Genbank accession
WPK39296.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MSIQSGPSVLNQFVPDFLIDSTPTNGQFLVYDETVQAFVNSTNPRIVLDSSNILDGSITIDKLAISGNKVPGYVLTITSAGGMAFLPVPGSGGQLPSLDELLDTNIVSPTVTQYLKWDGSAWVNSNITLNDVSDVSVISPTADDVLAWESGSWTNKKIDYTSLTNKPDLSDVVRSSELSPVAFSGDYNDLVNIPSATSNTIVGLTDVNDTALPNGFLRWNASGDEVEFITSISATVITGLAPVATSGNYNDLLGKPNLSVYPLRTEFSTVATTGNYSDLNNVPLTFAPSAHTHPAAQITGLASVATSNDYNDLVNKPTAMAPTAHTHAISDIIGLQNSLDSKLTVNLTTRLPKDVIYFNGTSWVNKQLSYTDISGTPNLDNYVTDSELSTVATTGRYSDLINKPELVENLNDLLDVDVSSKQTGNVLTWNGTAWVASAITQASIDWANISNKPSVFNPAAHTHDVVDVLGLQSLLDSKLDANIAFDGDYNSLTNKPGLIDLQDTFSPAVPNGFLRWNNLGTLVAYQDYIYPQDISGLSDVAISGQYSDLLGTPSLSTVAITGSYSDLIDAPPAFDGDYDSLTNKPFIPTNFDFKFIGLNDVSPTVQPGGYLKWNLDGSFVVSSANIPATDVAGLSVVSTTGQYSDLLGKPLLATVSSSGSYTDLINIPTEFNPAVHTHNIADISGLQAALDNKLNTSDAFSGDYNDLTNAPTNSSYSLVGLSDTNSVPVANGFLRWNASGSSVEYIQTIPVNAITGLAPVASSGQYADLQGTPDLSDYVLSVSLADIATTGEYSDLINAPDLSVYANKTDLSDVATTGQYSDLLGIPTQFTPTVHVHNVSQISGLATVATSGSYNDLSNKPSFANVATTGSYDDLNNKPSIPTNGSFSLLGLNDTNNTPVADGILRWNSSANQVIYANTIDAQSVSGLATVATIGKLSSLSDVDLIGLNQNEILQWNGSAWVPVPYNPNQIQAYIESGNTKVSTNDILDSIVLTAGPTTGNIIFELGNTNSSIILNPVANNVDALISSTSRIKLDSSTGISLGNISYPMTDGTVGQAVVTNGAGQLSFETVVKPSQLATVATSGNYNDLTNKPTLVTELNGLADVRMRDTNGNYLAQPEDVLTYSNGIWQARPNTSSSFIGLSDTQNITLPEDRANAYLRWDTTGNLIIYEDSISASVIAGLAEVATTGDLHDLINVNVNLPDMNNPATQAVWGLIWDRQNQRWINYNLRNIAGSGGSTVVALNDLTDVTLTFPVVDGNVLRATVQPDNSIVWQNKQLSYSDLTGTISMSLLQLTDTSSSAVPNGFLRWDSSGNTVQYITTISTNDITGLAPVATSGNYNDLSNTPAIPASINDLADVNTVSPVPTNGYVLTWDSSSNNWIAKEPATNPSGSTALADLTDVSLSDLAASDVLKYNGTTWVNEPVTYSELTDLPTFALVAFSGDYNDLTNKPSGSTTSILDLTDTADTALPNGFLRWNASGDEVLYQSSINVSDIIGLSGVAISGDYNDLSNKPENNSYYFRKLADAGNPQPNTFIKYPAFTIPPGSDIDDVNPILEYVSSINALTDIDNLAPVATNGILGSLVDVNLNSVEDGQVLTYDAVTNSWINKNSSGSPVVTSWTKINGNYTVTGSEYLLVDTTSASVTITLPVAPTENMVIRIADWKGTFRTNSCVVNTNGMPLMGASMDNTLTIQNQNASIELTFVDTTYGWKITDGIGEISKQNIPVTNWRTVDSSSTPAMLIAQPGEAIYVNTNNGAVTVKLPTGASVNAVVRIADLLGTYDKASCFVDGNGNPIMGKNEILEIANENASIEFTYVDSVVGWKVTDGIGELGRKTDIASDSDIIVYVATDGNDTTGSGTEESPFATLNAAFLSLDGKFVNSSAEIIVRVAEGVYEPTNPVAFSHIQGMNVKLIGELPQASSSFTVTNITNDAGLAKVTMQLSSVSDYEVGDIIKITSAATMLECVEIITAINTGSNTLEIVIPNSVLADVSDYTGYTGTISKFTTVFKNTNMYVAGGYSLGFIDNIALVDDTGLGTALTVGRTYTTGIYDGPAYVGLGANFAVYGYETAIQSIPGSSVVLAGNLCRQAGAAIRADGSILSFNAGQSVYIANQAQDGIVLKHGSKLIHNDDASQSFVFVIFNNIKSGTILSLDTSISTANFEVKNSEGIMIAATRHSTVDARSAIVSGTITGDLEVNATGMSIISINEPAGSTNIPLAVVCNPVYGSNTELQKGYIGL
Physico‐chemical
properties
protein length:2236 AA
molecular weight: 236375,99940 Da
isoelectric point:4,09789
aromaticity:0,07424
hydropathy:-0,02406

Domains

Domains [InterPro]
DC_0165
STR
694–782
WPK39296.1
1 2236
Architecture
STR
ATT
STR
STR
ATT
STR
RBD
STR 1-262 | ATT 321-591 | STR 592-862 | STR 876-1118 | ATT 1119-1394 | STR 1395-1841 | RBD 1842-2236
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage Deifobo
[NCBI]
3092176 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Pseudomonas aeruginosa PAO1
[NCBI]
208964 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales > Pseudomonadaceae > Pseudomonas

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPK39296.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR805293 [NCBI]
CDS location
range 67617 -> 74327
strand +
CDS
ATGAGTATACAATCAGGTCCTTCTGTATTAAATCAATTTGTTCCAGATTTTCTAATAGATAGTACACCAACTAATGGTCAATTTTTAGTTTATGACGAAACTGTCCAGGCATTTGTAAATAGCACAAATCCCAGAATCGTATTAGATTCGTCTAATATATTAGACGGTTCTATAACAATTGATAAACTTGCAATATCTGGTAATAAAGTACCTGGATACGTACTAACTATAACTTCCGCAGGCGGAATGGCATTTTTACCAGTGCCTGGCAGCGGTGGCCAACTACCTAGTCTAGATGAATTACTAGACACAAATATAGTATCTCCTACTGTAACCCAATATCTTAAATGGGACGGTTCTGCATGGGTTAATAGTAATATAACGTTAAATGATGTATCAGATGTCTCTGTTATCTCCCCTACAGCCGATGATGTATTAGCATGGGAATCAGGTTCTTGGACAAATAAGAAAATAGATTATACATCACTAACAAACAAACCAGATTTGAGTGATGTAGTTAGATCTAGCGAATTGTCACCAGTTGCATTCAGTGGTGATTATAATGATTTAGTAAATATTCCTAGTGCAACTTCTAATACTATAGTTGGATTAACAGATGTTAACGACACTGCACTACCTAACGGATTCTTGCGCTGGAACGCAAGCGGTGATGAGGTAGAATTTATTACTTCAATTTCTGCTACTGTAATAACCGGGTTAGCTCCGGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTATTAGGAAAACCTAATTTGTCAGTGTATCCGCTTAGAACTGAATTTTCCACTGTTGCAACCACCGGTAATTATTCTGATTTGAACAATGTGCCTTTGACATTTGCACCAAGTGCGCATACTCACCCGGCTGCACAAATCACAGGATTAGCATCTGTAGCTACTAGCAACGATTATAACGATTTAGTTAATAAACCGACTGCGATGGCGCCAACTGCACATACGCATGCTATATCTGATATTATAGGATTGCAAAATTCGCTAGATAGTAAGTTGACTGTTAATTTAACTACTAGACTTCCAAAAGATGTTATTTATTTTAACGGCACTTCATGGGTAAACAAGCAATTATCTTATACTGATATTTCCGGTACTCCTAACTTAGATAACTATGTTACTGATTCAGAATTATCTACTGTTGCTACAACTGGCAGATATTCTGATTTAATAAATAAACCCGAGTTAGTAGAAAATTTAAACGACTTATTAGATGTAGATGTTTCTTCTAAACAAACAGGAAACGTATTAACCTGGAACGGAACAGCATGGGTTGCTAGTGCAATAACACAAGCAAGCATAGATTGGGCTAATATAAGCAATAAACCAAGCGTTTTTAACCCCGCTGCGCATACACACGACGTAGTAGACGTACTAGGCCTGCAAAGTTTACTAGACAGCAAACTTGACGCAAATATTGCATTCGACGGCGATTATAATAGTTTAACAAATAAACCGGGGTTAATAGATCTTCAAGATACATTTAGTCCTGCTGTACCTAACGGATTCTTACGGTGGAATAATTTAGGTACCTTAGTTGCATATCAAGATTACATATATCCGCAAGATATTTCGGGATTGTCAGATGTTGCTATATCAGGTCAGTATTCGGATTTATTGGGTACTCCTTCCTTATCAACTGTTGCTATAACCGGGAGTTATAGCGACTTAATTGATGCGCCGCCTGCATTTGACGGTGATTATGATAGTTTAACAAATAAACCGTTTATTCCTACTAATTTTGATTTTAAATTTATAGGTTTAAATGATGTAAGTCCTACTGTTCAGCCTGGCGGCTATTTAAAATGGAACTTAGACGGTTCATTTGTTGTATCGTCAGCAAACATTCCTGCAACAGATGTAGCAGGTTTATCTGTTGTGTCTACAACCGGACAATATTCGGATTTATTAGGCAAACCGTTATTAGCTACAGTTTCTTCGTCGGGTAGTTATACTGATTTAATAAATATTCCTACTGAATTTAATCCAGCCGTACATACCCACAATATAGCAGACATATCCGGATTACAGGCAGCCCTGGACAATAAATTAAATACATCTGATGCATTTAGTGGTGATTATAATGATCTAACTAATGCACCTACTAATAGTTCATATTCATTAGTGGGTTTATCAGATACTAATTCTGTACCTGTTGCAAACGGATTCTTACGCTGGAATGCATCTGGAAGTAGTGTTGAATATATTCAAACAATTCCTGTAAATGCAATAACTGGATTGGCTCCTGTTGCATCATCTGGCCAGTATGCAGATTTGCAAGGAACACCGGATTTATCTGACTATGTTTTATCTGTATCATTGGCTGACATAGCTACAACTGGAGAATATTCAGATTTAATAAATGCACCTGATTTAAGTGTGTATGCTAATAAAACTGATCTGTCAGATGTAGCTACAACAGGACAATATTCGGATTTATTGGGTATTCCTACACAATTTACACCGACAGTTCATGTCCATAACGTTTCTCAAATAAGTGGATTAGCTACTGTTGCTACTAGCGGAAGTTATAATGATTTATCTAATAAACCGTCGTTTGCTAATGTTGCAACTACAGGCAGCTATGATGATCTAAACAATAAACCATCCATACCTACTAATGGCAGTTTTAGTTTACTTGGGTTAAATGATACAAATAATACGCCAGTTGCAGATGGTATATTGCGTTGGAATTCCAGTGCAAATCAGGTAATATATGCAAATACAATCGATGCACAATCTGTTTCTGGATTAGCTACTGTTGCAACTATAGGTAAACTATCTTCACTAAGTGATGTAGATTTAATAGGTTTGAACCAGAATGAAATATTGCAATGGAACGGTTCTGCATGGGTACCTGTACCTTATAATCCTAATCAAATACAAGCCTACATAGAGAGCGGAAATACAAAAGTTTCTACTAACGATATTTTAGATAGCATTGTTCTAACAGCAGGACCTACTACCGGAAATATAATATTCGAGTTAGGAAATACAAATAGCTCAATTATTCTAAATCCAGTTGCTAATAACGTAGATGCTCTTATTTCTTCTACTTCTAGAATAAAATTAGATTCATCCACTGGCATATCATTAGGTAATATAAGTTATCCAATGACCGACGGTACAGTTGGGCAAGCAGTAGTTACAAATGGAGCTGGCCAACTATCGTTTGAAACAGTAGTTAAACCCTCTCAATTGGCTACAGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTAACTAATAAACCTACATTAGTAACCGAACTAAACGGACTTGCTGACGTTCGTATGCGTGATACTAATGGAAATTATTTAGCACAACCAGAGGATGTGTTAACATATTCTAACGGAATATGGCAAGCACGACCGAACACTAGTTCTTCTTTTATAGGTTTAAGCGATACCCAAAATATAACATTGCCAGAAGATAGGGCTAATGCATACTTACGTTGGGATACTACTGGAAATCTAATTATATACGAAGATAGTATTTCTGCAAGCGTAATTGCCGGATTAGCAGAAGTAGCAACCACAGGAGATTTGCACGATTTAATAAATGTAAATGTAAATTTACCTGATATGAACAATCCAGCTACACAAGCTGTTTGGGGTTTAATATGGGATCGTCAGAATCAACGTTGGATAAATTACAATTTACGTAATATAGCAGGTTCGGGTGGATCTACAGTAGTAGCATTGAATGACTTAACTGATGTTACTCTTACTTTCCCTGTAGTTGACGGTAATGTTCTTAGAGCAACTGTGCAACCAGACAATAGTATTGTTTGGCAGAACAAACAACTATCTTATAGTGACTTAACTGGAACTATAAGTATGAGTCTGTTGCAATTAACTGATACTAGTTCATCTGCTGTACCTAATGGATTCTTACGGTGGGACTCATCGGGTAACACAGTTCAGTATATTACTACAATAAGTACAAATGATATAACCGGGTTAGCTCCGGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTATCTAATACACCTGCTATACCGGCATCAATTAATGATTTAGCAGATGTTAATACCGTTAGTCCTGTTCCTACAAACGGATATGTATTAACATGGGATAGTAGTTCGAATAATTGGATTGCAAAAGAACCTGCAACTAACCCATCTGGCAGTACAGCCCTAGCTGATCTAACAGATGTATCTCTATCTGATCTAGCTGCTAGTGATGTTTTAAAATACAACGGCACTACATGGGTAAACGAACCAGTTACGTATTCTGAATTAACAGATTTACCTACATTTGCGTTAGTTGCATTTAGTGGTGATTATAATGATTTAACTAATAAGCCATCGGGATCTACTACATCTATACTAGATCTAACTGATACTGCAGATACTGCACTACCTAACGGATTCTTGCGCTGGAACGCAAGCGGTGATGAGGTTTTATATCAATCATCTATTAATGTTTCTGATATAATAGGATTATCCGGTGTAGCTATAAGTGGTGATTATAACGATTTATCCAACAAACCGGAAAATAATTCGTATTATTTTAGAAAGTTAGCTGATGCAGGAAATCCGCAGCCTAATACATTTATAAAATATCCTGCGTTTACTATTCCGCCCGGTAGTGATATAGACGATGTTAATCCTATACTCGAATATGTAAGTAGCATAAATGCACTAACTGACATAGATAACCTAGCTCCGGTTGCCACTAACGGAATACTAGGAAGTTTAGTAGACGTAAATCTAAATTCAGTAGAAGATGGACAAGTTCTTACTTATGATGCTGTAACAAATAGCTGGATAAACAAAAATAGTTCAGGATCGCCGGTAGTAACTTCGTGGACAAAGATAAATGGCAACTATACTGTAACTGGCTCAGAATATTTATTGGTAGATACAACTTCTGCTAGTGTAACAATTACTCTGCCTGTTGCCCCTACCGAAAATATGGTAATTCGTATTGCTGATTGGAAAGGTACATTTAG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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
86ca78e609004d7481f4e0bbba87be384a6b9e869bf16c2d72d5814723526cb6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3694
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Phage Paride can kill dormant, antibiotic-tolerant cells Maffei,E., Harms,A. and Humolli,D. GenBank