Protein
View in Explore- Genbank accession
- XBA97593.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MAKKVTLPKGQTGATGTTLGQAGNILDLSDIDDIFGDTPKAKKGSPVTEFFNGIKQGLFDSVKPQQALKAFMRSAAPDGFSRMFGVYEDTMSTIRDVKDSVERTSASDLLFLTREAQDLAVKLKDKVPASVFDRLNNRLESQIENYKYAEDSNRNYKEIRRRMEAERDEDELKSAIDQVTLVQRDLAIKAEQGEVKRFAIGQAERGIRDKVSADRFDWMAKAMGQTVDNLSKLASYNEQVNYSIQKKGLEIQFRSMLHLRKIAQQTEATMELLNNGFAALVRNTGIPDHKKSSMKDLVGFNAAQRVSNSFVDNAIQTLPNFLGNFGSAVTNNATRFANENIRNFADAARAGNMFGADAWENRYNIAGQFAGSYLGDWTRNSVIPVLGRMVRPGVERFSNNYLGGRHNQASYLLDNFPAWTQEYMNNYQNTYGARGILRDIMAPFIPQFTLQDRLKTGSYQTIGQDSGFNQLTQRTIVEAIPGYLSRLLQETRMIRTGRDDITREVFDLSTGSFMSVEDSAANTERRLVSRSTVRGVSGALTDVLEAFDPNKELSIDARKALTERLIRDANMNKRFDPEAYARAGGYDRSKVSGEAIKELTEYIKRQYNIGADGRMASTNENFARRQEISTLFLDVRNFSRDPIKEIERLTNAGKTDQLREMGIIITEQGIDRINYPRIWELMSSEVKYGGWGNDNPFDRYSDTPPSDGGPGQLSPLGDQNNPHFIGPMYQSQTERKMRQAQEQVIRASKLAQEQANKGYDYAQQKVSLATDYVRDNVPNQFSELRRNINIPASMNFGDLRDQLYGQAGDMYSRAVNYSNQFNGYSDIVNQSIADLYTKANTFTPVIKGMDFLNGNLIDINTGKIVEKISDITGEIKNQAGITVVTAQEVATGLYNQRGDLLTKATDIASQLRDKAAQIAGDARERLTQGLDNVSDMAKDWYLPGREEAVILGRDLLAGEYIDTATNQIITNLKDAKGTIINRAGDVVVTAQELAKGLIRSDGFNLRRNVADASNWIQRNVLGGGSTTQKIFNAMGTVANKAKDFTIGLGKDILSNRDAYLPGMLKPVLQKVKLKAGEYYTTAGNLLKSFDEINGPVLDRDGNIVVDEEQIPELINSDGSKHTAAKNKGLFRTGLGNLARGYANMSMRYWKWLGKKSVDTAKGMAGLGYKLLGSPFKKRFSAFTGKVETQIDKKALDTTTDQLLAGIWEELRNQKPDANKPRRGSWQDLTSRVSDTLNGKNNSDEETTESKGLFGKLGDTLKNIFGKKKGDEEDEGLLEDLGLGGKKGGKWAAARQILDRGALAIGGGALSTAAAYASFGGTGASTNDKLAGAAIVTSNPIMWALKDFLIKPVLGWRGSQKFKDDLISYRMMQYGATTTDQMNKVTELEQLVSSVATRGGDASFDVRALNARDIIKIFGYSADDGPAIMRLANWIDFRFKPIFEAWLKGLSKINRSDVDISEVDSKVPNELKGQLIRSVSFPYEGNTPYLVLNNPFGEEDLSIDVASIQMKEKELLDKYSSTEKTPAAPKATSSSFKESATDVINDTITTIKSKSTDITNWFRDSTIGKAIKAVSPVESIRKMVTTVVDTIIPKANASDSLTSLQALRVHAYGMQGLDLAAVNGLLSIESLVNDKMRVANGKATYTGDIEELIKWTGQAFGMVTTSDGPDRVKVVDWLYRRFLPVFKAFIVTARSVSTSITLSQIETLTATQRLQIANAIMGATDDEGVSIWKAPSIFNIVGDMDSVEDLAKISLDEIKKEAETEVAEAPGKSKSAQIAGKNDAASGRSFASRIIDNVKSTFNSATTKVTNWMENTSARVSQVIGRAQEGITDTYYTAKYKLGAGGELTPTGQTYGQLATGNGGVWENIPMPQSNKSRDAAQATFKAVSEMTGVPVELLNIFCGIESSFNYNAKAPTSSAAGWFQFIKSTWKGMLAKYGAKFGIPADDENGSLRFDPRINALMGAMFLRDNYEYLENALGRAPTDVDLYLAHFMGPAGARKFLTRDQNSIGAEIFPDQARANRSIFFKTDGSARTLGEIYQVMENKVAKFRTGGGKNANSQSLGKPKSTEELMNDAATAKQKDMATDKELIGGAADTSITDSSNNKIGLGKIMSGMASPLRTNAPSMMLPGAPSSATDVSSGQQPVVDTGAATQATVRASQIEEQRKVVTSQDKAMLDIASEQLSVLKQFHADMLNYIKNKAANPSAQTGQEQANTIAPSQRPGRVVDNRPLPIRLR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2236 