Protein

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Genbank accession
YP_007517928.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,78
Protein sequence
MAIKAKITSTNSAGPQKVSVTVPASGGTVTSVTAIGDLTDVIASSLPDGAILQYLTSSGNWVSTALVDDDTFPSSTATAKSLHSGESLRNFILDGTSTLTNKTIDLDANTLTGTITEFNSALQGADFATLANTETFTNKTLTQPKIAEIVSLSTGGITLDADTDIVLDADGADIILKDGGSEFGRFTNSSGELVIKSSSSATTALTFSGSSATLAGNLTVTGTSTFNGGTINLGDAATDTIAFNGTITGSLVFEGSTSDSFETTLTPGNPTADITLTLPSSASDTLVGKATTDTLTNKSIDLANNTITGSVAEFNSALQSDSFVTLTGSETLSNKQFTNPVIAHIDGTGGIELDAVQDITLDAGGGDIFLKDDTAAFGALTNSSGNLIIKSGTTTAMTFSGANVTMAGNATVAGNLTVQGTTTTVDSSSINVQNALVFEGATADSFETTLTTVDPTADRTISLPNATDTLIGKATTDTLTNKTLTTPVIAEIDSNASITLDAATDIILDAGEQDIILKDDGTEFGRFTNSSGELVIKSGSSSTTAISMSGANVTIAGNLVVTGATENDGNITIGDAATDTITFGGTIQGSLVFEGSTADSFETTLTPGNPSGDITLTLPSSATDTIVARNTTDTLTNKTLTSPTINAGTLSGAFTGTADLTGLVLSGASPLVFEGSTNDSFETTLAVTDPTADRTITLPNSTGTLVVTADVSGDATMATSGALTLATVNSNTGSFGSTTSIPVITVNAKGLVTAMSTATIVTTLTVAADSGSDDAVSLATDTLNYEGGANITTTVSNNNIAIALDASPSVTALTTSANVNVGGSIVFEGSTANSFETTLTVTDPTADRTITFPNNTGTVALTSDITGGGQAGSFTNLTSSGNTILGNATSDTVTFNGRIASHFVPSADDTYTLGTASLKWAELHVSGSTIFLGGAQLTASGTTVVLPANSTVGDRAIPDADPTTGIVTRKVPLFTKAGGLSSAAKTFTFKASGSSDRVFDTFTKEDGAGITTQERALFSF
Physico‐chemical
properties
protein length:1020 AA
molecular weight: 102582,22470 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,04706
hydropathy:0,09157

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC008M
[NCBI] 		1283076 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062
[NCBI] 		335992 Bacteria > Proteobacteria > Alphaproteobacteria > Pelagibacterales > Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_007517928.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_020484 [NCBI]
CDS location
range 46673 -> 49735
strand +
CDS
ATGGCAATTAAAGCAAAGATAACATCAACTAATAGTGCAGGTCCTCAAAAGGTATCAGTAACAGTACCCGCTTCTGGCGGTACAGTAACAAGTGTTACTGCTATAGGTGATTTAACAGATGTTATTGCTTCATCATTACCTGACGGTGCTATTTTACAATATTTAACTTCCTCAGGTAACTGGGTATCCACAGCATTAGTAGATGATGATACATTCCCTTCATCAACAGCAACAGCAAAAAGTTTACACTCTGGCGAAAGTCTTAGAAATTTTATTTTAGATGGTACATCAACACTTACTAACAAGACAATAGATTTAGACGCCAACACCTTAACAGGTACAATAACAGAATTTAATAGTGCATTACAAGGTGCTGACTTTGCTACTTTAGCAAATACAGAAACATTTACAAATAAAACTTTAACTCAACCAAAGATTGCTGAAATAGTTTCCTTATCAACTGGTGGTATTACACTAGACGCTGATACTGATATTGTATTAGACGCTGATGGTGCAGATATAATTTTAAAAGATGGTGGTAGTGAGTTTGGTAGATTTACAAACTCATCTGGTGAATTAGTAATTAAATCAAGTTCAAGTGCTACAACAGCATTAACATTTAGTGGTTCAAGTGCCACATTAGCAGGTAACTTAACAGTTACAGGTACATCTACATTCAATGGTGGTACAATTAATCTTGGTGACGCAGCTACAGATACAATTGCTTTCAATGGTACAATTACTGGCAGTTTAGTATTTGAAGGTAGTACAAGTGATAGTTTTGAAACTACATTAACACCAGGTAATCCAACTGCTGATATTACACTTACATTACCATCAAGCGCTAGTGATACACTTGTAGGTAAAGCAACTACTGATACACTTACAAACAAATCAATAGATTTAGCAAACAATACTATAACAGGTTCAGTTGCAGAATTTAATAGTGCATTACAAAGTGATAGTTTCGTTACACTTACAGGTTCAGAAACTTTATCAAACAAACAGTTTACAAATCCAGTTATAGCACATATAGACGGTACTGGTGGTATAGAATTAGACGCAGTACAAGATATTACTTTAGACGCAGGTGGCGGAGATATATTTTTAAAAGATGATACAGCTGCTTTTGGTGCATTAACAAATAGTTCAGGTAACTTAATAATTAAATCTGGTACTACAACTGCTATGACATTTAGTGGTGCTAATGTAACTATGGCAGGTAATGCTACAGTTGCAGGTAACTTAACAGTTCAAGGTACTACAACTACAGTTGACAGTTCATCTATAAATGTTCAGAATGCTTTAGTCTTTGAAGGTGCAACAGCAGATAGTTTTGAAACAACATTAACTACAGTTGACCCTACAGCAGATAGAACAATATCATTACCAAATGCAACAGACACATTAATAGGTAAAGCAACTACTGATACATTAACAAATAAAACTTTAACAACTCCTGTAATTGCAGAAATAGATTCCAATGCTTCTATAACTTTAGACGCTGCTACTGATATTATATTAGACGCAGGTGAACAAGATATTATTTTAAAAGATGACGGTACTGAGTTTGGTAGATTTACTAATAGTTCAGGTGAGTTAGTAATTAAATCAGGTTCAAGTTCTACAACGGCAATCTCAATGTCAGGTGCCAATGTTACGATTGCAGGTAATTTAGTAGTAACTGGTGCAACAGAAAATGATGGCAATATAACAATTGGTGACGCTGCTACAGATACTATTACTTTTGGTGGTACTATTCAAGGTAGTTTAGTCTTTGAGGGTAGTACAGCAGACAGTTTTGAAACAACTTTAACACCAGGTAATCCTAGTGGAGATATTACTCTTACATTACCGTCAAGTGCTACAGATACTATAGTTGCAAGAAACACTACAGACACATTAACAAACAAAACTTTAACAAGTCCAACAATCAATGCAGGAACATTAAGTGGTGCATTTACTGGAACGGCAGACTTAACAGGACTAGTTCTTTCAGGTGCAAGTCCTCTTGTTTTTGAAGGTTCAACAAATGATAGTTTTGAAACAACTTTAGCAGTTACAGACCCTACAGCAGATAGAACAATTACTTTACCTAACTCTACAGGTACTTTAGTTGTAACTGCTGATGTATCTGGTGACGCTACAATGGCAACATCTGGTGCATTAACATTAGCAACAGTCAATAGTAACACAGGTAGTTTTGGTAGTACAACATCAATACCAGTTATAACAGTCAACGCAAAAGGTCTTGTTACTGCCATGTCAACAGCTACAATTGTAACAACATTAACTGTAGCCGCTGATAGTGGTTCAGATGACGCTGTTTCTTTGGCAACTGACACACTTAATTATGAAGGTGGTGCAAACATTACAACAACAGTTTCTAATAACAATATAGCGATTGCCTTAGACGCTTCTCCATCAGTAACAGCATTAACAACAAGTGCTAATGTAAACGTTGGTGGTAGCATTGTATTTGAAGGTAGTACAGCAAATAGTTTTGAGACAACACTTACAGTTACAGACCCAACAGCAGATAGAACAATAACTTTCCCTAACAATACAGGTACAGTTGCGTTAACAAGTGATATTACTGGTGGTGGTCAAGCAGGTTCATTTACAAATTTAACATCTTCAGGTAATACTATACTTGGTAACGCTACCTCAGACACAGTAACATTCAATGGTAGAATAGCGTCACACTTTGTACCTAGTGCTGATGATACATATACTTTAGGTACTGCTTCTTTAAAATGGGCAGAATTACATGTATCAGGAAGTACAATCTTTTTAGGTGGCGCACAATTAACTGCTAGTGGAACAACAGTAGTATTACCGGCGAATAGTACAGTAGGTGATAGAGCAATACCTGACGCAGATCCTACTACAGGTATTGTAACAAGAAAAGTACCATTATTTACAAAAGCAGGTGGTCTATCTTCAGCAGCAAAAACTTTTACTTTTAAAGCGTCTGGTTCATCTGATAGAGTTTTTGATACATTTACTAAAGAAGATGGCGCAGGAATAACAACACAAGAGAGAGCATTATTTTCATTTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7571efac9146142835172a907d960d3d1db369a9c120bff4f83a0f7b745a689d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2908
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50