Protein

Genbank accession
AKU43925.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,73
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,89
Protein sequence
MATIKQIQFKRTTKAGVKPTAVQLAEGELAINLTDRMLFTKDQNGAIIDLGFAKGGNIDGNVTQTGNYIQTGRYDLNGDMTAINVAFSGDTSTKAIIIRPNGSAAGKPLVITNYGGSVTRFEQILAGTANITDLILRGFYGDTEANFKDIATFSINPVTGAVKSVLDGDVFLSYPVAKKLVISTVWNGTTVLGDNSIAIGDSDTGIKWLADGKYAMVSNGAATLRFQDGYTESVRSLVFRYSNADYGNNNLIAPDGASLARFDTHLDGNSAGDGNTYIALNQGGKYNHYLRGSGAAYVDTKNGLVLSTSTVLYAAAGVDTYNKPLTSYDVSSMTNQPAGETLSLNRLRRFRAREGGTIMHEAMIQEATNDNYSYGLTYWTGGGIDTWISTLKNDGTLILKNGVKANGAGGVFQINSSVASSGYLQGNIADNTSAWLVGKSRGDDSLVSFASHLNKADANSYNSLNLRKDGSVTVTSQGRTNKLLLNKDHVLIDATQWPLTYGHAYAEQWAYDAPVTVDMGNVSGVSDYYPCIAQKTIATTHGYNTKIELGTLRNGGAQWGRGIIRVGTFGYEPDRNRQGVFTFTIEGDFISQRYVTAPHFLTGVGSSAYPNKPGITIGDTDTGIYWASDGVVTHWANAQQIAVLDTGGFRTEAGKSLVSYGDLNQASDSHSTYVRDLYVRSDIRVKSELRKFESPSETLKKMNGYLYLQKKGFKEDGSINWEQSSGLIAQEVQAVLPELISVDKDNPEGLLRLNYNGIIALNTATINEHTDEISELKARIQKLEEIISALI
Physico‐chemical
properties
protein length:791 AA
molecular weight: 85380,21820 Da
isoelectric point:5,85904
aromaticity:0,08976
hydropathy:-0,27383

Domains

Domains [InterPro]
AKU43925.1
1 791
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Citrobacter phage Merlin
[NCBI]
1675602 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Citrobacter freundii
[NCBI]
546 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Citrobacter

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AKU43925.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KT001915 [NCBI]
CDS location
range 159254 -> 161629
strand +
CDS
ATGGCAACTATCAAACAAATTCAGTTCAAAAGAACTACAAAGGCTGGAGTGAAACCTACAGCCGTCCAGCTTGCCGAAGGTGAACTGGCTATTAACTTAACCGATCGTATGCTGTTCACTAAAGATCAGAATGGTGCTATTATCGATTTAGGATTTGCTAAAGGCGGTAATATCGATGGTAACGTAACTCAAACTGGCAATTACATTCAAACCGGGCGCTATGATTTAAATGGCGACATGACCGCAATAAATGTTGCGTTCTCTGGCGATACTTCCACTAAAGCAATTATCATACGTCCTAACGGCAGCGCCGCAGGAAAGCCTTTGGTTATCACTAACTACGGAGGCTCAGTTACGCGTTTTGAGCAAATTCTAGCTGGAACCGCCAATATCACTGATTTGATTCTTCGCGGTTTTTATGGCGATACAGAAGCTAATTTCAAAGATATAGCAACATTTAGTATTAACCCGGTCACAGGAGCTGTAAAGTCTGTATTAGATGGAGATGTGTTCCTAAGTTATCCCGTAGCTAAAAAACTAGTTATTAGCACTGTCTGGAATGGAACTACTGTGTTAGGTGATAACTCCATTGCAATAGGTGATTCTGACACTGGCATTAAATGGTTAGCTGATGGCAAATATGCTATGGTATCAAATGGTGCCGCGACATTAAGATTTCAAGATGGATATACAGAATCAGTTCGTTCTTTGGTGTTTCGCTATAGTAATGCTGATTATGGTAATAATAATCTTATTGCGCCGGATGGCGCTTCATTGGCAAGATTTGATACTCACTTAGATGGTAATTCTGCTGGAGATGGTAATACTTATATTGCACTTAACCAAGGTGGAAAATATAATCACTATTTAAGAGGTAGCGGTGCAGCTTATGTAGATACTAAAAACGGTTTAGTATTAAGTACAAGTACAGTATTATATGCTGCTGCAGGTGTGGACACTTATAATAAGCCTTTAACATCTTATGATGTTTCAAGCATGACTAATCAGCCAGCTGGTGAAACATTATCGTTAAACCGCTTGCGTCGCTTCCGTGCTCGTGAAGGCGGAACTATCATGCATGAAGCAATGATTCAGGAAGCCACAAATGATAATTATTCTTATGGTTTGACTTATTGGACCGGTGGAGGTATTGATACCTGGATTTCAACTCTTAAGAATGATGGAACATTAATTCTTAAGAATGGTGTAAAAGCAAATGGTGCTGGTGGCGTTTTTCAAATAAACAGCTCAGTTGCTAGTTCTGGATATTTGCAAGGTAATATAGCAGATAATACATCAGCATGGTTGGTTGGTAAATCTAGAGGTGACGATAGTCTTGTCTCGTTTGCATCTCATTTAAATAAAGCTGACGCAAATAGTTATAATAGTCTAAATTTGCGCAAAGACGGTTCTGTTACTGTAACATCTCAAGGAAGAACTAATAAGCTTCTGCTGAATAAAGATCATGTATTAATTGATGCAACACAATGGCCATTGACATATGGTCATGCCTATGCCGAGCAATGGGCTTATGACGCTCCTGTTACAGTTGATATGGGTAATGTCTCTGGGGTTTCTGATTATTATCCGTGTATTGCTCAGAAAACTATAGCAACGACCCATGGGTATAACACAAAAATTGAACTCGGCACTCTTCGTAACGGTGGAGCTCAATGGGGCCGAGGAATTATCCGTGTCGGTACATTTGGATACGAACCTGACAGAAACCGTCAAGGTGTTTTTACCTTTACAATTGAAGGTGATTTTATATCTCAACGGTATGTTACTGCTCCTCATTTCTTAACCGGAGTAGGATCATCAGCATATCCAAATAAACCTGGTATAACTATCGGTGATACAGATACCGGAATATATTGGGCCAGTGATGGTGTTGTTACCCACTGGGCAAATGCTCAGCAAATTGCCGTATTAGATACAGGTGGATTTAGAACCGAAGCTGGTAAATCATTAGTTTCTTATGGCGATTTGAACCAAGCTAGCGATTCACACTCCACTTATGTTCGCGATCTTTATGTTCGTTCGGATATTCGTGTTAAGAGTGAACTTCGTAAATTTGAATCTCCTTCTGAAACTCTTAAGAAGATGAATGGATATCTATATCTTCAGAAGAAAGGGTTCAAAGAAGACGGCTCTATTAATTGGGAACAGTCATCCGGTTTAATTGCTCAAGAAGTTCAAGCTGTATTGCCTGAGTTGATTTCAGTCGATAAAGATAATCCAGAAGGATTACTTCGTCTAAACTACAATGGTATTATTGCGCTAAACACTGCAACAATTAACGAACACACTGATGAGATTTCTGAATTAAAAGCTCGCATTCAGAAGCTTGAAGAAATCATTTCTGCATTAATTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
dc0b4396686ace4e174c1b4e742fc6d79505077054aa67c6967024a7435d6521
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5665
Evidence 0,5665

Literature

No literature entries available.