Protein
View in Explore- Genbank accession
- XUI95521.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MYSIKTDLDVSGNSTVGKDLLVKGNAVFSNDLTVNGEVSFANAVFTAITAGSVNVTGALDVAGKATLSGGADVSGAATFAGNITAADGTTAKFDNLEANSGSFNSVESTDITSTGTATFKDVNISGTLGGTFNLSDINATTLNVSGASALTGSVTLGANITGLASTANFRDIRIGPNEAGQAYRLNFGYTVPGQRPTVLLQNEVQSELMSPAKLNVLQTATFGDSSLSTYGITGNGLNKLDYVTISGNAIQSPTTPLLEVTKGKTKVVDLEVTGVATIPNIESSGTANFNNINVSGTIGGSFDLDDIQATTLSVSGASALTGAVTLGANITGLASTATFKAINLGQNTADANVKLGFAYTAPSARPTVLLANEVQSELMSPAKLNVLQTATFGSAALSTYGITGNGLNKLDYLTITGNATQNPATPQLQVGGKAILNDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPKSVVAAEVIKGQTLESVGQTTVGSSLQVGGAATVTGALSAASGTFSGDVSGSKGIFSDSVSGTSATFTGDVSGDNATFSGDLSAVAGTFSGDVTVTGQTITVKDLVVTGTSTGVTAIADVDGLDIAPNKVDVTTTLSVAGESTLAGVTATSINSTGAIAGTAISGSTITATGEISGASSVVTGLSKSGSVETGALKASSVETAIISNTAGVSITNNTSIAGNLSVTGTVTPGAIDLSTTDIDAKSLTTTEGANIGGDLVVAGTVDLSAADVAVKSLTSTGAVISSEGTVSSVLPKLSSTEANITTVTATTANATTLNVTGTSTLAGVNASGAITSATNITATGVLKGASVETASISNADGVAINNNTTITGNLDVSGTLTPGAIDLSTTDISSKSLTTTEGATIGGDLVVAGTVDLSAADVSVKSLASAETITSAGVITVSDTVNSSTLPKLITTDATIGAVHAATIETTGSSTLKQVSATEVTATSIVLNSVGEGLRVDNNANINGILSVNNITSTNDTIAIAKSAAITGDLTVSGTLTPGAIDLSTTDISSKSLSTTEGATIGGDLVVNGSIDLSSSNVSAITLASSGNTTVGGNLVLTTGVVTGSPSVSGNLSVAGTAAVTGATTLTDIVNIGKKVTVSTGGIQVVAGGINTDAILVSGDTTLNNTTVNTTLNVTGQSTVAALSAASLNVSGDSTVQKLTVEGELVPQGGIDLTGADISANSLATASTITATGLSTLSGGVSTTNVTASGTVNAGSLDVTNNATVGGNLGVTGSLTSGPLSVTGIANITGVTTVGSLVSGAVSGSTGTFSSTLGVTGAATFDNDVTVEGVFTPAGGLDLTTSDITAKSLSVSETIHSDGAASFGGNTTVGGTLGVTGAVTAPSATLSGTGTALAVTNNATIGGTLGVTGQASLGSIVTSGVSATSGSFSTTLGVTGAATFGNDVTVVGTLTPGSLDLTGADISAKTLTLSETLNATGNTTLGGTLGVTGLATIGGTLTSGAVTAPSATLNGSGTGLAVTNNATVGGTLGVVGQTTLGSVKTGATLTVGTPLGEQPETVQIMPDTYIAGKLRVEGGINADIDVGGQTLEPFAVIASDSLSSAGNITAGAAIISSSATIGEVGSQNNNLIVNGNVVNNGNFTVTGVLNAQLNQADSDVAVKSLTATNNVAAGTTLSAGTAITAGTSITATGLLKGNTLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITAGNLTVGGDISATGTAGFGATTVSTITTSGLATLASTSVTGNATVGGTLAVTGALTANGNVTLGDAAADVLTVNATSSFKENAVFDKAVTVTGELTTTNANLTTTTVTTKKYDVIPTQVTSSVIAPTGTWTPDGTSNVYFITLDQDTTLAPITGLIGGGKAASVYIYVKQDTTGNRNFTTDGTYAVVDGELNKTAGSVTIYQVIYDGVSPVTDLFIAQRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1906 AA molecular weight: 184987,95400 Da isoelectric point: 4,09499 aromaticity: 0,02833 hydropathy: 0,29565
