Protein
View in Explore- UniProt accession
- A0A1D7SR93 [UniProt]
- Protein name
- Structural protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MDINKVSHVSSYQTPQFIESEYPLFNKFIEYYYQSQEKTGLGQNIINNFLQYLDIDKLDIGILDGVTKVVDPVNVTDTTITVETVDPFLEKNGSILIGDEVIYYEETVSSPNIALTPGISYTQVQLKWVLLANNISLFDGVRRVFPLVSQDNPIGPSSPQHLIVKVYGKTLTPVVDYTVSGTNIVYTIAPRTATAADDISTTSVTYLNGFSENTIVQIDDISSAFGDNKTTFELTVNSEKYEPIADEFLLAVYDDRLLVPKVDYFIDGSIFIFNVAPLNGRSLSLYSIEAPIPSFGSGAVGYSRVNDLGNISSVIPSTNGFGYRFDYPPKVSVNSSVGSGASVKTLVDGIKSVSLLSGGAGYSESNPPTVKVQFPTKEGYVEPTLKATVTNGAVSAIDIISSGSGYTFTPRITFEQPGGAVLAPPTIVGGSVSGAITITNGGQGYTTPPLVYIDEPTGLDGIKASFTTTLTDGEITAVNILNAGQGYETVPRISVIDPVGAQVLETVVDGDGRVISVELLFGGSGYTDVPSVYIVDNRQNDVGTYIGGTGATAVAAIFNGQITDINITNFGTGYSADNPPQIVIQKPVDAKASATVGLQEITGFSVLKAGKEYTKAQFLGCARAASGITDYTQDGNAVFSNSTTAAEASTDTSVKCLDALFIKRLLDKYTEQFLPDVPTLDYSKIDVRTSIKTIKDFYSAKGTSFSIAYLFKLLYGETVTVSYPKDQIIKPSAATWSVDTVLRATLVSGLPENIQDGLLEQVADISDPNILAATALIENFISIQTAQDTIYELALSEETIEGTFVVPYKTKLAEPLNTTEGIITVDSTIGWPERNGEFVISSGVGSEVVQYKEKSLNQFIECTRSVNGVVEDWDSATQVSSNFNVFINRGTAQEVVLNIVGIVDAQQTTLTDTGSYYLPGDKLLISKLGGTGTGPELTTWLYNVKKLIEVESIAFGGINNQSATVTCSNPHGLLVGDQVTIYGANPIIYNGSFLVTSRDSTTVFQYQLPQPANVVPQGNILVSIDLNKGKSDSSAVNNAISPYTTNVQNTFFNTTNTYIASTGIPNYNIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPITPVTISTKNLIVPGPIGTWVNGVSIWSYKSDVTKIFGAVTSIAINNAGNGYDAAFPPAITISGGGGTGAAATATVNGSISEVTVTEGGSGYTSSPLVSIVGGGGSGASATAIITKGVVSSILVNSGGTGYTSQPSITVVGGGGSGAEGTAAVRGPIQSVAITNGGASYTSNPSIILSSGAGAVAQAIINDGRIISIAIISAGSGYTTAPEVTIQGDGFGAVARATIDVDGENAGKVTGIEIVNRGIGYSQGTTIINLNSVGQGASFLANVFQWTYNLQETTTVDSAKGSVFEGFNNQYGGEYAHLSNPQRLRYILGDNLFANVNDQILEQDDQLGHSPIIGWAFDGNPIYGPYGYSDPTNQSSSISRLRTSYRLKANLVYDEVTNPTPVRTDGPLLSEEIAGKFVEDYEYSFSLGDLDQYNGRFCKTPEYPTGRYCYFVTIDATEQGNPVFPYILGPSFNSVVDTWNLSTTAVQQNIPIGVVRYRDPYENVDIDVERAPNASTNGLTLENGDILTFDVEDENRDGVISAEETADPDQIFEESPLQLFDYFPTVKLDSKVDIEVETITKFEDASITGFVVENAGINYQVDDRLIFDNTDTGGDGASARISRIKGETVSAYTFENVSGNNFGVLTTSVPHNLQVTDTVFVDYTPIMDNTNKTFVVRQFKGIENITIAQSGSGYNEDIPPTLVIDGDGVSGKLEAVVTSVGSIDTVNILNSGSGYTSNPRVIISHPQVFKKAEYIVSKIENNENVKVNDIFVNNNKEIFICGKTLDSSGNSVAFVSKLSTTGVKEWEKTLELSTGTNYAEFQKLYVDGDDIWVVGVNRPNILVLDAYNPDIILVKYTQSDNGLSASLQFQKGYSGISGATRADNITCIKKYSDTRYVIGGFTNTNSGSPFDAFIALIDTAGSFAIKRKIASVNDSEKLTDIVVDEGNIYFTLETSNTNTDNNVNVAFGKATVGTNSIQVEYVNEYSNAGYSFLDSSLAIDEFKELYINATLRAKSDNVTRDSVWVGKVDTAGEFVWNYRYLAPGRDVNAVGKCAIDIFGDLNIAFNRVDNTTGLKTVDTVKIGYDGVLKNHTTNEFNEYRIEGITAHSIDVDNSGDVYVFGQTSWNRNEFLLEFTGGATTDTFGNYTPTFVGADATQSLHLDGGVAKIYGRDVATPANWENAYIEFPNSTLGNTLNENWTLEFMLYQNSASTDTHSQDQQTLVAIGDATDATGGLWLYYDRTAAGPSGYLELIVTNNTTSINSAGGAVQSSLTTMFADDTWQFIGLKKEDNLFTVYVNGISVITATVADTSFTSKKLYIGNIAGRNGTTGNWRSDEQGQYFVDNLKLRNRAITPTVPSDVSALPTSSAFGLSYSWTDTSWFDTYNNLHDYIDYSGWGVKVDKNADATRIGDQGIQLNTQLGYVRTAVTPVTGSALTIGSTGFALGSLGLQSLDFDDATTTMSEDTETLTYTKDIWSSRTATIPSPGSQKLIINAVVKDRYYFKVTDTVKIDNIQILTINQAFRFTVGTKLVLNDDSGSFINSGYITKVDNANNKVYLAINNNSWTNDLNTGQLSTSQFDEQSTYGIVGPIPLDINQIDSYTFAEVDNTTPGTFTIDLDKYNLDGTYNAAGSQNLDSFAKFKPYSDDDYSVRIDEISGSSTFIVGSVVTINGGDISYNAAYSTATITNLTGVLKITLVANLTKILRVTAVSNSDEVYVITDTRHYLTPGSMLNVDGNPSETVNTVVYDEYDGSFPVDTVISPLEFTYKLPQAAITSPATSASNVSIYIKSPVLKMYYGHQYLFDLSHSSMVGGNLSFSKDPLYKLEYSFNSIERVGTPGVTGEGATTPTVKFKVDEDVVTNISYYFDPSRVGDNDSPIIQGSYLDVVSSPYRGTFQVSGVAGATITRGADQIKFPLQNEPEGNADVSRASYSTSSRRAVGSIDNIRIVNPGGFYTRLPIVDSIQSTRQIERVTINEPGTEYAVGQYTGVPIAGDGEGGFVTITVADGTDAEGGAIPGQVQSVIVTSPGKGYTTATVDIDSVPGILGAGLTGSGAEVTVVIPPFGTAASIFTVGSSVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEITFPINAQLTSTSILDSVTVTDPGSGYSQAPAVIITGGGGTGAIAQSTIKNGRLDRIEVKDPGLGYSSTPTVELKSSFNYVVNLDLGLLQFSFPHGIAQGSAITLAVVDTGDGAEFPIAAGAVGRLNGVTTYYAISGAANSLEDDQLKFAITPANAALGDALSFTNAGTGRQQVLTTSFGGAATANVITSTFLEGEQVYQGSSFENATAFGFVSTNNGWQVGPRIVKIVDYTGEFNIGESVTGVISKSSGTISSLNIATGVLDVGSITETSGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSINDWKDILIKNVHPASFKVFGELNLNEYGFVPNKETFFQLTKSVELARQATVPNIQSFALVEPVYSAFDNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISNLFDGERISFPLQIDGSNVVANANQLMIILNGVVQTPDTSFEVQNDSIVFAEPPQPPASVKYVNVTIQPIQVYRFTVTNNSGIFPSTNNTVLGTQSGSRLTVTSVVGDDIFGFVAEGNVGIVTALDNATLTSGAGYTDGTYTEVATTSSGVGTGLTLNITVASGVVTQVSINSAGVGYASSEVITIAGGTTSATIAVSTISGFNINELISVGATGFTATLTQITPIVNLNLFSFNEQIKNLTGKIAVVEEVNLETGDSVPLADLRYTVGAGTSSIELIDSDALTDTAVPASTFTVGANYQLGSEIVTVSAITVGPNSTTLTVTRGQLGTTATSHQEDLPLYGTDISVTNELALSKTVGTYQSKPGLFDIQLDDVIIGSQSGVVARITSTSAYQDPTTNEFIEQVNISDGSSFFGLLFNRLTSASYPNIILDNIAESQVNIVDFTDNTTNFDSKFPGTEFISNLVIPYDNTTGTFQENEIIRNYKLGYGNVTGVFNSSEDMVTKKLAFDSRVGSGFFQLGQVIRTQDTKGEVIGYNQALSTIYLGKVGRTLSTGEDYHKVTFNNNAQLDTDQSHYGLSSLLLDGTGDYLSIPTSTEFGFGTGAFTIECWIRPSSVTGTQQIFDFRTTAVEVSSELLLVGTNLNYRVNNSTTITGTATLAVDTWYHVAISRNASTTKLFVNGTQDGGDYSDGSNYGTTKPIIIGASYAFGDGFAGHIDEFRVSNTSRYQTTFTAPTGIFQGDANTKLLLHFEGDDTQTYIEDWSGGESFTDNEDFNNDAILKNWNENSTNLPAGFAGKSQRYYDAANLIESNKNFVAKEAVYLLTQQYPSLVIPGGNVNCEDDIRDILTAMIEDLRNGCNSHIWDASALYVDRTANPITISHVDTEVTETVWVYDKVKDILQYIINNTLWSVSGSHGVRQITDTTITDSSTSSFTTLQPSAISYNAATGDMVMTSNGHGLTTSNTIAIAAESLTFTCTSDGNERELVHPRVSDTRAYNQVLAITAADTNTFTVNVGASPAEQQYVHTFVSATSGAVTVLDYTTGDCADVYSTIGNLLDILTDTLEQANLGTPVDHLATITKVTTEYEFVGATVNAYLEVPFSTTYHSAASDILYTNRIDVAGRGRFRDASNLINANASVIVDKAAFDMLARYPDLAVDMPRNADGSSTDGTLRCKTDLGLILGAIAKDIYDGGNFFTVQAAKFYIGENDELRHIRLQVWQSVYAHDRLAYYAKQAVTGDLTYDNTDNIIVGDWGITNDAGNCANVQSAIDTLVTTINDIIAPTSEDFNIAGDRLYFNREYIAEEITGLTAAYLTYQVDNTNQVAYTYDVAKCERDIKLLITAIISDLQTGGNNSTVDNMNLYLTANGELNYIEEELLPTVFAFEQIRSLGEKAIRNLLYDSGSTVSGQQYAAIFSDNTAYRD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- Physico‐chemical
properties -
protein length: 6376 AA molecular weight: 683755,45400 Da isoelectric point: 4,34906 aromaticity: 0,09849 hydropathy: -0,08869
Domains
Domains [InterPro]
DC_0042
ATT
1–435
ATT
1–435
DC_0832
ATT
418–547
ATT
418–547
IPR013320
STR
2258–2432
STR
2258–2432
PF13385
LEC
4162–4305
LEC
4162–4305
DC_0069
STR
4167–4640
STR
4167–4640
IPR006558
LEC
4181–4308
LEC
4181–4308
1
6376
Architecture
ATT 1-547 | ATT 713-1523 | STR 1524-1534 | STR 1630-2938 | ATT 3124-3681 | STR 3778-4066 | STR 4137-4640 | RBD 4641-4998 | STR 5044-5534 | RBD 5584-6375 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Cyanophage S-RIM12 [NCBI] |
1278402 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Brizovirus > Brizovirus syn33 |
| Host |
Synechococcus [NCBI] |
1129 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO16214.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349312
[NCBI]
CDS location
range 53724 -> 72854
strand +
strand +
CDS
ATGGATATCAATAAGGTTTCACACGTCTCCTCTTATCAAACTCCTCAGTTTATAGAGAGTGAGTATCCCCTATTCAATAAATTTATTGAATACTATTATCAGTCCCAAGAAAAGACTGGATTGGGTCAAAATATCATTAATAATTTTCTTCAATATCTTGATATTGATAAATTGGATATTGGTATTCTTGACGGTGTTACTAAAGTTGTTGATCCTGTTAATGTAACTGATACCACAATCACTGTTGAGACTGTAGACCCCTTTCTTGAGAAAAATGGTTCTATTCTAATTGGTGATGAAGTAATTTATTATGAAGAGACTGTATCTTCTCCAAATATTGCATTAACTCCTGGTATTTCTTATACTCAGGTTCAACTTAAGTGGGTTCTGCTTGCCAACAATATTAGTCTCTTTGACGGTGTACGAAGAGTCTTTCCCTTAGTTTCTCAAGATAATCCTATTGGACCTTCTTCACCACAACACCTTATTGTTAAAGTTTATGGAAAAACTTTAACTCCAGTAGTAGATTACACTGTTAGTGGAACTAACATTGTTTATACAATTGCTCCTAGAACGGCGACAGCGGCTGATGATATTAGTACTACTAGTGTTACATACTTAAATGGTTTTAGTGAGAATACCATTGTACAAATTGATGATATTTCTAGTGCTTTTGGTGATAATAAAACTACTTTTGAACTGACTGTTAATAGTGAGAAGTATGAACCTATTGCAGATGAGTTTTTACTTGCTGTTTATGATGATAGACTACTTGTTCCTAAGGTAGATTATTTTATTGACGGATCTATCTTTATATTCAATGTAGCACCATTGAATGGTAGATCTCTGTCCTTATATTCCATTGAAGCACCTATTCCATCTTTTGGTTCTGGTGCCGTTGGATATTCCAGAGTAAATGATCTTGGAAATATTAGTTCTGTAATTCCAAGTACAAACGGTTTTGGGTATAGATTTGATTATCCTCCCAAGGTTAGTGTAAATTCTAGTGTAGGTTCTGGTGCTTCTGTAAAGACCCTAGTAGATGGAATCAAGTCAGTTTCATTACTTAGTGGCGGTGCTGGATATAGCGAAAGTAATCCCCCTACTGTAAAAGTACAATTTCCTACAAAAGAAGGATATGTAGAACCTACTTTAAAGGCAACAGTAACTAATGGTGCAGTTAGTGCTATTGACATCATTAGTTCGGGTAGTGGATATACATTTACTCCTAGAATCACTTTTGAACAACCTGGAGGCGCTGTGCTTGCTCCCCCAACCATTGTTGGAGGATCGGTTAGTGGTGCTATTACTATTACTAATGGTGGTCAAGGATATACTACTCCTCCTTTGGTATACATTGATGAACCCACTGGACTTGATGGTATTAAAGCATCATTTACAACTACCTTGACAGATGGTGAAATTACTGCTGTTAATATTTTAAATGCTGGTCAGGGTTATGAAACAGTCCCTAGAATTTCTGTTATTGATCCTGTTGGAGCACAAGTTCTTGAAACTGTAGTTGATGGAGATGGTAGAGTTATTTCTGTCGAACTTCTGTTTGGTGGCAGCGGTTACACAGACGTTCCATCTGTTTATATTGTAGATAATCGTCAGAATGATGTTGGTACTTATATTGGAGGAACGGGTGCTACTGCAGTAGCAGCAATCTTTAATGGACAAATCACTGATATTAACATTACTAACTTTGGTACTGGTTATAGTGCAGATAATCCTCCTCAAATTGTAATCCAAAAACCTGTTGATGCTAAAGCATCTGCAACAGTTGGTTTGCAGGAAATTACAGGTTTTTCTGTTCTTAAAGCAGGAAAGGAATATACTAAAGCACAATTCCTTGGTTGTGCCAGAGCTGCTTCGGGTATTACTGATTATACGCAAGATGGTAATGCAGTATTCTCTAACAGCACTACAGCAGCAGAGGCATCAACAGATACCTCTGTAAAGTGTCTGGATGCATTGTTTATTAAAAGACTACTCGATAAGTATACAGAGCAGTTCTTACCTGATGTTCCTACACTTGATTATAGTAAGATTGATGTTCGTACATCTATTAAGACTATTAAAGACTTCTATTCTGCAAAGGGTACATCTTTCAGTATTGCATATTTGTTTAAACTTCTTTATGGCGAAACTGTTACAGTTTCATATCCTAAAGATCAAATTATCAAACCATCTGCAGCAACCTGGTCTGTTGATACGGTTTTACGTGCAACATTAGTTAGTGGTCTTCCAGAAAATATTCAAGATGGTCTTCTTGAGCAAGTTGCTGATATTTCAGATCCAAATATTTTAGCAGCAACAGCATTGATTGAAAACTTTATTTCAATTCAAACTGCCCAAGATACAATATATGAACTAGCACTTTCAGAAGAAACAATTGAAGGTACATTTGTAGTTCCATACAAAACAAAACTTGCTGAACCTCTTAATACTACAGAAGGTATCATCACTGTTGACTCTACTATTGGATGGCCAGAAAGAAATGGTGAATTTGTAATTTCGTCAGGTGTTGGTTCTGAAGTTGTTCAGTACAAAGAAAAATCACTAAACCAGTTTATTGAGTGTACTCGTTCTGTTAATGGTGTTGTAGAAGATTGGGATTCTGCCACTCAGGTATCGTCTAATTTTAATGTATTCATTAATAGAGGAACTGCTCAAGAAGTAGTATTGAATATTGTTGGTATTGTTGATGCTCAACAAACAACACTCACCGATACAGGTTCTTATTACTTACCAGGAGATAAACTGTTAATCTCTAAACTGGGTGGTACTGGAACAGGTCCAGAACTCACAACTTGGTTGTATAATGTTAAAAAGTTGATTGAAGTTGAATCAATCGCTTTTGGTGGAATTAATAATCAATCTGCTACTGTAACTTGCAGCAATCCTCATGGTCTATTGGTCGGAGATCAAGTTACAATTTATGGTGCAAATCCAATCATCTACAACGGATCTTTCCTTGTAACCTCTAGAGACAGTACTACTGTATTTCAGTATCAACTTCCTCAACCTGCAAATGTAGTTCCTCAAGGAAATATCCTTGTTTCCATTGACTTGAACAAAGGTAAGTCGGATAGTTCTGCAGTTAATAATGCAATTAGTCCTTACACAACTAATGTTCAAAATACTTTCTTCAATACTACAAACACTTATATTGCGTCTACAGGTATTCCAAACTACAATATTGGACCTTTCCCTGGATCGGCATTATTACCTGGCAACCAACGTAAATTGAATAGGTTTCCAATCACTCCTGTTACAATCTCAACTAAAAATCTGATTGTACCTGGTCCTATTGGAACATGGGTAAATGGCGTCTCTATTTGGTCCTATAAGTCTGATGTCACTAAAATCTTTGGTGCCGTAACGTCAATTGCTATCAATAATGCAGGAAATGGATATGATGCTGCATTCCCACCAGCAATTACGATTAGTGGTGGTGGGGGAACTGGAGCAGCAGCAACTGCGACTGTTAATGGTTCTATTAGTGAGGTTACAGTAACTGAAGGCGGTTCTGGGTACACTTCTTCTCCATTGGTATCTATTGTTGGTGGAGGCGGTTCTGGAGCGTCAGCAACAGCAATTATTACAAAGGGTGTAGTTTCTAGTATTCTTGTCAATTCTGGAGGAACTGGATATACTTCCCAACCATCTATCACTGTTGTTGGTGGTGGAGGATCTGGTGCTGAAGGTACTGCAGCGGTTCGAGGGCCAATTCAATCAGTCGCCATCACTAATGGTGGGGCATCTTATACATCTAATCCTAGTATTATTCTTAGTTCTGGTGCTGGTGCTGTTGCACAGGCAATTATTAATGATGGACGTATTATTTCAATTGCTATCATTTCGGCAGGTTCTGGATATACTACAGCACCAGAGGTAACTATCCAGGGAGATGGTTTTGGTGCTGTTGCTAGAGCAACTATTGATGTTGATGGTGAAAATGCTGGTAAAGTTACTGGAATTGAAATTGTTAATAGAGGTATTGGATATAGTCAAGGTACGACTATTATTAACTTAAACTCTGTTGGTCAAGGTGCTTCTTTCTTAGCAAATGTATTCCAATGGACTTATAATTTGCAAGAGACAACAACCGTTGATAGTGCTAAGGGATCTGTATTTGAAGGATTTAATAATCAGTACGGTGGAGAATATGCACACCTTTCCAATCCTCAAAGACTTAGATACATTCTAGGCGACAATCTATTTGCTAATGTAAATGATCAAATTCTTGAACAGGATGATCAATTAGGACATTCTCCTATTATTGGATGGGCATTTGATGGCAATCCAATTTATGGTCCTTATGGATATTCAGACCCTACCAATCAGTCTTCTTCAATCTCTAGATTGAGAACTTCTTATAGATTAAAGGCAAATTTAGTTTATGATGAGGTTACTAATCCAACTCCTGTTAGAACTGATGGACCTCTGCTATCAGAGGAGATTGCAGGTAAGTTTGTAGAAGATTATGAGTATTCCTTCAGTTTAGGAGATCTTGATCAATATAATGGTAGGTTCTGTAAGACTCCAGAATATCCCACTGGTAGGTATTGCTATTTTGTAACTATTGATGCTACAGAGCAAGGTAATCCAGTATTTCCATATATTCTTGGACCAAGTTTTAACTCGGTTGTTGATACCTGGAATCTTTCTACGACTGCTGTTCAACAAAATATTCCTATTGGTGTTGTTCGTTATCGCGATCCTTATGAAAATGTAGATATTGATGTTGAAAGAGCACCAAATGCATCTACTAATGGATTGACATTGGAAAATGGAGATATTCTAACTTTCGATGTAGAAGATGAAAATAGAGATGGTGTTATTAGTGCAGAAGAAACTGCAGATCCAGATCAAATATTTGAAGAGTCTCCATTACAACTATTCGATTACTTCCCGACAGTAAAATTAGACTCTAAGGTTGATATTGAAGTAGAAACTATCACTAAATTTGAAGATGCTTCAATTACGGGATT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Genbank protein accession
AOO17721.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349319
[NCBI]
CDS location
range 53711 -> 72841
strand +
strand +
CDS
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