Protein

Genbank accession
QBQ79300.1 [GenBank]
Protein name
putative long tail fiber, proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,60
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYIIDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIIHLVDLDKLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAASSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATAGTINLTLPTGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTVAGTSYWVVQQNVPTVERVDAGTDTTRARVGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNSGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNEFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPININASGTLNANGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDGGSTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLSINNQFGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKASDLYTRAPTSDNVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139426,50950 Da
isoelectric point:5,34329
aromaticity:0,07436
hydropathy:-0,30147

Domains

Domains [InterPro]
QBQ79300.1
1 1291
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_MM02
[NCBI]
2508202 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBQ79300.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK373784 [NCBI]
CDS location
range 151058 -> 154933
strand +
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACTGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCTATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCAAATACGCCGGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAGGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGTCCGCGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTATCGATTATGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGACACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAACGGTGATATAATCCACCTAGTTGATTTAGATAAATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAGTAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTACGGCTGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTACAGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACTGTTGCTGGTACAAGTTATTGGGTTGTTCAACAAAACGTCCCAACTGTAGAACGTGTCGATGCTGGAACTGATACAACTAGAGCTCGTGTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACAGCATCATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGGCCGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACACCTAAGAAATTGCAGGCACGTCAGGGCTCTGAAACACTATCTGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACTCCTGCTGAAACTCGTGGGGCCGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATGCTCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCTGGACAATCTCAAGCAGGTTATTCTCATGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAACTTGCTACGCAAGTCGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAACGAACCAACATGGGCTGCTACTACTGCAATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACCCAAGATTTAGAACTGTATGAGAAAAATAGCTATGCGGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATCTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGTAGATAGTAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAACTCTGGAACAGCTACTCGACTGATTTTTGAAAAAGGACCTCAGACCGGAACAAATCCTGCTCAAACTATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATGAATTTGGTGGTGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGCGATGAAACATCTAATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGCTGGGAATATAACGTTTAGCATTAATGGTACTGTGATGCCAATAAATATTAACGCTTCAGGCACGTTAAATGCGAATGGCGTTGCAACATTTGGTCGTTCAGTTACAGCCAATGGTGAATTCATTAGCAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATTAGTGGTGATTACGGATTCTTTATTCGCAATGATGGCGGCAGCACATATTTTATGCTTACTGCATCTGGTGATCAGACCGGTGGATTTAATGGATTACGTCCATTATCAATTAATAATCAATTCGGTCAAGTTACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGCGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAGCATCTGATTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATAATGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACCCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACTCGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAAGTATTTGATGGGGGTAACCCTCCTCAGCCATCTGATATTGGTGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTCGAGTGGATTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
24a4b53384e04c66d3e97aeee3d1fbc5cc01cfbcc5903ad3fd21d8ec902bd2d4
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7927
Evidence 0,7927

Literature

Title Authors Date PMID Source
Still something new to discover - new insights into E. coli phage diversity and taxonomy Korf,I.H.E., Adriaennsens,E., Dreiseikelmann,B., Kropinski,A., Nimtz,M., Meier-Kolthoff,J.P., Rohde,M., van Raaij,M. and Wittmann,J. 2019-05-17 GenBank