Protein

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Genbank accession
AMO43344.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSFKFNSDREQIRAISPSLIGGSELTIRGGVGSNEREILRTLLDPGTSLPRVGINRTGQRIDNISVTNPGGGYTDIPTITVAPPPIGGVQSFASAQISEGRLVGVVIDNPGSGYTSAPAVSISGGNGVGAAATAFLDTVDFELDINGAIRTSTSIISDTARILNLDIENLVTPDAQYRAPNLKTFINNTGVPWARDTFIQENTFVYRGANVYQSLNEGTTDSNPLNPPIHSDGIVLNGNDLDDAIPGVQFKHIGFRVSNPNEVYYNETGEAGLYPRSITPLLGDKSDKIATTEYVLNLATNDVGGRVYVSQQIGNDENDGRSAVAPVRTIKKAAQIAWTTPGIKETLIVSGGNYVEDNPISLPPDCSVVGDNLRLVIIRPNNPRKHIFKFGDKNYVTGVTYRDYVDSDGDEQHTWDFAMVFDDKQRVTYDYDVNGDFGTSFPVGHQVFGEQIFRATFQSNTGLQNLTANQTLRGENAGGLILSRNVNFDLVSGPSAYITGSFDFVVTNGSVSTGETLFFAGAGSQRFQINTAYDLNDLVWTEDHLYQVTVAGTSSTSNPTHDTGAVTNGTAEFTYLRDTYSLVTTDIISIRAEGEVVFEDTDIQSVLPIFRIDFSQQGQAAIASGGFGDYGTPEDLGGIIFYTNPLVEDDNIHDFKEGQTIEITGMPTSAPDLSALNGKQRIYKVIEDPDGRSRRFVIPKKYPSLTNDNFTGFSLDASVKSYAKSVTFSLLNSPFEFNEATPVARRFQDAGLQIKNNREFIADEVVGRINDEFKKDYFAAYEIGGTPTTTLTPTNTTYNPATGIATFTVASHGLSDGDGVRIVDGSITFTCAMDGNKTEHSYPDSHHYSSGKSLPVENATTNTFELNVGISGPDQQFTPITASYNPATGDLVLDLDTAHGLSVGEGIVIADNSLSFTCSMDNYDSTKTYPRPGIDPYAGRSIPITAVPSDTEITLNVGISGPNKTFTPTNATYDPVTGDMTVTVGQHGLGVGRGIVIENNSFTFTCATDGNAEQKTYPRSGEDPYADGKSIPITAVGSTSHTVTNATYNPVSGIVELTIPSHGFTQGDYIKLDDLSLVFSCELDGNVTNKAYPRAGYDYPSGRWLQISEVAANTFRIDIGSSSYTGAHTFVSAVSNGLKLQDGTFTVNVGAISSPSDQSAHTFVTAQTNAIRHNPQSAHTFQGATSNAIKHLPQSAHTFIRSAPDSLVVGGSEFKIFLGTSRFIHEYVSGGTVTFGGTTANITNFVYDNVINGTAVVSMDQSLGALAEDDIVQIADITLRCVVNGVTTEKTYPSFNIPVSDDKCRRDIRHFLNALVEDLEFGSNNNIVSAARRYVDGTTTQIDFVDNEIIQTVRAIEYARELAIFAMSKWRTGNRTPTDPVYTPQYSTLPRYFDATIIDDGQSPACANVASAIDTLSYLFVDVLANDSSGTVLDAAYLIARNRHHIADEAYNLAITNYPSLGLINIDERKCRRDINFILSGWIRDLVLGGNSGTVTNAEAYFNGGQLAGIPQSELGATLFAFEKTRDLAIAAMRNWKTATGTSYPAATHTPIPRFTDATILADPNGNPLCADVESSITTLHALLEDILDSTIAPGATTKNTGTLFDIAGIINYADSTITDARGNIITVKSTFDDYPIIEASPYTQNASIISRLGGSGALIDGSKVKQPNCPRAGLTQLGEAKFPNQGKSMVAAAFTIVAEGGIGYKIIEDGYVQLVSVFCIFCQDGVLAESGGYASITNSATNFGIFALRSRGFRREAYEFDVATINNVSSTPTGRTIFSVSGLGREPLEHYVVKIDGYENANPDIEYFVDVVEGVTVGPPFSAQITLESGSGGSAEFRDLSNNAIVSLASLVGETVRLHRPSIVNSSSHTWEYAGSGTSYLALPENGGTKVESNEQVSEDYGRTYVSGTDELGDFKVGTFARIENRTGNITFTGTVTISEVEFLKLKGGDVVVTGFDNSNTLGGANTTDSKLPTQKAVKDFVTNNLGPFINKPYSTNPVPRALVELTDSGKISEDQIPPLRPFQVYTVGPGERTTVEGALAGDIAIEQSTPPVSFILNNDNDSLFLGFPVDSTLSFTIGDIFTGDLSGGKIQATEYRTGVLYQINLTDSGSGYITPPVVTIAGTTQAGGIQAAATTQIANGQVVLIEIVAFNGFIGGKGYTSAPTITIAAPAGSGTQATAVGLIESRLYGDIVNNIKITDTDDIESSDLPAETINITRVTNTSGSNTLNWISLSSDAISANQITSGIISTARLASNASGETSAANSFTFLRGDQAYAPAVQTMKGPETRYFGILKTTASTNASQLVFEGSTQFGLGHDVKNNVVGIQADTNIDGILTENGETTVSIDKFLTATLPAGTVVEFDRGASPITFESSQTQGEFVDSIVIQNGGSGYDNGPFFNVPIGGGNGTGLRANIFTTNGAVTGVTIVSGGSDYGQNTQAQSVDFICDIPSELGTNGTGLVLLAKVTTVLRQYANVAIDINRVTNQTLNQDDFGTLGVARFKKSQFVIGVSGNGSVEINTGPDSGLDADTLDGAQGAFYLNAGNLNAGFLKIERLSGTYNIGISGRSGSTIKLITSTNSPTGNLAPNEFSEGVICDTKNNSADGLFDGGTRHMVMTFRAGGSDFDATFGGVRQLAITDGSPLNGGNLWLRGSHTSPANAFGGWNLLWHSGNDGIGSGLDADRLDSRQGSWYQNAVNINEGILANNRIPVHQTARDFNEKIRIVDWTGTPRYQMLIRDELLGGAAPFLPGQSVNLYDAGDNGVGSISISKVTPYQDVNDSSNNFTIIVGSLTTGDFVDSNGNTIAKFIGTGGVANAYEFQDWSISNLDDNADGDVDGTFEVIDMLSDGGNARLKLGRIDGQQSSDPSIYFRSSQSPASNYNSAFIASGGNAGDGSGSLELKVADEYAFTINGNYFWNQANIAFNATNIAPTTNNQGVITVRSGVMRDVNGNFEAGTITADLTGAASENVLKAGDTMSGSLTIGGVTAANQALEVSGRADFLSNITVGDDLTVGSDVFHVDATDNAVGFGTSTPDTGIPIHVFKGSVTNDSIATVMKLETTRGDFVSTPGGSQIMFKNQDGNNSPNEAFIQAVTVNANTYGDNDEANTNFIFRQTNGGTAQDNMIITGDGRVGINEMNPTEKLHVAGNIKVDNSITAIEGLTLGTTANNDEAPIYFLGNTGGLVGGGPDQLSNFRMGNGILSGDIFEITANDGTVGATSWKSTPALAIQGTNNRVAINTDSFQGNDPEDNTLRTYTLNIEGDVNFNGTLFQNNGEFVTSRWTEAPNEADIYRPSFVGINFQTDRNPEEALEVEGNIEVSGNLQINGDVQWIDTYGVIRTTRQTIDEDISIANSTNALSHGIVNINNTRTVTVGAGAIWTIV
Physico‐chemical
properties
protein length:3380 AA
molecular weight: 359277,90600 Da
isoelectric point:4,51537
aromaticity:0,08284
hydropathy:-0,19731

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM44
[NCBI] 		1278485 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Vellamovirus > Vellamovirus rhodeisland44
