Protein

Genbank accession
AIX27619.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,84
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MGGSLYVFNDIFYDEITGRNLSISGIATLRQLEIQQDLEVAGLSTFVGLVSFRDAVGTNLTVYNLSANTGNFVEINVDGGGGGGGGTGIDSTSVNTEFLNVTGVATFNNGIATNFSAEFIDAGVTTTTDLHFTNGYGVNLNMSGITTVGILTVYENIYDSRNQVGYGDSLLVTQGGKLVWTRPDIAGIATSFQPGSTFYVSENGSNTNDGRSPEKAWSSIAYAVSQIGDTSHDILEVTAGEYTETFPITVPKGLTISGAGQRATIVRPSQATETNDGFLLNDRSTIHNITVTGFYKPQGSINYAFKFSVGAAITSRSPYVDKVTVINKGTQTSASDPYGYGSADSYPTTAPGGAGVLVDGSVVATNSLEAAILLNEVTLFTAGNQGIKITNGGRVEWLNGFIYFASEALVGLSDKTTGLAGAGKARLTLENASGGLVGGNTVQYYDSDGTTVLASGTIDNVSGSYVTLTNAGVGTFTTPRNRTAKKVDFVNGAQLSTAQARFGTSSLDVTGAGTDNITVDSTSDFGFGTGDFTVEFWIYRTGNINGKVICDFRDTAATDQAITIQGDGGNETDVYIGTTSVVTGTVPTTLNAWNHIAVCRVGSTITQYIDGAVSGSGTAATDLGVARQLTFGDRYDNSNNGPTAYLDELRVTKGAAKYTGAFTSPSVALTGDKDTSILLHFDGINGATSTTDDIIVLQDIRITGGNTADKVTLADYSQFGADLRSIACAIEYGNQGMIGDGDGVTLRAISINFNHVGALGDITNDPNLAIQSNEVIELNGGQVSYVSIDQKGDFRVGEAFYVNQETGEVSFTDTVTDLTALSSLTITDGTNSSIITPTSGRFGNVLISGQSVESVTGDLNIKTGGSGEINIFGNTNVIGILTAQIIEINAIQKGDTAIALDDTGTDGTIRFITDGQEAQRITNQQRVGINTTTPVTQLEVKGGTQLENLNVTGIATLNGVGIATIGGDPDFRNLNITGLSTFAGVGTFLSDLYVGGNLSVLGDIKFDEVDARNANITGIATVGFASITDARVGSALTNLGHTQLNTLNVSGVSTLSLLEVSGNSVFTGISTFNNNVTINGDLTINGSQNVDSFGTGDLIVSGIASINQAKIATGIVTTLTATRTESAELKVTGLSTFVGVATFANDVFVAGNLNVLGDIAYDEVTGRNLNISGIATIGFASITDAKIGVATITKLDVTEINVDGGTGIDDNSVTTENLVVSGIATINSGILTTLQAEVGSITNLTAGVSTFTGIVTTTEDLYVGGNLYVFNDIFYDEITGRNLSISGVSTLGFASVRDLRVSGVATFLGDVEISGSQIVDSLITGDLEVTGVTTTKELRFTDAVGVGLTLTNLVVTGNAELNGSGIVTAGQDINFRNLEVAGLSTFVGLQSFRSAVGTALTVYNLRVPENGIVSLPGIPVQGGDAEFRNVNVTGVSSFSGVSTFGSDLYVDGNLFVSGLDFRETLAGENLLVAGVGTVNNLNSNIGIITHLQAGISTFTGITTFQSDASFLSDVYVDGNLNVTGDIRYDEVNGRNLNISGIATIGYSSITDAKIGVATISTLSFGDGVGTALTLTDLTVTGDANLNGSGIVTAGSDVAFRNLEVTGLSTFTGVGTFLSDLYVGGDLFVFNDIKYDEINGRNLNISGISTLGFTSISDIRVSGGSTFLGNVEIDGNLDVTGDLTFDEFDATNANITGIATIGNLLAGVGTITTLSSTDGEITTLTSTDTVVGTLTATDATITTLGVTDSIVGTSTITTLSVTDSVVGTSTITTLNFTDGVGVALTLTDLNVLGEANLNGSGIATAGSDIEFRNLSITGLSTFVGVATFQDDLYVAGNLNVLGDLTYDEVNGRNLNISGIATIGFASITDLRVSGVTTFLGPVNIDGGQQTDFIQTTDLIVTGVATIGYATVTKLIADHSDMRNLNVSGIATIGSLVSDGNGGIIVDGAVSISGIVTIGENSIILDGRKDVEAIYLGDTGRAIVSGISTDNKRTYVKFDDGRFDRLNVSGISTFNDVVSTSSTITNLDVTTATVGFLTATQGYVGVLTVGTFTNDGGGSVIGDDITTRNLNVTGVSTFAGIVTTTGDLYVGGDLFVFNDIFYDEINGRNLNITGVATIGYSSITDVRVSGVATFLGDVNISGVTSVTTLEATGIDAYRVTTQRLIVPDDGFVQLPGIPVSGGSAEFSELLITGISSFVGVATFKDDVYIDGDFIVGGSQVIDNVATENIIISGIATIRTGEITELNVGIATVGFLTATDGYIGVLTAQNYTSLSDERLKSNIETIDDALAGVLRLDGVMFQWNNTGKTDMGVIAQQVEAVFPEIVHGDDTKGVNYNGLIGVLIEAVKELKVENDSLRERLDRLE
Physico‐chemical
properties
protein length:2362 AA
molecular weight: 244478,79670 Da
isoelectric point:4,12091
aromaticity:0,06986
hydropathy:0,17379

Domains

Domains [InterPro]
IPR011050
191–491
IPR011050 IPR013320 IPR036388
G3DSA:2.60.120.200
478–655
G3DSA:2.60.120.200 IPR030392
PF13385
513–655
PF13385 IPR030392 Coil
AIX27619.1
1 2362
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX27619.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019085 [NCBI]
CDS location
range 197438 -> 204526
strand +
CDS
GTGGGTGGTAGTTTATATGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAGATTACTGGTAGAAACCTCAGTATCTCTGGTATTGCCACACTCAGACAGTTAGAAATCCAACAGGACCTAGAAGTTGCAGGTCTCTCCACATTTGTTGGTTTAGTATCGTTCAGAGATGCAGTAGGTACAAACCTAACAGTTTATAATCTTTCCGCCAATACTGGTAACTTCGTAGAGATTAACGTCGATGGTGGAGGAGGCGGCGGTGGCGGTACTGGTATCGATAGTACCTCCGTCAATACCGAGTTCTTAAACGTCACTGGTGTTGCAACATTTAACAATGGTATTGCCACCAACTTCAGTGCAGAGTTTATTGACGCTGGTGTAACCACAACTACCGACCTCCACTTCACTAATGGTTATGGTGTCAATCTCAATATGAGTGGCATCACAACTGTTGGTATTCTAACAGTCTATGAGAATATCTATGACTCTAGAAACCAAGTTGGCTATGGTGACTCACTACTAGTCACACAGGGTGGGAAACTAGTATGGACTAGACCTGATATTGCAGGTATTGCCACTTCATTCCAACCAGGTTCTACCTTCTATGTAAGTGAGAATGGTAGTAATACCAATGATGGTAGAAGTCCAGAGAAAGCATGGAGCTCTATTGCATATGCCGTATCACAGATTGGAGATACTTCTCACGATATTCTAGAGGTTACTGCTGGTGAATACACAGAAACCTTCCCTATCACAGTCCCTAAAGGTCTAACCATTTCTGGTGCTGGACAAAGGGCAACCATTGTCAGACCGTCACAGGCAACCGAAACCAATGATGGTTTCCTACTAAACGATAGATCCACTATCCATAACATCACAGTTACTGGATTCTACAAACCACAAGGTTCTATCAACTACGCCTTCAAGTTTAGTGTTGGAGCAGCAATCACCAGTAGAAGTCCTTATGTTGATAAGGTCACGGTCATCAACAAAGGTACTCAGACAAGTGCCAGTGACCCATATGGTTATGGTTCAGCTGACTCCTACCCAACCACAGCACCTGGTGGTGCTGGTGTTTTAGTTGATGGTAGTGTAGTTGCAACCAACTCACTAGAAGCAGCAATTCTCCTCAATGAGGTTACACTATTCACTGCTGGCAACCAAGGTATTAAGATTACCAATGGTGGTAGAGTAGAGTGGTTGAATGGTTTCATCTACTTCGCTTCTGAAGCACTTGTAGGTCTTAGTGATAAGACTACTGGTTTAGCGGGTGCTGGTAAGGCAAGACTAACCCTAGAGAACGCCTCTGGTGGATTGGTTGGTGGTAATACCGTTCAATACTATGATAGTGATGGAACCACAGTTCTTGCTTCTGGTACCATTGATAATGTATCTGGTAGTTATGTAACACTAACCAACGCTGGTGTTGGTACATTCACAACTCCTAGAAATAGAACAGCCAAGAAGGTTGACTTTGTTAATGGAGCACAACTATCCACAGCACAGGCAAGGTTCGGTACATCCTCACTAGATGTAACTGGTGCCGGAACTGATAACATCACAGTTGATTCCACTTCAGACTTTGGGTTTGGAACTGGAGACTTCACCGTTGAATTCTGGATATACAGAACTGGTAATATTAATGGTAAGGTAATCTGTGACTTCAGAGATACCGCCGCTACAGATCAGGCAATTACTATCCAAGGTGATGGTGGTAATGAGACTGATGTTTATATTGGTACTACATCCGTTGTCACTGGTACAGTTCCTACCACACTGAATGCTTGGAACCATATCGCTGTTTGTAGAGTTGGTTCTACCATCACTCAGTATATTGATGGTGCTGTTTCTGGTAGTGGAACTGCTGCTACTGATCTAGGTGTTGCTAGACAACTAACCTTTGGTGATAGGTACGACAATAGTAACAACGGTCCTACAGCATACCTAGATGAACTTCGTGTCACTAAGGGGGCAGCAAAATACACAGGAGCATTCACTTCACCTTCAGTAGCACTCACAGGTGATAAGGATACTTCTATCCTACTACACTTTGATGGTATCAATGGAGCAACCTCCACTACAGATGATATCATTGTCCTCCAGGATATTCGTATCACTGGTGGCAACACAGCAGATAAAGTTACCCTAGCAGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGACCTCAGGTCTATCGCTTGTGCCATTGAATATGGTAACCAGGGTATGATTGGTGATGGTGATGGAGTAACTCTCCGTGCTATCTCTATCAACTTCAACCATGTAGGTGCTCTTGGTGATATCACTAACGATCCTAACCTAGCGATTCAATCGAACGAGGTTATCGAACTCAATGGTGGTCAAGTATCCTATGTAAGTATTGACCAGAAGGGTGACTTCAGAGTTGGTGAAGCATTCTATGTGAATCAGGAGACTGGTGAAGTATCCTTTACAGATACTGTAACAGACCTAACTGCTTTATCCTCACTCACTATTACTGATGGTACTAATAGTAGTATCATTACTCCTACTTCTGGTAGGTTTGGTAATGTTCTTATCAGTGGTCAGAGTGTAGAGAGTGTAACCGGAGACCTCAACATTAAGACTGGTGGTTCCGGTGAGATCAATATCTTTGGTAACACCAATGTTATTGGTATTCTAACCGCTCAGATCATTGAGATTAATGCTATTCAGAAGGGCGATACAGCAATCGCTCTAGATGATACTGGAACTGATGGGACTATCCGTTTCATCACAGACGGACAAGAAGCACAACGTATTACAAACCAACAGAGAGTTGGTATTAACACCACCACCCCAGTTACTCAGTTAGAAGTTAAGGGTGGAACACAACTAGAGAACTTAAATGTAACTGGCATTGCCACACTTAATGGTGTTGGTATTGCTACTATCGGTGGTGATCCTGACTTCAGAAACTTAAATATCACTGGACTATCGACGTTCGCTGGTGTTGGTACTTTCCTCAGTGATTTGTATGTTGGTGGTAACCTCAGTGTCCTAGGTGATATCAAGTTTGATGAAGTTGATGCGAGAAACGCCAACATCACTGGTATTGCCACAGTTGGTTTCGCCTCTATCACAGATGCCAGAGTTGGAAGTGCCCTCACTAACTTGGGTCACACTCAACTCAATACTCTGAATGTAAGTGGAGTATCTACACTATCACTACTAGAAGTCAGTGGTAACTCAGTATTTACTGGTATCTCTACCTTCAACAACAATGTAACTATCAATGGTGACCTCACCATTAATGGTTCTCAGAATGTAGATAGTTTTGGAACTGGTGATTTAATAGTTAGTGGTATTGCTAGTATCAACCAGGCGAAGATCGCCACTGGTATTGTTACCACACTAACTGCCACTAGAACAGAGTCAGCAGAACTAAAAGTAACTGGTCTCTCCACCTTTGTTGGTGTTGCTACCTTTGCTAACGATGTATTCGTGGCAGGTAACCTCAATGTTCTAGGAGATATTGCATATGATGAAGTCACTGGTAGAAACCTAAACATCTCCGGTATCGCAACCATCGGGTTCGCTTCTATCACAGACGCCAAGATTGGTGTCGCCACTATTACAAAACTTGATGTCACTGAGATCAATGTAGATGGTGGAACAGGTATTGATGATAACTCAGTAACTACAGAGAACCTAGTTGTTAGTGGTATCGCTACCATCAACTCAGGTATCCTCACAACCCTCCAGGCGGAGGTAGGAAGTATCACAAACCTCACCGCTGGTGTTTCTACCTTTACTGGTATTGTAACCACTACAGAGGATCTATACGTTGGTGGAAACCTCTACGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAAATCACTGGTAGGAACCTTTCTATCTCTGGAGTATCTACATTAGGTTTCGCTTCTGTTAGAGATCTAAGAGTATCTGGTGTCGCTACATTCCTTGGTGATGTGGAGATCAGTGGATCACAGATTGTTGACTCACTAATAACTGGTGACTTGGAAGTTACTGGTGTTACTACAACTAAGGAACTAAGATTTACAGACGCTGTTGGTGTAGGACTCACACTCACCAATCTAGTTGTAACTGGTAACGCGGAACTCAATGGTTCTGGTATTGTTACCGCTGGTCAAGACATCAACTTCAGAAACCTAGAAGTTGCTGGTCTATCAACCTTTGTTGGTCTCCAGTCCTTCAGGTCAGCAGTTGGAACGGCACTCACAGTTTATAACCTAAGAGTTCCTGAAAATGGTATTGTTTCACTACCTGGTATTCCTGTTCAGGGTGGGGACGCTGAGTTTAGAAACGTCAATGTAACTGGTGTATCTTCCTTCAGTGGAGTATCAACTTTCGGTAGTGACCTCTATGTGGATGGAAACCTATTTGTTTCTGGTCTAGACTTCAGAGAGACACTTGCTGGTGAGAACCTATTAGTTGCTGGTGTTGGTACTGTTAATAATCTCAATAGTAATATTGGTATTATCACTCATCTACAGGCAGGTATATCAACCTTCACTGGTATCACCACCTTCCAGAGTGATGCCTCCTTCTTGAGTGATGTATATGTAGATGGAAACCTTAATGTTACGGGTGACATCAGATATGATGAGGTGAATGGTAGGAACTTGAATATCAGTGGTATCGCTACCATTGGTTACTCCTCTATCACAGACGCCAAGATTGGTGTTGCTACTATCTCCACACTATCCTTTGGTGATGGTGTTGGAACAGCACTCACACTTACAGACCTCACGGTAACAGGTGACGCCAACCTCAATGGTTCTGGTATTGTAACCGCTGGTTCTGATGTAGCGTTTAGAAATCTAGAAGTAACTGGACTATCTACCTTCACTGGTGTTGGTACTTTCCTCAGTGACTTGTATGTTGGTGGTGACCTCTTTGTATTCAATGATATCAAGTATGATGAGATTAATGGTAGAAACCTAAACATCTCTGGTATCTCCACACTTGGTTTCACTTCTATCTCCGACATCAGAGTATCTGGTGGTTCTACCTTCTT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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
605721e96d53369ccb595e49f1fb21f120e416c60a0b76ace015831c7f68239f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5038
Evidence 0,5038
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank