Protein

View in Explore
Genbank accession
AFA44802.1 [GenBank]
Protein name
putative structural protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
TSP
Evidence DepoCatalog
Probability 1,00
Protein sequence
MRFNMSLNNLSATNISGALIDAGDFVINKRLVSNNQILYYTDPVTSIKTGYVWKGTLPHITSTNNPNTDGGISDTAWVPVIYSKLKEKMETEGLTLDWNAHLPTVEVAYGLTKNSLKMWKSGTTATSDDYWLYTDGTVWNGVGVLGSTPETSTGFEKITPNFNASIKTYSASATDGQTDFNIPFTFSTITVFVNGSIQLPGLNYTVSGSTLTFTTELEAGDLLYVFIGNPNISTNDKLNRIYTANAMQGQTTIQVPYDFSTAIVYINGVLQNPSTAYSIGADKIITFSEELYQNDEIIIMLGDVVVQSDEYVLKNDLLSPDASDNINTNDGTSVQQNIDNFSNFNNLFSNDNGLSNINYKSSLFSNNYKSTLYDLYQNKLSLFEFIPPELHDGIRNYTYKGDLSVYIQNAIDQANLLGGAVIECPPGQYYCNVVTKQYVVLIGSRNGSVRRSLPWTYGTPGNPSRPYGTRFRNFSNDWIIKSETNSQNDVSSRSFGIIGIDFDATDAINSTGGVRLRGPEFCVKSCSFYGFQDQGLEVSGNIGLIEDVIANECLKNRIRTDYVGTIEISGASDCQIHRIEGNAQVKGLNSITNSSPYICGIKISGNNHYISGLMGEISETGIYISASSVHHKISDSRADNNVGPGYLLNGVQMVNCHSYNNSRTGDGLYPAFGALDSASRLLLSNCLAWTDNAPVDGTGTQRLHSYGFDFSNVDYLSLRLKPWINQCFSYGDKNGWINSPLTYGVEYTPTNGLLTISSNATTTPNVDGVSVISISTTSLSQITGFVGGMIGQEVDVYLNATASVTLVNSSTFLINNFAKNSNKTMVVGRVYKFIKTSATIWREVGDVVRVYSGTTAERPSTAATTGMQYFDTTINKPIWRNADNTGWVDSSGTSV
Physico‐chemical
properties
protein length:895 AA
molecular weight: 97786,61410 Da
isoelectric point:4,90415
aromaticity:0,10391
hydropathy:-0,22335

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.80
ATT
20–91
G3DSA:2.10.10.80 DC_0941
G3DSA:2.10.10.80
ATT
30–80
G3DSA:2.10.10.80 DC_0397 IPR011050
AFA44802.1
1 895
Architecture
ATT
STR
ATT 20-241 | STR 242-895
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
AFA44802.1
1 895
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 402 402 0,9960
Central domain 403 750 349 0,9919
C-terminal 751 895 144 0,9871
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-402
Central
403-750
C-terminal
751-895

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage vB_KleM_RaK2
[NCBI] 		1147094 Uroviricota > Caudoviricetes > Alcyoneusvirus >
Host Klebsiella sp.
[NCBI] 		576 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFA44802.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JQ513383 [NCBI]
CDS location
range 336020 -> 338707
strand -
CDS
ATGAGGTTTAATATGTCATTGAACAATTTAAGTGCAACAAATATTTCAGGTGCACTAATTGATGCTGGTGACTTTGTTATTAACAAACGATTAGTATCAAACAACCAAATTTTATATTATACAGATCCAGTAACTTCAATTAAAACTGGATATGTATGGAAAGGTACATTACCTCATATTACCAGTACTAATAATCCAAATACAGATGGTGGTATTTCAGATACCGCTTGGGTTCCGGTTATATACAGCAAATTAAAAGAAAAAATGGAAACAGAGGGTTTAACTCTGGACTGGAACGCACATCTCCCTACTGTTGAAGTTGCTTATGGACTAACTAAAAATTCATTAAAAATGTGGAAATCTGGTACTACTGCAACATCAGATGATTATTGGTTATACACTGATGGTACAGTGTGGAATGGGGTTGGTGTTCTTGGTAGTACCCCTGAAACCAGTACTGGTTTTGAAAAAATTACTCCAAATTTTAATGCAAGTATTAAAACATATTCTGCATCAGCAACCGATGGTCAAACTGATTTTAATATTCCATTCACATTCAGTACTATAACTGTATTTGTTAATGGTTCAATTCAGTTACCCGGATTGAATTACACTGTATCTGGTAGCACATTAACATTCACTACTGAATTAGAAGCTGGTGATTTGTTGTATGTTTTTATTGGCAATCCGAATATCAGTACTAATGATAAACTTAATAGAATTTATACAGCTAATGCAATGCAAGGCCAAACAACAATTCAGGTACCATATGATTTCAGTACTGCAATTGTTTATATTAATGGTGTTTTACAGAATCCCAGTACTGCATATAGTATAGGTGCAGATAAAATAATTACATTTTCTGAAGAACTTTATCAAAATGATGAAATTATTATAATGCTTGGTGATGTTGTTGTACAAAGTGATGAATATGTTTTGAAAAATGATTTATTATCACCTGATGCTTCTGATAACATTAATACAAATGACGGGACTTCTGTACAGCAAAATATTGATAATTTTTCTAACTTTAATAATTTATTTTCCAATGATAATGGATTGAGTAATATAAATTATAAAAGTTCTTTGTTTTCTAATAATTATAAATCTACTCTATATGATTTATATCAAAATAAGCTGTCATTATTTGAATTCATACCACCAGAATTACATGATGGTATTAGAAATTATACATATAAAGGTGATTTGTCTGTATATATACAAAATGCCATCGATCAAGCAAATTTATTAGGTGGAGCGGTAATTGAATGTCCACCTGGACAATATTATTGTAATGTAGTTACTAAACAATATGTGGTGCTTATTGGTAGTAGAAATGGTTCAGTTCGTCGTTCCTTACCTTGGACTTATGGCACGCCGGGAAACCCATCTAGACCATATGGAACGAGATTCAGGAATTTTTCCAATGATTGGATTATAAAATCAGAAACTAATAGCCAAAATGATGTATCATCCAGAAGTTTTGGTATTATTGGAATAGATTTTGATGCTACTGATGCTATTAATAGTACCGGTGGGGTAAGATTACGTGGTCCTGAATTTTGCGTTAAATCTTGTAGTTTTTATGGTTTTCAAGATCAAGGTTTAGAAGTTAGTGGTAATATTGGATTAATAGAGGATGTTATCGCCAACGAATGTTTAAAAAATAGAATCAGAACTGATTATGTCGGAACTATTGAAATATCAGGTGCATCAGATTGTCAAATACACAGAATTGAGGGAAATGCCCAAGTAAAAGGACTTAACTCAATTACCAATTCGTCTCCTTATATATGTGGAATTAAAATATCAGGAAATAATCATTATATTTCAGGATTAATGGGTGAAATATCAGAAACTGGTATATATATATCTGCTAGTTCCGTTCATCATAAAATTTCTGATTCACGTGCAGATAATAATGTTGGTCCTGGTTATCTTTTAAATGGTGTACAAATGGTTAATTGTCATTCATATAATAATTCTAGAACTGGTGATGGCCTATATCCAGCTTTTGGAGCATTGGATTCTGCATCAAGATTATTATTAAGTAATTGTTTAGCATGGACTGACAATGCACCAGTTGATGGAACTGGTACACAACGTTTGCATAGTTATGGATTTGATTTTTCTAATGTTGATTATCTATCACTTAGATTAAAACCTTGGATAAATCAATGCTTTTCTTATGGTGATAAAAATGGATGGATAAATTCTCCATTGACATATGGTGTTGAATATACACCAACTAATGGATTATTAACAATTTCATCGAATGCTACCACAACACCAAATGTAGATGGTGTTAGTGTTATTTCTATTTCAACAACATCGTTATCACAAATAACAGGATTTGTTGGTGGTATGATAGGTCAGGAAGTTGATGTATATTTAAATGCTACTGCATCCGTGACGTTGGTTAATAGTTCAACATTCTTAATTAATAATTTTGCAAAAAATTCAAATAAAACAATGGTGGTTGGTAGAGTTTATAAATTTATAAAAACATCCGCTACTATATGGAGAGAAGTTGGAGATGTAGTGCGTGTTTATTCTGGTACTACCGCTGAGAGACCTTCAACGGCTGCAACAACTGGGATGCAATATTTTGACACTACTATAAACAAACCTATTTGGAGAAATGCTGACAATACTGGATGGGTGGATTCTTCAGGAACTTCAGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

1 / 2
PDB ID
Source
Method
Resolution
Oligomeric State