Protein

Genbank accession
ADP00052.1 [GenBank]
Protein name
predicted protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAVTTKKTFSAADGSTKSFGPIGIELNNQDDLDVYVTLSGGTRRLSLRQSSDTTATSSHPQVNDTTGLYFPAVSVGDQLYNYSISTDNNNIVFNNNLPSGAVVSCERRTRDSSGNYTNFSGGSTIRSTDLNTAFDESNFTAQEARNKAFEIEGKIFGTEATSTSFITSDEIVDGTIVDADLSSTAEIQVSKLKDGTARQVLQTAANGSDVEWTSNVDIPGTLDVTSSAAFDSNVTVSGTTTAAAINASGAVGVDGNFDVNTNKFTVDSSTGNTVIGGNLSVSGTASITGTSTYTGQQNVPGGALVKNIRVGLDADNEVSTTSGNLILDSANGTVQVTDTLDVVGNVTVSGTVDGRDIASDGSKLDGIEAGATADQTASEIRTLVESASNSNVFTDADHSKLNAIEASATADQTASEIKTLLQSDKLTASEIATGALDGRYYTETESDARYFNISTGDTIKDGDAFPDNDTTIATTAAINDRIIDLVDDVGGFVPIANELAFPNANPDVNNGAGTLVSIKTLSTNYTSSGSGVISISNGTVGNSTVTINGAENSTTYSSGYGMIVETTTTLNTYTFHRLVPKATEVTTVAGKATEIGRLGTAAAVEDLGILGTTAVVEDLNLLGTAAVVADMALLGDSAVIADMATIADTSNLISNIGTVAGIQANVTTVAGNSANVTSVADNMGTVNDFAARYRVGANNPTSSLDTGDLFFNTSANELKVYNGSSWQGGVTASGSFATVTGNTFTGDNLYNDNVKLKLGTGSDLEVYHDATDNQIKSVNGKVVITTTAGNSDIEITPHGSGVVKLDGLSWPTADGSANQYLKTDGSGALSWATVDLSAATDYADNVKVRFGTGNDLEIYHDSSNSYVTDQGTGALLLAGNEVKIINAAHNENGLVFDENGAISLYYDNSLKLATTAAGINLDNSGGTTGYGKITFGNSGQQYIEAKDSGNFGSGAYVTIGSGTDVAIKAKHDNAVELYYDNSKNFETTSTGVKVTSSGSSHGLDIIHSNGNTVAQLIHGGTGDEGVLNLRDSNTSTVIIRGEVGQDTDITTGANFDLEHDSAKLRLGAGNDLEIYHDGSNTYIDNNTGTLNILAATDVSMWAANSEQTIKGIANGAVELYYDATKKFETTSEGVETQGELHFKAPSSSTGEQVGRLEWWNENDAGVMAKIAVDRTAGSLAPGDLVFSTSANVDTTANGGDGDITERLRITSDGKVKVPDNGSAVFGNGSDLSIYHNGVNSVIYENGTGNLSIMSSGGAIVLEKSTGEPMGTFAVDGAVSLYYDNSKKFETTDAGGTLTGALTVTNEINLFNGATDASRYIDAGLGDGNTLFIRGCSGGDANHETLAQFTRNGGVSLFYDAAKKFETDTNGVTITGQCNVTSNIALPDHSSGYVGKMVFGGGDDLQIYHNGSDSYIRDTGAGSLKIDTSQLLLRDSSGSDSMITATADGAVELYYDNSKKLATTSGGVHIYNALSTSGAISIGNGANLTLEDNGEAVFGFGSDLKIYANGSASYIAHNGDGDLFISTGASGENLYVSSAEHLILRTAASENAVYCSKNAHVSLYYDSSQKFYTQSYGAVIDGTLKPAANNTHDLGDNSYKFSTVWAKNTAKAWINVDGDASTASIRASHNVSSLTDDAYERHTVNFSTNMGSASNYCFVSGARAGDSGGGGRVVVGYDTPTASAFKYQMRNLGNSNEHVDAACLAFFST
Physico‐chemical
properties
protein length:1708 AA
molecular weight: 177043,01940 Da
isoelectric point:4,37015
aromaticity:0,06909
hydropathy:-0,23308

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage 9515-10a
