Protein

Genbank accession
XYM57503.1 [GenBank]
Protein name
short tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLTRLDNLITSKTGKYLYVSPDDFNASDELNNRGNSPVRPFKSIQRAFLEVARYSYLPGVDNDRFDQFTIMLMPGEHFIDNRPGLGGVDDISVFGFDQATNEWTDNSILDLSNPDNIFYKFNNTEGGCIIPRGTSLVGYDLRRTMVKPLYVPDPADSREPRSAIFNVTGGCYFWQFTIKDGETTSLSPLYNSSAAIPSGEVYYSKTDFTKKTAPNYSHHKLTVFEYADKEELGLLYRKIAKAFSAFQPTIDDINSSGKPEFDVRVQENRIVGPLSDSRAIESLQFDDATSDPSIPGSNVRVTVTTKIEHGYFAGQSVAVLNTDIDDKIEGTFVISDIDPNDGRKFTYFVFGEVVTTIGPGSNVGASSIAPGDVLNISSSPALGTGALTLAEVDSVESASPYVFNCSIRSTWGICGIWANGLKATGFKSMVIAQYTGVSLQKDDRAFIRYDEFTNTFNQASLKDAFDSIPYHTKGDAFFKDEWRNFHVRASEDAFIQNVSIFAVGFADHFLMESGGDMSITNSNSNFGNTSLHAIGHKGFAFNSDKGGYIDAIIPPKVIEPTEKRINYYPFNLPATINGVEGIQTANQGVTVLNHTRLYIESNDDALDPAKRPAVSIDGYRLGARQNDKIYVKLEKGYATDDQEYSAELNPTGFVKFIAKPDIISPSTGGVIDNLSLDAANLIEANKTFFQEEVFGYVLEKYPDLQQISYVNPGLDPESNRYQDARNLIVANTDEIVDEAYDSMYAAFGPAGENNATFTGGYNETEWKGFIRDIVDAIAEDLRDGGNGNIITATGEYFNPDGTPKATGGLLNQEEFAIFAFRRARDFAKQAIANLLTVTDNTITIDPANTVAKDFQPTGATYDPSNGNFVFTIEDHGFKVGDCLELNPGGFTFTCAMDGNKTEHSLPQAGQFAYNKTIPIDAVTDNTIRVNVGASGPDVQFTPSAATYDPATGDLVLEIGAHTLSTGEGVVIDDNSLSFTCAMDGNQSTKTYPRPGIDPFAGRSMPITATTATSITVNAGVSGPNVAFTPTNATYSGTELTLTIGQHGLGVGRGVLLADDSITLDIDGTPRTFPNATADPAIQGNSLSITSVGSTQHTATNAVYDAATGVVTLTIPTHGFTNGDYIKVADGSLTFTCDLDGNTAQKAYPRAGYDYPSGRWLAISNVTTNTFDINVGSSSYTGAHTFVSATTNGIDRQTGTLTVDVGNIGTTVSFVSATANAVVHQPQSAHTFVGATANAVKHLPQSVHTFVRATSNAVTIYSRTNILATANRNKDTRDLINANKNDIIDAAIAAINAYNPGFVFPGGSDVKCKRDLGLIIDGITQDLWFGGNEYTVANVIEYFDGNSLLSNGVAGEVNETIVALQKVKDQINLAINNQLASTDTTVTLDACGDPTIVDDSHCDAEKLIRKNKKFIAKEAYQRMLAAYPSYTPSTGNTEQDCLDDVYDVMDEILYNLKFGGNHKTYDAAKIYTTGIYEGKNPQTFTPTAATYDPSTGVTVLTIAGHGMLQGQYVKLARESLTFTCAQDNNLTEHSYPRVGDANYLEWAQITNATTDTITINVGVSSNTTAHTFVRAFNDAVIYGTTQDTFLNSERDEAARVFTEALAVSTDVMRNIAVTPTSWTPAGETLQVIDSTIIADTTNPTCQGVASSLNTLFGIITQAIGTDAGVGTLSATRTEPTQPTTYAEHNCADVLANIDTLVSIFTDNLSAGNLTSLPDVDNGLWDCANVRSTIDTLTSILTDALDAGNLNSLPDVVTGGFALDRLSSKCYRDVGIITDAVINDLRFGGNLNSIQAGEAYFIGNNLAYIDGEKTETLDAWGAIKNLAISALRNHTTQINGCQLTTGSAIVNVGSNTGLAIGMKVTEYLSTDFSSDAQLNVGATPITSNVDGETYIKRLVGGDRIELGVRNARLDTGATKPVQGAGGNNITLYFEMLEGQWADTLPVTDPTISTSNAGYPECANTASAVATLVDNIISIINNGIGAVDLVEQVATSSDFAKRATVWTIDTTGQSSPNPHLLETGTAVRLVPRPRWDDEASKYVDVDKRLVRLPNGFETNRTYYVIAPGRKTAPHDYSPTSFTKTESTKLMLAETKANAAAGIYIYSAESDTIDKDVEIDLYQFTLDEKYDLTTYKCNLDIAVSGGTAVTGGIETNVAHIFDAPQNVPQRVFFRPIGTNDLPLLAASFQSDNAAANNNDSTAGVADSAGRLNPEFEFYVRYQASTTKPNKIFTIYKTFADAINDQNRITFQTLNPDLKFTVYANKAKAPFGFDPRGISYSNAAGGRWYIKVKDTSSSTNPAIYQESILWRTHQSDYTQSPDPKTADSWYFRQEDLREAEDRTYKLRYVIPNYLEGVRDPINGFVIKTRTDTNRRLRPQKILLKPAPGNFKSDAFFQNDANPGERIGWTTDQILTNLGSLQNAYDPYNLAQGKKTIVTDNNISMTIQSGRFKTVNGDQLLELHVYDYEPNPNILSLNKARFRTVKITAPQGGSFEVEKTLDGGTINSANRITWTGNTSGSAYVHAYTNVGNDHYLILKGFSDGDLEYSPFYNTRFQQGSIYADMLDDPDMGKSLPLKRLIAKEQNDLFYKQDGAPVYTITPGDTIKEDGTENRYVVDSVEDVGDITDTFYIFEIETLQRRIAQQQDGIYYLTAIRGNMSPLPLGAGNQRNFRNFKFSQPISYLYPQNYKNDPFWFQYAGTTANEKANAATLIDPPATFSAADNYVHGLVRTNDSKSSMTKEAIIDLVATPAFEDNTYLTNVGDIDARIQAQEGNASSGAEDRQIPIAGDNRVFTDQKWYVELRRPSIARAGNHTFEYLGFGPGNYSTGLPARQEIVLTATQDYYAQAKRQDGGIVFYTGINSNGELYIGNRKINAITGEEEFLERAALLDSDDDDDDISSLVTTFEVPVTFNQNITINGGDGELVSNFNSPVAINVNNNDLTFQPNALQIYSNVDQNDPDENGQPNGPANNPLLDRNSFTPRQTGDIFIGKNQVKAAQFALNPIKNGQGYKVQTHTIIDGGIVFPSNVSPNQSALYSLSTGGTALDAKQYVKYGTSGAYILPTDGDIILKGGSVERSGSLGWVYANFYTAIQNAEIASVQFNGTKYVKLNWNIVSSVQQTNNSLGIVETSRIRIGNFYPNGALNSDGGFPIVSPVISGSVVPFNPNDTFCYIEIGESIAAVSYDNDGDGAIDPPVSNPTWDNLVLRAGSPINGGTPAPTMEFSSANWKETGVIGADVLRTDTGSIGDYKLGINTIAAAAHSAYETAFVDVNTDPKANLEVIGTTWISGKKVLTWLDESAATLTNKTETGQANAFLVGGFRDNPDSTALIRANTLTNRVGINIANNNTLLDKTFVVDGEVRFSNTLTLTNGTIESPSGTFNLGPTSTTINLFPLATTLNVANDATATQTINIGNSTDNQTLTIGSAADTSALYIHSSSESSVVDIATVSNSNASYQSSITMGGAFANSASLFNIRNRLLKVDGDMQIGTPSTGVTKMYSFTPRLEIFSASGGSNEIDAFRTGSILSIGADAGTTTINNSLYVKASEEVDGNITLNGGLSVGIISATRGIFNTTTSSHAVGATDDLNIDIYRRVEIGKTIDSQGNALWGGTTFQEGSNTYFLPLNEAIGVADIAIGDLLLIDRGDTTGGSNQANSEILRVVTLINASDATDSEGYRVEVERAQEGTTLRTDHPDNCKVVKLTKQNNVSYLTQAIATAGNQGDTVQITTAEFGGSININDILRLNDGELFNVSGVSTDASNIQGLRVNDGAEPTAFTVFEVLSTTGQTTIEGPTEVRDDITLTGSTSNNDKMFTITNGASTPITTFDVDSSDGDTRILGDLSVGANFQEFTIDGDLGNVTMRGGNLDIFNDAGNTKQLEFINGNGNLTIAGVIETEGTGTNLFAGDIQLNGGDLTVNDGSTTRFKVNNDGGIDLGGITDYISQTGARKWVYQSTVSGDGGVLTANVNYFTKASSDLVLKLPANAQTGDMIRFVDIGGALTYNVRMIIRAPDGIPVAGDSTNTNLSIGSVDFTNYGGGELIVTTPNASFGLVYSGATNADGSATGVPSNLRGWWLMEI
