Protein
View in Explore- Genbank accession
- QVW29390.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYIIDYGKESITVTPAAPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDKLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDTFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATAGTINLTLPSGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTVAGTRYWVVKQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNTDFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEVATQAETNAGTDDTTIITPKKLDARQGSEVLSGIVKYTSTTGTTAATIRGNAGTNVYNKAVDNLTISPKALDQYKATPTQQGAVILAIESEVIAGESQAGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPSWTATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQSLESYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADSNLLDGLDSLQFIRRDIDQTVNGSLSLTKQTNLSAPLVSTSTASFGSEASVTRRLTLNDSSGSEIVFTKGTQSLSNKENFVVRAWGNSATDGARDTVFEAGDETGYHFYSQRAADNRVSFNINGTLYSTGIVSTNGLNVTGVSTFTGPISATGEIVSSSPIAFRAINGNYGVMLYNAGNSSYIALTNSGDQTGTFNNLRPITINNATGLVRLDNGVQITSGATITTGGLTVNNRIISNGVKTATVYTDKPTASTVGFWSIDINDSAVYSQFPGYWTRDNKGNRDQEIKYPGTLTQFGNSLDSLYQDWICYPTGANGGSIRYTRTWQKNKDAWTSFAMVFDSGNPPSPSDVGAIPSDNAVIGNLTIRDFLQLGNVRIVPDPVNKTVKFIWVE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1277 AA molecular weight: 137758,62160 Da isoelectric point: 5,22887 aromaticity: 0,07361 hydropathy: -0,27940
Domains
Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–140
ATT
15–140
IPR048390
ATT
969–1089
ATT
969–1089
1
1277
Architecture
ATT 15-140 | STR 343-968 | ATT 969-1089 | STR 1090-1135 | ATT 1136-1225 | STR 1226-1261 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_EcoM_SQ17 [NCBI] |
2834246 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QVW29390.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW882907
[NCBI]
CDS location
range 148322 -> 152155
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACCGATGCACAATGGATAACTGTTGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACATTGCCAAATACGCCGGTTGACGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATCATTGATTACGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGGCACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTCGATTTAGATAAATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACACGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTACAGCCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTTCCGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTCGCATTACTTCAGTTCCCTAAACGTTCCGAATATCCACCTGACGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACCGTTGCTGGTACACGTTATTGGGTTGTTAAACAAAACGTCCCTACGGTAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCGGCTAAAGAAGTTGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATACCGATTTTGCATTCCAAGACGACTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTGAACGAACGTACAGCAACTGAAACCCGTAGAGGTGTTGCTGAAGTTGCAACACAGGCTGAAACTAATGCTGGAACAGATGACACCACTATTATTACTCCTAAGAAATTGGATGCCCGTCAAGGTTCTGAAGTTTTATCCGGTATTGTAAAATACACATCTACGACTGGTACTACAGCTGCTACTATTCGCGGTAATGCCGGGACTAACGTTTATAACAAAGCCGTAGATAATTTAACTATTTCTCCAAAGGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCCTACTCAGCAGGGTGCAGTAATTCTTGCTATTGAAAGTGAAGTTATCGCTGGCGAATCACAAGCCGGTTGGGCTAATGCTGTAGTGACCCCTGAAACTCTGCATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAACACTGGAACTGATTATACTAGAGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCTGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGACGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCACCTAAGAATTTAAAATGGATTGTTCAATCAGAACCATCATGGACTGCTACTACGGCGATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATTACATTCGTTGGTAATGATACGGTTGGTTCAACACAATCTTTAGAATCATATGAGAAAAATAGCTATGCGGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTACTTACCGTTGAAAGCTAAAGCAGCTGATAGTAATTTGTTAGATGGTCTAGATTCTCTTCAGTTCATCCGTAGAGACATCGACCAGACGGTTAATGGTTCTTTAAGTCTTACTAAACAGACCAACCTGAGTGCTCCTTTAGTATCTACAAGCACTGCTTCTTTTGGTTCCGAAGCATCTGTTACTCGTAGATTAACTCTTAACGATTCTAGCGGTTCCGAAATAGTTTTCACTAAAGGAACCCAATCTCTTAGTAATAAAGAGAATTTCGTTGTTAGAGCATGGGGTAATAGCGCTACAGATGGTGCCCGCGATACAGTATTTGAAGCGGGTGACGAAACAGGATACCATTTCTATTCTCAGCGCGCTGCTGATAATAGAGTATCATTTAATATTAATGGAACACTTTATTCAACAGGTATTGTTTCTACAAATGGATTAAATGTTACAGGTGTTTCTACCTTTACCGGGCCTATTAGTGCTACAGGCGAAATTGTTTCTAGTTCTCCTATTGCATTCAGAGCTATTAACGGTAACTATGGTGTTATGCTTTATAATGCTGGTAACAGTTCTTATATTGCATTAACTAACTCAGGTGACCAGACCGGGACGTTTAATAACTTACGCCCTATCACGATTAACAACGCCACAGGCTTAGTTCGTCTTGACAATGGTGTTCAAATCACGAGTGGTGCAACAATAACTACTGGTGGGTTAACTGTAAATAACAGAATTATTTCTAACGGCGTTAAAACTGCTACTGTTTATACCGATAAACCAACAGCTTCTACTGTAGGTTTTTGGTCTATTGACATTAACGATTCTGCTGTATATAGCCAATTCCCTGGATACTGGACGCGTGATAACAAAGGTAACCGTGACCAAGAAATTAAATATCCTGGTACTTTGACTCAATTCGGCAATAGCTTAGATTCGCTTTATCAGGATTGGATTTGTTATCCTACAGGTGCAAATGGCGGTAGCATTCGATATACTCGTACCTGGCAGAAAAATAAAGATGCTTGGACTTCATTTGCAATGGTATTTGATAGTGGCAACCCACCTTCACCTAGCGATGTCGGTGCTATCCCATCTGATAATGCTGTTATTGGAAACCTTACTATTCGAGACTTCTTACAATTAGGAAATGTGAGAATTGTTCCAGACCCGGTTAACAAAACAGTTAAATTTATATGGGTTGAATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
9fe12ce5e5715e9cebab0f19d650fc441d86cd618c1bd554ac9ba06a037e47f5
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50