Protein

Genbank accession
AOO10405.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MALTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSIQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYVVDNRPGEVLYTNVAPIDENSNLDLTSPNNVLYKYNSIEGGIIVPRGASLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTVFAAKGINTEDQVPSRTSIFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYFKPDSVETLAPKFSHHRLTCFEFADGVNSLSTLISQGRVPNSDYSAVPNILERTDLEIYYQKVSKAFASIPDTSGDPAADQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGNTATAVTVDEFDNPRDHGFSVGVNINISGVTGSTGPQSELDASLYNGSFTVTSASGNIFTYQMIQEPTGNAVGSNVTVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMLADGSRATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNESTGNYDVASAGDGAHLDGFAEYRKGWAHRHIVASNDAFIQAVSVFAVGYGSHFTCESGADMSITNSNSNFGNTALRAAGFKAKSFSKDKAGEITHIVPPKALNVISTIASGASGEASITLANDGSVNGVVQGMTVTGDNIGTGATVVSVNTNTRIITLSVVNSDAVNGNVIFGEETSVNWVNIDIQRTKVINQSLAGAGGTPGTRLYLYGYTAPAGAPTTRVQGYTVGARQDGTGVSAIPDKINCLLVAQGATEATVQSAFISPYGPSVSGLAAGVAGSPIQYDSNTYTISGVAGQVGGWYLSVDSVDNDIYTTLSTNTRYNNVNFTPTTFLRRIPDPRDLADRTFRIRLKIDKDKTNPLPRDPLSGYVLQPLNSDSTNYKLDKTFYIYDIEKVQEFERGVSDGLYYITLLCASITPSTSNFNDRKFSQNVNEVYPTFDRDNPVADPNPAVSVADNETIGLVYSTDGATPTPNKDPKRSITKEAIKFLLTDTGWTQPGTTPNFDSVNNRLSNVELTARAGDEEVRKINIRENNDGTVAPIPVEFRRHSILRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLSADQVKFSQSIKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVVGEENTTIETFSELVLTDKLTVIGGASNQLESIFAGPVTFQGQVSSTSNLIAKKITYNNQDGTVIKQTLLAPEDALGQPDFTNITGYTTPSDGDLVYNINWTPGKSLGWIYYQGLWKEFGITDTGQIDIQTFVDGDGVDQQHLGFGVAANSTYRANILGNVRIDGNLTTTGTGGISADKYVTRTYTGDGNTLTYNITTFTGGVKHTADSLLVFLNGVAQIGGTNFSVDANGANIIFGAGDAPLSTDTIHIIELPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1325 AA
molecular weight: 142705,44240 Da
isoelectric point:4,81099
aromaticity:0,09283
hydropathy:-0,23442

