Protein

Genbank accession
AIX14691.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANENPTLAQGEIGIELDTNRFKIGDGVRGWNTLPYERPIESVANTANTLVKRDADGNFTAGAITATLIGNSATSSRLANPRQIQLSQDLSGSGTFDGSSNLSLAAQLQTLTSLPHYDGTTSSSGQYTKVTVDAKGRITNASQPSSYVDLGLTDVQPIDSDLSAISNLTTTGIIARASAGNMQTRSVQGSSGRISVVNGNAVAGNPTLDLIDTTVALEAEFIAAAGLYNIPTLISVGGDDLPEAANRTVNSTRYTVDQYGRFTSALTIPIATAREGSKYAAYGAGVTYARYDIIEESSGVYQAIASIAAGQGAPTHTDASDAGAWRYLGAALTEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTLENFELDQELTATSGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGALNQTLDKTGDGDLTFQLTQDTASNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTIQINASEATGKVHVEDYRFQTNYLGTTDATMHLDPGDDRAITGTVRVWGNLQIDGVTTTINSTTLTVDDVTILLGGDTVPTTDDNLDRGIEFNYYDTEARLGFYGWDTSYTDLNSHGGGYRFLHAATNSSEVFTGTDSGIVAGNLKLTTNNNSTSNTTGDFVVAGGAGIGQDVNIGGLVDIDSTLRVHSTSRFDDNMVIQGASKTLQLNNGSGTTRVELQSTTGNASFYGVVDITNNLNINTDKFNVTAASGNTYTAGTLEVTQGSTLNGAVDLNNTLNVSSTVHFEATDEPTFAQNAGTGLWEIQSNDYGSFRFDGGGYIAGDFMFDSDVVINGTILQKESSTEVFNEQNFLRVRRKLESGSVQALNPSYANHTNSNLRIFGGAGIVQDLHIGDDLYIGKVNNGDTVEFTVLGESGNTQIGRSGAGTASVGTLTVYGDTLLDRDLTVNGSQITLGNANTDILTVNSDATFTDNLTVNQSVEFDSTLNVDDNVTFGAQLTVTGTTEFNNTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLYIQSSNEFFKIQNGSSVDKFTVDTDNGNTAIIGTLTVSNATQLNNTLGCQGIASFTNTTDQDVVSGSYTADGGVRITSGLGVERNLAVGGDTRFYGTVGFESALDVDNAVDISGNLNISNGNDVSNFTDTTVALKVSGGARISKKMMVGGDFTVYDSSGALNNFFVEKTTGNAELRNNLVVGGDLTVNGTTTTVNSTTLTVDDPIITLGGDSVPTTDDNLDRGVEFRYYDTQARLGFFGYDNNLNRYRFLVEATNSSETFSGTDASLQAGSLQLTSSGTGLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTAKINNLNADLLDSMTTDSANTATTVVARDNSGDFAANQITVNNGIGAVAGIQGNATSADALRTARVITVDGVVNGNVSFDGSAAVTITTTYDDDDITALAAQTGTGIMARTAANTYAHRTIAVTGSGIGITNADGISGDPLITITSASTNSANNIVIRDVNGDFAAGTITATLVGDVTGDLTGNADNALQVSTGSGGAGGTMYFAMTNQYGAGSSRTLFANTSTITLDTSGGVGNNTLIVDKVTADLTGNVIGNVTGEVSSLANHDTADLAEGTNLYYTNARAEASFDTKIAAATTTDLTEGTNLYYTDERVDDRVGDLVVGGTGINALYDDGNGALTLTVTQGDIDTDNVTEGSTNIFYTEGRFDASLATKSTDQLTEGANLYYTNTRADDRVNLQTGTNLDLSSKSTSDLSEGTNQYYTEARVQTKLDNAFAQLQAMLTNLATTTTLTLNLSGDPTPGAAVTTLITNNGSGGFTAGTNVATTGGTGTSLTVDTTVDAQGRITAATVNTPGSDYVVNEVVFILNANAGKVLSLNLASLAGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVNITASAGAITNVIINDGGTGYVAGETITIVQPTGADGLNPAAGGSVDVATVATNAGLQLTDVTTMELGAVVTGSESGTTGIITNIDTQAITVDTVDGFFKVGEVVSANDVTTLTLSSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2058 AA
molecular weight: 213182,08550 Da
isoelectric point:4,10545
aromaticity:0,06220
hydropathy:-0,16132

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–229
SSF69349
IPR041352
5–42
IPR041352
AIX14691.1
1 2058
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014d
[NCBI] 		1493509 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX14691.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019028 [NCBI]
CDS location
range 81764 -> 87940
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAACTTAGACGTGGTGGTGCTCAGGAATGGGCTAACGAAAACCCGACCCTAGCCCAAGGCGAGATTGGCATTGAACTTGACACTAACCGTTTTAAAATCGGTGATGGTGTTAGGGGATGGAATACTTTGCCCTATGAAAGACCGATTGAGTCCGTAGCAAATACGGCAAACACGCTTGTAAAACGAGATGCTGATGGTAATTTTACCGCTGGTGCAATTACAGCAACTCTAATTGGTAATTCTGCAACTTCTTCACGTCTTGCTAACCCAAGACAGATTCAGTTGTCGCAGGATCTTTCGGGTTCTGGTACTTTTGACGGTTCATCTAACCTATCTCTTGCTGCCCAACTTCAAACTTTAACCTCACTTCCACACTACGACGGAACAACTAGTTCTAGTGGACAGTATACTAAAGTAACTGTTGATGCTAAAGGTAGGATTACTAATGCATCTCAACCTTCGTCTTATGTTGACCTAGGATTGACTGATGTTCAACCTATTGACTCTGACCTGTCTGCTATCTCTAACCTGACAACTACAGGTATTATTGCTAGAGCATCTGCAGGAAACATGCAGACCAGATCTGTACAGGGTTCTTCAGGTAGGATTTCAGTTGTAAATGGTAACGCCGTTGCAGGTAACCCAACGCTTGACCTGATTGATACTACTGTAGCGTTAGAAGCAGAATTTATTGCTGCTGCTGGTCTTTATAATATTCCCACACTTATTTCAGTTGGTGGAGATGATCTGCCCGAAGCAGCAAACAGAACTGTAAACTCAACCAGATATACTGTTGATCAGTATGGTCGTTTCACTTCTGCCCTGACTATTCCTATTGCTACCGCTAGAGAAGGTAGTAAGTATGCTGCATATGGAGCAGGTGTAACGTATGCAAGATATGATATTATTGAAGAAAGTAGTGGAGTATATCAAGCAATCGCTAGTATTGCTGCAGGACAAGGTGCTCCAACTCATACTGATGCTTCAGATGCTGGTGCTTGGAGATATCTCGGTGCTGCACTGACAGAACAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGACAGCAATGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTTGATAATACACAACTACAAAACAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCCTAGAAAATTTTGAACTGGATCAAGAACTTACTGCAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATGTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAACGTACGGTCGTACTTCTCTGACCCTGATATTACTCTTGATGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGCGACCTAACATTCCAGTTAACTCAGGACACTGCCTCAAATAGAAACTTTAATATTCTGACAACCAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTATACAGATTAATGCGTCAGAAGCAACTGGTAAGGTTCATGTAGAAGATTATAGATTCCAGACAAATTATCTTGGTACTACTGATGCAACTATGCATCTTGATCCAGGTGATGATCGTGCAATCACTGGCACCGTCCGTGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGGGTAACAACTACAATCAATTCAACTACACTGACTGTAGATGATGTCACTATTCTACTCGGTGGGGATACTGTACCTACAACTGATGACAATTTAGATCGTGGTATTGAATTCAACTATTATGATACTGAAGCCCGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAGCTATACTGATTTGAATTCTCATGGTGGTGGATATCGTTTCCTCCATGCTGCTACAAATAGTTCTGAAGTCTTTACTGGTACTGACTCTGGTATTGTTGCTGGTAATCTTAAACTAACTACAAATAATAATTCTACTTCCAATACAACTGGTGACTTTGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATTGGTCAAGATGTCAACATCGGCGGTCTGGTTGACATTGATAGCACTCTCAGAGTTCATAGTACCTCCCGCTTTGATGACAACATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACTCTGCAACTTAATAATGGTAGTGGCACTACTCGTGTTGAACTGCAATCTACCACTGGTAATGCATCATTCTACGGTGTTGTTGATATTACCAACAACCTGAATATTAATACTGATAAGTTTAATGTTACTGCAGCAAGTGGTAACACTTACACTGCTGGAACTCTTGAAGTTACTCAAGGTAGCACACTCAATGGTGCTGTGGACCTCAATAACACACTGAATGTTTCTAGTACTGTTCATTTTGAAGCAACAGATGAACCTACATTCGCACAGAACGCTGGCACTGGTCTTTGGGAAATTCAATCCAATGACTATGGTTCATTCCGATTTGATGGTGGTGGATATATTGCTGGCGACTTTATGTTTGACAGCGACGTTGTTATCAACGGTACTATTCTACAAAAAGAATCCTCTACTGAGGTCTTCAACGAGCAGAACTTCCTGAGAGTTCGTCGTAAGTTAGAATCTGGTTCTGTTCAAGCTCTCAATCCATCTTACGCAAATCATACAAACTCCAACCTTAGAATATTTGGTGGTGCTGGTATTGTACAAGACCTTCACATTGGAGATGACTTATATATTGGTAAGGTTAATAATGGCGACACCGTAGAATTCACAGTTCTGGGTGAGAGTGGTAATACTCAAATTGGTCGTTCTGGTGCTGGTACTGCATCGGTTGGTACTTTAACTGTCTATGGTGATACTCTGCTTGATAGAGATCTGACCGTCAATGGTTCTCAGATTACTCTTGGTAATGCAAATACAGATATACTTACAGTAAATTCAGATGCAACCTTTACTGATAACCTAACAGTTAATCAATCAGTTGAGTTTGATAGTACTCTTAATGTTGATGACAATGTTACATTCGGTGCTCAACTAACTGTTACTGGTACAACTGAGTTTAATAATACTGTTGATGTTGATGCCAACTTCGCTGTAAGAAGTGGTAGCACGGACAAGATGACCGTTGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTTCAGGGTCAGACAACTATCAATGACTCTCTGTATATACAATCATCTAATGAATTCTTTAAAATTCAGAATGGTAGTTCTGTAGATAAGTTTACTGTTGATACTGATAATGGCAATACTGCTATTATTGGCACTCTAACGGTCTCCAATGCCACTCAACTGAATAATACACTTGGTTGCCAAGGAATCGCTTCCTTTACCAATACAACCGATCAGGACGTTGTTTCAGGGAGTTATACTGCAGACGGTGGTGTTAGGATTACTTCTGGTCTTGGAGTAGAGAGAAACTTAGCAGTTGGTGGAGATACTAGATTCTACGGAACAGTTGGATTTGAGTCTGCTCTTGATGTTGACAATGCTGTTGACATTTCAGGTAACCTGAACATCAGCAATGGTAACGATGTTAGTAATTTTACTGACACTACTGTTGCACTGAAGGTTAGTGGTGGTGCAAGAATCAGTAAGAAAATGATGGTCGGTGGAGATTTCACCGTATATGATTCTTCTGGAGCATTAAATAATTTCTTTGTTGAGAAGACTACAGGTAATGCAGAGTTAAGAAACAACCTGGTAGTTGGTGGAGATCTCACAGTAAATGGTACAACCACAACTGTAAATTCAACCACATTAACAGTGGACGATCCTATCATCACTTTGGGTGGAGATAGCGTTCCTACAACTGATGATAACTTGGATCGTGGTGTTGAATTTAGATACTATGACACTCAAGCGAGATTAGGTTTCTTTGGTTATGACAATAACCTCAATAGATATAGATTCTTAGTTGAAGCTACAAACTCATCAGAAACATTCAGTGGTACTGATGCGTCACTTCAGGCGGGTTCACTGCAACTAACCTCAAGTGGAACTGGACTTGATGTTGATGCTAACGCTAACATTGATGGTACTCTGACTGTAGATGGACAGATCATCTCTCAGGTTTCTTCTGGTCCTGCCCTGGTCATTCCTACCACTGCCAAGATCAACAATCTGAATGCTGATCTTCTGGACAGCATGACTACCGATTCGGCAAATACAGCGACTACTGTTGTTGCTCGTGACAATAGTGGAGATTTTGCTGCGAATCAAATTACAGTTAATAACGGTATTGGTGCTGTTGCAGGTATTCAAGGTAATGCTACATCAGCAGATGCACTGAGAACAGCAAGAGTCATCACAGTTGATGGTGTTGTTAATGGTAACGTATCGTTTGATGGATCGGCAGCAGTAACAATCACCACGACTTATGATGATGACGATATAACTGCTCTTGCTGCTCAGACAGGCACGGGTATTATGGCAAGAACTGCCGCCAATACTTATGCTCATCGTACTATCGCTGTTACTGGTTCTGGTATTGGTATCACTAATGCAGATGGAATCAGTGGTGACCCATTAATTACAATCACTTCTGCAAGCACAAACTCGGCAAATAACATAGTTATTCGTGACGTTAATGGTGACTTTGCTGCTGGAACAATCACAGCAACCTTGGTTGGTGATGTAACTGGTGATCTAACTGGTAATGCAGACAATGCTCTACAAGTTAGCACTGGATCTGGTGGTGCTGGTGGTACTATGTACTTTGCCATGACGAATCAATATGGTGCTGGTTCAAGTAGAACTCTGTTTGCTAATACCAGTACTATTACACTTGATACTTCTGGCGGTGTTGGAAACAATACTCTGATCGTAGATAAGGTTACTGCTGACTTGACTGGTAATGTAATTGGTAACGTAACTGGTGAAGTTTCTTCCCTTGCAAATCATGACACTGCTGATCTAGCAGAGGGAACTAACCTTTACTATACAAATGCTCGCGCTGAGGCATCCTTTGACACCAAGATTGC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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
07af9f35ac610ffaa2a5a6cd64d6b06568377a28b180981bb5f7f5141742b8c9
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4988
Evidence 0,4988
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank