Protein
- Genbank accession
- BAW85699.1 [GenBank]
- Protein name
- pectate lyase
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MSLIQLSPSNGDLLLINSGSFSTGKVIRTRNELVFYTDQYGNSTGYRWLGNLPHVINGNSPQTDGGISSTSWESYITSNLYDKLKSENITLSGTAHLPTVEVAYGLKKGSLKVWSAGLVSSSSQYWLYTDGTVWSGVGVLGTEPDVPFTQIHLQRDIIKYNYIVQTDGETLINIPYDFTSIDVFINGVLQNSNSGSYKIIQSTIQFSDVLNKGDNIQFYLSNVPISSVRFALSSDLTNYVLKSDLSNTSGANNVGFYPGGTVQDAIVYTTPEMFGAIGDGITDDTNALQNAINFSKNKTLLFSNGKKYRTKNLIVPHPMTFKGLGRRQDGAIIPYGNVSSESFIHTGTLILLTTSSTVTFYDLTVDARGITLSFVDGQRLTGVGAADNNSGVYQSGLQMYNCNVSGFSGNNLYGGGSKSFGILKDCQFESSGKSCVRIDGVDWRISHCAIGRSLESYGIEILNENNFVSNCDSYFNKLSGIFYQQPTGMAFIKLIGNTINSNGQHGISCSLPYAQPAGTVITNNIFWNNSTELTGTYHNIDLNYGRGHIVENNVHKAYQATAGSDSARCGYCINLRNGATLSGFINDAIDPLYSYVIDKINVNSQNFANQNEISIGTGLSLTKTVSSDTSIGIKLNINSESYDRVQINPGKILLGNGSAEPTHGIQQLAAYPGITMGVLGLGVVGNYSSSVFRIGTHRIWSGGDNTLRTKYGADPTSATDGNILSVKVSVPSTATSTGIVGQWAADDTYLYICTAANTWKRVSINTW
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 767 AA molecular weight: 82849,42870 Da isoelectric point: 6,07304 aromaticity: 0,09909 hydropathy: -0,15945
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage K64-1 [NCBI] |
1439894 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Klebsiella pneumoniae [NCBI] |
573 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Klebsiella |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BAW85699.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LC121105
[NCBI]
CDS location
range 1 -> 2304
strand +
strand +
CDS
ATGTCATTAATTCAACTTTCACCAAGTAATGGTGATTTATTATTAATAAATTCCGGCTCATTTAGTACTGGTAAAGTTATAAGAACTAGAAATGAACTTGTTTTTTATACTGATCAATATGGTAACAGCACTGGATATCGCTGGTTAGGTAATTTACCTCACGTGATTAATGGTAATTCACCACAAACTGATGGTGGTATTTCAAGTACATCATGGGAATCTTATATTACTTCAAATTTATATGATAAATTAAAATCAGAAAATATAACTCTATCAGGTACCGCCCATTTACCTACTGTTGAAGTTGCTTATGGACTGAAAAAAGGATCATTAAAAGTTTGGTCTGCTGGATTAGTCAGTTCATCATCACAGTACTGGTTATATACCGATGGGACTGTATGGAGTGGTGTTGGTGTGTTAGGAACTGAACCAGATGTTCCATTCACACAAATACATCTACAACGAGATATTATAAAATATAATTATATTGTTCAAACAGATGGTGAAACACTAATTAATATACCATATGATTTTACATCTATCGATGTTTTTATTAATGGTGTATTACAAAATTCGAATTCAGGTTCTTATAAAATTATTCAAAGTACAATTCAGTTTAGCGACGTATTGAATAAAGGTGATAATATTCAATTCTATCTTTCTAATGTTCCAATTTCGAGTGTTCGCTTTGCTTTATCTAGTGATTTAACTAATTATGTTTTAAAATCAGACCTTTCTAATACATCAGGTGCGAATAACGTTGGGTTTTATCCAGGCGGGACTGTTCAAGATGCAATCGTATATACTACACCTGAAATGTTTGGTGCAATTGGAGATGGTATTACAGATGATACTAATGCATTACAAAATGCAATTAATTTTTCAAAAAATAAAACATTACTTTTTAGTAATGGTAAAAAATATAGAACAAAAAATTTAATAGTACCACATCCAATGACATTTAAAGGTTTAGGTAGAAGACAAGATGGTGCTATTATTCCATACGGAAATGTTTCATCTGAATCATTCATTCATACTGGAACATTAATATTATTAACTACTTCTAGTACAGTAACATTCTATGATCTTACAGTTGATGCAAGAGGAATAACTCTATCATTCGTTGATGGACAAAGATTAACTGGAGTTGGTGCAGCAGACAATAACAGTGGTGTATATCAATCTGGTCTTCAAATGTATAATTGTAATGTTTCTGGATTTAGTGGGAATAATTTATACGGCGGCGGGTCAAAATCATTTGGTATCCTAAAAGATTGCCAATTTGAAAGTTCGGGTAAATCATGTGTTAGAATAGATGGTGTAGATTGGAGAATTTCACATTGTGCAATTGGTAGATCATTAGAATCTTATGGTATTGAAATTCTAAATGAGAATAACTTTGTTTCTAATTGTGATTCTTATTTCAATAAACTTTCTGGTATTTTTTATCAACAACCAACTGGAATGGCTTTTATTAAATTAATAGGGAACACTATTAACAGTAATGGTCAACATGGTATTTCTTGTTCATTACCATATGCCCAGCCAGCAGGTACCGTAATTACGAACAATATTTTTTGGAATAATAGTACAGAATTGACAGGAACTTATCATAATATTGATTTAAATTATGGTCGAGGACATATAGTTGAAAATAATGTTCATAAAGCATATCAAGCCACTGCTGGTTCTGATTCTGCGAGATGTGGTTACTGCATAAATTTGAGAAACGGGGCAACACTATCTGGATTCATTAATGATGCAATAGATCCATTATACTCATATGTTATCGATAAGATAAATGTAAATTCCCAAAATTTTGCTAACCAAAATGAAATATCAATTGGTACAGGTTTATCATTAACAAAAACCGTATCTTCAGATACATCAATAGGAATAAAACTTAATATAAATTCAGAAAGCTATGATAGAGTTCAAATAAATCCTGGTAAAATTTTATTAGGAAATGGTTCAGCAGAACCAACACATGGTATACAACAATTAGCAGCGTATCCTGGAATAACAATGGGAGTACTAGGATTAGGTGTTGTTGGAAATTATTCTTCATCAGTTTTTCGTATAGGGACACATCGTATATGGTCTGGTGGCGATAACACACTGAGAACCAAATATGGGGCAGATCCTACATCAGCAACAGATGGAAATATATTATCAGTAAAAGTGTCAGTCCCATCTACCGCTACAAGTACTGGTATAGTTGGACAATGGGCAGCCGATGATACATATTTATATATATGTACAGCAGCTAACACATGGAAGAGGGTATCTATAAATACTTGGTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
2a27947fc5f2fea31c0f04e31838d1c4e288412ddba86439e3dd78804c095276
PDB ID
2a27947fc5f2fea31c0f04e31838d1c4e288412ddba86439e3dd78804c095276
Literature
No literature entries available.