Protein

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Genbank accession
XAI94017.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MSSKIKFTDQYILSSVGQTSNNIVYLQVNDDQQLVVTHPMYATEWSTLGGLRVTGDQSKFDGSLEVGYELLVGQTSTFNNDMVVNGLVTVNRDSLDAMLIHGNVTLHGNLTVVGSSSGTTPGQVTISDNIMVVNTDDVGPGVTATYSGFEVQRGIPVGETNSHGEPGQGKLPSAGLVWNEVQKSWDLNYNPILSEKLPQNPRIINLGQPVADNDASTKKYVNDSITAALDDDIYLDRLTDVTISSPANKNILQYDSSTSQWRNLPYSFIRLTDVTGVSVPRGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGSLSFLSDVTLSSLSNTQALFYNGTSWVNRLINYSDIQNTPTNNSYSFIGLNDTNNTVVNNGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGSLDYLTDVSIGTASSGNVLRYNGTDWVNQVLSYTDLSNTPTNNSYSFIGLNDTNDTALSGGYLRWNPTGTQIVYQSTIDYAQLTGLSSVAKAGQGALSFLSDVTISSPGASNTLRYDTTSSKWVNTRLAYSDLTGQPTSANYQLVGLSDTASTSVPLGYLRWNAAGTQVTYATTIDISVISGKSTVASAGSATLSNLEDAAVTTPAAGNTLIWNTSTNKWTNGILDVSNITNAVPVSRTVSAGTGLSGGGNLSSNITLSVNRTLTDTWYAAASHTHDASNITSGVIANARLPVGSTTAQGILQLTDGVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHDASNITSGTIAVARLPVSSTTAQGIVQLTDGVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANASHTHDASNITSGVIANARLPFASTTVYGIVTLLDSVASTSISTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHTPAQVGLSNISNNGNTITGNTTISGALSVTGNAVFNTSDIKLKDNIQPIKNPVELLSKISGYTYTRNDCNNEKQTGIIAQEVETIQPESVREVDGIKTVNHNGIIALLVSAVNELSKEIEELKQQLSYKKRD
Physico‐chemical
properties
protein length:1008 AA
molecular weight: 106468,08770 Da
isoelectric point:4,93791
aromaticity:0,06448
hydropathy:-0,18740

Domains

Domains [InterPro]
DC_0911
ATT
1–387
DC_0911 DC_0165 IPR005068 DC_1854 IPR005068 DC_0203
DC_2293
STR
527–765
DC_2293 IPR005068 IPR030392
DC_1854
STR
807–886
DC_1854 IPR030392 Coil
XAI94017.1
1 1008
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 1-387 | STR 443-886 | RBD 887-1008
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage vB_Pa-PAC2
[NCBI] 		3127731 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Pseudomonas aeruginosa PAO1
[NCBI] 		208964 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales > Pseudomonadaceae > Pseudomonas