Physico‐chemical
properties
protein length:4070 AA
molecular weight: 438453,47000 Da
isoelectric point:4,56954
aromaticity:0,08894
hydropathy:-0,27528

Domains

Domains [InterPro]
IPR009050
1264–1370
IPR009050
XYM57503.1
1 4070
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-CH1b
[NCBI] 		3413213 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM57503.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340850.1 [NCBI]
CDS location
range 22367 -> 34579
strand +
CDS
ATGCCATTAACAAGACTGGACAACCTGATCACCAGTAAAACAGGTAAATATCTTTATGTTTCACCTGATGACTTCAATGCATCAGATGAACTGAATAATAGAGGAAACTCCCCTGTTAGACCTTTCAAGAGCATTCAGCGTGCTTTTCTAGAGGTTGCACGATATTCTTACCTTCCTGGGGTAGATAACGATCGTTTTGACCAGTTTACCATCATGCTCATGCCAGGTGAGCACTTTATTGATAACCGTCCTGGTTTAGGTGGTGTTGATGATATTAGTGTATTCGGTTTTGATCAGGCAACGAACGAGTGGACTGATAACTCCATTCTAGATCTGTCTAATCCAGATAACATCTTCTACAAATTCAATAACACTGAGGGTGGTTGTATTATCCCTCGTGGTACTTCTCTTGTCGGTTATGACCTTCGTAGAACGATGGTCAAGCCTCTGTATGTTCCCGACCCTGCAGACTCTAGAGAACCAAGATCTGCTATCTTCAATGTAACTGGTGGTTGTTACTTCTGGCAGTTCACCATCAAAGACGGTGAAACTACTTCTCTATCTCCTCTATACAACTCTTCTGCTGCTATTCCTAGCGGTGAGGTTTACTATTCTAAGACTGACTTCACTAAGAAGACTGCTCCTAACTATTCTCACCACAAACTGACTGTATTTGAATATGCAGACAAGGAAGAACTAGGTCTACTTTACAGAAAGATTGCGAAAGCATTTTCTGCATTCCAACCAACTATTGATGACATCAATTCTAGTGGAAAACCAGAATTTGATGTAAGAGTTCAGGAAAACAGAATTGTAGGTCCACTGTCTGACTCTAGAGCAATTGAGAGTCTACAGTTTGACGATGCTACATCTGATCCATCTATTCCTGGTTCTAATGTCAGAGTCACAGTAACCACAAAGATTGAGCATGGTTACTTTGCTGGACAGTCTGTTGCTGTCCTCAACACTGACATTGATGATAAGATTGAAGGAACTTTCGTAATTTCTGACATCGATCCTAACGATGGTAGAAAGTTCACTTACTTTGTATTTGGTGAAGTTGTAACTACGATTGGTCCTGGTTCTAACGTTGGTGCAAGTAGCATTGCTCCTGGTGATGTTCTTAATATCTCTTCTTCTCCTGCACTAGGAACTGGTGCGTTAACTCTCGCGGAAGTTGACTCTGTTGAGTCCGCATCTCCGTATGTTTTCAACTGTTCTATCCGTTCTACCTGGGGTATTTGCGGAATTTGGGCGAACGGTCTGAAGGCGACTGGATTCAAATCCATGGTTATCGCGCAGTACACGGGTGTTTCGCTCCAGAAAGACGATAGAGCATTCATTCGTTACGACGAGTTTACCAACACATTTAATCAAGCATCACTCAAAGATGCATTTGATAGCATCCCTTATCACACCAAAGGTGATGCATTCTTCAAAGATGAGTGGAGAAACTTTCACGTTCGTGCATCTGAAGACGCATTCATCCAGAACGTTTCGATCTTCGCTGTTGGTTTCGCTGATCACTTCCTGATGGAGTCAGGTGGTGACATGTCGATCACCAACTCGAACTCCAACTTTGGTAATACATCACTACATGCAATCGGTCACAAAGGATTTGCATTCAATAGTGACAAGGGTGGTTATATTGATGCTATTATTCCTCCAAAGGTTATCGAACCTACTGAGAAGAGGATCAATTACTACCCATTCAACCTTCCTGCAACTATCAATGGCGTAGAAGGCATCCAGACTGCCAACCAAGGCGTCACAGTTCTCAACCACACCAGACTATACATTGAGTCTAATGATGATGCTCTAGACCCTGCAAAGCGTCCTGCGGTATCCATCGATGGATATAGATTAGGTGCTAGACAGAACGACAAAATTTATGTAAAACTTGAGAAAGGATATGCTACGGATGACCAGGAGTATAGTGCAGAACTAAATCCAACTGGTTTCGTCAAGTTTATTGCTAAACCAGACATCATTTCACCTTCTACTGGTGGAGTAATTGACAACCTTTCTCTTGACGCTGCTAACTTAATTGAAGCAAACAAGACATTCTTCCAAGAAGAAGTCTTTGGATATGTTCTAGAGAAGTATCCTGATCTGCAGCAAATTTCTTATGTTAACCCTGGTTTAGATCCAGAGTCTAATCGTTATCAAGATGCTCGTAATCTTATTGTTGCAAATACAGATGAGATTGTAGACGAAGCATATGATTCGATGTATGCTGCATTTGGTCCTGCTGGTGAGAATAATGCCACATTTACTGGTGGTTACAATGAGACTGAATGGAAAGGGTTTATCAGAGACATTGTTGATGCTATTGCAGAAGACTTGAGAGATGGTGGTAATGGTAATATCATTACTGCAACTGGTGAATATTTTAATCCTGATGGTACACCAAAAGCAACTGGTGGTCTTCTTAATCAGGAAGAGTTTGCTATTTTCGCATTCCGCAGAGCTCGTGATTTTGCTAAGCAAGCGATTGCAAACCTATTGACAGTAACCGACAATACGATTACTATTGATCCTGCTAACACTGTTGCTAAGGACTTCCAACCAACAGGAGCAACATATGATCCTTCTAATGGTAACTTCGTATTTACTATTGAAGATCATGGATTTAAAGTTGGAGACTGTCTAGAACTCAACCCAGGTGGATTTACTTTTACCTGTGCAATGGACGGTAATAAGACCGAGCATTCTCTACCACAGGCAGGACAGTTTGCATACAATAAGACTATCCCCATTGATGCAGTAACTGATAACACCATTCGTGTTAATGTTGGCGCATCTGGTCCTGATGTACAGTTCACTCCATCTGCAGCAACATACGATCCTGCAACTGGTGACCTTGTACTAGAAATTGGTGCTCATACACTATCTACTGGTGAAGGTGTTGTTATTGATGATAACTCTTTGAGTTTTACTTGTGCGATGGATGGAAATCAGTCTACTAAGACTTATCCTCGCCCTGGTATCGACCCATTTGCTGGTAGATCAATGCCTATCACGGCAACTACCGCTACTAGCATTACTGTTAATGCTGGCGTATCTGGTCCTAATGTAGCATTCACTCCAACAAATGCTACTTACAGTGGAACTGAGTTAACTCTTACTATTGGACAGCATGGTTTAGGTGTTGGTCGTGGAGTTCTTCTTGCTGATGATTCTATCACTTTAGACATTGATGGAACACCACGCACATTCCCCAATGCAACTGCTGATCCAGCAATTCAAGGAAATTCTCTTTCCATCACTAGTGTTGGTTCTACGCAACACACAGCAACTAACGCTGTATATGATGCAGCAACTGGTGTTGTAACACTTACTATTCCAACTCATGGATTTACCAATGGCGACTACATTAAGGTTGCTGATGGTTCTCTAACCTTCACATGTGATCTAGATGGTAACACGGCACAGAAAGCATATCCTCGTGCTGGATATGACTATCCAAGTGGCAGATGGTTGGCAATTAGTAATGTAACTACTAACACATTTGATATCAATGTAGGATCTTCTTCCTATACTGGCGCTCATACATTTGTTAGTGCAACTACTAACGGTATTGATCGTCAAACTGGAACTCTAACGGTTGATGTTGGTAACATTGGTACAACTGTTTCTTTCGTTAGTGCAACTGCTAATGCTGTCGTTCATCAACCACAGAGTGCTCATACATTCGTAGGCGCAACTGCTAACGCTGTCAAGCATCTACCTCAGTCGGTACATACTTTCGTAAGAGCAACTTCTAATGCTGTTACTATTTACTCTAGAACTAACATTCTTGCTACTGCAAATAGAAACAAAGATACTAGAGATCTAATTAATGCTAACAAGAATGATATCATCGATGCTGCCATCGCTGCTATCAATGCATATAACCCTGGTTTTGTATTCCCAGGTGGAAGTGATGTTAAGTGTAAGCGCGACCTAGGACTCATTATTGATGGTATCACTCAAGACCTTTGGTTCGGTGGTAACGAGTATACTGTTGCTAATGTAATCGAATACTTTGATGGCAACTCTCTCCTAAGCAATGGAGTTGCTGGTGAAGTTAATGAGACAATTGTTGCTTTACAGAAAGTCAAGGATCAAATTAACCTTGCTATTAATAATCAACTAGCAAGCACAGACACTACCGTTACTTTAGATGCTTGTGGTGATCCTACAATCGTTGATGATTCACACTGTGACGCTGAAAAACTAATCAGAAAGAACAAGAAGTTCATTGCTAAAGAAGCATATCAGCGTATGCTTGCTGCATATCCTTCTTATACTCCATCTACAGGCAACACTGAGCAAGATTGCTTGGATGATGTCTATGATGTAATGGATGAAATCCTCTACAACCTCAAGTTTGGAGGAAACCATAAGACATATGATGCTGCCAAGATTTACACCACTGGCATCTACGAAGGTAAGAATCCACAGACCTTTACTCCTACTGCTGCTACATACGATCCTTCTACTGGCGTTACCGTTCTAACGATTGCTGGTCATGGTATGCTTCAGGGTCAGTATGTTAAACTTGCAAGAGAAAGTCTCACATTTACTTGTGCTCAAGACAATAACCTAACAGAGCATAGTTATCCTCGTGTTGGCGATGCAAACTACTTAGAGTGGGCACAGATTACTAACGCAACTACCGACACCATTACTATTAATGTTGGTGTCTCTAGCAACACCACAGCACATACTTTTGTTCGTGCATTCAATGATGCTGTCATCTATGGAACTACTCAGGATACATTCCTCAATTCCGAGAGAGATGAGGCAGCAAGAGTATTTACTGAAGCACTAGCAGTTTCTACTGATGTAATGCGTAACATCGCAGTTACTCCAACCTCTTGGACTCCTGCTGGTGAGACTCTTCAGGTAATTGATTCTACAATTATTGCTGATACTACTAACCCAACATGTCAGGGTGTAGCATCTTCTCTCAATACTTTGTTTGGCATCATTACTCAAGCAATCGGAACTGATGC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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.