Protein

Genbank accession
XVB83206.1 [GenBank]
Protein name
minor head protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,51
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MIHVLDFNSKIIDFISSDDIAVTRAEYTRNKQDKSELLNIEILSERAEHFKKRNRVIIQDKTNAYREFIINRIEESGDILEVECDPSYVEDIGKAKPIPTGNFTKTTVNEALSEILRDSGWVEGLCEYGGIKSMSWTSVRTPYEMISQLTTTYKLEPDYEIEIDGNEVVKRKVNMLEPKPLFKGKEIVYGKDLISMKRTVDMTEVKTALFAFGPEKDDGTRISTVVVDDEAQQQFNLPKRYLWGIYEPESDDQDMTIERLTTLTKIELNKRNSAALSYEIEAFDLEEDYPHEIIRFGDIIRIKNTDFTPSLYAESEVIGFTHELISGELTWTFGNIVEYEEDDLLKYFRSRLKDIEKKFNDDINNVGSIITDRIDEEVERLQRKLHRGPTPPDNPEEGDFWFDTSNPNVAVLREFVNGEWKHASAHDVEQIGGLSREVIIYRQLLEATHSMSAEIANQMERTNVALSSEYLVDLDVKGKLQKALSDMLAKLQIVKNYMDSMTEETATIGRLMEWQSALVDLRNDFYYLIVALIEAEKAIQERLKYLQSQYTEEKFNEAMQNVADKFGFEYTEDGFLVGEGSLISGAIQALREDTEEQFKQVVKSVDYETDKKGIVERLNSADSAREQLDKLIKDRVTLTEYNKMKIGTRNLLLNSKERSDLFGSSTHRRIVYHLTEPLKVGQEYTLTFDMEVTSGDNFGKTTVLPYEPSNGSIDITIDNSTHNKLTFVANVPSTLLLIYSAVNSTPENDTTEIKVTDAMLVEGNKIGDYSQAPKEQEERLETMETGIEQNGIDISLRAKETDLNKTKQTLSKIAAEILVNTTTGVTLKYDENGTVSDVTVGPGGVKINANVFEINDGDVIVKDGVTTIKDAYIDKLFSKQATINYLNSVDITAKRIEAKDNKASVNIENGTITMTRADGHKLDMGINGIEMLNPDGSKRFSMDRLLVTSAALGTSNSNVYLAAQQDFEVRAVDITQIPSDGAWDSYRYVPIRADSFIGNKVMTNGGTNLYLGSDAEVRVTSRGGYNGTDTIYRDVRALGFYGNYLDSNYVTAGQNIYIRPDRGSEVRFTVRGTTDSYVDIRGGTGWLASVSHRGSNARFYIGSDNGVRITGRSLYNGGDIIWRDLAANGLYANFLEINPNTNASNLYLRANNEVRITKRNSTNSYIPIRAASATWTSSERYKYDIENWDIDVLEHLVDRVQLYSYKLYSEMEEDSQRVRHGVVLERETPDEWKNGDGVDSYEMTAWCLKAIQELTKKVRALETELEAKL
Physico‐chemical
properties
protein length:1269 AA
molecular weight: 143752,25910 Da
isoelectric point:4,83304
aromaticity:0,08432
hydropathy:-0,50252

Domains

Domains [InterPro]
IPR007119
28–330
IPR007119
IPR010572
94–324
IPR010572
XVB83206.1
1 1269
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Mammaliicoccus phage phi6223
[NCBI] 		3414230 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XVB83206.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV389081 [NCBI]
CDS location
range 35044 -> 38853
strand +
CDS
TTGATCCATGTATTAGATTTTAATAGTAAAATAATTGATTTTATTAGCAGTGATGATATTGCTGTGACTAGAGCTGAATACACGAGAAACAAACAAGACAAAAGTGAACTTTTAAATATAGAAATCTTAAGTGAGAGAGCTGAACACTTTAAAAAGCGTAATCGTGTCATCATACAAGATAAAACCAATGCGTATCGAGAGTTCATTATCAACAGAATTGAAGAAAGTGGCGATATATTAGAAGTTGAATGTGACCCTTCTTATGTAGAAGATATCGGAAAAGCTAAGCCAATACCTACAGGTAACTTTACAAAAACGACTGTCAACGAAGCCTTATCTGAAATATTAAGAGATTCTGGTTGGGTTGAAGGTTTATGTGAATATGGCGGAATTAAATCGATGTCATGGACGTCAGTAAGAACACCATATGAAATGATAAGCCAATTAACCACAACTTATAAATTAGAGCCAGATTATGAAATAGAGATTGATGGTAATGAAGTTGTTAAAAGAAAAGTAAATATGCTTGAACCAAAGCCATTATTTAAAGGTAAGGAGATTGTATATGGTAAAGATTTAATTTCTATGAAACGTACGGTTGATATGACAGAGGTTAAAACTGCCTTATTTGCTTTTGGGCCTGAAAAAGATGACGGAACACGTATCAGTACAGTTGTAGTAGATGATGAAGCACAACAACAATTCAATTTACCAAAGCGTTATTTATGGGGTATCTATGAACCTGAATCAGATGACCAAGATATGACAATTGAAAGATTGACGACACTTACAAAAATAGAACTAAATAAACGTAACAGTGCAGCTTTAAGTTATGAAATAGAAGCGTTTGATTTAGAAGAAGACTATCCACATGAAATTATAAGGTTTGGAGATATTATCAGAATTAAGAATACTGATTTCACACCTAGTTTATATGCTGAAAGTGAAGTGATTGGCTTCACACATGAATTGATATCAGGGGAGTTAACTTGGACGTTTGGCAATATCGTTGAGTATGAAGAAGATGATTTACTTAAATATTTTAGAAGTCGTCTAAAAGATATAGAGAAGAAATTTAATGACGATATAAACAATGTTGGCTCAATCATTACAGATCGTATTGATGAAGAAGTTGAACGTCTACAAAGGAAACTACATCGTGGGCCAACACCACCTGATAATCCTGAAGAAGGTGATTTTTGGTTTGACACATCAAATCCAAATGTAGCTGTTTTAAGAGAGTTTGTAAATGGCGAATGGAAACATGCTTCGGCACATGATGTGGAGCAAATCGGTGGTTTAAGCAGAGAAGTCATTATTTATAGACAATTATTAGAAGCTACACATTCAATGAGTGCTGAAATAGCTAATCAGATGGAAAGAACTAATGTTGCATTAAGCTCAGAGTATCTCGTTGATTTAGATGTTAAAGGTAAATTGCAAAAAGCTTTAAGTGATATGCTGGCGAAATTACAAATCGTTAAAAATTACATGGATAGCATGACTGAAGAAACTGCCACTATTGGTAGACTAATGGAATGGCAAAGCGCATTAGTAGACTTGAGAAATGACTTTTATTATCTAATCGTGGCGCTAATCGAAGCAGAGAAAGCTATTCAAGAACGTTTGAAATACTTACAATCACAATACACAGAAGAAAAATTCAATGAAGCCATGCAAAATGTAGCTGATAAATTTGGGTTTGAATATACAGAAGATGGTTTTCTTGTTGGAGAGGGTTCTTTAATCAGCGGTGCTATTCAAGCATTACGAGAAGATACCGAAGAACAATTTAAACAAGTAGTGAAAAGTGTTGATTATGAAACAGATAAGAAAGGTATTGTTGAACGTTTAAATAGTGCAGATAGCGCAAGAGAACAATTAGATAAATTGATAAAAGACCGTGTAACTTTGACCGAATACAACAAGATGAAAATAGGTACACGTAACTTATTGTTGAATAGTAAAGAACGTTCGGATTTATTTGGAAGTTCCACGCATAGAAGAATTGTTTACCATTTAACAGAGCCTTTAAAAGTTGGGCAAGAGTATACATTAACATTCGATATGGAAGTTACAAGTGGAGATAATTTTGGGAAAACAACTGTATTGCCATATGAACCGAGTAATGGATCAATAGATATAACAATTGATAATAGCACCCATAATAAACTTACTTTTGTAGCAAATGTTCCAAGTACACTTTTATTGATTTATTCAGCGGTTAATTCAACACCAGAGAATGACACAACTGAAATTAAAGTTACAGACGCAATGCTAGTTGAAGGGAATAAGATTGGCGATTATTCACAGGCACCAAAAGAACAAGAAGAACGTCTTGAAACAATGGAAACAGGCATTGAACAAAATGGTATAGACATATCCTTAAGAGCCAAAGAAACAGACTTGAACAAGACAAAACAAACGCTATCTAAAATTGCAGCCGAAATTTTAGTGAACACGACAACAGGCGTGACATTAAAGTATGACGAAAATGGTACGGTTAGTGATGTTACAGTTGGACCAGGTGGCGTTAAAATTAATGCCAATGTATTTGAAATTAATGATGGAGATGTCATTGTTAAAGATGGTGTCACAACAATTAAGGACGCTTATATAGATAAACTATTCTCTAAACAAGCGACTATCAATTACTTAAACAGTGTTGATATTACCGCAAAACGTATTGAGGCGAAAGACAATAAAGCGTCAGTAAATATTGAAAATGGCACTATAACTATGACTAGAGCAGATGGTCATAAACTTGATATGGGTATCAATGGTATTGAGATGTTAAACCCCGATGGGTCTAAACGTTTTAGTATGGATAGATTATTGGTTACAAGTGCAGCATTAGGAACATCTAATTCCAATGTGTATTTAGCAGCTCAACAAGACTTTGAAGTTCGAGCAGTTGACATTACACAAATACCAAGTGACGGTGCGTGGGATAGTTATCGCTATGTACCCATTAGAGCAGATAGTTTTATAGGTAATAAGGTTATGACTAATGGAGGTACTAATCTTTACTTGGGCAGTGATGCAGAAGTACGTGTGACATCTCGTGGTGGATATAATGGTACAGATACGATTTATAGAGATGTTAGAGCATTAGGTTTTTATGGTAATTATTTAGATTCAAACTATGTCACAGCGGGCCAAAATATTTATATTCGACCTGACAGAGGCTCAGAGGTGAGGTTTACTGTTAGAGGTACGACAGATAGCTATGTTGATATAAGAGGTGGTACGGGTTGGCTAGCATCAGTATCTCATCGAGGTTCAAACGCTCGCTTTTATATCGGAAGTGATAATGGCGTTAGAATCACTGGACGTTCTCTATATAATGGTGGGGATATTATTTGGCGCGACTTAGCTGCCAATGGACTATATGCAAATTTCTTGGAAATCAATCCGAATACAAACGCCTCTAATTTATATTTAAGAGCGAATAACGAAGTCCGTATTACAAAGCGGAATTCCACTAATTCATATATACCTATTAGAGCAGCAAGTGCAACGTGGACGTCCTCTGAACGTTATAAATATGATATTGAGAATTGGGATATAGATGTATTAGAACATTTGGTTGATCGAGTGCAATTATATAGTTATAAGCTATATTCAGAAATGGAAGAAGACAGTCAACGAGTTAGGCATGGTGTTGTCTTAGAAAGAGAAACGCCAGACGAATGGAAAAACGGAGACGGTGTCGATTCTTACGAAATGACGGCATGGTGTCTTAAAGCTATACAAGAATTAACTAAAAAAGTCCGTGCATTAGAAACGGAATTGGAGGCAAAATTATGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
87519c2d79340fefaa29b1f74165d022c8b619d033e70f700a4c7aeb7a4579a8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2375
Evidence 0,2375
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterisation of phylogenetically distinct temperate phages from Kenyan Mammaliicoccus sciuri Cherbuin,J.D.R. 2025-10-09 — GenBank