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XAI94017.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP408249.1 [NCBI]
CDS location
range 75593 -> 78619
strand +
CDS
ATGTCGAGTAAAATTAAATTCACGGATCAATATATCCTATCTAGTGTTGGGCAAACTTCTAATAATATAGTATATTTGCAAGTAAATGATGATCAACAATTAGTTGTTACTCATCCTATGTATGCAACTGAATGGTCTACATTAGGTGGGCTTAGAGTAACAGGTGATCAGTCTAAATTTGATGGATCATTAGAAGTTGGATATGAATTGCTAGTAGGACAAACATCTACCTTTAACAACGACATGGTAGTAAACGGTTTAGTTACAGTAAACAGAGATTCTCTAGATGCAATGCTCATTCACGGGAATGTTACATTACATGGCAACTTAACTGTAGTAGGTAGCAGCTCAGGGACTACACCCGGGCAAGTAACTATTTCCGACAACATTATGGTCGTGAATACAGATGACGTAGGTCCGGGCGTCACTGCAACATATTCTGGTTTTGAAGTCCAGCGTGGAATTCCCGTAGGCGAAACTAATAGTCACGGTGAACCTGGCCAAGGTAAATTGCCTTCTGCTGGATTAGTTTGGAATGAAGTGCAAAAATCCTGGGATCTTAATTATAACCCTATTCTTTCTGAAAAATTACCACAAAATCCTAGAATAATTAACTTAGGGCAGCCAGTTGCTGACAACGATGCTTCTACAAAAAAATATGTGAATGATAGCATAACTGCTGCACTTGACGATGATATTTATTTAGATAGACTTACTGATGTAACAATTTCTTCTCCGGCTAATAAAAATATACTACAGTACGATTCTTCTACATCGCAATGGAGAAATTTACCATATTCGTTTATACGATTAACGGATGTAACTGGTGTATCTGTCCCGAGAGGATACGTGAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGATTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGTCAAGGATCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACATTATCATCGTTATCTAATACACAGGCATTATTTTATAATGGAACCTCTTGGGTTAATAGACTAATTAATTACTCCGACATTCAAAATACTCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGATTAAATGATACAAATAATACAGTTGTTAATAACGGATATGTAAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGATTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGTCAAGGATCGTTAGATTATTTAACAGATGTTAGTATAGGAACTGCTAGCTCCGGTAATGTACTAAGATATAACGGAACTGATTGGGTAAACCAAGTATTATCATATACTGATCTTTCTAATACCCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGGTTAAATGATACTAATGATACTGCACTTTCGGGTGGTTATTTACGATGGAATCCCACCGGAACACAGATAGTATATCAATCCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGGTTATCTTCTGTTGCTAAAGCAGGACAAGGGGCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACTATATCGTCACCTGGCGCTAGTAATACATTGCGATACGATACTACTTCATCTAAATGGGTAAACACCAGACTTGCTTATTCCGATTTAACAGGTCAACCGACTTCTGCTAATTATCAACTAGTTGGGTTAAGTGATACTGCAAGCACATCTGTACCATTGGGATATCTTAGATGGAACGCCGCCGGAACTCAAGTAACATATGCTACTACTATAGATATATCAGTTATATCTGGTAAATCTACTGTAGCTTCTGCTGGTTCGGCAACACTATCTAATCTAGAAGATGCTGCTGTCACAACGCCTGCTGCTGGGAATACTTTAATATGGAATACGTCTACAAATAAATGGACAAACGGCATATTAGATGTATCTAATATTACTAATGCTGTACCTGTTAGTAGAACAGTATCTGCAGGGACTGGACTATCCGGCGGAGGAAATTTATCTAGTAATATTACGTTGTCGGTTAATAGAACATTAACCGATACATGGTATGCTGCTGCATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGACTGCCAGTTGGAAGCACAACAGCACAAGGTATTTTACAGTTAACAGATGGTGTTGCTAGCACATCTACAACTACTGCCGCTACACCCAATTCGGTGAAAACTGCATATGACTTAGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTACTATTGCTGTAGCCAGACTTCCAGTTTCGTCTACTACTGCACAAGGTATAGTTCAGCTTACTGACGGTGTTGCTAGCACATCTACAACTACTGCTGCTACACCTAATTCAGTAAAAACTGCATATGATTTAGCAACGACAAAAGCTAATGCTTCTCACACCCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGACTGCCGTTTGCCTCAACTACTGTATATGGTATAGTAACTCTGTTAGATTCAGTTGCCAGTACATCTATATCTACTGCTGCTACACCGAATTCGGTGAAAACTGCATATGACTTAGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACACATACTCCTGCTCAAGTAGGTTTATCGAATATTTCTAATAACGGAAATACTATAACGGGAAATACAACTATATCCGGTGCATTGTCAGTAACAGGAAATGCTGTTTTTAATACATCTGATATAAAATTAAAAGATAATATACAGCCCATTAAAAATCCAGTAGAACTTCTTAGCAAAATTTCAGGATATACCTATACTAGAAATGATTGTAATAACGAAAAACAAACCGGTATTATTGCGCAGGAAGTTGAAACGATACAACCTGAAAGTGTAAGAGAAGTAGACGGTATAAAAACTGTAAACCATAATGGAATAATTGCACTGTTAGTTAGTGCAGTTAATGAACTTTCTAAAGAAATAGAAGAATTAAAACAACAACTTTCTTACAAAAAAAGGGACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0a721da7542bf845c3131f5f749b2b5cfb0e23136019399d829c4a9a8fd3031e
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5820
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50