Protein

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Genbank accession
QHR70554.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit adhesine
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,80
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKSIQFKRSKIAGAKPTAAQLDEGELAINLRDRTIFTKSDQGQIIDLGFAKGGTIDGDVLQNGTFNLNGNQYVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYINETGDSKYWTFNRNGNFQVDSGSLMVSAGNISASGNINSANGIITGPEIVTKNINFSTKTFVANANIGYDWVSLPTWVYNPPADGSDDTTNGLNYLRKLRASSASSIFHEIADCRKGKPQEISWWTGVGPSSFQWAFDNSGRITAGKSISVGLPDNGTNGRYPLDSAISIGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDFMANGISSATILNNGINSTKKLMVGYSRDSGTTWDFPNNNQAMFTARTDVDDNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGQGRMSVSMGDGLLVEPGILDVKTGSNRVAIRADGTFDSTNRISMRTGLFLNGDDNTNALSFKAPSGVDGTKTINWDAGTRNGQNKNTVTIKAWGNSFNAGGGNRETVFEVSDSQGYYFYAQRTNPSVAGGVGPVNFKFNGTVETGHIVGLGDITASGKGSFGGGVTFENGAAIRGGANISGQVKIGGVNDALRIWNDRYGAIFRRSETSLHIIPTNENEGENGPISNLRPFSIELGTGAINIGHSLMIGNSARGDGLLNIDTKAFLITINSHSKINPNYRMDLENGAYINALMDANGRSAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRDDTSTYVPMIKQRYVQGNGCFSIGTLLNNGNFRVHYHAGGDGGSTGAQIADYGWEFTKSGDFVSPKRVSAGGSVYLGTDGNITGGSGNFSNLNTTLDRKVTTGWINYSSASGWYKLATVNMPQGVATVQFKITGGSGFNVGIFKQATINEIVLRSGNNTPKGINGVLWQRETDAIKDIAYVNTSGDEYDVYINCGTYLNRLTLEYSTSENASVVVHGLYGPTQSPVEELPVDTVKGRVFKLLNNSSDVFDAGSSNISTNATFVANTTVGFRHKSNGDESGSAATLFYNDGTTFHILLTDKNTDTDKTKASGSNNSLRPFSINIASGKVTISNSMSVSGVAEFYNGLNLKNNGSINFDKSGANPRNMCIFHAGDASRGNRIEIADESNYIVYFEKTPGGANRSSYNQCEVNGITTLNVNTKINTPQIGAFGVNTTNAWGGNSIAIGDNDTGFRQVGDGLLEVWTNAARRMRFQGGDTYSDMNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALEKVEQLDGLIYDKADYIGGEVVHTEAGVIAQKLNDVLPEAIREVEDIKGNKVLTVSTQAQVALLIEAVKTLSAKVKELEAKLN
Physico‐chemical
properties
protein length:1324 AA
molecular weight: 142204,80070 Da
isoelectric point:6,24873
aromaticity:0,09063
hydropathy:-0,37855

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–949
DC_0538 DC_1942
IPR030392
CHP
1226–1282
IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1226–1323
IPR030392
QHR70554.1
1 1324
Architecture
STR
ATT
STR 1-949 | ATT 1066-1323 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QHR70554.1
1 1324
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 302 302 0,0846
Central domain 303 501 200 0,4600
C-terminal 502 1324 822 0,6183
