Protein
- Genbank accession
- AIX23766.1 [GenBank]
- Protein name
- virion structural protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MAQNTNLNVTPYYDDFDKDRNFYRVLFRPGFPIQARELSTMQSILQNQVESVGSHLFKDGAMVIPGQVGYDLNVQAILLQESFLGSDVETYRTQLTGTIIEGLTTGVKAKVLYSISASESERGYVTLYVKYIDSGDTTSESALNTFQINEQLIASKEITFGTTLIEIGTPFAQLLPVNATAVGSTAYISDGVYFIRGHFVNVPSSYLILNQYDTNPSYRIGLEILESIITPEDDESLNDNAAGTSNYSAPGAHRFKIGTQFVKRLITDEADKNFIELLRINNSNVESFVERTAYSELEKSMARRTYEESGDYVIDTFDVTPREHLNDGFNNGVYSANQTSSNGNLATDSKVALEVSPGTAYVRGYRTEFITPQYIDVDKPRDFDTRQNGIINFNLGNFLKVYDVYGWPEVSGDGVTDAYQILDLYDDYAANATSSVKAGANRIGRCRTVQLQKSSTALAATSPFGISPNITGGVYDLWVFDVQMFTVLNIANAVTPYTAGTRIVGKTSGAAGYIADTGNGSHYIYLEQVNGVFINSEILEVNGRTVGTLEAAWSYQLSDTRSCFGKDSGSNIIFGSNFILNDSRPVEASTVDIDDTTDDEITGFRTRFEKDLRPGDVVTPTISDFEGVNTHRILRVDPTAIATTAANKKSTVSAGNEIFDFAEQTAKIDGSLLNGTVTDGEYSELIRLRPFIFQKDYQNGELSFDLPEDTMKSLDDESFFVYRNFSSKTVTTGSITFTVPETESFAALSSDNYVLTVVSNGGSGTYSNGQNIDIDAEVDAANLTASFGANNQSFTVSGLGSVATVTLTALVSKNTVSKKLKTASKMQALKVFKTVEDLVEQPTGLTFSALYGTRVEDEDLSFGIQDVYRVHAVYESYDENDASAPYVVLTESVFFAGGTLIIGKTSGARGRVISFSNADLKLYYVGLNDIPFVQGETINGFNSANEDITGIIDDSDSSIFAGSKVVTNQFELEAGQKTNYYDVSRLRRLSTAVPPTRRLLVIFDYFAHASSGDYFSSQSYSGINFKEIPNYKLDGSIKFIRDQIDFRPGIKNLRNGSGTISAPYFVNCTTFDFVSRVFDNTGSTIFDIMQVNSSFRADYAWYLPRIDKLFLSHDGALRIAKGVSGYYLIPPADVQNSMLLATIEYKPYVFDPERDILITPEVLRRYTMKDIGDIEQRLTHVEYYTSLSMLESQADNTKTYDENGFDRLKNGYVVDDFTDHTTGDVLNVDYKCSLDFREGQLRPQHYTTNVGLRYNPTASTNVVRTNGNVVMLPFDDVAIVTQPYASRTENVNPFNVFTFIGRVDLTPASDDWIDIERLPARVENVEGDFSAVSRDLNVDQNGFAPIQWQSWQTTWKGETIRSRNRFTSRSGTYGVGRQLGRAGHGQRRQGLFYLHERRTIRVVNNQARQGIRTRVIPKIEQKSLGDTILSRTVIPWIRSRNIGFNVDRMKPRTRFYAFFDGDNVTNYITPKVVELIKNSTTDNRTNETPFVVGETVTGQTSGCQLKVVAPDDGYKTNPYGKGTETLPTSYSSQTVYLNHDITEISENISPNHFGNVQVGELLVGQTSGAIAVVKDRRILTDNVGNVQGTLFIPSPKNDANPRWATGTRSLRFTTSETNLKTPGTVDSSAQTTYSATGTLQTVRENILAVRNAEIVTDTVSEERVVQTTRTETRQVGWYDPLAQSFIIEEEGGMFLTGVDIFFNTKDANIPISMQIRTMENGYPTKTILPFSDVTITPDDIEISESAAVPSRFSFKAPVYIKSSVEYCFVLLSDSNEYQVWISRMGDVDVTGTRTISEQPYAGVLFKSQNASTWTADQYEDLKFTIYRANFTSTTGTVTLENAPQGKGNNGIHRLIENPIQTIKPKQILSLGPAVTQYTFSQGARLLQQTTAAQATIISTTTSSSVSDTLTINDASGSWLQGTANTYLVRSSESLATIVAGSSSGTLEVGDIVTGATSNSVGIVKTWDGSTNLVLHYITGAFTDTETLSEPGGWTATVTSSAESGDSYGAYLTAAPTFDSDQTEVLVYHQNHGMYNRSNNVSVEGVISEISPTTLTGALAAGATSISVLDANTFHTTVNGSVVSGSNPGYIRINSELIQYSAISSDGKTITVATSGRGSNSTTDTTHPSGSVVECYNLDGIPLIDINKTHTSVSCPWLDTYMLHITGVANSGIRGGGINVYASQNIQFETLTPSVSVMDLPETDITARVNTTSATSIGDGSTSVDQASFVNDGSYVPVTLNDLNLFNNPRMICSEVNELAKLSGQKSFTMKVDLSTEKDTLSPVVDLDRCSLITTSNRINQWPGGPDAYGQQSQIDTSQDVSTLPFGDRNDAVYITRLARLIRESRSLRIDLQMSRPPEADVRIYYRAFSSGTNDDFDSIGWTLIDTPLQYDASPNEEILWKDYYYEVSGLNFNAFQIKIVMRSSNQARVPLIADLRCIALAT
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2442 AA molecular weight: 268428,84540 Da isoelectric point: 4,79002 aromaticity: 0,09623 hydropathy: -0,27842
Domains
Domains [InterPro]
IPR032096
12–67
12–67
1
2442
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage ACG-2014a [NCBI] |
1493507 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX23766.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019068
[NCBI]
CDS location
range 76713 -> 84041
strand +
strand +
CDS
ATGGCACAAAATACCAATCTAAACGTTACACCTTATTACGACGACTTCGATAAGGATAGGAATTTTTATCGAGTTCTGTTCCGCCCTGGATTTCCAATTCAGGCGAGGGAACTTAGCACAATGCAGAGTATTCTGCAAAATCAAGTCGAATCGGTTGGTTCTCATCTATTTAAAGATGGTGCTATGGTCATCCCTGGACAAGTGGGATATGACTTAAATGTACAGGCAATTTTGCTGCAAGAATCTTTTCTTGGTAGTGATGTTGAGACATACAGAACTCAATTGACTGGTACTATCATTGAGGGTTTGACGACAGGTGTTAAGGCAAAAGTATTGTATAGCATCTCTGCCTCTGAATCTGAGAGGGGATATGTCACACTATATGTAAAGTATATTGATTCTGGGGATACAACTTCCGAATCTGCATTGAATACTTTCCAAATCAATGAACAGTTGATTGCAAGTAAGGAAATTACTTTTGGTACGACGCTGATTGAAATTGGCACTCCATTTGCTCAATTGTTGCCTGTTAATGCAACTGCAGTCGGATCGACAGCATACATTAGCGATGGTGTTTATTTCATTAGAGGTCATTTTGTTAATGTACCTTCTAGTTATTTGATTCTGAATCAATATGATACTAACCCTTCTTATAGAATTGGTTTAGAAATTTTAGAATCTATTATCACCCCCGAAGATGATGAATCTTTGAATGATAATGCTGCTGGAACATCAAATTATTCTGCACCTGGTGCCCATAGATTTAAAATTGGTACTCAGTTTGTAAAACGATTAATTACTGATGAGGCAGATAAAAACTTTATTGAACTTCTCAGGATCAATAACAGTAATGTAGAAAGTTTTGTTGAGAGAACAGCATATAGCGAACTTGAGAAGTCGATGGCTCGTAGGACTTATGAAGAGTCTGGCGATTATGTCATTGATACTTTTGATGTAACTCCTCGCGAGCATCTCAATGACGGATTTAATAATGGTGTGTATAGTGCGAACCAGACTTCTAGTAATGGAAACCTTGCTACAGATTCTAAGGTAGCATTAGAAGTTTCTCCTGGAACTGCATATGTTAGGGGTTATAGAACAGAGTTTATTACACCTCAATACATTGATGTTGATAAACCAAGGGATTTCGATACTCGTCAAAATGGAATTATCAACTTTAACCTTGGCAATTTCCTGAAAGTTTATGATGTTTATGGTTGGCCAGAAGTTTCTGGTGATGGAGTAACAGACGCATATCAGATTCTAGATCTTTATGATGATTATGCTGCGAATGCAACATCATCAGTAAAGGCAGGTGCTAATAGAATTGGTAGATGTAGAACTGTTCAGTTACAGAAGTCTTCTACTGCTCTTGCTGCAACGTCACCATTTGGAATTAGTCCTAATATAACTGGTGGTGTTTATGATCTATGGGTATTTGATGTTCAGATGTTCACCGTTCTGAACATTGCTAATGCTGTAACACCATATACAGCAGGAACTAGAATTGTAGGTAAAACATCTGGAGCAGCTGGTTACATTGCTGATACTGGAAATGGTAGTCACTACATTTATCTTGAGCAGGTCAATGGAGTATTCATTAATAGTGAAATTCTAGAAGTAAATGGAAGAACAGTTGGTACTCTTGAAGCAGCATGGTCTTATCAGTTAAGTGATACTAGATCGTGCTTTGGTAAGGATAGTGGCAGTAATATTATCTTTGGTTCTAATTTTATTCTGAATGACTCTCGACCTGTTGAGGCATCTACAGTTGATATTGATGATACAACAGATGATGAAATTACTGGTTTCAGAACTAGGTTTGAAAAAGATCTTCGTCCTGGAGACGTTGTTACTCCAACAATTTCTGATTTTGAGGGAGTAAATACTCATCGCATTTTAAGAGTTGATCCTACTGCTATTGCAACAACAGCAGCTAATAAGAAATCTACAGTTAGTGCTGGAAATGAAATCTTTGATTTTGCAGAGCAAACTGCAAAAATTGATGGTAGTCTGTTGAATGGTACAGTAACTGATGGAGAATATAGCGAACTAATTAGATTGCGTCCGTTTATCTTCCAAAAAGATTATCAGAATGGAGAACTTTCATTCGATCTTCCAGAAGATACTATGAAGTCTCTTGATGATGAATCATTCTTTGTATATAGAAACTTCTCTTCAAAAACAGTAACCACTGGTTCTATTACCTTTACTGTTCCTGAAACCGAATCTTTCGCAGCATTATCTTCTGATAATTATGTCTTAACTGTCGTTAGTAATGGTGGTTCTGGCACATATAGTAATGGTCAAAATATTGATATTGATGCTGAGGTAGATGCTGCAAATCTAACTGCTTCTTTTGGTGCTAATAATCAATCATTTACGGTTAGTGGATTAGGTTCAGTTGCAACAGTCACTCTGACCGCATTGGTTTCTAAGAACACTGTTTCTAAGAAACTGAAGACTGCTTCTAAGATGCAGGCATTAAAAGTATTCAAAACAGTAGAAGACTTAGTAGAACAACCTACAGGACTTACATTTAGTGCTCTATACGGAACCAGAGTTGAAGATGAAGATCTCTCGTTTGGTATTCAAGATGTATATAGAGTTCATGCAGTATATGAATCGTATGATGAGAATGATGCGTCGGCACCATATGTAGTTTTAACTGAATCAGTCTTCTTTGCAGGTGGAACATTAATTATTGGTAAAACTTCTGGTGCTAGAGGTCGTGTAATTTCATTCTCTAATGCAGATTTGAAGTTGTACTATGTTGGACTAAATGACATTCCATTCGTTCAGGGTGAAACTATTAATGGTTTCAATTCTGCTAATGAAGATATTACTGGTATTATTGATGACTCGGATTCTTCAATTTTTGCTGGTAGTAAAGTAGTTACAAATCAATTTGAACTTGAAGCGGGACAGAAAACTAATTACTATGATGTTTCACGATTAAGAAGATTAAGTACTGCTGTACCTCCGACAAGAAGACTGCTGGTAATCTTTGATTATTTCGCACATGCATCTTCTGGTGATTACTTCTCATCACAATCTTATAGTGGAATTAATTTCAAAGAGATTCCTAACTATAAATTAGATGGTTCTATTAAGTTTATTAGAGATCAAATCGATTTCCGTCCTGGTATTAAGAACTTAAGAAATGGATCAGGCACAATCAGTGCTCCATACTTTGTAAATTGTACTACGTTTGATTTTGTATCCAGAGTATTTGATAATACTGGATCAACAATCTTCGATATCATGCAAGTCAATTCTTCATTCCGTGCAGACTATGCTTGGTATCTTCCTAGAATTGACAAACTATTCTTATCGCATGATGGAGCACTTAGAATTGCTAAGGGTGTTTCTGGTTACTACTTGATTCCACCAGCAGACGTTCAAAATTCAATGCTTTTAGCGACTATTGAATACAAACCATACGTCTTTGATCCTGAAAGAGATATTCTGATTACTCCAGAAGTTCTCAGACGTTATACAATGAAGGACATTGGTGATATTGAGCAGAGATTGACTCATGTTGAATACTATACATCATTGTCTATGCTTGAGTCTCAAGCAGATAATACTAAGACCTATGATGAAAATGGTTTCGACCGTCTGAAAAATGGTTATGTTGTTGATGACTTTACTGATCACACCACTGGCGATGTATTAAACGTCGATTATAAGTGTTCTTTAGACTTTAGAGAAGGTCAGTTGCGTCCTCAGCACTATACTACTAATGTAGGACTTAGATATAATCCTACAGCATCTACTAATGTCGTTAGGACTAATGGTAATGTAGTAATGCTTCCCTTTGATGATGTTGCAATTGTTACACAACCATATGCATCTAGAACTGAGAACGTCAATCCATTCAACGTCTTTACCTTTATTGGTCGTGTTGATTTAACACCTGCATCTGATGACTGGATTGATATTGAGCGTCTTCCTGCTCGTGTTGAAAACGTTGAAGGTGATTTCTCTGCTGTTTCTAGAGATCTCAATGTTGATCAGAATGGTTTTGCTCCTATTCAATGGCAGTCTTGGCAGACAACTTGGAAGGGTGAGACAATTAGATCTAGAAATAGATTTACATCTAGATCTGGTACATATGGTGTTGGTCGTCAGTTAGGTCGTGCAGGTCACGGTCAGCGTCGTCAAGGTCTATTCTATCTTCACGAACGTCGCACTATTCGTGTTGTTAATAATCAAGCACGTCAGGGTATTCGTACTAGAGTTATTCCTAAGATTGAACAGAAGTCTTTGGGAGATACAATCCTGTCACGTACAGTAATTCCTTGGATTCGCTCTCGTAATATCGGTTTCAACGTTGATCGTATGAAACCCCGTACAAGATTCTATGCATTCTTTGACGGTGATAATGTCACTAACTACATCACACCAAAAGTTGTTGAACTTATCAAAAACTCCACCACTGATAATAGAACCAACGAAACTCCTTTTGTTGTAGGTGAAACTGTTACTGGACAAACCTCTGGTTGCCAACTTAAAGTTGTTGCACCTGATGATGGATATAAAACTAATCCATATGGTAAGGGTACAGAAACTCTTCCAACTTCATACTCATCCCAAACAGTATATCTAAATCATGATATCACTGAAATTTCTGAGAATATATCACCAAATCATTTTGGTAATGTTCAGGTTGGGGAACTTTTAGTTGGTCAAACGTCAGGTGCAATTGCGGTGGTAAAAGATCGTCGCATCCTCACTGATAACGTTGGTAATGTTCAGGGTACATTATTCATTCCTTCCCCTAAGAATGATGCCAACCCACGTTGGGCAACAGGTACTCGCTCTTTGCGTTTCACAACTTCAGAAACTAATCTGAAGACACCTGGTACTGTAGATTCTTCTGCACAAACAACGTATTCGGCAACAGGTACTCTTCAAACTGTTCGTGAAAATATTTTGGCAGTTAGAAATGCTGAAATTGTTACCGATACTGTTAGTGAAGAAAGAGTTGTCCAGAC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Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
812a52cf7bc16053515a7163d367397c191c23d91e1db846812a1d4dadc8461e
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community | Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. | 2015-03-20 | — | GenBank |