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AMO43344.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU594607.1 [NCBI]
CDS location
range 94231 -> 104373
strand +
CDS
ATGAGCTTTAAGTTTAATTCTGACAGAGAACAAATAAGAGCAATCTCTCCTTCTCTTATCGGAGGCAGCGAACTCACTATTAGAGGTGGGGTTGGATCTAATGAGAGGGAGATTCTCAGAACTCTACTTGACCCAGGAACCAGTTTGCCTCGCGTTGGTATCAACCGAACTGGTCAAAGAATTGATAATATTTCTGTAACTAACCCAGGGGGAGGTTACACCGATATCCCGACAATCACTGTTGCACCACCTCCTATTGGTGGTGTTCAATCATTTGCGTCTGCTCAGATTTCTGAGGGCAGACTTGTTGGTGTTGTTATTGATAATCCTGGTAGTGGATATACATCTGCTCCTGCTGTAAGTATCAGTGGTGGAAATGGTGTAGGTGCTGCTGCAACCGCATTTCTAGACACGGTTGACTTTGAACTTGACATTAATGGTGCTATCAGAACATCTACGTCTATCATTTCTGATACGGCGCGAATTCTAAACCTAGACATTGAAAACCTAGTTACTCCTGACGCACAATACAGGGCACCAAATCTCAAAACATTCATTAACAATACAGGTGTTCCTTGGGCGCGTGACACATTTATTCAGGAGAATACTTTTGTATATCGTGGAGCTAATGTTTATCAATCACTGAATGAAGGAACAACTGATTCAAATCCACTGAATCCTCCTATTCATAGTGATGGAATTGTATTGAATGGTAACGATCTGGATGATGCTATTCCAGGTGTTCAATTTAAGCACATTGGTTTCCGTGTATCGAACCCCAACGAAGTATACTACAACGAAACTGGAGAGGCTGGTCTCTACCCAAGATCTATCACCCCTCTCTTGGGTGATAAGTCGGACAAAATTGCTACTACAGAATACGTCCTCAACCTAGCAACAAATGACGTTGGTGGTCGTGTCTATGTTTCTCAGCAGATTGGTAACGACGAAAACGATGGACGTTCTGCTGTTGCTCCTGTTAGAACTATTAAGAAAGCAGCACAAATTGCATGGACTACACCTGGCATTAAAGAAACACTTATTGTTTCGGGTGGTAATTATGTAGAAGATAACCCAATTTCACTGCCACCAGATTGCTCAGTTGTTGGTGACAACCTGCGTCTGGTTATCATTAGACCAAATAACCCAAGAAAGCACATCTTTAAGTTCGGTGACAAGAACTATGTCACTGGTGTTACTTATAGAGACTATGTTGACTCAGATGGAGACGAGCAGCATACATGGGACTTTGCTATGGTCTTTGACGATAAGCAAAGAGTTACTTATGACTATGATGTTAATGGAGATTTTGGAACTAGTTTCCCAGTTGGTCACCAAGTTTTTGGTGAGCAAATTTTTAGAGCAACCTTCCAGTCAAATACTGGTCTACAAAATCTAACTGCCAACCAGACACTAAGAGGTGAAAATGCTGGTGGTCTGATTTTATCTAGAAATGTAAACTTTGATTTGGTATCAGGACCATCTGCGTATATAACAGGATCATTTGATTTTGTTGTAACTAACGGTTCTGTTTCAACTGGCGAAACACTATTTTTTGCTGGCGCAGGATCACAAAGATTCCAGATTAATACTGCATACGATTTAAATGATCTTGTATGGACTGAAGATCATCTATATCAAGTAACAGTTGCTGGAACATCATCAACAAGTAACCCAACACATGACACTGGTGCTGTAACAAACGGAACAGCTGAATTTACATATTTGAGAGATACTTACTCATTAGTAACTACTGATATTATCTCAATTCGAGCTGAAGGTGAGGTTGTCTTTGAAGACACTGATATTCAATCTGTTCTTCCTATTTTTAGGATTGACTTCTCTCAGCAAGGTCAGGCAGCAATTGCTTCAGGTGGTTTTGGAGACTATGGAACACCAGAAGATCTTGGTGGCATTATCTTCTACACAAACCCACTTGTAGAAGACGACAACATCCATGACTTTAAAGAAGGTCAGACGATCGAAATCACTGGTATGCCTACTAGCGCACCAGATCTATCTGCTTTGAATGGTAAGCAAAGAATTTACAAGGTTATCGAGGATCCTGATGGCAGATCAAGAAGATTTGTTATTCCTAAGAAGTATCCATCACTAACAAACGACAACTTCACAGGATTTTCTCTTGATGCTTCTGTCAAGTCATATGCCAAGTCTGTAACTTTCTCCCTTCTAAACTCTCCATTTGAATTTAATGAAGCAACTCCTGTTGCAAGGAGATTCCAAGATGCTGGTCTGCAAATTAAGAACAATAGAGAATTTATTGCAGATGAAGTAGTTGGTCGCATCAATGATGAATTTAAAAAAGATTACTTCGCTGCTTATGAGATTGGTGGAACACCAACTACAACATTAACACCAACAAATACAACTTATAATCCTGCAACTGGTATTGCAACATTTACTGTTGCAAGTCATGGTCTCTCGGATGGAGATGGCGTAAGAATCGTTGATGGGTCTATCACGTTCACTTGTGCCATGGATGGCAACAAGACTGAGCACTCATATCCAGATTCACATCATTATTCTAGCGGCAAGTCTCTTCCTGTCGAAAACGCTACTACAAATACATTTGAACTTAACGTTGGTATATCTGGTCCTGACCAACAATTTACTCCTATTACAGCGTCATATAATCCTGCTACAGGTGATCTAGTCTTAGACTTAGATACTGCTCATGGTCTCTCTGTAGGTGAAGGTATTGTTATTGCCGATAATTCATTGTCCTTCACTTGCTCAATGGACAATTATGATTCTACCAAAACATACCCACGTCCAGGTATTGATCCTTATGCTGGTAGATCAATTCCCATCACAGCAGTTCCATCTGATACTGAAATTACCCTAAACGTTGGCATTTCTGGTCCAAATAAAACATTCACCCCAACTAATGCAACGTATGATCCTGTAACTGGTGACATGACTGTCACTGTGGGTCAACATGGTCTTGGAGTCGGTCGTGGTATTGTTATTGAGAACAACTCATTTACATTTACGTGTGCAACTGATGGCAATGCAGAACAGAAGACTTATCCACGTTCTGGTGAGGATCCATATGCAGATGGGAAGTCTATCCCCATTACTGCGGTTGGAAGCACATCACATACAGTAACTAATGCAACTTATAACCCTGTATCTGGTATAGTCGAACTGACTATTCCAAGTCATGGATTTACTCAGGGTGATTATATTAAACTAGATGATCTTTCACTGGTCTTCTCTTGTGAACTAGATGGTAATGTAACTAATAAAGCATATCCTCGTGCTGGATATGACTATCCATCTGGTCGCTGGTTACAGATTAGCGAAGTAGCAGCAAATACATTTAGAATCGATATTGGATCTTCATCTTATACTGGAGCACACACTTTTGTTAGTGCAGTTTCTAATGGTCTGAAACTCCAAGATGGAACATTTACTGTTAATGTTGGTGCAATCTCAAGTCCTTCTGATCAGTCTGCACATACCTTTGTAACTGCTCAAACTAACGCGATTAGACATAATCCACAGTCTGCTCATACTTTCCAAGGTGCAACTTCTAATGCAATCAAGCATCTACCACAGTCTGCACATACATTCATTAGATCTGCTCCTGATTCACTAGTTGTAGGTGGTTCTGAATTCAAGATCTTCTTAGGAACTTCTAGATTTATTCATGAATATGTAAGCGGAGGAACAGTTACATTTGGAGGAACTACAGCAAATATCACAAACTTTGTTTATGATAATGTTATCAATGGAACTGCTGTCGTTTCGATGGATCAGTCTCTAGGAGCACTAGCAGAAGATGATATTGTTCAGATTGCAGATATTACGCTGCGTTGTGTCGTCAATGGAGTAACTACAGAAAAAACTTACCCAAGTTTCAATATTCCAGTCAGTGATGATAAGTGTCGTAGAGACATCAGACACTTCCTCAATGCACTAGTAGAAGACCTTGAGTTTGGAAGCAATAACAATATTGTTTCTGCAGCAAGAAGATATGTAGATGGAACAACCACTCAAATTGATTTCGTTGATAACGAGATTATTCAAACTGTTCGTGCTATTGAATATGCTAGAGAACTAGCTATCTTTGCTATGAGCAAATGGAGAACTGGAAACAGAACTCCAACGGATCCTGTCTACACACCTCAATATTCTACTCTGCCAAGATATTTTGATGCCACTATCATTGATGATGGACAGTCACCTGCTTGTGCTAACGTAGCATCTGCTATTGATACCCTATCGTATCTGTTTGTTGATGTTCTAGCAAATGATTCTTCAGGAACTGTTCTGGATGCTGCATATCTGATTGCTAGAAATAGACACCATATTGCAGATGAAGCATATAACCTCGCGATTACTAATTATCCATCTCTTGGTCTCATTAATATTGATGAGCGTAAGTGCCGTAGAGATATCAACTTTATCCTTAGTGGATGGATTAGAGACCTTGTTCTCGGAGGAAACTCTGGCACAGTAACTAATGCTGAAGCATACTTCAACGGTGGTCAACTTGCTGGCATTCCACAATCAGAACTTGGCGCAACTCTATTTGCTTTTGAAAAGACTAGAGATCTAGCAATCGCAGCAATGCGTAACTGGAAAACTGCTACAGGAACTTCATATCCTGCTGCTACACATACACCAATCCCAAGATTTACTGATGCCACTATCCTTGCTGATCCTAATGGAAACCCACTATGTGCTGATGTAGAATCAAGTATCACAACTCTACATGCTCTTCTAGAAGATATTCTAGATAGCACGATTGCTCCTGGTGCTACAACGAAAAATACAGGAACTCTATTTGATATTGCTGGCATAATTAATTATGCAGATAGCACTATCACTGATGCTAGAGGCAATATCATCACGGTCAAATCAACTTTTGATGACTACCCAATTATTGAAGCATCTCCATATACCCAGAACGCTTCTATCATCTCAAGACTTGGTGGCAGTGGTGCTCTGATTGATGGTTCTAAGGTCAAGCA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GTGTCATCAGAACAACTCGTCAAACAATTGATGAGGACATTTCAATTGCGAACTCAACCAATGCATTAAGTCACGGTATTGTTAATATAAATAATACCAGGACTGTAACAGTTGGTGCTGGAGCAATCTGGACAATTGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
15022c56bd84ef40399da55969e5b6b5a2fc199333f255986b37ce8981cb630b
AlphaFold3
Source AlphaFold3
Method AlphaFold3
Resolution 0,8333
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The genomic content and context of auxiliary metabolic genes in marine cyanophages Marston,M.F., Martiny,J.B.H. and Crummett,L.T. 2016-12 — GenBank