Protein

Genbank accession
YP_010355196.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,85
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MALTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDDIDNRGNSSLRPFKSLQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPSEYIIDNRPGEILYTNIPPLDSNSNMDITSPNNVLYKFNSVEGGVIVPRGCSLVGMDLRRTKIIPKYVPYPTTYPAKGINTEDQVPSKTAVFRVTGGCYFWQFSFFDGDSSGVYFKPDDSELIPPSYSHHKLTAFEFADGTNTLSQLINDLGTVENSSEITGSSIPNLLERTDLDIYYQKVSRGFATIPDTSGDPATDQIQARVEENRIVGPISDEFRVLQITRNGNTATAITVDEQGNPKNHGFSVGVNVNISGVTGSTGPQTDLDAQNYNGSFAVTSASGNVFTYQLAEEPSGNAIGSNIVVKVEIDTVDSASPYIFNLSLRSTWGMCGMHADGAKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVKYNSTTGNYDEGGPGAHLDGFAEYKKGWRSTHVMCSNDSFVQVVSVFAVGYADHFAGYQGADMSITNSNSNFGNTALRSKGFKRASFTKDKAGTITHIIPPKSLSDVDEISANWTNIDIKRTKDINNALAGQGGTLGSRLYIYGYTNVNAPPPNKVQGYVIGARQDGIGAAAVPDKLYCLLIASGATSPTIQAAEINPFGPDVSGTVAGGDGSPLQYDANTYTINGVANEVGGWYLSVNSTNNEIYQTLVNNTATYNNLNFTPTTFIKRVPDARNLTDRTYRVRYVIPKEQNPPLPRSPIAGFVLQPYNTDNTAYQLNKCYYIYDITEVSKFERGVTDGIFYLTLLCGSIAPTTSNFDDMAFSQNVNEVYPAFDRDNPNSDPEPSISVADNETIGLVYGTDGAQPTPARDDQRSITKEAVLFLLNDSGWVAGSSPGWNSINETLSDIPLTSRLGDEEARKIPILQDSADNDALVPINVELRRHSILRSGNHTFEYTGFGPGNYSTAFPQTQVETLTDEQIRLSQSLKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITSEDIAQLNVLGEENTTIETFSEVVVTDKLTVIGGASNNLESIFSGPVTIQGTLTAQKEFIAKKLTYNNQDGTVLKSTLLAPELKTGTPPVGQGVPDLSNILNYNAPSDGDILYNIDWSPGSNLGWMYYEGAWVKFGLTNTGVFQFGAYGGASAQNIGLGRAASTTYRLEVDGSQRITGDLRVDGRGGVAPDKYLTRRTQGDGSTLNYQITSYSGVVHTSKSLIVTINGVLQHPDVNYTVDSNGTNVVFASGDAPTTSDYVEIRELPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1264 AA
molecular weight: 137060,23170 Da
isoelectric point:4,73312
aromaticity:0,09494
hydropathy:-0,31835

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014d
[NCBI] 		1493509 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010355196.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_062734.1 [NCBI]
CDS location
range 22580 -> 26374
strand +
CDS
ATGGCACTTACTCGTCTTAAGAATATTATCACGTCCCGTACGGGTCGTATCATTTATGTCAACCCCGATGACTTTGATGCGAGTGATGATATTGATAACAGAGGAAACTCTTCCCTCCGACCATTCAAATCCCTGCAACGTGCGTTTCTTGAAGTAGCAAGATTTTCGTATAGAGTGGGTTTGTCTAATGACGAGTTTGATGCCTTCAGTATCATGCTCTATCCTTCTGAGTATATTATTGATAATCGTCCTGGTGAGATTCTATACACTAATATCCCACCATTGGATAGTAATTCCAATATGGATATTACTTCTCCCAATAATGTATTATATAAATTTAACTCCGTTGAAGGTGGTGTAATCGTACCTAGAGGTTGTTCTTTGGTCGGTATGGACCTTAGAAGAACGAAAATCATTCCTAAGTACGTTCCATATCCTACAACTTATCCTGCTAAAGGTATTAACACAGAGGATCAAGTTCCTTCTAAGACTGCTGTTTTCCGTGTTACTGGTGGTTGTTACTTCTGGCAGTTCTCATTCTTTGATGGTGATTCAAGTGGTGTATATTTCAAACCAGATGATTCTGAACTGATCCCACCATCATACTCTCACCATAAACTAACAGCATTTGAGTTTGCTGATGGTACTAATACTTTAAGTCAACTAATTAATGATCTTGGAACTGTAGAGAACTCTTCAGAGATTACTGGTTCTTCTATCCCTAACCTGCTAGAAAGAACTGACCTTGATATTTACTATCAGAAAGTATCTCGTGGTTTTGCTACTATTCCCGATACTTCTGGTGATCCTGCAACTGACCAGATTCAGGCAAGAGTAGAAGAAAATCGTATTGTTGGACCGATTTCAGATGAATTTAGAGTTCTCCAAATTACACGCAATGGCAACACTGCTACAGCAATTACTGTTGATGAGCAAGGAAACCCAAAGAACCACGGATTTTCTGTCGGCGTTAACGTTAACATTTCTGGTGTCACTGGATCTACTGGACCACAAACAGACCTAGATGCACAAAACTATAACGGATCATTTGCTGTAACTTCAGCATCAGGTAATGTCTTTACATATCAATTAGCAGAAGAACCTAGTGGTAATGCTATCGGTTCTAATATTGTTGTTAAAGTTGAAATTGATACTGTAGACTCTGCTTCTCCATATATCTTCAACCTGTCCCTAAGATCCACTTGGGGCATGTGTGGTATGCACGCTGATGGTGCTAAGGCAACAGGATTTAAGTCCATGGTTGTTGCCCAGTTCACTGGTTTGAGTCTTCAAAAAGATGATAGAGCGTTTGTTAAATATAACTCTACGACAGGAAACTATGACGAGGGTGGTCCTGGTGCTCACCTAGATGGTTTCGCTGAATATAAGAAAGGTTGGAGAAGTACACATGTTATGTGCTCCAATGACTCATTTGTTCAGGTTGTTTCTGTGTTCGCGGTTGGATATGCTGACCACTTCGCTGGTTATCAAGGCGCTGACATGTCTATTACTAACAGTAATAGTAACTTTGGAAACACAGCTTTAAGATCAAAAGGGTTCAAGAGAGCATCATTTACCAAGGATAAAGCGGGTACGATTACTCATATTATTCCTCCCAAGTCCTTGTCAGATGTTGATGAGATCTCTGCAAACTGGACTAACATTGATATTAAGAGAACCAAAGATATTAACAACGCTCTTGCTGGTCAAGGTGGCACACTTGGTTCCAGATTGTATATCTACGGATATACTAATGTTAATGCACCCCCACCGAATAAGGTCCAAGGTTATGTTATTGGTGCCAGACAAGATGGTATCGGTGCTGCTGCTGTACCTGATAAACTTTACTGCCTATTGATTGCTTCTGGTGCAACTTCGCCAACTATTCAAGCAGCAGAGATCAATCCATTCGGTCCTGATGTATCTGGAACCGTTGCAGGTGGTGATGGTTCTCCTCTGCAATATGATGCCAATACTTATACTATTAACGGTGTAGCGAATGAAGTTGGTGGGTGGTACTTATCAGTCAACTCAACTAATAATGAGATCTATCAGACTCTAGTTAATAACACTGCAACATATAACAATCTAAACTTCACTCCAACAACATTTATCAAGCGTGTTCCTGACGCTAGAAACCTTACTGACAGAACATATCGTGTTCGTTATGTAATTCCTAAGGAACAGAATCCACCCCTTCCTCGTTCACCTATTGCAGGATTCGTACTTCAACCATATAATACTGACAACACTGCATATCAACTGAATAAGTGTTACTATATCTACGATATCACTGAGGTATCAAAGTTTGAACGTGGTGTCACTGATGGTATATTCTATCTGACTTTGTTGTGTGGTTCTATTGCACCAACTACATCAAACTTTGATGATATGGCGTTCTCTCAGAACGTAAACGAAGTATATCCTGCTTTTGATAGAGACAATCCTAATAGTGATCCTGAACCTTCAATATCTGTTGCCGATAATGAAACTATTGGTCTCGTATATGGTACTGATGGAGCACAACCAACCCCTGCAAGAGATGATCAGAGATCAATCACTAAGGAAGCAGTATTGTTCCTTCTAAATGATAGTGGTTGGGTCGCAGGTTCTTCTCCTGGTTGGAACTCTATTAACGAAACTCTATCAGATATCCCACTCACTTCTCGTCTTGGTGATGAAGAAGCGAGAAAGATTCCTATCCTTCAAGATAGTGCAGACAATGATGCTCTTGTTCCAATCAACGTAGAACTTCGTCGTCACTCTATTCTTAGATCTGGTAATCACACGTTTGAGTATACTGGTTTCGGTCCTGGTAACTATTCCACGGCATTCCCACAAACTCAGGTTGAGACACTAACTGATGAGCAGATTAGACTATCACAGTCTCTCAAAGAAGAGGCAGGAGTTGCATTCTATTCGGGTCTAAACTCTAATGGTGACCTATTCATTGGTAACCAAGTTATTAACCCTGTTACGGGTCAGATTACATCTGAAGATATTGCTCAGTTGAACGTTCTTGGTGAAGAGAATACTACTATTGAGACATTCTCTGAGGTTGTTGTTACTGATAAACTCACTGTTATTGGTGGTGCATCAAACAACTTAGAATCTATTTTCTCTGGTCCTGTAACGATTCAGGGCACGTTAACAGCACAGAAAGAATTTATTGCTAAGAAACTTACATATAACAACCAAGATGGTACAGTTCTTAAGTCTACATTACTAGCACCTGAGTTAAAGACAGGCACTCCACCTGTTGGTCAAGGTGTACCTGATCTAAGCAATATTCTGAACTATAATGCACCTTCTGATGGTGACATTCTTTATAACATTGACTGGAGTCCTGGATCTAATTTAGGTTGGATGTATTATGAAGGTGCTTGGGTTAAGTTTGGTCTAACTAACACTGGAGTATTCCAATTTGGTGCCTATGGTGGTGCTTCTGCACAGAATATTGGTCTCGGTCGTGCTGCTTCTACCACATATAGACTGGAAGTAGATGGATCCCAGCGTATTACTGGAGACCTGAGAGTTGATGGACGTGGTGGAGTTGCCCCTGATAAGTATCTCACAAGGAGAACACAAGGTGATGGTTCAACATTGAACTATCAGATTACGTCCTATTCTGGTGTTGTTCATACTTCCAAATCTTTGATCGTTACTATCAACGGTGTCCTTCAACATCCTGATGTAAACTATACTGTAGACAGTAATGGTACTAACGTAGTGTTTGCCTCAGGCGATGCACCTACGACTAGTGATTATGTTGAAATTAGAGAGTTGCCAATCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
4c8fdc0a53014e0572ad66f2e5cb604ab672b6cd230524425d5f8191901ae6ea
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,3412
Evidence 0,3412
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank