Protein

View in Explore
Genbank accession
WNV47046.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein host specificity
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,66
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MLINILDVNLQKVAFLSNDVPGLPSYYDDEFHEYRDQGAATFKFTVKKVINNKLQSYARFLNGQSYFSFQIDGNDYLMTPASEQAIHETSEEISFFCVSLDRELMSEQANPLVNTSSHNIQWYFDQMGLISNTQITIGINEVSNLTRTINYDGQETKLARLISVIGNFDAEFEFITKLNNDGSLNSVTLNIYKENDGLNIQGVGKKRDDVRLIFGENIQAVERDVSTEGFLNATTVTGADNLNWNSASFSYINADGVEEFYKRAGSDTAFAPLSAKIYPAQLSKDKDDIWTRIDFTTEYKNVNDMWAYAVRQFKQYAYHQVTYTVTPSSKLVNAEIGDGPPLAKGDTVIIQDNNYIDIDGNVGLLLSARVSEKIVSETHPENNKLIFSNYKKLKSEVSTDIQAIVNQLVDAATPYRAELTTTNGTQFKNGTGSTTLAAHIFKGSATTETITDSYEWSKDGTVVANVQEITVDASGVSDKAVYSFKATVAGKVVASQSVTITNVDDGTNGRSVTNVSQKWRLTTTTATPTQAWSDAGWLTTQPTTTATNKYLWSITRTTFNLAPLTQDVIEQKAVYGDKGDKGDTGNDGRAGKDGVGINSTTITYAISSSGTVTPTAGWNSQVPTLVKGQYLWTKTVWNYSDGTSESGYTVSYIAKDGNNGHDGIAGKDGVGITATTITYAQSTSGTTAPSSGWTTSVPTVPAGQFLWTKTVWSYSDKTSETGYSVAMMGAKGDKGDQGVQGIQGVDGRQGIPGPKGADGKTQYTHIAYANSADGVTDFSTSDSNRAYIGMYVDFNINDSTTPSDYSWTLVKGADGTQGTPGKPGADGKTPYFHTAWSYSADGKDRFTTVYPNLNLLDGTRNFSGTWTNSSSWVTDGTYKGLTVKKRTGQWNGIYKTFTAPKDGIYTFSAYVKGSGIDSKIYRFLSVNGVVNGTVMPDTLIGNNFDWLRDSFTVTLKANDVVYAKYEIVGSGTDSILWTAGHKWEEGSTATPYMPSASEVTTADWPSYIGQYSDFTQADSTNPSDYTWSLIRGNDGKDGADGHDGIAGKDGTGIKTTTITYAGSTSGTTAPNTGWTTTVPTVAAGNYLWTKTVWAYTDNTSETGYSVAMMGVKGDKGDQGPTGPAGSDGNPGKVIQQNTEPTNKFLDMLWQYTGTEPLNATGITVLSNIIYVWNGTAWQIWLLNPQNIQAVNAWITNAMIGNAAIKLANIDTATITELSAVTATLGDVEAGSITNDISYGFVAQGNHHYLGNSVINYRGINISETMTLDNVLQYTQSMGFDAITGLFFQRLSENKDIISSIRLIEVGNNEMGLYVGNATEFATLTSKGLALSTDVPWTILSPMGGFSGGSIQFSVQNGVEFFSIAGLSVPQMNANQWYQATSLPAGSIAIPSINRVYPISGNNNAWDLLINPAGGVFIRCQAAVSATSNLVNGGCGFPIG
Physico‐chemical
properties
protein length:1439 AA
molecular weight: 155326,85380 Da
isoelectric point:4,81224
aromaticity:0,10354
hydropathy:-0,32189

Domains

Domains [InterPro]
DC_0690
STR
2–762
DC_0690 IPR008983 DC_1328
PTHR24637
Unmapped
578–1132
PTHR24637
DC_1441
STR
693–1004
DC_1441 DC_1328
G3DSA:1.20.5.320
STR
729–782
G3DSA:1.20.5.320 IPR008983
WNV47046.1
1 1439
Architecture
STR
STR 2-1426 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage D7138
[NCBI] 		3077243 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Lactococcus lactis
[NCBI] 		1358 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WNV47046.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR480987.1 [NCBI]