Domains
Domains [InterPro]
DC_0092
STR
1–277
STR
1–277
DC_0092
STR
252–594
STR
252–594
1
1906
Architecture
STR 1-1125 | STR 1238-1388 | RBD 1501-1906
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage WPEC5 [NCBI] |
3425169 | Viruses > |
| Host |
Escherichia coli [NCBI] |
562 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XUI95521.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV654397.1
[NCBI]
CDS location
range 229059 -> 234779
strand +
strand +
CDS
ATGTACTCGATTAAAACGGATCTTGATGTATCTGGTAATTCCACGGTAGGTAAGGATCTTTTGGTCAAAGGTAATGCAGTATTCAGTAATGACCTAACGGTTAATGGGGAAGTGTCTTTTGCTAACGCAGTATTCACTGCAATTACCGCTGGTTCTGTGAATGTCACAGGTGCATTGGATGTTGCTGGTAAGGCAACCTTATCCGGTGGTGCTGATGTTTCAGGTGCTGCGACATTTGCAGGAAACATTACTGCTGCTGACGGCACAACTGCAAAATTTGATAACTTAGAAGCTAATTCAGGATCATTTAATTCTGTTGAATCAACTGATATTACTTCAACTGGCACAGCAACTTTTAAAGATGTAAACATTTCTGGTACACTTGGTGGTACTTTTAATCTTTCTGATATTAATGCTACAACACTTAATGTGTCTGGTGCTTCAGCACTAACTGGTTCAGTCACATTGGGTGCAAATATCACTGGTCTTGCAAGTACTGCAAACTTCCGTGATATTCGTATCGGGCCTAATGAAGCAGGTCAAGCATATAGACTAAACTTTGGTTACACCGTTCCAGGACAACGACCAACCGTTCTTCTACAGAACGAAGTTCAATCCGAACTAATGTCACCAGCTAAGTTGAATGTTCTACAAACTGCAACATTTGGTGATTCTTCACTTTCAACTTACGGTATTACAGGTAATGGTTTAAACAAATTAGATTATGTAACTATTTCTGGTAACGCAATTCAATCACCAACCACTCCTTTACTTGAAGTAACTAAAGGTAAAACTAAAGTTGTTGATTTAGAAGTAACTGGTGTAGCAACTATTCCTAATATCGAAAGTTCTGGTACTGCAAACTTTAACAACATCAACGTATCTGGTACTATTGGTGGTAGTTTTGATTTAGATGATATCCAAGCAACAACATTATCAGTATCCGGTGCTTCAGCACTAACTGGTGCAGTTACATTGGGTGCAAACATCACTGGTCTAGCAAGTACTGCAACATTCAAAGCAATCAATTTGGGTCAAAATACCGCTGATGCTAACGTTAAGCTAGGTTTTGCATATACTGCACCTAGTGCACGTCCAACAGTCTTGTTAGCAAACGAAGTTCAATCTGAACTAATGTCTCCTGCTAAGTTGAACGTTCTACAAACTGCAACCTTCGGTTCTGCTGCACTATCTACCTATGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAATTAGATTATCTAACAATTACTGGTAACGCAACACAAAACCCTGCTACTCCACAACTTCAAGTTGGTGGTAAAGCAATTCTTAATGATGTTGAATTTACAGGTACTGTAACTGGCCTAACTGTTGATGTGAGTGGACAAGATCTAACTCCTAAATCAGTAGTTGCTGCTGAAGTAATCAAAGGCCAAACTCTTGAATCAGTTGGTCAAACAACTGTAGGTTCATCTCTACAAGTTGGTGGTGCTGCAACTGTTACTGGTGCATTATCTGCTGCCTCTGGTACTTTCAGTGGTGATGTTAGTGGTTCTAAAGGTATCTTCAGTGATAGCGTATCCGGTACAAGTGCAACCTTTACTGGGGATGTTAGCGGTGATAACGCAACCTTTAGTGGCGATTTATCTGCTGTAGCTGGCACTTTCAGTGGTGATGTAACCGTAACTGGTCAAACAATCACGGTTAAAGACTTGGTAGTAACTGGAACTTCAACTGGTGTAACTGCAATCGCTGACGTTGACGGTCTTGATATTGCTCCAAACAAAGTTGATGTTACAACAACTCTATCTGTTGCTGGTGAATCAACTCTTGCTGGTGTTACAGCAACTTCAATCAATAGTACTGGTGCAATTGCAGGTACTGCAATTTCTGGCTCTACTATTACAGCAACTGGTGAAATTTCTGGTGCATCATCTGTAGTAACTGGTCTTTCTAAATCTGGTAGCGTTGAAACTGGTGCTCTAAAGGCATCTTCTGTTGAAACTGCAATCATTAGCAACACTGCTGGTGTGTCAATAACAAACAACACTTCAATTGCAGGTAATCTATCTGTAACTGGAACTGTTACCCCTGGTGCAATTGACCTAAGTACTACTGATATTGATGCTAAGTCTCTAACAACTACTGAAGGTGCTAACATTGGTGGTGACCTAGTTGTTGCAGGTACAGTTGATCTAAGTGCTGCTGACGTTGCTGTTAAATCTCTAACCAGTACTGGTGCAGTTATTAGTTCTGAAGGTACAGTAAGTAGTGTTCTACCTAAACTTTCCAGTACTGAAGCTAATATTACCACAGTGACTGCAACCACTGCAAATGCAACCACACTAAATGTAACTGGTACATCAACTCTAGCTGGTGTTAACGCTTCTGGTGCTATTACTTCTGCAACTAACATTACCGCTACTGGTGTATTAAAAGGTGCATCTGTTGAAACTGCGTCAATCAGCAATGCTGATGGTGTAGCAATTAACAATAACACTACAATCACTGGTAATTTGGACGTATCTGGGACATTGACCCCTGGTGCAATTGACCTAAGTACTACTGATATTAGTTCTAAGTCTCTAACCACAACTGAAGGTGCTACAATTGGTGGCGATCTTGTGGTAGCAGGTACTGTTGACCTAAGTGCTGCTGATGTGTCTGTGAAATCTCTTGCAAGTGCAGAGACAATTACAAGTGCTGGTGTTATTACAGTTTCGGATACAGTGAATTCTAGCACTCTACCAAAACTAATTACTACTGATGCAACTATTGGTGCTGTCCATGCAGCTACTATTGAAACAACTGGTTCAAGTACACTAAAACAAGTATCTGCTACTGAAGTAACAGCTACAAGTATTGTACTAAATTCAGTTGGTGAAGGTTTACGTGTTGACAATAATGCAAACATTAATGGTATATTAAGTGTTAATAATATTACTTCTACCAATGATACTATTGCAATTGCGAAAAGTGCTGCTATTACTGGTGATCTGACCGTATCTGGGACATTGACCCCTGGTGCAATTGACCTAAGTACTACCGATATTAGTTCTAAATCCCTAAGTACTACTGAAGGTGCTACAATTGGTGGTGACCTAGTTGTTAATGGTTCAATTGATTTAAGTTCTTCCAATGTTTCAGCAATTACCCTTGCTAGTTCTGGTAATACTACCGTTGGTGGTAACCTAGTACTAACAACTGGTGTTGTAACTGGCAGCCCATCTGTATCTGGTAACCTTTCAGTTGCAGGTACTGCGGCAGTAACTGGTGCAACTACCCTAACTGATATCGTAAATATCGGTAAGAAAGTAACTGTAAGCACTGGTGGTATTCAAGTAGTTGCAGGTGGTATTAATACCGACGCTATATTAGTATCCGGTGATACAACTTTAAACAACACTACTGTAAACACTACCTTAAATGTAACTGGTCAAAGTACAGTAGCTGCACTAAGTGCTGCATCTTTGAATGTATCTGGTGATAGTACTGTTCAAAAACTAACAGTTGAAGGTGAATTGGTTCCACAAGGTGGTATCGACCTAACTGGTGCAGATATTTCTGCTAATAGTCTTGCAACTGCTTCAACAATCACTGCAACTGGACTAAGCACACTAAGTGGTGGTGTAAGTACTACTAATGTTACTGCATCTGGTACAGTGAATGCTGGTAGTTTGGATGTTACTAACAACGCAACCGTTGGTGGTAATTTGGGTGTAACTGGTTCATTAACTTCTGGACCATTGAGTGTAACAGGTATTGCGAATATTACTGGTGTAACAACTGTTGGTTCATTGGTTTCCGGTGCTGTATCTGGTAGTACTGGTACATTTAGTTCAACATTAGGTGTAACTGGTGCAGCTACATTTGACAATGACGTAACTGTTGAAGGTGTATTCACCCCAGCAGGTGGTTTAGACCTAACAACTTCTGATATTACAGCTAAGAGTTTGTCAGTATCTGAAACTATTCACTCTGATGGTGCAGCTTCCTTTGGTGGTAACACAACAGTAGGTGGTACATTGGGTGTAACTGGTGCAGTAACTGCTCCATCGGCAACCCTAAGCGGTACTGGTACTGCACTAGCAGTAACTAATAATGCAACTATTGGTGGTACATTGGGTGTAACTGGTCAAGCATCACTTGGTTCTATAGTAACTTCTGGTGTATCTGCAACAAGTGGCTCTTTCAGTACTACTCTTGGCGTTACTGGTGCTGCGACATTTGGAAACGATGTAACTGTAGTTGGAACACTAACTCCTGGTAGCTTAGATCTAACTGGTGCAGATATCTCTGCTAAAACACTAACTCTATCTGAAACATTAAATGCGACAGGTAATACTACCCTTGGTGGAACATTAGGTGTAACTGGTTTAGCAACAATTGGTGGAACACTAACGTCTGGTGCAGTAACTGCTCCATCTGCAACCTTGAATGGTTCAGGAACTGGTCTAGCAGTAACTAACAACGCAACCGTTGGTGGTACATTAGGTGTAGTTGGTCAAACAACACTAGGTTCTGTTAAAACTGGTGCAACTCTAACAGTTGGTACACCATTAGGTGAGCAGCCTGAAACTGTACAGATTATGCCAGACACTTATATTGCTGGTAAACTACGTGTTGAGGGTGGTATTAACGCAGATATCGATGTTGGTGGACAAACACTAGAACCGTTTGCAGTAATAGCATCTGATTCTTTATCTTCTGCTGGTAATATTACTGCTGGTGCAGCAATTATTTCAAGTTCTGCAACAATTGGTGAAGTCGGTTCACAAAACAACAACCTAATCGTTAATGGTAACGTTGTAAACAACGGTAACTTCACTGTTACTGGCGTACTAAATGCACAATTGAACCAAGCAGATTCCGATGTAGCTGTTAAGTCTTTGACTGCAACTAACAACGTAGCTGCTGGAACCACATTAAGTGCAGGTACTGCAATTACTGCTGGTACTTCCATCACTGCAACTGGATTACTTAAAGGTAATACTTTAGAAGTTACTACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACTATGTCAAGTGGTGCAAACATCACTGGTACAGTAGGTATTACTGCTGGTAACCTAACAGTGGGTGGTGATATCTCTGCAACTGGCACTGCTGGATTCGGTGCAACAACCGTTTCTACAATTACAACATCAGGTTTGGCTACACTTGCAAGTACATCCGTTACTGGTAACGCAACAGTAGGTGGAACACTAGCAGTAACAGGAGCACTAACTGCGAATGGTAACGTAACATTAGGTGACGCAGCGGCTGACGTTCTAACCGTTAATGCAACTTCATCATTTAAAGAAAATGCTGTGTTTGATAAGGCAGTAACAGTAACTGGTGAACTAACCACTACTAATGCTAACTTAACTACTACAACAGTAACTACCAAAAAGTATGATGTAATCCCAACTCAAGTTACATCATCAGTAATTGCTCCAACCGGAACATGGACTCCAGATGGTACAAGTAACGTGTACTTCATCACTCTAGACCAAGATACCACGTTGGCTCCAATTACTGGCCTAATTGGTGGCGGTAAAGCTGCATCAGTATACATCTATGTTAAACAAGATACAACTGGTAACAGAAACTTTACAACTGATGGTACTTATGCTGTTGTTGATGGTGAACTAAACAAAACTGCTGGTAGCGTGACCATTTACCAAGTAATTTATGATGGTGTAAGTCCAGTTACTGATTTGTTCATTGCACAACGTACTGCTTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
c7f4c398ee225d0e191a716bcbda0f60ade8ec0ced0ce24cbd2538cebabbf4e0
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50