAACTACTTTAGGACAAGTATACCAAGCAACTGAAACTGAAGTTATAAGTGCTCCAGTAGATAATCCACTAGTTCCATTAGCGGTTTCTCCTGAAATGCTTCATAAGAAAACTGCAACTACAACTCGTATTGGTTTTACTCAAACTGCTACTCAAGTTGAAGTTAATACAGGCACTGATAATTTTAAGTATGTTACACCTAATACTTTGAATGGGCGAATTTCTTCAGAGACATTAACAGGTATTGCTAGAATTGCTACACAGGTTGAATTTGATGCAGGTTTGTTAAATACTGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTGCTACGCATTTCTCAGATATTAACCGTACTGAAGTAATATCATCTTCCGGCCTGACTCAAAGTGGAAATCTCTGGAACCATTATACACTGAATATTCTTGAAGCAACAAGTGTTCAACGTGGTACAGCAAGATTGGCTACTCAAGTTGAAGTTGATGCAGGCGTAGAAGCTAAATCTATTGTAACAGCAGCTACTTTGTCAGGTAAAAAAGCAACTGAAACCACCGAAGGTATAATTCGTGTGGCAACACAAGCAGAATCTGTTGCAGGTACTTCAAGTATATTAGCGATTTCTCCTAAGAACTTGAAATATATTGCTCAAACAGAATCTACTTGGGAATCAACTCCACTTCGTCGTGGTTTTGTTAAAATGACTGAAGGCGCTTTAACCTGGGTTGGTAATAATACTGTAGGCAATACTCAAGATGTAGAATTATATGCAAAAAATGGTTATGCTATTTCGCCATATGAATTGAACTTGACTTTAGCCCATTATTTACCTATTGAAGCTACGGCTGTTAATAGTACTAAATTTGATAACCTAGCCTCCACTCAGTTCATACGTAGGGACATTAATCAAACGGTTGATGGAATACTAACCCTTACTAAACAATTGAATACGAGCGCTCCTGTGCTCTCCAGCTCAACTGGTACCTTTGTTGATGTTGTTGGGACTAATACAGTTAATGCTGGTAATTCTTTAGGCACTTCTTCTATTTCTATTCTTGGCAAAGCTAATAACTGGAAATTTAATGCTGTTGCTGATGGCACAACTTTATTAGTCAATGATGTATTAACTTTGAATCAAAATGGCAATGCTTCTATTAAGCAAACGCTTAATATCGGTAACCGTGCAGATTCAGTTAATGGCTATTCTGTTGGCGGGATTGTTGTTTTACAGAATAATGCTTTAACTACTGAAGTTGGTAACGTTGTTCGTCCGCTAGTATTGAAATCTCCTGATGCAAGTAATATTATTGCTGATGATGGAACTCAATATAAAGTATTAACAGAAAAAAATGCTGTTTCCGTAATTGGCAATTCATTTGTTAAGAAAATTGGCGATACTATGACAGGTCGTTTAACTGTTAATAGTGCAATAACTGTTCAGTTAGCAGAAGCTTCTATAAGTGTTATTCCTACTGAAACTACAAAAGGTATGTGGACCGCTGAAGTTACTACACCAGCACAATATAATTTACTTCCTGGTTATGCTGTTCCGGTATTTGGAACAAATCCAGATGGCAGTGATAATGCTGTTATTGTAAGTTATAATCTGGTTAAAGGCCCAGGTACATTAGTTCAAAATGGTGTTGGCACTAATTATGCTTATCAAGTATGGAATCCACGCCCAACTGCTACTGCTCCTAACCACTTTGCTCGTACTCAATGGATAAGAAACTTTAACCCATTGATTAGTGGATGGGATGAATGGGCTCGTGTATTTACAAGTCAAACGCCTCCTACTGCTTCTGATATTGGTGCTGTATCTTCTACAGGTTCAGCATTCAATAACATGACAGTTAGAGATTGGCTACAGATTGGTAATGTTCGTATTACTCCTAATGTAGCAACACGTACTGTTGAATTTGAATGGATTGATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
e83bc06aadbefea267e60d716b2b7df113ebc48957f173e141ca2c3a0f5c95fc
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5751
Evidence 0,5751
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization and complete genome sequence of Yersinia bacteriophage, fHe-Yen9-01 Jun,J.W., Wicklund,A. and Skurnik,M. 2013-12 — GenBank