Protein

Genbank accession
BAW85699.1 [GenBank]
Protein name
pectate lyase
RBP type
TSP
Evidence DepoCatalog
Probability 1,00
Protein sequence
MSLIQLSPSNGDLLLINSGSFSTGKVIRTRNELVFYTDQYGNSTGYRWLGNLPHVINGNSPQTDGGISSTSWESYITSNLYDKLKSENITLSGTAHLPTVEVAYGLKKGSLKVWSAGLVSSSSQYWLYTDGTVWSGVGVLGTEPDVPFTQIHLQRDIIKYNYIVQTDGETLINIPYDFTSIDVFINGVLQNSNSGSYKIIQSTIQFSDVLNKGDNIQFYLSNVPISSVRFALSSDLTNYVLKSDLSNTSGANNVGFYPGGTVQDAIVYTTPEMFGAIGDGITDDTNALQNAINFSKNKTLLFSNGKKYRTKNLIVPHPMTFKGLGRRQDGAIIPYGNVSSESFIHTGTLILLTTSSTVTFYDLTVDARGITLSFVDGQRLTGVGAADNNSGVYQSGLQMYNCNVSGFSGNNLYGGGSKSFGILKDCQFESSGKSCVRIDGVDWRISHCAIGRSLESYGIEILNENNFVSNCDSYFNKLSGIFYQQPTGMAFIKLIGNTINSNGQHGISCSLPYAQPAGTVITNNIFWNNSTELTGTYHNIDLNYGRGHIVENNVHKAYQATAGSDSARCGYCINLRNGATLSGFINDAIDPLYSYVIDKINVNSQNFANQNEISIGTGLSLTKTVSSDTSIGIKLNINSESYDRVQINPGKILLGNGSAEPTHGIQQLAAYPGITMGVLGLGVVGNYSSSVFRIGTHRIWSGGDNTLRTKYGADPTSATDGNILSVKVSVPSTATSTGIVGQWAADDTYLYICTAANTWKRVSINTW
Physico‐chemical
properties
protein length:767 AA
molecular weight: 82849,42870 Da
isoelectric point:6,07304
aromaticity:0,09909
hydropathy:-0,15945

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage K64-1
[NCBI]
1439894 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI]
573 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Klebsiella

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BAW85699.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LC121105 [NCBI]
CDS location
range 1 -> 2304
strand +
CDS
ATGTCATTAATTCAACTTTCACCAAGTAATGGTGATTTATTATTAATAAATTCCGGCTCATTTAGTACTGGTAAAGTTATAAGAACTAGAAATGAACTTGTTTTTTATACTGATCAATATGGTAACAGCACTGGATATCGCTGGTTAGGTAATTTACCTCACGTGATTAATGGTAATTCACCACAAACTGATGGTGGTATTTCAAGTACATCATGGGAATCTTATATTACTTCAAATTTATATGATAAATTAAAATCAGAAAATATAACTCTATCAGGTACCGCCCATTTACCTACTGTTGAAGTTGCTTATGGACTGAAAAAAGGATCATTAAAAGTTTGGTCTGCTGGATTAGTCAGTTCATCATCACAGTACTGGTTATATACCGATGGGACTGTATGGAGTGGTGTTGGTGTGTTAGGAACTGAACCAGATGTTCCATTCACACAAATACATCTACAACGAGATATTATAAAATATAATTATATTGTTCAAACAGATGGTGAAACACTAATTAATATACCATATGATTTTACATCTATCGATGTTTTTATTAATGGTGTATTACAAAATTCGAATTCAGGTTCTTATAAAATTATTCAAAGTACAATTCAGTTTAGCGACGTATTGAATAAAGGTGATAATATTCAATTCTATCTTTCTAATGTTCCAATTTCGAGTGTTCGCTTTGCTTTATCTAGTGATTTAACTAATTATGTTTTAAAATCAGACCTTTCTAATACATCAGGTGCGAATAACGTTGGGTTTTATCCAGGCGGGACTGTTCAAGATGCAATCGTATATACTACACCTGAAATGTTTGGTGCAATTGGAGATGGTATTACAGATGATACTAATGCATTACAAAATGCAATTAATTTTTCAAAAAATAAAACATTACTTTTTAGTAATGGTAAAAAATATAGAACAAAAAATTTAATAGTACCACATCCAATGACATTTAAAGGTTTAGGTAGAAGACAAGATGGTGCTATTATTCCATACGGAAATGTTTCATCTGAATCATTCATTCATACTGGAACATTAATATTATTAACTACTTCTAGTACAGTAACATTCTATGATCTTACAGTTGATGCAAGAGGAATAACTCTATCATTCGTTGATGGACAAAGATTAACTGGAGTTGGTGCAGCAGACAATAACAGTGGTGTATATCAATCTGGTCTTCAAATGTATAATTGTAATGTTTCTGGATTTAGTGGGAATAATTTATACGGCGGCGGGTCAAAATCATTTGGTATCCTAAAAGATTGCCAATTTGAAAGTTCGGGTAAATCATGTGTTAGAATAGATGGTGTAGATTGGAGAATTTCACATTGTGCAATTGGTAGATCATTAGAATCTTATGGTATTGAAATTCTAAATGAGAATAACTTTGTTTCTAATTGTGATTCTTATTTCAATAAACTTTCTGGTATTTTTTATCAACAACCAACTGGAATGGCTTTTATTAAATTAATAGGGAACACTATTAACAGTAATGGTCAACATGGTATTTCTTGTTCATTACCATATGCCCAGCCAGCAGGTACCGTAATTACGAACAATATTTTTTGGAATAATAGTACAGAATTGACAGGAACTTATCATAATATTGATTTAAATTATGGTCGAGGACATATAGTTGAAAATAATGTTCATAAAGCATATCAAGCCACTGCTGGTTCTGATTCTGCGAGATGTGGTTACTGCATAAATTTGAGAAACGGGGCAACACTATCTGGATTCATTAATGATGCAATAGATCCATTATACTCATATGTTATCGATAAGATAAATGTAAATTCCCAAAATTTTGCTAACCAAAATGAAATATCAATTGGTACAGGTTTATCATTAACAAAAACCGTATCTTCAGATACATCAATAGGAATAAAACTTAATATAAATTCAGAAAGCTATGATAGAGTTCAAATAAATCCTGGTAAAATTTTATTAGGAAATGGTTCAGCAGAACCAACACATGGTATACAACAATTAGCAGCGTATCCTGGAATAACAATGGGAGTACTAGGATTAGGTGTTGTTGGAAATTATTCTTCATCAGTTTTTCGTATAGGGACACATCGTATATGGTCTGGTGGCGATAACACACTGAGAACCAAATATGGGGCAGATCCTACATCAGCAACAGATGGAAATATATTATCAGTAAAAGTGTCAGTCCCATCTACCGCTACAAGTACTGGTATAGTTGGACAATGGGCAGCCGATGATACATATTTATATATATGTACAGCAGCTAACACATGGAAGAGGGTATCTATAAATACTTGGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
2a27947fc5f2fea31c0f04e31838d1c4e288412ddba86439e3dd78804c095276
AlphaFold3
Source AlphaFold3
Method AlphaFold3
Resolution 0,8124
Evidence 0,8124
PDB ID
2a27947fc5f2fea31c0f04e31838d1c4e288412ddba86439e3dd78804c095276
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6698
Evidence 0,6698

Literature

No literature entries available.