[NCBI] 		444875 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Prochlorococcus marinus str. MIT 9515
[NCBI] 		167542 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADP00052.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071100 [NCBI]
CDS location
range 16466 -> 21592
strand -
CDS
ATGGCAGTTACAACTAAAAAAACATTCTCAGCGGCTGATGGATCAACAAAATCCTTTGGCCCGATTGGGATCGAACTGAATAACCAAGATGATCTTGATGTATATGTAACCTTATCGGGTGGTACTAGGAGGCTTAGTCTAAGACAAAGTTCAGATACTACTGCTACTAGCTCTCACCCACAGGTTAATGATACAACTGGATTATATTTTCCAGCCGTTTCGGTTGGAGATCAACTTTATAATTACTCAATATCCACTGATAACAACAATATTGTTTTTAATAACAATTTACCGTCAGGTGCTGTAGTATCTTGTGAGCGTCGAACTAGGGATAGCTCGGGTAATTACACAAATTTCTCAGGTGGTAGTACAATCAGATCAACAGATTTGAATACTGCATTTGATGAATCTAATTTCACAGCACAGGAAGCAAGAAATAAAGCATTTGAAATAGAAGGAAAGATATTTGGGACAGAAGCTACAAGTACATCATTTATCACAAGTGATGAAATTGTAGATGGTACTATTGTAGATGCAGATCTATCATCTACTGCAGAGATACAAGTTAGTAAATTAAAAGATGGTACTGCAAGACAAGTTTTACAGACAGCAGCTAATGGTTCTGATGTAGAATGGACAAGTAATGTAGACATTCCTGGTACATTAGATGTTACAAGTTCAGCAGCATTTGATAGTAATGTTACTGTATCTGGGACTACTACAGCAGCTGCTATTAATGCAAGTGGGGCTGTAGGAGTAGATGGTAATTTTGATGTAAATACTAATAAATTTACAGTTGATTCATCGACAGGTAATACAGTTATTGGAGGTAATTTAAGTGTCTCTGGTACAGCTAGTATAACTGGTACATCTACATATACAGGTCAACAGAATGTTCCTGGTGGAGCTTTAGTTAAGAATATAAGAGTTGGTCTTGATGCTGATAATGAAGTTAGTACAACAAGCGGTAATTTAATACTAGACTCAGCTAACGGTACTGTTCAAGTTACTGATACACTAGATGTTGTTGGAAACGTTACTGTTTCAGGGACTGTAGATGGTAGAGATATAGCAAGCGATGGTTCAAAACTAGATGGAATAGAAGCAGGTGCTACAGCTGATCAAACAGCTAGTGAAATTAGAACCCTTGTAGAAAGTGCTAGTAATTCAAACGTTTTTACAGATGCTGATCACAGTAAACTAAATGCTATCGAAGCTTCAGCTACTGCAGACCAAACAGCTAGTGAAATTAAAACACTATTACAGTCTGACAAGTTAACCGCTAGTGAGATAGCAACTGGTGCATTAGACGGAAGGTATTACACAGAAACAGAATCAGATGCTAGATACTTTAACATCAGCACAGGTGACACTATTAAAGATGGTGATGCCTTCCCAGATAATGACACAACCATAGCTACAACTGCTGCTATCAACGACAGGATTATTGATCTTGTTGATGATGTAGGTGGTTTTGTACCAATAGCAAATGAATTAGCTTTCCCAAATGCTAATCCCGATGTTAATAATGGTGCAGGTACTCTTGTCAGTATTAAGACTTTATCTACAAACTACACTTCAAGTGGTAGTGGTGTTATATCTATTTCTAATGGTACTGTAGGTAATTCTACTGTCACTATTAATGGTGCTGAAAATAGTACTACTTATAGTTCTGGGTATGGTATGATCGTAGAAACAACTACGACATTAAATACTTATACTTTCCATAGATTAGTTCCTAAAGCTACTGAAGTAACTACGGTTGCTGGTAAAGCTACAGAAATAGGTCGTCTTGGTACAGCAGCAGCTGTTGAAGATTTAGGAATATTAGGTACAACAGCAGTTGTTGAAGATCTAAACTTGTTAGGTACAGCAGCAGTTGTTGCTGATATGGCATTGCTAGGTGATTCAGCTGTTATAGCTGATATGGCTACTATTGCTGATACAAGTAATTTAATATCTAATATTGGTACGGTTGCAGGTATACAAGCTAATGTAACTACAGTTGCAGGTAACAGTGCTAATGTAACTTCAGTAGCCGATAATATGGGTACTGTTAACGACTTTGCAGCTAGATACCGTGTAGGAGCTAATAACCCAACATCAAGTTTAGATACTGGAGATTTATTCTTTAATACATCTGCTAATGAACTAAAGGTTTATAACGGAAGTTCTTGGCAAGGTGGTGTAACAGCTAGTGGTAGTTTTGCAACCGTTACTGGTAATACATTTACTGGAGATAACTTATATAATGATAATGTTAAATTAAAACTTGGAACTGGATCGGATTTAGAAGTCTACCATGATGCAACTGATAATCAAATTAAATCAGTTAATGGTAAAGTAGTTATTACAACTACAGCTGGTAATAGTGATATTGAAATCACACCACATGGATCTGGTGTTGTAAAATTGGATGGACTTAGCTGGCCTACAGCTGATGGTTCAGCCAATCAATACTTAAAGACAGATGGATCAGGAGCTTTATCTTGGGCAACTGTTGATTTAAGTGCTGCTACTGATTACGCTGATAACGTTAAAGTTAGGTTTGGAACAGGTAATGATTTAGAAATCTACCATGATTCATCGAACTCTTATGTAACAGATCAAGGTACGGGTGCATTATTATTAGCTGGTAATGAAGTCAAAATTATTAATGCAGCACATAATGAAAATGGTCTTGTCTTTGATGAAAACGGAGCTATATCATTATATTATGACAACTCACTGAAGCTTGCTACAACTGCTGCTGGAATCAATTTAGATAATTCTGGAGGTACAACAGGTTACGGTAAGATTACCTTTGGTAATAGTGGTCAACAATATATTGAAGCAAAAGACTCAGGTAATTTTGGAAGCGGTGCTTATGTAACTATTGGGTCAGGAACCGATGTAGCTATAAAAGCAAAACATGATAATGCCGTAGAACTCTATTACGACAATAGTAAGAATTTTGAGACAACGAGTACTGGTGTAAAAGTAACTTCTAGTGGTTCAAGTCATGGTTTAGATATTATTCATAGTAATGGTAATACAGTTGCACAATTAATTCATGGTGGTACTGGTGATGAAGGGGTTTTAAATTTAAGAGATTCAAATACATCTACAGTCATTATAAGAGGAGAAGTTGGTCAAGATACTGATATAACTACTGGTGCTAACTTTGACCTTGAGCACGACTCAGCTAAGTTAAGACTTGGAGCTGGAAATGATCTAGAAATCTACCATGATGGATCGAATACATATATTGACAATAATACTGGCACGTTAAATATATTAGCTGCAACTGATGTCAGTATGTGGGCTGCTAATAGTGAGCAAACTATTAAAGGTATAGCTAACGGAGCTGTAGAACTATATTATGATGCTACTAAGAAGTTTGAGACAACTAGCGAAGGAGTAGAAACTCAAGGAGAGCTTCATTTTAAAGCACCTTCTTCATCTACTGGAGAACAGGTAGGAAGACTTGAGTGGTGGAATGAGAATGATGCTGGTGTTATGGCAAAGATTGCAGTAGATAGAACTGCTGGATCATTAGCTCCTGGTGATTTAGTCTTTTCAACTTCTGCAAATGTTGATACTACAGCTAATGGTGGCGATGGAGATATTACAGAAAGGCTCAGAATTACATCTGATGGAAAAGTAAAAGTTCCAGATAATGGTTCAGCTGTATTTGGTAATGGATCAGATTTAAGTATCTACCATAACGGGGTTAATTCCGTAATTTACGAGAATGGTACAGGTAATTTATCTATAATGTCTAGTGGTGGAGCCATTGTTCTTGAAAAGAGTACTGGTGAACCAATGGGTACATTTGCAGTAGATGGAGCTGTATCACTCTATTACGACAACAGTAAAAAGTTTGAGACAACTGACGCTGGTGGTACATTAACAGGTGCTCTTACTGTTACTAACGAGATAAATTTATTTAATGGAGCTACTGATGCCTCTAGATATATAGATGCTGGACTTGGAGATGGTAATACATTATTTATTAGAGGATGTTCTGGTGGTGATGCTAACCATGAAACTTTAGCTCAATTTACTAGAAATGGTGGTGTAAGTCTCTTTTATGATGCTGCTAAGAAGTTTGAGACAGATACAAACGGCGTGACTATAACAGGTCAATGTAATGTAACGTCAAATATAGCTTTACCTGATCATAGTAGTGGTTATGTAGGAAAGATGGTATTTGGAGGTGGAGATGATCTACAGATCTACCATAATGGATCGGACTCTTATATTAGAGACACAGGAGCAGGTTCCTTAAAAATAGATACTAGCCAACTTCTTTTAAGAGATAGTTCTGGATCAGACAGTATGATTACAGCTACAGCAGATGGAGCTGTAGAACTCTATTATGATAACTCGAAGAAGCTTGCTACGACTTCAGGAGGAGTACACATATATAATGCACTTAGTACAAGTGGAGCAATATCCATTGGTAATGGAGCTAATTTAACATTAGAAGATAATGGAGAAGCTGTATTTGGTTTTGGGTCAGATCTAAAAATCTATGCAAACGGAAGTGCTTCTTATATAGCTCATAACGGTGATGGGGATTTATTTATATCAACTGGTGCGTCTGGAGAGAATTTATATGTATCCTCTGCAGAACATCTAATATTAAGAACCGCAGCAAGTGAAAATGCTGTTTATTGTTCTAAAAACGCACACGTTTCTCTTTACTACGACAGCTCACAAAAGTTCTATACTCAAAGTTATGGAGCTGTTATTGATGGTACTCTAAAACCTGCTGCTAATAATACTCATGATTTAGGTGATAATAGCTATAAATTCAGTACAGTTTGGGCTAAAAACACAGCAAAAGCTTGGATTAACGTAGATGGTGATGCAAGTACAGCATCAATCAGAGCTAGTCATAATGTAAGCTCTTTAACTGATGATGCCTATGAACGTCATACAGTTAACTTTAGTACAAATATGGGTAGTGCCTCTAATTACTGCTTTGTTTCTGGTGCAAGAGCTGGTGATAGCGGTGGTGGAGGTCGTGTCGTAGTCGGTTATGACACACCAACAGCAAGTGCCTTTAAATATCAAATGAGAAACTTAGGTAACAGTAACGAACACGTTGATGCTGCCTGTTTAGCTTTCTTCTCTACTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
b78a4c2a598900d17eafa224c03c488177b52372b63792e76351c6f1e84e141f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6398
Evidence 0,6398
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage 9515-10a Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Erlich,R., Young,S.K., Koehrsen,M., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Borenstein,D., Chen,Z., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heiman,D., Hepburn,T., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Mehta,T., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., Walk,T., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C., Galagan,J. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank