Protein

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Genbank accession
AGE60398.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MPTALQLRRGSTSQNNSFTGAVGEVSVDTDKDTLRVHDGSTAGGFEVITATATQTLTNKTLTSPNISGASFTGASFTFEGATDDSFETTLTVVDPTADRTVTIPNATTTLVGTDVSQTLTNKTLTTPVIAEIDSGGSITLDATADIILDADGANVTIKDGGTTTLDFVSNGATDITLDAPGDVKIDADGGDIIFMDGGAVYGSATNNSGNLIIKSGTTTAATFSGANVTLAGTVASGAITSSGSFTGTQAILSNASPLVFEGATADSFETTIAVTDPTADRTLTLPDATDTLVGRATTDTLTNKTLTTPVIAEIDSAGNFTVDAATDIILDADGGDVFLKDAGTTYGSLTNTGGNLIIKSGTTTAMTMSGANVTIAGNLTVSGSTTTVDSSTVNLQTGFVFEGSTADSFETTLVATDPTADRTVTIPDLTGTVSLITATETLTNKTLTTPVIAEIDSGSTITLDATTDIILDADGDNITLKAGGTTALDFVLNGTTDITLDAPGDIKIDADGGDIFFLDAGTTYGSATNNSGNLIIKSGTTTAATFSGANVTLAGTVASGAITSSSTVTATGAVLSGSVVFEGATNDSFETTLGVVDPTADRAVNIANVAGTLQPFAAASTDAITATPAELNLIDGGTARGTTAIADGDGVLINDGGTMRMTTVETLAAYMDDEITAMPNLVTTGALNSGSITSGFGTINNGSSTITTTGQITGGIIQSTNNMLIGAGYSLVFEGSTNDSFETTLGVVDPTADRTVNIANVAGTLQPFASASTDQITATVAEINLIDGGTARGTTAVADGDGILINDAGTMRMTNVQTVSAYMSAESVGGSNIVTTGALNSGSITSGFGNIDNGSSTLDTGALTATTIAGTTITASTGVETKNGATGAGFVKFFEDSDNGTNAVTLVGPASTGDITITLPTQAGTVVVSNTTDGNDVQLDSLGLNTAASGTAGELRATNDITAFYSSDIALKENIINIPSPLEMIKKINGVFFDWKDSFIESKGGEDGYFVRKRDVGVIAQDVEKVMPEIVGTRPDGIKAVKYDRLVSVLIEAVKELTDEVTELKKKQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1068 AA
molecular weight: 107670,18510 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,04401
hydropathy:0,08755

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.30
ATT
1–53
G3DSA:2.10.10.30 DC_1617 DC_0203
IPR041352
ATT
6–41
IPR041352 IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
967–1068
IPR030392
AGE60398.1
1 1068
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 1-53 | STR 78-397 | RBD 940-1068
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC008M
[NCBI] 		1283076 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062
[NCBI] 		335992 Bacteria > Proteobacteria > Alphaproteobacteria > Pelagibacterales > Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGE60398.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC465899 [NCBI]
CDS location
range 51699 -> 54905
strand +
CDS
ATGCCAACAGCATTACAATTAAGACGAGGATCAACGTCTCAAAATAATAGTTTTACAGGTGCTGTAGGTGAGGTAAGTGTAGATACTGATAAAGATACTCTTAGAGTCCATGATGGCTCGACAGCAGGCGGTTTTGAAGTAATAACGGCAACTGCTACACAAACACTCACAAACAAAACCTTAACGAGCCCAAATATTTCAGGCGCCTCTTTCACAGGTGCAAGTTTCACTTTTGAAGGTGCAACAGATGACAGTTTTGAAACAACTCTAACAGTTGTAGATCCAACAGCTGACAGAACAGTAACTATTCCAAATGCAACTACTACACTAGTTGGTACGGATGTTTCACAAACTCTTACGAACAAAACTTTAACTACACCAGTTATCGCTGAGATAGATAGTGGTGGTAGTATAACTTTAGACGCAACAGCAGATATTATATTAGACGCTGATGGTGCTAACGTAACTATAAAAGACGGCGGTACAACAACATTAGACTTTGTTAGTAACGGTGCAACAGATATTACACTAGACGCTCCAGGCGATGTTAAAATAGACGCTGATGGCGGAGACATAATCTTTATGGATGGTGGTGCTGTCTATGGTAGTGCAACAAACAATTCAGGTAACTTGATTATCAAATCAGGAACTACAACAGCTGCAACATTTAGTGGTGCAAATGTAACATTGGCAGGTACAGTTGCTTCAGGTGCAATTACATCATCTGGTTCATTTACTGGTACTCAAGCAATATTATCAAATGCAAGTCCATTAGTATTTGAAGGTGCAACAGCAGATAGTTTTGAAACAACTATTGCAGTTACAGACCCAACAGCAGATAGAACACTTACATTACCAGACGCAACAGACACATTAGTGGGAAGAGCAACAACAGATACGTTGACTAATAAAACACTAACTACTCCAGTTATTGCTGAAATAGATAGTGCTGGCAACTTTACAGTTGACGCAGCTACAGATATCATATTAGACGCAGATGGCGGAGATGTTTTCTTAAAAGACGCTGGTACTACTTACGGTTCATTGACGAACACAGGCGGTAACTTGATTATAAAATCAGGTACAACTACTGCTATGACCATGTCAGGTGCAAACGTAACAATCGCAGGTAACTTAACAGTATCAGGTTCTACAACTACAGTTGATAGTTCAACAGTTAACTTACAAACAGGTTTCGTTTTTGAAGGTTCAACAGCAGACAGTTTTGAAACAACACTAGTTGCTACTGACCCAACAGCAGATAGAACAGTAACTATACCAGATTTAACTGGTACAGTTTCTTTAATAACTGCTACAGAAACATTAACAAATAAAACACTTACAACTCCTGTAATTGCAGAAATAGATAGTGGTTCAACAATCACACTTGACGCAACTACAGACATTATCTTAGACGCTGATGGTGATAACATCACTTTGAAAGCGGGTGGTACAACTGCCTTAGATTTTGTTTTAAATGGTACAACTGATATTACATTAGACGCTCCAGGTGATATTAAGATAGACGCTGATGGCGGAGATATTTTCTTCCTAGACGCAGGTACTACTTATGGTAGTGCAACTAATAACTCTGGTAACTTAATTATAAAATCAGGTACAACTACAGCTGCAACATTTAGTGGTGCAAATGTAACATTAGCAGGGACAGTTGCTTCAGGTGCAATCACATCATCAAGTACAGTAACAGCAACAGGCGCAGTATTAAGTGGTTCTGTAGTATTTGAAGGTGCGACAAACGACAGTTTTGAAACAACATTAGGTGTAGTTGATCCAACTGCTGACAGAGCAGTCAACATCGCCAATGTTGCAGGTACATTACAACCATTTGCTGCTGCTTCAACAGACGCAATCACAGCAACACCGGCAGAATTAAATTTAATTGACGGTGGTACTGCTAGAGGCACAACAGCAATTGCAGACGGTGATGGTGTACTAATCAATGACGGCGGTACAATGAGAATGACTACAGTTGAAACTCTTGCTGCCTACATGGATGACGAAATTACAGCAATGCCAAATCTTGTGACAACAGGTGCATTAAACTCAGGTTCAATCACATCAGGTTTTGGTACTATAAACAACGGTTCATCTACAATCACAACTACAGGTCAGATAACTGGTGGTATTATTCAATCTACTAACAACATGTTAATAGGTGCAGGTTACTCACTTGTATTTGAAGGTTCAACAAATGATAGTTTTGAAACAACATTAGGTGTAGTTGACCCAACTGCTGATAGAACAGTTAATATTGCAAATGTAGCAGGTACTTTACAACCTTTTGCTTCTGCTAGTACAGACCAAATTACGGCAACAGTTGCTGAAATTAATTTAATAGATGGTGGTACTGCTAGAGGTACTACTGCTGTAGCAGACGGTGATGGTATTCTAATCAACGATGCTGGTACAATGAGAATGACGAATGTTCAAACTGTTTCAGCGTATATGTCTGCTGAAAGTGTTGGTGGTTCAAACATAGTTACTACTGGTGCATTAAACTCAGGTTCAATCACTTCAGGTTTTGGTAACATAGATAACGGTTCATCTACATTAGATACAGGTGCCTTAACGGCAACTACAATTGCAGGTACAACAATTACTGCTTCTACTGGAGTAGAAACAAAAAATGGTGCTACTGGTGCCGGTTTTGTTAAATTCTTTGAAGATAGTGACAACGGTACTAATGCAGTAACTTTAGTAGGTCCTGCTTCAACAGGTGATATAACGATTACTTTACCAACTCAGGCAGGTACAGTTGTTGTATCAAACACAACAGACGGTAATGATGTACAGTTAGACAGTTTAGGTCTTAATACTGCCGCTTCAGGTACTGCTGGTGAGTTAAGAGCAACAAACGATATTACTGCCTTCTACAGTTCAGATATAGCGCTTAAGGAAAACATTATCAACATTCCTTCTCCACTTGAAATGATTAAGAAAATCAACGGTGTATTCTTTGATTGGAAAGATAGTTTCATTGAGAGTAAAGGTGGCGAAGACGGATACTTTGTAAGAAAAAGAGATGTTGGTGTTATCGCACAAGATGTTGAAAAAGTTATGCCAGAAATCGTTGGTACAAGACCAGACGGTATCAAAGCAGTTAAATATGACAGACTAGTATCAGTATTGATTGAAGCTGTTAAAGAATTAACAGACGAAGTTACAGAATTAAAGAAAAAACAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1e18d38906e5a543622474a0209319a7d8ec1a256fc43ee94acc40a59cf23fdf
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2923
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50