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RIM8
[NCBI]
756278 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO10405.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349286.1 [NCBI]
CDS location
range 23253 -> 27230
strand +
CDS
ATGGCTCTTACTAGACTTAAGAATATTATTACGTCCAGAACTGGACGTATTATCTACGTTAACCCTGACGATTTCGATGCATCTGATGCTATTGATAATAGGGGAAACTCTGCACTTCGTCCGTTTAAGTCTATTCAGAGGGCATTCTTAGAAGTTGCTAGATTTTCGTATCGAGTCGGTCTGTCAAACGACGAATTTGACGCCTTCTCGATTATGCTTTATCCAGCAGAATATGTTGTTGATAACAGACCTGGAGAAGTTCTTTATACAAACGTTGCTCCTATTGATGAAAACTCTAACTTAGATTTAACATCACCAAACAACGTTCTTTACAAATATAATTCTATTGAAGGTGGTATCATTGTTCCTAGAGGTGCTTCCCTCGTTGGTACTGACCTTCGTCGTACAAAAATTATTCCTAAGTATGTTCCCTATCCTACAGTATTTGCTGCAAAGGGAATCAACACAGAAGACCAAGTTCCTTCTAGAACTTCAATCTTTAAGGTAACTGGTGGTACTTATTTCTGGCAATTCTCGTTCTTTGATGGTGCTGAAGAGGGTGTCTATTTCAAACCAGATAGTGTAGAAACACTTGCACCTAAGTTCTCTCACCATAGATTGACATGTTTCGAGTTTGCTGATGGTGTAAACTCTCTTTCAACTCTTATTAGTCAAGGAAGAGTACCAAACTCAGACTATTCTGCAGTCCCTAATATCCTTGAAAGAACTGACTTAGAGATTTACTATCAGAAAGTATCGAAAGCATTTGCATCAATTCCCGATACATCTGGAGACCCTGCAGCAGACCAAATTCAGGCAAGAGTTGAAGAAAACAGAATCGTTGGTCCTATTTCTGACGAATATCGTGTTCTTCAAATTACTCGCAACGGCAATACTGCAACCGCAGTTACTGTTGATGAATTTGATAACCCCAGAGACCATGGATTCTCTGTTGGTGTTAACATTAACATCTCTGGTGTTACTGGTTCTACTGGACCACAATCAGAACTGGATGCTTCCTTGTATAATGGTTCATTCACAGTAACATCTGCGTCTGGTAACATTTTTACCTATCAGATGATTCAAGAACCTACAGGTAATGCCGTTGGTTCTAACGTTACAGTTAAGACTGAGATTGATACTGTTGACTCTGCATCACCATATGCGTTCAACTTGTCTCTTAGAAGTGTCTGGGGCATGAATGGAATGCTCGCAGATGGTTCTCGTGCAACTGGTTTCAAATCGATGGTTGTTGCACAGTTTACGGGTCTATCTTTGCAGAAAGATGATAGAGCGTTTGTAAGATATAATGAGTCTACTGGTAACTATGATGTTGCATCTGCTGGTGATGGTGCTCACTTAGACGGTTTTGCTGAGTATCGTAAAGGTTGGGCACACAGACACATTGTTGCATCTAACGACGCATTTATTCAGGCAGTTTCGGTGTTCGCGGTTGGATATGGTTCCCACTTCACTTGTGAGAGTGGTGCTGACATGTCCATCACCAACTCTAACTCCAACTTCGGTAATACCGCTCTTCGTGCTGCTGGATTTAAGGCAAAATCTTTCTCTAAAGATAAAGCAGGAGAGATTACACATATTGTTCCACCTAAAGCACTTAATGTTATTTCAACAATCGCAAGTGGCGCTAGTGGCGAAGCATCAATCACTCTTGCAAATGATGGATCGGTTAATGGTGTTGTTCAGGGAATGACTGTTACTGGAGACAATATTGGAACTGGAGCAACAGTTGTCTCTGTCAATACAAATACTAGAATTATTACACTTTCGGTAGTTAATTCTGATGCAGTTAATGGCAACGTAATTTTTGGTGAAGAAACTTCTGTTAACTGGGTCAACATTGATATTCAACGTACTAAAGTAATTAACCAGTCTCTTGCTGGTGCTGGTGGTACTCCTGGCACCAGACTTTACCTCTATGGATATACTGCTCCTGCGGGTGCCCCAACAACCAGAGTTCAGGGTTATACAGTTGGCGCTCGTCAAGATGGTACTGGAGTAAGTGCAATTCCTGATAAAATTAACTGCTTATTGGTTGCCCAAGGTGCAACTGAGGCGACAGTACAATCTGCATTTATTTCACCCTATGGTCCCAGTGTATCTGGTCTCGCTGCTGGTGTTGCTGGTTCACCCATTCAGTACGATAGCAATACCTACACTATTAGTGGAGTTGCTGGACAAGTCGGTGGTTGGTATCTTTCTGTTGATTCTGTAGATAATGATATCTACACAACACTGTCTACTAATACTCGTTATAACAATGTCAACTTTACTCCAACTACATTCTTAAGAAGAATCCCTGACCCTAGAGACCTTGCAGACAGAACATTCCGTATTCGTTTGAAGATTGATAAAGATAAGACTAATCCATTACCCAGAGATCCCCTGAGTGGTTATGTACTACAACCATTGAATAGTGATAGTACAAACTACAAACTTGATAAAACTTTCTACATTTACGATATTGAAAAAGTACAAGAGTTTGAGAGAGGTGTTTCCGATGGACTTTACTACATTACCCTCCTTTGTGCATCTATTACACCTTCAACTTCTAACTTCAACGATAGAAAGTTCTCCCAAAACGTCAACGAAGTCTATCCTACGTTTGACAGAGACAACCCTGTTGCTGACCCTAACCCTGCTGTATCCGTCGCTGACAACGAAACTATCGGTCTAGTATATTCTACTGATGGTGCAACTCCAACTCCAAACAAAGACCCCAAACGTTCTATTACTAAGGAAGCGATTAAGTTTCTTCTGACTGATACTGGTTGGACACAACCAGGTACAACACCTAACTTTGACTCTGTTAATAATAGACTTTCTAACGTTGAACTTACTGCTCGTGCTGGTGATGAAGAAGTTAGAAAGATTAACATCAGAGAGAACAATGATGGAACAGTTGCTCCTATTCCAGTAGAGTTCAGAAGGCACTCCATCTTACGTTCAGGTAACCATACGTTTGAATATCTTGGTTTCGGTCCTGGTAACTATTCTACCGCATTCCCCCAGACTCAGGTAGAAACTCTGAGTGCAGACCAAGTTAAGTTCTCGCAGTCTATTAAGGAAGAAGCAGGTGTTGCTTTCTATTCTGGTTTGAACTCTAACGGTGACCTGTTTATTGGTAACCAGGTTATTAACCCTGTTACTGGTCAAATTACAAACGAAGATATTGCACAACTGAACGTTGTTGGTGAAGAAAATACAACAATTGAAACATTCTCTGAGTTGGTTCTTACCGATAAACTTACGGTTATTGGTGGTGCATCTAACCAGTTGGAATCTATCTTTGCTGGTCCTGTTACTTTCCAAGGTCAAGTATCTTCTACTAGTAACTTAATTGCTAAGAAGATTACCTACAATAACCAAGATGGTACTGTTATTAAACAGACCTTACTTGCACCAGAAGACGCACTGGGTCAACCAGACTTTACTAATATCACTGGATATACCACACCTTCCGATGGTGATTTAGTTTACAACATTAACTGGACACCTGGTAAATCTCTTGGATGGATTTACTATCAAGGTCTTTGGAAAGAGTTTGGAATCACAGATACAGGTCAAATTGATATTCAAACGTTTGTAGATGGTGATGGTGTAGACCAGCAGCATCTTGGTTTTGGTGTTGCTGCTAACAGCACTTATAGAGCAAACATTCTTGGTAATGTTCGAATTGATGGTAACTTAACTACAACTGGTACTGGTGGTATTTCTGCTGACAAGTATGTCACCAGAACATATACTGGTGATGGCAATACTCTCACCTATAATATCACCACATTCACTGGTGGTGTTAAGCATACGGCGGATTCTCTGCTAGTATTCTTAAATGGTGTTGCTCAGATTGGTGGAACTAACTTCAGCGTTGATGCAAATGGTGCCAACATTATCTTCGGTGCTGGCGATGCACCACTCTCTACGGATACGATTCATATCATTGAATTGCCTATCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
ced890010c32533c01aeb8a28794e3ca46a0b45ecb83f04fe4bcb406b961bfe7
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,3846
Evidence 0,3846

Literature

No literature entries available.