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-302
Central
303-501
C-terminal
502-1324

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage dhaeg
[NCBI] 		2696391 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR70554.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850609 [NCBI]
CDS location
range 4253 -> 8227
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAATCGATACAATTTAAAAGAAGTAAAATAGCAGGAGCCAAGCCTACTGCAGCCCAGTTAGATGAAGGTGAACTGGCTATTAACTTGCGTGATCGCACTATTTTTACTAAGTCAGACCAAGGTCAGATTATTGATTTAGGCTTTGCAAAGGGTGGGACCATTGATGGGGATGTTCTTCAAAACGGGACATTTAACCTCAATGGCAACCAATATGTTTATGCAGGTAAATACATCGAATTCCTGCCTAAAACAGCTGGCAACGGCGCCTGGGCTAACCAACATCTGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTGAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCACCCTTTGATTAAGCAACGTTATAAAGACGGTACTTTTTCAGCAGGTACATTAGTAAACGAAGGCAGTTTTAAATTCCACTATATTAATGAAACAGGTGATTCAAAATATTGGACCTTTAATCGTAATGGTAATTTTCAAGTTGATAGCGGTAGTTTAATGGTATCAGCAGGTAATATTTCTGCATCAGGAAACATAAATTCAGCTAATGGTATTATCACCGGTCCTGAAATTGTTACCAAAAATATTAATTTCAGTACAAAAACATTTGTAGCTAACGCCAACATCGGGTATGATTGGGTTTCATTACCTACCTGGGTTTATAATCCACCTGCTGATGGCTCTGATGATACTACTAACGGTTTAAACTATTTGCGTAAATTGCGTGCATCAAGTGCATCAAGTATTTTCCATGAAATTGCTGATTGTCGCAAAGGTAAACCACAAGAAATTTCTTGGTGGACTGGTGTAGGTCCTTCATCTTTCCAATGGGCGTTTGATAACTCTGGACGTATTACTGCGGGTAAATCTATTTCAGTAGGTCTTCCGGATAACGGTACAAATGGACGCTATCCTTTAGATTCCGCCATTTCTATTGGTATTGCAATTGGCGATAACGATACCGGTATTAAATGGGTCCGCGATGGTGTTATTGATTTCATGGCTAATGGTATTTCATCTGCTACCATTTTGAATAACGGTATTAATAGCACTAAGAAATTGATGGTTGGTTATAGCCGTGATTCAGGTACTACATGGGATTTCCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCACGCACTGATGTCGACGATAATAATAACGGTGATGGGCAGACTCATATCGGTTATAGCAGCAATGCAAAGATGTATCACTATTTCCGTGGCCAAGGTCGTATGTCTGTTAGTATGGGCGACGGGCTTCTTGTTGAGCCGGGTATTTTAGATGTTAAAACCGGGTCCAATAGAGTTGCTATTAGAGCAGATGGTACATTTGACTCCACCAATCGCATTTCTATGCGTACTGGTTTATTTTTAAACGGTGATGATAATACCAATGCATTATCATTTAAAGCTCCTTCCGGTGTAGATGGTACTAAAACCATTAACTGGGACGCCGGCACCCGAAATGGCCAGAACAAAAATACCGTTACAATTAAGGCATGGGGTAACTCATTTAACGCGGGCGGTGGTAATAGAGAAACTGTATTCGAAGTATCAGACTCACAAGGATATTATTTCTATGCTCAACGTACTAATCCATCCGTTGCTGGTGGTGTAGGACCTGTTAATTTTAAGTTTAACGGAACTGTTGAAACAGGTCATATCGTTGGTCTTGGCGATATTACCGCTTCAGGTAAAGGTTCTTTTGGTGGTGGTGTTACTTTTGAAAATGGAGCGGCTATTCGCGGCGGCGCTAATATAAGCGGCCAGGTTAAAATTGGTGGCGTTAACGACGCATTAAGAATTTGGAACGACCGGTATGGGGCTATTTTCCGCCGCTCAGAAACATCATTGCATATTATCCCAACCAATGAAAACGAAGGGGAAAACGGGCCGATAAGCAATTTACGTCCATTTAGTATTGAATTAGGTACTGGCGCAATTAATATAGGCCATTCTTTAATGATAGGCAACTCGGCTCGAGGCGATGGCCTGCTGAATATTGATACCAAAGCATTCTTGATTACAATTAACAGTCATTCTAAAATTAACCCTAACTATCGTATGGACCTGGAAAACGGTGCTTATATAAATGCTTTGATGGATGCAAATGGTCGTTCAGCTGGTGCAGGTTCATTTGCTTCCCAGAATAATGAAAATGTCCGCGCTCCATTCTACATGAATATTGACCGAGATGATACTAGCACTTATGTTCCAATGATTAAGCAACGTTATGTTCAGGGTAATGGATGTTTTTCAATCGGTACTTTGTTGAATAACGGCAACTTCCGCGTTCATTATCATGCTGGTGGTGATGGTGGTTCGACCGGTGCTCAGATTGCGGACTACGGTTGGGAATTCACTAAATCAGGTGATTTTGTATCTCCTAAACGTGTTTCTGCTGGCGGTTCTGTTTATCTAGGTACGGATGGTAATATCACTGGTGGTTCTGGTAATTTCTCTAACCTGAATACTACTTTAGACCGCAAAGTTACCACGGGCTGGATTAACTATTCTTCTGCAAGTGGTTGGTATAAATTGGCAACAGTAAATATGCCTCAAGGTGTAGCTACGGTCCAATTTAAAATAACAGGCGGCTCTGGTTTTAACGTTGGTATTTTCAAACAAGCAACAATTAATGAAATTGTATTACGTTCTGGTAATAATACGCCTAAAGGAATTAACGGTGTTTTATGGCAACGTGAAACAGATGCTATTAAAGATATTGCGTATGTTAATACCTCAGGCGATGAGTATGATGTTTATATTAATTGTGGCACTTATTTAAATAGACTTACTCTAGAATATAGCACTTCAGAAAACGCCTCAGTAGTAGTTCATGGATTATACGGGCCTACGCAATCACCGGTAGAAGAGCTTCCTGTAGATACTGTTAAAGGTCGTGTTTTTAAACTTCTTAATAATAGCTCAGACGTTTTTGACGCGGGTAGTTCTAATATTTCTACAAATGCCACCTTTGTTGCTAATACAACTGTAGGTTTCCGCCATAAATCCAATGGTGATGAAAGTGGTTCTGCCGCTACTCTGTTTTATAATGATGGTACGACGTTCCATATATTATTAACAGATAAGAACACTGACACTGATAAGACTAAAGCCTCTGGTTCTAACAACAGTTTAAGGCCTTTTTCTATCAATATTGCTTCCGGTAAAGTAACTATTTCAAACTCTATGAGTGTTTCTGGAGTTGCAGAGTTTTATAATGGCCTTAACCTCAAAAATAATGGAAGCATTAACTTTGATAAGTCTGGGGCGAACCCGAGAAACATGTGTATATTCCATGCAGGTGATGCTTCTCGTGGAAACCGTATTGAAATAGCTGACGAATCAAATTATATTGTTTATTTCGAAAAAACTCCAGGTGGTGCAAACCGTTCTTCATATAACCAGTGTGAAGTAAACGGTATAACTACTCTTAACGTTAATACCAAGATTAATACGCCTCAAATTGGTGCCTTTGGTGTCAACACAACTAATGCCTGGGGTGGTAACTCGATTGCAATTGGCGATAACGATACGGGTTTCAGACAAGTTGGTGACGGGCTTTTAGAAGTTTGGACCAATGCCGCCCGCCGAATGAGATTCCAAGGTGGCGACACTTATTCAGATATGAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTGAAATCAAACTTCAAACCAATTGAAAACGCTCTTGAAAAGGTTGAACAGCTTGATGGTTTAATCTATGATAAAGCTGATTATATTGGTGGAGAGGTTGTTCATACTGAAGCTGGTGTTATTGCTCAGAAATTGAATGATGTATTACCTGAAGCTATTCGTGAAGTTGAAGATATCAAAGGTAATAAAGTTCTGACAGTTTCGACTCAGGCACAAGTTGCTCTATTAATTGAAGCAGTTAAAACCCTGTCGGCTAAAGTAAAAGAACTTGAAGCTAAGTTAAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
41f6d2501c85212e91dcf85574aa6bdd84b88f48f4db65171ee80e21544b635f
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4769
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank