Protein

Genbank accession
AGG54291.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANENPTLAQGEIGIELDTNRFKIGDGVRGWNTLPYERPIESVANTANTLVTRDADGNFSAGAITATLIGNSATSSRLANPRQIQLSQDLSGSGTFDGSSNLSLNAQLQVLSSLPHYDGTTTSTGTYTKVIVDAKGRITNASQPSSYVDLGLNDVQPLDSDLSAIANLTSTGIITRNAGGSALTRSVQGSSGRISVVNGNAVAGNPTIDLIDTTVALEAEFIAGSGQYNIPSLTSVGGDNLPEAANRTVNSTRYTVDQYGRFTSALTIPIATAREGSKYPNYDAATTYSRYAIIQNASKVYQALTTINAGAGAPTHSSGDTGSWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAAAGVDNTQLQNNLLRFADGNATEDFELDNELTSTTGYRGFNKLNYVKVNDTSGNLLVGLNNTGDGGAGELDVNVRSYFSDPDVTFDGAVQQAINKTGDGDFQILHQQNTASARTFAIAAQNSGSGNSQVAISAENVVSIDATDSAGKVHIEDLRIQDNYLASTGQLNLDPGDDRTNAGLVRIFGDLQIDGTTTTVNSTTMTVDDVTILLGGDTAPASDDNLDRGIEFRYYDTQARLGFYGWDTSYTDLSGHEGGYRFLHAATNTGEVFAGTDSGIIAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVLGGAGIGDDVNIGGSVDIDTNLRIHGTSRFDDNVVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTSGNGSLAGILDVTGNFNVNSNKFNVVAASGNTSIAGTLAVTQGTTMSAGLDLNSTLNVSNTVYFEDTNEPTWAKNSGTGLWEIQSNDYGAFRFDGGGYVAGDFMFDSDVVINGTILQRDDATETFNEQNYLRVRRKLFVGNIQALTPSYASHSNTNLRVYGGAGIQTDLHIGDDLYIGKLNSNDSVKFQVLGESGNTTIQGTLLVENNTNFNGTLDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLTVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSTGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVQASNEFFKVQNGSSADRFTIDTDNGNTSVIGTLTVSQATDLNNTLNVAGITTFENNTDQNITNVSYSADGAVRIDGGVGIDKKLAVGGASRFYGTAEFSSDLDINAAADISGNLTISNGNQVTSFADTTVALKVTGGARINKNLMTGGDFTVYDNSGGLNSFLVEVATGDATLRNDLVVGGNLTVNGTTTTVNSTTVTLDDPIMTLGGDTAPVSDDNKDRGIEFRYYDTQARLGFIGFDNNLEKFRFLVNATNSSEVFSGTDGSLQAGTLNLTGSGTALDVDNNANIDGTLTVDGVITSTKTSGAPFVVNSTSKVTNLNADLLDGMTTAATNTVSTVVARDSSGNFAAGTITAALVGNSSTATALETARNIAVAGVVSGTVSFDGTSDVSITTSFVDADVAALAAMSGTGMVTRTAGNTYAQRTLSKSGAGITITNGDGVSGNPTINIQSASTNSASNLVLRDASGNFSAGTVTANLTGNVTGNVTGTVSDISNHDTDDLSEGSTNVYYTNARADARVNLQTGANLSLANKTTTDLAEGTNQYYTEARVQAKLDNAYEQLRAMLTNLATSTTLTLNLSGDPTPGAVVAIGAIQNNGIGGFSNSTGLATGGGSGTSLTVDLTTSAGAITGIAINTPGTNYTTSDTITITNPNAGGVNAFNFGSLSAGTNYVSTNNVLTTGGSGTGLRVNFTAGSGNVTNVTVASAGSGYVNGETVTIPNDGAASASITAAGTGYSVDSLVSTTGGTGSGLTISIDTVNPGTGAITGLSIVSGGHGYTASDVITVSGGNGDATFTIGSVHAGNATIDISQVFTNATFALSDVTEMEVGATVTGATSGTTARISSLGATAITVDNVDGFFKKGEVVSANDVTTLTISSFS
Physico‐chemical
properties
protein length:1931 AA
molecular weight: 198695,43280 Da
isoelectric point:4,24487
aromaticity:0,06163
hydropathy:-0,16396

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–230
SSF69349
IPR041352
5–42
IPR041352
AGG54291.1
1 1931
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-SSM6b
[NCBI] 		682651 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGG54291.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ316603 [NCBI]
CDS location
range 4818 -> 10613
strand -
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAACTTAGACGTGGTGGTGCTCAGGAGTGGGCTAATGAAAACCCAACCCTAGCCCAAGGCGAAATTGGCATTGAACTTGATACCAACCGATTCAAAATCGGTGATGGTGTCAGGGGATGGAATACCTTACCGTATGAACGGCCGATTGAATCCGTGGCAAACACGGCTAATACTCTTGTAACTAGAGATGCTGATGGTAACTTCTCTGCTGGTGCTATTACTGCTACCTTAATTGGTAACTCTGCAACATCTTCTCGTCTTGCCAACCCTCGTCAGATCCAACTATCTCAAGACCTTTCAGGTTCTGGTACTTTTGACGGTTCGTCTAACTTATCTCTTAACGCTCAGTTACAGGTTCTTTCTTCATTACCACATTACGATGGTACAACAACCTCTACTGGCACTTATACTAAAGTAATTGTTGATGCTAAAGGTAGAATTACAAACGCATCTCAACCATCATCTTATGTTGATCTTGGATTAAATGATGTTCAACCTTTAGACTCAGACCTTTCTGCAATTGCAAACTTAACCAGTACAGGTATTATCACTCGTAACGCTGGTGGTTCTGCACTTACCAGATCTGTACAAGGTTCATCAGGTAGAATTTCTGTTGTAAATGGTAACGCTGTTGCTGGTAATCCAACGATTGACCTTATTGATACTACCGTTGCTCTTGAGGCAGAATTTATTGCTGGTAGCGGTCAATACAATATCCCAAGTTTAACGTCAGTAGGTGGTGATAATCTACCAGAAGCAGCAAACAGGACGGTAAATAGTACAAGATACACTGTAGATCAGTACGGACGTTTCACGTCTGCATTGACTATTCCTATTGCTACCGCTCGTGAAGGTAGCAAGTATCCTAACTATGATGCAGCAACAACCTATTCTAGATATGCAATTATCCAGAATGCGTCCAAAGTTTACCAAGCACTTACAACAATTAACGCTGGCGCTGGTGCTCCTACTCATTCCAGTGGCGATACTGGATCATGGCGCTACCTCGCGGCTGAAGCCACGGAACAGAAGGGACTGGCTAGCTTTGCACAGGAAGATTTTGACGTTGACAGCAACGGGCACGTTACCATCGCCGCCGCAGGCGTAGACAATACACAACTACAAAATAATCTTCTAAGATTTGCTGACGGAAACGCTACAGAAGATTTTGAATTAGATAACGAATTAACTTCAACAACTGGTTATAGAGGATTTAATAAACTTAATTATGTTAAAGTCAACGATACTAGTGGTAATCTGCTGGTTGGCCTTAATAACACTGGCGATGGTGGAGCGGGGGAACTTGATGTCAATGTAAGATCATACTTCTCTGATCCTGACGTAACCTTTGATGGTGCTGTACAGCAAGCAATCAATAAAACTGGTGATGGAGATTTCCAAATTCTACATCAACAGAACACTGCGTCTGCTAGAACTTTTGCAATTGCTGCTCAAAACAGTGGTTCTGGAAATAGTCAGGTTGCAATCAGTGCTGAGAACGTTGTTTCAATTGATGCAACTGATTCTGCTGGTAAGGTTCATATTGAAGACCTTAGAATTCAGGACAACTATCTAGCAAGCACAGGACAACTTAATCTTGATCCTGGCGATGATCGTACGAATGCTGGTTTAGTTCGTATCTTTGGTGATTTACAAATTGACGGTACTACTACCACAGTAAACTCCACTACTATGACAGTGGATGATGTTACTATTCTTCTCGGTGGTGATACTGCTCCTGCATCTGACGATAACCTTGATAGAGGTATTGAGTTTAGATACTATGATACTCAAGCACGTCTTGGTTTCTATGGATGGGATACAAGTTATACAGATTTAAGTGGTCATGAGGGTGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACTAATACTGGTGAAGTTTTCGCTGGTACTGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACTTAAAACTCACAACAAATACAAACTCAACATCTAATACTACTGGAGACTTGGTAGTTCTCGGTGGTGCAGGTATTGGTGATGATGTCAATATCGGTGGTTCAGTTGATATTGATACTAACCTCCGTATTCATGGTACATCTCGTTTTGATGATAACGTAGTCTTACAGGGTGCTTCTAAGACTCTGCAACTTAATAATGGATCTGGAACTACTAAGATTGAGTTTCAATCTACAAGTGGTAATGGTTCTCTTGCAGGTATCTTAGATGTAACTGGTAACTTTAACGTTAACTCTAACAAGTTTAACGTTGTTGCTGCCTCAGGTAATACTTCTATCGCTGGTACTCTTGCAGTAACACAAGGTACTACGATGAGTGCTGGTCTTGATCTGAACAGCACACTGAATGTATCAAACACTGTATACTTTGAAGATACTAACGAACCTACATGGGCAAAGAATAGTGGCACTGGTCTTTGGGAAATTCAATCCAATGACTACGGTGCATTCCGATTTGATGGTGGTGGTTACGTTGCTGGTGACTTCATGTTTGATAGTGACGTTGTTATCAACGGTACTATCCTTCAGAGAGATGATGCTACTGAGACATTTAACGAACAGAACTACCTAAGAGTTCGTCGTAAACTATTTGTTGGTAATATTCAAGCACTGACACCTAGTTACGCTTCTCATAGTAATACAAACTTGAGAGTTTACGGTGGTGCTGGTATTCAAACTGATCTCCATATTGGTGACGATCTTTACATTGGTAAATTAAACAGTAATGATAGTGTTAAGTTCCAAGTTCTAGGTGAGAGTGGTAATACAACTATTCAGGGTACATTACTTGTTGAAAATAATACAAACTTCAATGGTACTCTTGATGTTGACGCAGACTTTGCTGTTAGAAACGGAACTACTGACAAGTTCTTTGTTGACAATGTAACTGGTAACACAGATATTCAAGGCACTCTGGATGTTAACGGTGCAACTGAAATCACTAACACCTTAGATGTTAGCAATGCTGTTACCTTTGACCAGACACTTACAGTACAAGGTAATTCTGAATTCAACGGAACTGTAGATGTTGATGCAAACTTTGCAGTCAGATCAGGTTCAACTGATAAGATGACTGTTGCATCTTCTACAGGTAACATTGCAACTGATGGAACTTTAGTTGTTCAAGGTCAGACAACTATCAATGATTCTCTGATTGTACAAGCATCTAATGAATTCTTTAAGGTTCAGAATGGTAGTTCTGCAGATAGATTTACTATTGATACTGATAATGGTAACACCTCTGTTATTGGTACTCTTACAGTTTCCCAAGCAACTGACCTTAATAATACTCTTAACGTTGCTGGTATTACAACGTTTGAAAATAATACTGATCAAAATATTACCAACGTATCTTATAGTGCCGATGGTGCTGTAAGAATTGACGGTGGTGTAGGTATTGATAAGAAACTTGCTGTAGGCGGTGCTTCAAGATTCTATGGAACTGCTGAGTTTAGTTCCGATCTTGACATTAATGCTGCTGCAGATATTTCTGGCAACCTTACTATTAGTAATGGAAACCAAGTTACTAGTTTTGCTGACACTACAGTTGCTCTTAAAGTTACTGGTGGTGCGAGAATTAACAAAAACTTGATGACTGGTGGAGACTTCACCGTTTATGATAATTCTGGTGGTCTTAATAGTTTCCTTGTAGAAGTTGCTACTGGTGATGCTACCTTGAGAAATGACTTGGTAGTCGGTGGTAACTTAACTGTTAATGGTACGACTACAACCGTTAATAGCACTACGGTCACACTAGATGATCCTATCATGACACTGGGTGGAGATACCGCTCCAGTATCTGATGATAACAAAGACCGTGGTATTGAATTTAGATATTACGATACTCAAGCAAGACTTGGATTCATTGGTTTTGATAACAACCTAGAGAAGTTTAGATTCCTTGTTAATGCCACAAACTCCAGTGAAGTATTCTCTGGTACTGATGGTTCTTTACAGGCAGGTACATTAAACCTTACTGGTTCTGGTACTGCACTTGACGTTGATAATAATGCAAACATTGACGGAACTCTAACCGTTGATGGTGTAATTACATCTACTAAGACATCTGGTGCTCCTTTCGTAGTTAACTCTACTTCTAAGGTCACTAATCTTAACGCAGATCTCTTAGATGGAATGACAACTGCTGCTACTAATACAGTATCTACAGTTGTTGCTCGTGATTCTTCTGGTAACTTTGCTGCTGGAACTATCACTGCTGCTCTGGTTGGTAACTCTTCTACCGCAACTGCTCTTGAAACTGCAAGAAACATTGCAGTTGCTGGCGTTGTTTCTGGTACTGTGTCGTTTGATGGTACTTCAGACGTATCTATCACAACTTCATTTGTTGACGCTGATGTGGCTGCTTTAGCAGCTATGTCTGGTACTGGTATGGTTACCAGAACTGCAGGAAATACTTACGCGCAGCGTACACTTTCCAAGTCTGGTGCTGGTATTACAATCACTAATGGTGATGGTGTTTCTGGCAATCCTACTATCAATATTCAGTCTGCATCTACTAATAGTGCATCTAATCTCGTTCTTCGTGATGCGTCTGGTAACTTCTCAGCAGGCACTGTTACTGCAAACTTGACTGGTAACGTTACTGGTAATGTGACTGGTACAGTTTCTGATATTAGTAACCACGATACTGATGATCTTAGCGAAGGATCTACTAATGTCTACTATACAAATGCTCGTGCTGACGCTAGAGTTAATTTGCAGACTGGTGCAAACCTCAGTCTTGCTAATAAGACTACGACTGATCTTGCTGAGGGAACTAATCAATATTATACAGAAGCAAGAGTACAAGCAAAACTTGATAATGCATACGAGCAACTTAGAGCAATGCTTACCAACCTTGCGACTTCTACCACATTAACGTTGAATCTCTCTGGAGACCCAACACCTGGTGCTGTTGTTGCAATCGGTGCTATTCAAAACAACGGTATTGGTGGATTTAGTAACTCTACTGGTCTTGCTACTGGTGGGGGTAGCGGAACTAGTTTGACTGTGGATCTTACAACATCCGCTGGTGCGATTACTGGAATTGCCATTAATACACCTGGTACAAACTACACAACCTCTGATACCATCACTATCACTAACCCGAATGCTGGTGGTGTGAATGCATTCAACTTTGGATCTCTTTCTGCTGGTACTAACTACGTTTCAACTAACAATGTGTTAACCACTGGTGGTAGCGGAACTGGATTGAGAGTTAACTTTACTGCTGGTTCTGGTAACGTTACTAACGTGACTGTGGCATCGGCAGGATCTGGATATGTAAATGGTGAGACAGTCACCATCCCGAACGATGGTGCTGCCAGTGCATCTATCACTGCTGCTGGTACTGGTTATAGCGTTGACAGTCTCGTATCTACCACAGGTGGAACTGGATCTGGTTTGACAATCTCTATTGACACTGTGAATCCTGGAACGGGTGCTATTACAGGACTCTCTATTGTAAGCGGTGGTCATGGATATACTGCCAGTGATGTTATTACTGTCTCTGGTGGTAATGGTGATGCAACATTTACTATTGGTAGTGTCCATGCTGGTAATGCAACCATTGACATCTCTCAGGTGTTTACTAATGCAACATTCGCACTTAGTGACGTTACTGAGATGGAAGTCGGTGCAACTGTCACTGGTGCTACATCTGGTACTACAGCAAGAATTAGTTCTCTCGGTGCTACTGCAATTACTGTTGATAATGTTGACGGATTCTTCAAGAAAGGAGAAGTCGTCAGTGCAAATGACGTTACTACTCTAACTATCTCCTCATTCTCCTGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
dd02d6389bd49c63f0e729d09fd6217863ed43d076c92492f979fd73a7bb4cd0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5534
Evidence 0,5534
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage S-SSM6b Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Erlich,R., Young,S.K., Koehrsen,M., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Borenstein,D., Chen,Z., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heiman,D., Hepburn,T., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Mehta,T., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., Walk,T., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C., Galagan,J. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank