Protein
- Genbank accession
- AKU43925.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber distal subunit
- RBP type
-
TSPTFTF
- Protein sequence
-
MATIKQIQFKRTTKAGVKPTAVQLAEGELAINLTDRMLFTKDQNGAIIDLGFAKGGNIDGNVTQTGNYIQTGRYDLNGDMTAINVAFSGDTSTKAIIIRPNGSAAGKPLVITNYGGSVTRFEQILAGTANITDLILRGFYGDTEANFKDIATFSINPVTGAVKSVLDGDVFLSYPVAKKLVISTVWNGTTVLGDNSIAIGDSDTGIKWLADGKYAMVSNGAATLRFQDGYTESVRSLVFRYSNADYGNNNLIAPDGASLARFDTHLDGNSAGDGNTYIALNQGGKYNHYLRGSGAAYVDTKNGLVLSTSTVLYAAAGVDTYNKPLTSYDVSSMTNQPAGETLSLNRLRRFRAREGGTIMHEAMIQEATNDNYSYGLTYWTGGGIDTWISTLKNDGTLILKNGVKANGAGGVFQINSSVASSGYLQGNIADNTSAWLVGKSRGDDSLVSFASHLNKADANSYNSLNLRKDGSVTVTSQGRTNKLLLNKDHVLIDATQWPLTYGHAYAEQWAYDAPVTVDMGNVSGVSDYYPCIAQKTIATTHGYNTKIELGTLRNGGAQWGRGIIRVGTFGYEPDRNRQGVFTFTIEGDFISQRYVTAPHFLTGVGSSAYPNKPGITIGDTDTGIYWASDGVVTHWANAQQIAVLDTGGFRTEAGKSLVSYGDLNQASDSHSTYVRDLYVRSDIRVKSELRKFESPSETLKKMNGYLYLQKKGFKEDGSINWEQSSGLIAQEVQAVLPELISVDKDNPEGLLRLNYNGIIALNTATINEHTDEISELKARIQKLEEIISALI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 791 AA molecular weight: 85380,21820 Da isoelectric point: 5,85904 aromaticity: 0,08976 hydropathy: -0,27383
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Citrobacter phage Merlin [NCBI] |
1675602 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Citrobacter freundii [NCBI] |
546 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Citrobacter |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AKU43925.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KT001915
[NCBI]
CDS location
range 159254 -> 161629
strand +
strand +
CDS
ATGGCAACTATCAAACAAATTCAGTTCAAAAGAACTACAAAGGCTGGAGTGAAACCTACAGCCGTCCAGCTTGCCGAAGGTGAACTGGCTATTAACTTAACCGATCGTATGCTGTTCACTAAAGATCAGAATGGTGCTATTATCGATTTAGGATTTGCTAAAGGCGGTAATATCGATGGTAACGTAACTCAAACTGGCAATTACATTCAAACCGGGCGCTATGATTTAAATGGCGACATGACCGCAATAAATGTTGCGTTCTCTGGCGATACTTCCACTAAAGCAATTATCATACGTCCTAACGGCAGCGCCGCAGGAAAGCCTTTGGTTATCACTAACTACGGAGGCTCAGTTACGCGTTTTGAGCAAATTCTAGCTGGAACCGCCAATATCACTGATTTGATTCTTCGCGGTTTTTATGGCGATACAGAAGCTAATTTCAAAGATATAGCAACATTTAGTATTAACCCGGTCACAGGAGCTGTAAAGTCTGTATTAGATGGAGATGTGTTCCTAAGTTATCCCGTAGCTAAAAAACTAGTTATTAGCACTGTCTGGAATGGAACTACTGTGTTAGGTGATAACTCCATTGCAATAGGTGATTCTGACACTGGCATTAAATGGTTAGCTGATGGCAAATATGCTATGGTATCAAATGGTGCCGCGACATTAAGATTTCAAGATGGATATACAGAATCAGTTCGTTCTTTGGTGTTTCGCTATAGTAATGCTGATTATGGTAATAATAATCTTATTGCGCCGGATGGCGCTTCATTGGCAAGATTTGATACTCACTTAGATGGTAATTCTGCTGGAGATGGTAATACTTATATTGCACTTAACCAAGGTGGAAAATATAATCACTATTTAAGAGGTAGCGGTGCAGCTTATGTAGATACTAAAAACGGTTTAGTATTAAGTACAAGTACAGTATTATATGCTGCTGCAGGTGTGGACACTTATAATAAGCCTTTAACATCTTATGATGTTTCAAGCATGACTAATCAGCCAGCTGGTGAAACATTATCGTTAAACCGCTTGCGTCGCTTCCGTGCTCGTGAAGGCGGAACTATCATGCATGAAGCAATGATTCAGGAAGCCACAAATGATAATTATTCTTATGGTTTGACTTATTGGACCGGTGGAGGTATTGATACCTGGATTTCAACTCTTAAGAATGATGGAACATTAATTCTTAAGAATGGTGTAAAAGCAAATGGTGCTGGTGGCGTTTTTCAAATAAACAGCTCAGTTGCTAGTTCTGGATATTTGCAAGGTAATATAGCAGATAATACATCAGCATGGTTGGTTGGTAAATCTAGAGGTGACGATAGTCTTGTCTCGTTTGCATCTCATTTAAATAAAGCTGACGCAAATAGTTATAATAGTCTAAATTTGCGCAAAGACGGTTCTGTTACTGTAACATCTCAAGGAAGAACTAATAAGCTTCTGCTGAATAAAGATCATGTATTAATTGATGCAACACAATGGCCATTGACATATGGTCATGCCTATGCCGAGCAATGGGCTTATGACGCTCCTGTTACAGTTGATATGGGTAATGTCTCTGGGGTTTCTGATTATTATCCGTGTATTGCTCAGAAAACTATAGCAACGACCCATGGGTATAACACAAAAATTGAACTCGGCACTCTTCGTAACGGTGGAGCTCAATGGGGCCGAGGAATTATCCGTGTCGGTACATTTGGATACGAACCTGACAGAAACCGTCAAGGTGTTTTTACCTTTACAATTGAAGGTGATTTTATATCTCAACGGTATGTTACTGCTCCTCATTTCTTAACCGGAGTAGGATCATCAGCATATCCAAATAAACCTGGTATAACTATCGGTGATACAGATACCGGAATATATTGGGCCAGTGATGGTGTTGTTACCCACTGGGCAAATGCTCAGCAAATTGCCGTATTAGATACAGGTGGATTTAGAACCGAAGCTGGTAAATCATTAGTTTCTTATGGCGATTTGAACCAAGCTAGCGATTCACACTCCACTTATGTTCGCGATCTTTATGTTCGTTCGGATATTCGTGTTAAGAGTGAACTTCGTAAATTTGAATCTCCTTCTGAAACTCTTAAGAAGATGAATGGATATCTATATCTTCAGAAGAAAGGGTTCAAAGAAGACGGCTCTATTAATTGGGAACAGTCATCCGGTTTAATTGCTCAAGAAGTTCAAGCTGTATTGCCTGAGTTGATTTCAGTCGATAAAGATAATCCAGAAGGATTACTTCGTCTAAACTACAATGGTATTATTGCGCTAAACACTGCAACAATTAACGAACACACTGATGAGATTTCTGAATTAAAAGCTCGCATTCAGAAGCTTGAAGAAATCATTTCTGCATTAATTTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
dc0b4396686ace4e174c1b4e742fc6d79505077054aa67c6967024a7435d6521
Literature
No literature entries available.