CDS location
range 33417 -> 37736
strand +
CDS
GTGTTAATTAATATTTTAGATGTAAATTTACAAAAAGTTGCATTTTTGAGTAATGATGTTCCTGGACTTCCAAGTTATTATGATGATGAGTTTCATGAATATCGTGATCAGGGAGCCGCTACTTTCAAATTTACAGTAAAGAAAGTTATCAATAACAAGCTACAATCGTATGCTAGATTCTTAAACGGACAGTCATATTTTAGTTTTCAAATTGATGGGAATGATTATTTGATGACTCCTGCTTCTGAACAAGCAATCCACGAAACAAGTGAAGAAATTTCATTCTTTTGTGTCTCTCTTGATAGAGAACTGATGAGTGAACAAGCTAACCCACTTGTTAATACATCAAGTCATAATATCCAGTGGTATTTTGACCAAATGGGATTAATATCAAACACTCAAATTACAATCGGAATCAATGAAGTTTCTAATCTGACACGAACCATTAACTATGATGGACAAGAGACAAAATTGGCACGTTTAATTTCTGTTATTGGAAACTTTGATGCAGAGTTTGAATTTATTACTAAGCTTAATAATGATGGTTCTCTCAATTCTGTTACACTCAATATTTATAAAGAAAATGATGGATTGAACATACAGGGTGTAGGTAAAAAAAGAGATGATGTTCGTCTAATATTTGGGGAAAACATTCAAGCAGTAGAACGTGATGTTAGTACAGAAGGATTTTTAAATGCAACAACTGTAACTGGGGCAGATAATTTAAATTGGAATAGCGCTTCATTCAGTTATATAAATGCGGATGGTGTGGAAGAATTTTATAAAAGAGCTGGTAGTGATACTGCATTTGCACCCCTCTCAGCTAAAATATATCCTGCACAATTATCAAAAGACAAAGACGATATCTGGACGAGAATAGATTTTACTACTGAATACAAGAATGTAAATGATATGTGGGCTTATGCGGTGCGCCAATTTAAGCAGTACGCTTATCATCAAGTTACCTATACTGTTACACCATCATCAAAACTAGTAAATGCAGAAATTGGAGATGGCCCCCCACTTGCAAAAGGCGATACGGTCATCATACAAGATAATAATTATATTGACATTGATGGCAATGTAGGGCTCTTATTATCTGCTAGGGTTTCAGAAAAAATAGTATCTGAAACACATCCTGAAAATAATAAACTTATTTTTTCAAATTATAAGAAGCTAAAGAGTGAAGTATCCACAGATATTCAAGCCATAGTTAATCAGTTGGTCGATGCAGCTACTCCATACAGAGCAGAGCTTACAACAACTAATGGCACACAGTTCAAAAACGGCACTGGATCAACAACTTTAGCAGCTCATATTTTCAAAGGCTCTGCAACAACTGAAACAATTACTGACAGCTACGAATGGTCGAAAGATGGAACGGTTGTCGCAAACGTTCAAGAAATCACAGTTGATGCCAGCGGAGTTTCGGATAAAGCAGTTTACAGCTTTAAAGCGACAGTTGCGGGTAAAGTAGTCGCAAGTCAGTCGGTTACCATCACTAATGTAGATGATGGAACAAATGGACGTTCTGTTACAAACGTTTCTCAAAAGTGGCGTTTGACAACGACTACTGCAACACCAACGCAAGCTTGGTCAGACGCAGGTTGGCTCACTACTCAACCAACAACGACAGCTACTAATAAATATCTATGGTCTATCACTCGAACAACTTTCAATTTAGCACCTTTAACGCAAGATGTTATTGAACAAAAAGCAGTTTATGGTGATAAAGGCGATAAGGGAGATACTGGAAATGATGGGAGAGCAGGTAAGGACGGTGTTGGAATTAATTCAACTACAATTACATACGCTATATCTTCAAGCGGAACAGTTACCCCAACGGCTGGATGGAATTCACAAGTCCCTACTTTAGTCAAAGGGCAATATCTCTGGACTAAAACCGTTTGGAATTACTCAGACGGAACGAGTGAATCGGGATATACAGTCTCTTACATTGCGAAAGACGGAAACAACGGTCATGACGGAATTGCTGGTAAAGACGGAGTAGGAATTACAGCAACTACAATAACTTATGCACAATCAACAAGCGGAACGACAGCGCCAAGCAGTGGATGGACTACAAGCGTTCCTACTGTTCCTGCTGGACAATTTCTTTGGACAAAAACCGTATGGAGCTATTCTGATAAAACAAGTGAAACAGGCTATTCTGTTGCAATGATGGGAGCAAAAGGCGACAAGGGAGACCAAGGCGTCCAAGGTATTCAAGGTGTTGATGGACGTCAAGGGATTCCTGGTCCTAAAGGCGCTGACGGAAAAACGCAATATACACATATCGCTTACGCAAATAGTGCCGATGGTGTAACTGATTTTTCAACTTCTGATTCTAATCGTGCCTATATCGGGATGTATGTTGATTTTAACATCAATGATTCAACCACCCCAAGCGATTACTCATGGACGCTTGTTAAAGGAGCGGACGGAACGCAAGGGACACCAGGAAAACCTGGAGCTGACGGTAAGACACCATATTTCCACACAGCATGGTCTTACAGCGCAGACGGAAAAGATAGATTCACGACTGTTTATCCGAATTTGAATTTACTAGACGGTACTAGAAATTTTAGTGGTACTTGGACAAATTCAAGTAGTTGGGTAACTGATGGAACATATAAAGGCTTAACTGTTAAAAAACGCACTGGTCAATGGAATGGTATTTATAAAACATTTACTGCACCTAAAGATGGCATTTATACTTTTTCAGCTTATGTTAAAGGTTCAGGGATTGACTCAAAGATATATAGATTTTTGAGTGTAAATGGTGTCGTCAATGGTACCGTAATGCCTGACACGTTAATAGGAAACAATTTTGATTGGTTAAGGGACAGTTTCACTGTAACTTTGAAAGCTAATGATGTTGTTTATGCCAAATATGAAATAGTTGGTTCAGGTACAGATTCAATTTTATGGACGGCTGGTCATAAATGGGAAGAAGGCTCAACCGCCACTCCTTACATGCCGTCAGCTAGCGAAGTAACAACCGCTGACTGGCCGAGCTACATTGGTCAGTATTCAGACTTTACGCAAGCTGACAGCACTAATCCATCCGACTACACTTGGAGTCTGATACGAGGGAATGACGGGAAAGATGGAGCAGATGGTCATGACGGAATTGCTGGTAAAGATGGTACTGGAATCAAAACTACGACCATTACATACGCAGGTTCAACAAGCGGAACGACAGCACCAAATACTGGTTGGACTACCACAGTTCCGACAGTTGCAGCAGGTAATTACCTGTGGACTAAGACTGTTTGGGCTTATACGGATAATACCAGTGAAACAGGATATTCAGTTGCGATGATGGGTGTTAAAGGCGATAAGGGAGACCAAGGCCCAACTGGTCCTGCTGGAAGTGATGGTAATCCCGGTAAAGTAATACAACAAAATACAGAGCCAACAAATAAATTTTTAGATATGTTATGGCAATATACTGGAACAGAACCATTGAACGCTACAGGTATCACAGTTTTATCAAATATAATCTATGTATGGAACGGTACGGCTTGGCAAATTTGGTTATTAAATCCGCAAAACATACAAGCAGTAAATGCATGGATTACAAACGCAATGATTGGTAATGCAGCTATTAAACTAGCAAATATTGATACTGCAACAATTACAGAACTTTCTGCTGTAACTGCAACACTTGGAGATGTCGAAGCTGGAAGTATCACAAATGATATTTCTTATGGATTCGTTGCTCAAGGTAATCATCATTATCTTGGTAATAGTGTAATTAATTATCGAGGAATCAATATTTCTGAAACAATGACCTTAGATAACGTATTGCAATATACTCAATCTATGGGATTTGATGCAATTACAGGTTTATTTTTCCAACGTTTAAGTGAAAATAAAGATATTATTTCCAGTATTAGACTCATTGAGGTTGGTAATAATGAGATGGGATTATATGTTGGTAATGCTACTGAATTTGCAACTTTAACATCCAAAGGTCTTGCCCTTTCTACTGACGTTCCTTGGACAATCTTATCGCCAATGGGTGGGTTTAGTGGCGGTTCAATTCAATTTTCTGTACAAAACGGGGTTGAATTTTTCTCTATTGCAGGCTTGAGTGTCCCTCAGATGAATGCAAACCAATGGTATCAAGCCACTTCGCTTCCAGCAGGAAGTATTGCAATTCCTAGTATAAATAGAGTATATCCGATATCAGGGAATAATAATGCATGGGATTTGCTTATTAATCCGGCAGGAGGTGTTTTTATAAGGTGCCAAGCAGCAGTATCAGCAACTTCAAATTTAGTTAATGGTGGATGTGGTTTCCCAATAGGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8d1d45a3c85770ebf863b4b5ddbe5c1d4447e51b6ddb58ab39d140f31cfa79cd
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7167
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50