AA molecular weight: 245606,87080 Da isoelectric point: 8,68101 aromaticity: 0,07603 hydropathy: -0,46131
Domains
Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–898
STR
1–898
Coil
Unmapped
149–173
Unmapped
149–173
IPR023346
STR
1882–2014
STR
1882–2014
IPR008258
ENZ
1884–1977
ENZ
1884–1977
1
2236
Architecture
STR 1-2105 | RBD 2106-2236
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pseudomonas phage vB_PaM_W10-2 [NCBI] |
3153349 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Pseudomonas aeruginosa [NCBI] |
287 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XBA97593.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP793740.1
[NCBI]
CDS location
range 261687 -> 268397
strand -
strand -
CDS
ATGGCCAAGAAGGTAACATTGCCCAAAGGTCAAACTGGTGCAACCGGTACAACATTAGGGCAAGCCGGTAATATTCTTGACTTAAGTGATATCGATGATATTTTTGGTGATACACCGAAAGCTAAAAAGGGATCACCTGTCACTGAATTTTTTAATGGTATTAAACAAGGACTCTTTGACTCTGTTAAACCACAACAAGCTTTAAAAGCATTCATGCGGTCTGCGGCACCAGATGGCTTTTCACGTATGTTCGGTGTATATGAAGATACGATGTCAACTATTCGGGATGTCAAAGATTCTGTAGAACGTACGAGTGCTAGTGATTTACTCTTTTTAACAAGAGAAGCACAAGATTTAGCAGTTAAGTTAAAAGATAAAGTTCCAGCTTCTGTTTTTGACAGACTTAATAATCGATTAGAAAGTCAAATCGAAAACTATAAGTACGCTGAAGATTCAAATAGAAATTATAAAGAAATCCGTCGTCGCATGGAAGCTGAACGTGACGAGGATGAACTTAAATCTGCTATAGATCAAGTAACTCTTGTTCAACGGGATTTAGCTATAAAAGCTGAACAGGGTGAAGTTAAACGATTCGCTATTGGACAAGCTGAACGTGGAATACGCGATAAGGTATCAGCTGATAGATTTGACTGGATGGCTAAGGCTATGGGTCAAACAGTTGATAATTTATCTAAATTAGCTAGTTATAATGAACAAGTTAATTACAGTATTCAAAAGAAAGGATTAGAAATCCAGTTTCGTTCTATGCTGCATCTTCGGAAAATTGCACAGCAAACCGAAGCTACCATGGAATTATTAAATAATGGTTTTGCAGCACTTGTTAGAAACACAGGGATTCCCGATCATAAAAAGTCATCAATGAAGGATCTTGTTGGCTTTAATGCAGCTCAACGGGTATCGAATAGTTTTGTTGACAACGCTATTCAAACATTACCAAATTTCTTAGGTAATTTTGGATCAGCCGTAACTAATAATGCTACTCGCTTTGCGAATGAAAATATCCGTAACTTTGCCGATGCAGCTCGCGCTGGAAACATGTTTGGCGCGGATGCATGGGAGAATAGATACAATATAGCTGGTCAATTCGCTGGCTCTTATCTTGGTGATTGGACAAGGAATTCAGTTATACCTGTATTAGGTAGAATGGTTCGTCCTGGTGTGGAACGTTTTTCAAATAACTATCTAGGCGGTAGACATAATCAAGCATCTTATTTACTTGATAACTTCCCTGCCTGGACACAAGAATACATGAATAACTACCAAAACACTTATGGTGCTCGTGGTATTCTTCGTGACATTATGGCTCCATTTATTCCACAGTTCACATTACAAGATCGATTAAAGACTGGCTCCTATCAAACAATTGGTCAGGACAGTGGCTTTAATCAACTAACACAACGTACTATAGTTGAAGCTATTCCTGGATATCTATCTAGGTTACTACAAGAAACAAGAATGATCCGGACTGGTCGTGATGATATTACACGTGAAGTGTTTGATCTCTCAACTGGTTCATTCATGTCTGTAGAGGATTCAGCTGCAAACACAGAACGTCGTCTAGTTAGTCGTTCTACTGTACGAGGTGTGAGCGGTGCTCTTACCGATGTTCTTGAAGCATTTGACCCAAATAAAGAACTATCAATAGATGCTAGGAAAGCGCTAACTGAACGTTTAATTCGTGATGCCAATATGAATAAACGTTTTGATCCCGAAGCATATGCTCGTGCTGGTGGGTATGATCGTTCTAAAGTGTCCGGTGAGGCGATTAAAGAATTAACCGAATATATTAAACGGCAATACAATATTGGTGCTGATGGTAGGATGGCAAGCACTAATGAAAACTTTGCTAGGCGTCAAGAAATATCTACATTATTCTTAGACGTTAGAAACTTCTCACGTGATCCTATTAAAGAAATTGAGCGTTTAACCAATGCTGGTAAAACTGATCAATTACGTGAAATGGGTATTATCATAACTGAGCAGGGCATTGATCGTATTAATTACCCACGTATTTGGGAACTGATGAGTTCAGAAGTAAAATACGGAGGATGGGGTAATGATAATCCATTTGATCGTTATAGTGATACACCACCTTCTGATGGTGGTCCAGGGCAACTCTCCCCACTAGGCGATCAGAATAACCCGCACTTTATTGGCCCAATGTATCAGTCACAAACTGAACGAAAAATGCGGCAAGCTCAAGAGCAAGTTATTCGTGCTTCTAAGCTGGCCCAAGAACAAGCTAATAAAGGTTATGATTATGCGCAACAAAAAGTATCACTAGCTACGGATTATGTAAGGGATAATGTACCTAATCAATTTAGTGAATTACGCAGGAATATAAACATACCAGCGTCAATGAACTTTGGTGATTTAAGAGATCAACTGTACGGTCAAGCCGGCGATATGTATAGTCGGGCTGTTAACTATAGTAATCAGTTCAATGGATATTCTGATATAGTCAATCAGTCAATAGCTGATCTATATACCAAAGCTAATACTTTTACTCCAGTTATCAAAGGAATGGATTTTTTAAATGGAAATTTAATTGATATTAATACTGGTAAGATAGTAGAGAAAATATCTGATATCACTGGTGAAATTAAAAACCAAGCTGGTATAACTGTAGTAACCGCTCAAGAAGTAGCTACTGGTCTTTATAATCAACGTGGTGATTTATTAACCAAGGCAACTGATATTGCTAGTCAATTACGTGATAAAGCGGCACAGATCGCTGGTGATGCTAGAGAACGGTTAACTCAAGGTTTAGATAATGTTTCTGATATGGCTAAAGATTGGTATTTACCTGGCCGTGAAGAAGCCGTTATTCTTGGACGTGATCTACTAGCCGGTGAGTATATCGATACAGCAACTAATCAAATTATAACCAATTTGAAAGATGCCAAAGGTACTATTATTAACAGGGCTGGTGATGTAGTCGTAACTGCTCAAGAACTGGCTAAAGGTTTAATACGGTCAGATGGTTTTAATCTGCGAAGGAATGTAGCAGATGCATCTAACTGGATACAACGAAATGTACTAGGTGGTGGATCAACTACTCAGAAAATCTTTAATGCAATGGGTACAGTTGCTAATAAAGCAAAAGACTTTACTATTGGATTAGGTAAGGATATTCTAAGTAATCGGGATGCATATTTACCTGGTATGTTAAAACCAGTATTACAGAAAGTTAAACTAAAAGCAGGTGAGTATTATACAACTGCTGGTAACCTATTAAAATCATTCGATGAGATTAATGGACCAGTTTTAGATAGGGATGGTAACATTGTTGTTGATGAAGAACAAATACCTGAACTTATTAACTCTGATGGGTCTAAGCATACTGCTGCTAAGAATAAGGGTTTATTCCGAACTGGTTTAGGTAATCTAGCCCGTGGTTATGCTAATATGTCAATGCGTTATTGGAAGTGGTTAGGTAAGAAATCTGTAGATACTGCTAAAGGAATGGCGGGTTTAGGATATAAATTACTTGGATCACCTTTCAAGAAACGTTTTAGTGCATTTACTGGTAAAGTAGAAACACAGATAGATAAGAAAGCTCTAGATACCACCACTGATCAATTATTAGCAGGTATATGGGAAGAACTGCGTAATCAGAAACCAGATGCTAATAAACCTCGCCGTGGTTCCTGGCAAGATCTAACATCACGTGTTAGCGATACTTTAAATGGTAAAAATAACAGTGATGAAGAAACCACTGAATCAAAAGGTCTTTTTGGTAAACTTGGTGATACCTTAAAGAATATCTTTGGTAAGAAGAAAGGCGATGAGGAAGATGAAGGATTATTGGAAGACCTAGGTCTTGGTGGTAAGAAAGGTGGGAAATGGGCTGCTGCCCGCCAAATACTTGATAGAGGTGCTTTAGCTATTGGCGGTGGAGCATTATCGACAGCTGCTGCATATGCTAGTTTTGGTGGTACTGGTGCATCAACAAATGATAAATTAGCTGGTGCAGCTATTGTAACTAGTAATCCGATTATGTGGGCACTTAAAGATTTCTTAATAAAACCTGTATTAGGTTGGAGAGGAAGTCAGAAATTCAAAGATGATTTAATCAGTTATCGAATGATGCAGTATGGTGCCACAACAACTGATCAGATGAACAAGGTTACTGAATTAGAACAACTTGTATCTAGTGTAGCTACACGTGGTGGAGATGCGTCCTTTGATGTAAGGGCTCTTAATGCACGTGACATTATTAAGATATTTGGATATAGTGCTGATGATGGCCCAGCTATCATGCGTTTAGCCAATTGGATCGACTTTAGGTTTAAACCGATCTTTGAGGCATGGCTTAAAGGACTATCCAAAATTAATCGTAGTGATGTAGACATCAGTGAGGTTGATAGTAAAGTACCTAATGAACTAAAAGGACAGCTCATTAGATCAGTATCATTCCCATACGAAGGTAATACACCTTATCTAGTCCTTAATAACCCATTTGGTGAAGAGGACTTATCAATTGATGTTGCTTCTATACAGATGAAAGAAAAGGAATTATTGGATAAGTATAGTTCCACAGAGAAAACACCTGCCGCACCTAAAGCAACTTCCAGTAGTTTTAAGGAAAGTGCTACCGATGTAATAAATGATACCATTACTACGATTAAGTCTAAGTCAACTGATATTACTAATTGGTTTAGGGATTCAACTATTGGAAAAGCAATTAAAGCGGTTAGTCCAGTTGAATCTATACGTAAAATGGTAACTACAGTAGTAGACACAATTATTCCTAAAGCAAATGCAAGTGATTCATTAACTTCATTGCAAGCGCTACGTGTACACGCTTATGGGATGCAAGGTTTAGACTTAGCTGCTGTAAATGGATTACTATCGATTGAAAGTCTTGTTAATGATAAAATGCGAGTAGCTAATGGTAAAGCTACTTATACAGGTGATATAGAGGAATTAATTAAGTGGACTGGCCAAGCATTTGGTATGGTTACGACTAGCGATGG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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
403718b8ad31d86a41edad3f5ddf8e60302aaef83d9ac04ddd624f0e588a8ce0
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50