Protein

Genbank accession
AJD82057.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,57
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,85
Protein sequence
MADLIKASFRATNGLDAAGEKVINVATADKTKLTDGVNVDFFFKENTIQLYDTTRGYDSGFAIIYNNRLWVSNRIIPEPAGAFQETFWTAIRTDPKWTYVDVGPVTMQSGDYISANTSVNDLVLTLPNTPNDGETIFVRDVGGNLGYKSLKINTSNQRINFRNSQITSFTATRPYSQLMFVFSNRLWQLYVGENESIGTIITPSTGMFRSQAGDIIIRRYTTSAPCQIGLPKNAVTGDIIRTIDLDGLSPQNHLIVTTFDNTSSIGTIGTHSAEFRTAGDGFLVYDASDSIWRVYDADLRTRISVVTETTDLSPNQSVIVFGDNNATSKDITLNLPTDVAFGDTVEICLSYIRHGQTVTIKANAPDLIASTKLLLQFPRRSDYPPDVSWYTSEELIFNGYDDYAPTLELAFLQDPITLDKYWVVSENIPTIERVDATNNTTRKRLGVIALASQEQANVDLENNPEKSLAITPELLANRTSTESRRGIARLASTAEVNQDSTSTFLDTVIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETNTGTDDTTIVTPKKFAARKATTSMDGIITLVSSGAIAASDRDNPGTLVYNYNDTVKAITPATLHEARATKTTLGQLYQATETEVISAPVDNPLVPLAVSPEMLHKKTATTTRIGFTQTATQAEVNAGTDNFKYVTPNTLNGRNASEILTGIAKISTQNEFDAGLLDNVISTPLKIAAHFSDVNRTEVISSSGLTQSGNLWNHYTLNILEATNVQRGTARLATQSEVDAGVEAKSIVTAATLSSKKATETTEGIIRVATQAESVAGTSSILAISPKNLKYIAQTESTWESTPLRRGFVKMTEGALTWVGNNTVGNTQDVELYAKNGYAISPYELNLTLSHYLPIEATAVNSTKFDNLASTQFIRRDINQTVDGILTLTKQLNTSAPVLSSSTGTFVDVVGTNTVNAGNSLGTASISIIGKANNWKFNAVADGTTLLVNDVLTLNQNGNASVKQTFNIGNRADSVNGYSVGGVVVLQNNALTTEVGNIVRPLVLKSPDASNIIADDGTQYKVLTEKNAVSLIGTSFVKKIGDTMTGRLTVNSAITVQLSEASISVIPTETTRGMWTAEVTTPAQYNLLPGYAVPVFGTNQDGSDNAIIVSYNLIKGPGTLAQFGVGTNYSYQVWNPRPTAIVPNHFARTQWIRNFNPLINGWDEWARVFTSQTPPTASDIGAVSSTGSAFNNMTVRDWLQIGNVRITPNVATRTVEFDWID
Physico‐chemical
properties
protein length:1245 AA
molecular weight: 134958,32190 Da
isoelectric point:5,14429
aromaticity:0,07470
hydropathy:-0,18948

Domains

Domains [InterPro]
IPR048391
1091–1193
IPR048391
AJD82057.1
1 1245
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Yersinia phage vB_YenM_TG1
[NCBI] 		1589265 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Yersinia enterocolitica
[NCBI] 		630 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Yersinia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AJD82057.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KP202158 [NCBI]
CDS location
range 148062 -> 151799
strand +
CDS
ATGGCTGATTTGATAAAAGCCAGTTTTCGAGCTACAAATGGTCTCGATGCAGCTGGTGAAAAAGTAATTAACGTGGCAACAGCCGATAAGACCAAATTAACTGATGGCGTTAACGTTGATTTCTTCTTTAAAGAAAATACTATTCAACTTTATGATACAACTCGTGGATATGATTCAGGATTTGCTATCATTTATAATAACCGTTTATGGGTTTCTAACCGTATTATTCCTGAACCTGCTGGTGCCTTCCAGGAAACTTTTTGGACTGCTATAAGAACAGACCCAAAATGGACTTATGTTGATGTAGGTCCTGTTACAATGCAATCGGGTGATTATATTAGTGCAAATACCTCAGTTAATGATTTAGTATTAACTTTGCCTAATACGCCAAATGATGGGGAAACAATTTTTGTTCGAGATGTTGGCGGTAATTTAGGATATAAATCACTAAAAATTAATACATCTAACCAACGAATCAATTTCCGTAATAGCCAAATAACATCATTTACCGCAACTCGCCCTTATTCACAATTGATGTTTGTTTTCAGTAATAGATTATGGCAGCTTTATGTCGGTGAAAATGAATCGATTGGAACAATTATCACTCCTTCAACAGGAATGTTTCGTTCTCAAGCCGGTGATATAATTATTCGTCGTTACACAACGAGTGCGCCATGTCAGATAGGTTTGCCAAAGAATGCTGTAACAGGTGATATAATTCGTACAATAGATTTAGATGGATTAAGCCCTCAAAACCATTTAATTGTTACTACATTTGACAATACATCATCTATAGGAACAATTGGAACTCATAGCGCTGAATTCAGAACAGCCGGCGACGGTTTCTTAGTATATGATGCTTCTGATTCTATCTGGCGTGTATATGATGCAGATTTAAGAACACGCATCAGTGTAGTAACTGAAACTACTGATTTATCTCCGAACCAATCAGTTATAGTTTTTGGCGATAATAATGCTACATCTAAAGATATAACATTAAATCTTCCAACTGATGTTGCCTTTGGCGATACAGTTGAAATTTGTTTAAGTTATATTCGCCATGGACAAACTGTTACTATTAAGGCTAATGCTCCTGATTTAATAGCTTCTACTAAATTATTACTTCAGTTCCCACGTCGTTCAGATTATCCACCAGATGTTAGTTGGTATACTTCTGAAGAATTGATATTCAATGGGTATGATGATTATGCTCCGACTTTAGAATTAGCTTTCTTACAAGACCCTATTACTTTAGATAAGTATTGGGTAGTTTCAGAAAATATTCCTACAATTGAACGTGTTGATGCTACTAATAATACAACACGTAAACGTTTAGGTGTTATTGCACTAGCTTCTCAAGAACAAGCAAACGTTGATTTAGAAAATAACCCAGAAAAATCTTTGGCTATTACACCTGAATTGTTAGCTAATAGAACTTCGACTGAATCTCGACGTGGTATTGCTCGTTTAGCATCTACCGCTGAAGTTAACCAAGATTCTACTTCTACTTTCTTAGATACAGTTATTGTTACGCCTAAGAAATTAAATGAAAGAACCGCAACTGAAACACGTCGTGGTTTGGCTGAAATCGCTACGCAAGCAGAAACAAATACTGGAACTGACGATACAACAATTGTAACTCCTAAAAAATTTGCTGCTCGTAAAGCGACAACTTCTATGGATGGTATTATTACATTAGTTAGTTCAGGCGCTATTGCTGCTTCTGATCGTGATAATCCAGGTACATTAGTTTATAATTATAACGATACTGTTAAAGCTATCACTCCAGCTACGCTTCACGAAGCGCGTGCAACGAAAACTACTTTAGGCCAATTGTATCAAGCAACTGAAACTGAAGTTATAAGCGCTCCAGTAGATAATCCACTAGTTCCATTAGCGGTTTCTCCTGAAATGCTTCATAAGAAAACTGCAACTACAACTCGTATTGGTTTTACTCAAACCGCTACTCAAGCTGAAGTTAATGCAGGAACTGATAATTTTAAGTATGTTACTCCAAATACTTTGAATGGCCGAAATGCCTCAGAGATATTAACCGGTATTGCTAAAATTTCTACACAGAATGAATTTGATGCAGGTTTATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTGCTGCGCATTTCTCAGATGTTAACCGTACTGAAGTAATATCATCTTCCGGCCTGACCCAAAGTGGAAATCTCTGGAACCATTATACACTGAATATTCTTGAAGCAACAAATGTTCAACGTGGCACGGCAAGATTAGCTACACAATCAGAAGTTGACGCAGGCGTAGAAGCTAAATCTATTGTAACAGCAGCTACTTTGTCAAGTAAAAAAGCGACTGAAACCACCGAAGGTATAATTCGTGTGGCAACACAAGCTGAATCGGTTGCAGGCACTTCAAGTATATTAGCGATTTCTCCTAAGAACTTGAAATATATTGCTCAAACAGAATCTACTTGGGAATCAACTCCACTTCGTCGCGGTTTTGTTAAAATGACTGAAGGCGCTTTAACATGGGTTGGTAATAATACTGTAGGTAATACTCAAGATGTAGAATTATATGCAAAAAATGGTTACGCTATTTCACCGTATGAATTGAACTTGACTTTATCTCATTATTTACCTATTGAAGCTACAGCTGTCAATAGTACTAAATTTGATAACCTAGCCTCCACTCAGTTCATACGTAGGGACATTAATCAAACAGTTGATGGAATACTAACCCTTACTAAACAATTGAATACGAGTGCTCCTGTGCTCTCCAGTTCAACTGGTACTTTTGTTGATGTTGTTGGAACTAACACAGTTAATGCTGGTAATTCTTTAGGCACTGCTTCTATTTCTATTATTGGCAAAGCCAATAATTGGAAATTTAATGCTGTTGCCGATGGCACAACTTTATTGGTCAATGACGTATTAACTTTGAATCAAAATGGTAATGCTTCTGTCAAGCAAACATTTAATATTGGCAACCGTGCAGATTCAGTTAATGGCTATTCTGTTGGTGGTGTTGTTGTCTTGCAGAATAATGCTTTAACTACTGAAGTTGGTAACATTGTTCGTCCATTAGTATTGAAATCTCCCGATGCAAGTAATATTATAGCTGACGACGGAACTCAATATAAAGTATTAACAGAAAAAAATGCTGTTTCCTTAATTGGCACTTCATTTGTTAAAAAAATTGGCGATACTATGACAGGACGTTTAACTGTTAATAGTGCAATAACTGTTCAGTTATCAGAAGCTTCTATAAGTGTTATTCCTACTGAAACCACACGAGGTATGTGGACTGCTGAAGTTACTACGCCGGCACAATATAATTTACTTCCTGGCTATGCTGTTCCGGTATTTGGAACCAATCAAGATGGCAGCGATAATGCTATTATTGTAAGTTATAATCTGATTAAAGGCCCTGGTACATTAGCACAGTTTGGTGTTGGAACTAATTATTCATACCAAGTATGGAACCCACGTCCAACTGCCATTGTTCCTAACCACTTTGCTCGTACTCAATGGATAAGAAACTTTAACCCGTTGATTAATGGCTGGGATGAATGGGCCCGTGTATTTACAAGTCAAACACCTCCTACTGCTTCTGATATTGGTGCTGTATCTTCTACAGGTTCTGCATTTAACAACATGACAGTTAGAGATTGGCTACAGATTGGTAATGTTCGTATTACTCCTAATGTAGCAACGCGTACTGTTGAATTTGATTGGATTGATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
fa9c473946f260d85ab90208131303642c356794d8e38a3b3e4b482c4cb03b5c
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5751
Evidence 0,5751
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of vB_YenM_TG1, a broad host range bacteriophage which infects Yersinia enterocolitica Leon-Velarde,C.G., Kropinski,A.M., Chen,S., Griffiths,M.W. and Odumeru,J.A. 2014-10-28 — GenBank