Protein

View in Explore
Genbank accession
QHR72382.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,72
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKSIQFKRSKIAGAKPTAAQLDEGELAINLRDRTIFTKSDQGQIIDLGFAKGGQVDGDVNINGTLNLNGELVQTGTAGMRTEGSITAPVFRASKGSFYSRASNDTSNAHYWFENANGTERGVLYAKPQLENEGVITMRVRQGTAAGAQNSEFHFISNDGGIFQARKLAALTSISTPTISVNLVNHDSKTFGQYDSQSLVNYVYPGTGETNGVNYLRKVRAKSGGTMWHELCTAQLGQADEMSWWTGNTPQSKQYGVRNDGRLIGRNSLALGTMTTDFPSSDYGNTGAMGDKYLVLGDTATGLKYIKQGNFDLVGGGYSVASITTDGFRGTSKTIFGRSNDQGLTWLLPGQNSSMVSIRTEIDGNNSGDGQTHLGYNSNGKLYHYFRGTGRVAISMAEGMIIEPGILNIKTGVNELNLRADGTVSTTQRLMVNNGLVLNANNNTSALALTAPTGVDGTKTINWDAGTRNGQNKNTVTMKAWGNSFNAGGGNRETVFEVSDSQGYYFYGQRTNPASGETVGPINFKFNGSVETGHFSSLGNISASGTGSFGGNVTMTNGLFVQGGASISGQVKMGGTADALRIWNAEYGLIFRRSETGSSASFHLIPTLQNAGENGGISDLRPLSINLANGTVIMGNKSTGGPLFTVDNVSKFVQTDCRLRVNMDSDGIVLNASSQAASNFIQGRKADVTKWYLGIGDGGNVVRLHNYTYSHGIALNSDTVDITKPLKIGSDIRIGTDGNITGSSTLDNFKNLNSTLDHKVNMGGWSGGATTGWYKFATVEIPQSTGTVSFKIFGGSGFNFKSYGQASIAEIILRTGNNNPKGLNATLWNRTSEAISQIASVNTSEDIYDIYVYLGGYSNSLVVEYTCSSNSKVTVVGMDSGIQPLVETLPEGHIVGKSVRMLNNIDGMFAAGESDIVTRGEYVTNNQKGMRIKSKGNDLDSNAALLRNDGGSFYILATDKNTTEKPDAANGDWNGLRPFSINMADGRVGMNHGLNITGGGLNVTGGNTNLGNITSRVVSSARSPAGWADNSDAMKPKITFMADHGDLSNSGSYYPIVGAWSNYGSAGYRQTFEFGWVGSGTTAGWRDGIIRIRGDNANGQQARWRFVMDGTLECPGKVLLPQTSAFGINTINGFGGNSLVIGDSDTGFRQVGDGLLEVWTNASRRMRFQGGDTYSDMNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALEKVEQLDGLIYDKADYIGGEVVHTEAGVIAQKLNEVLPEAIREVEDIKGNKVLTVSTQAQVALLIEAVKTLSAKVKELEAKLN
Physico‐chemical
properties
protein length:1288 AA
molecular weight: 137578,54120 Da
isoelectric point:6,77017
aromaticity:0,08075
hydropathy:-0,33579

Domains

Domains [InterPro]
DC_1954
STR
1–883
DC_1954 DC_0128 DC_1942
G3DSA:6.20.80.10
STR
669–726
G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR048388
ATT
669–750
IPR048388 IPR030392 Coil
Coil
Unmapped
1235–1255
Coil
QHR72382.1
1 1288
Architecture
STR
ATT
STR
RBD
ATT
STR 1-668 | ATT 669-750 | STR 751-883 | RBD 912-1048 | ATT 1073-1287 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QHR72382.1
1 1288
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 707 707 0,0343
Central domain 708 914 208 0,6170
C-terminal 915 1288 373 0,8029
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-707
Central
708-914
C-terminal
915-1288

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage dhabil
[NCBI] 		2696390 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR72382.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850621 [NCBI]
CDS location
range 24169 -> 28035
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAATCGATACAATTTAAAAGAAGTAAAATAGCAGGAGCCAAGCCTACTGCAGCCCAGTTAGATGAAGGTGAACTGGCTATTAACTTGCGTGACCGCACTATTTTTACTAAGTCAGACCAAGGACAGATTATTGATTTGGGCTTTGCTAAAGGTGGACAAGTTGATGGTGATGTTAATATTAACGGGACTTTGAATTTAAATGGTGAACTTGTCCAAACAGGTACGGCAGGTATGAGAACTGAAGGTAGTATTACTGCCCCTGTTTTCCGAGCTAGTAAGGGCTCATTTTATTCTAGAGCGTCTAATGATACTTCTAACGCACATTATTGGTTTGAAAACGCAAATGGCACTGAACGTGGTGTTTTATATGCTAAACCACAGCTTGAAAATGAAGGCGTAATTACCATGCGTGTTCGCCAAGGTACTGCTGCCGGCGCGCAAAATTCAGAGTTTCACTTTATTTCTAATGATGGTGGTATTTTTCAGGCTCGTAAATTAGCGGCTTTAACTTCAATATCAACACCTACAATTTCCGTTAACTTAGTAAACCATGATTCAAAAACGTTTGGACAGTATGACAGCCAATCTTTAGTTAATTACGTATACCCGGGCACCGGCGAAACAAATGGTGTAAACTATCTTCGTAAAGTTCGTGCCAAATCTGGCGGCACTATGTGGCATGAGCTTTGTACTGCTCAATTAGGCCAAGCTGATGAAATGTCTTGGTGGACAGGTAATACTCCTCAGTCTAAACAATACGGTGTTCGTAACGACGGCCGTTTGATTGGTAGAAATAGCCTTGCATTAGGTACTATGACTACCGATTTCCCATCTAGCGATTATGGTAATACCGGAGCTATGGGTGACAAATACCTAGTTTTAGGTGATACCGCGACCGGTTTAAAATATATTAAACAAGGTAATTTTGATTTGGTGGGTGGAGGTTATTCTGTTGCTTCTATTACTACTGATGGTTTCCGCGGTACAAGCAAAACCATATTTGGACGTAGTAATGACCAGGGGCTTACTTGGCTTCTGCCGGGCCAGAATTCTTCTATGGTTTCTATTAGAACCGAAATAGATGGTAATAACTCCGGGGATGGCCAAACCCATTTGGGTTATAATTCTAATGGTAAACTTTATCATTATTTCCGTGGCACAGGTCGTGTAGCCATTTCTATGGCAGAAGGTATGATTATTGAACCTGGTATTTTAAATATTAAGACCGGGGTTAACGAATTAAATCTTAGAGCAGACGGCACAGTTTCTACTACACAGCGTTTAATGGTTAATAACGGCCTAGTTCTTAACGCAAACAATAATACTTCTGCATTGGCATTAACTGCTCCTACCGGTGTTGATGGTACAAAAACCATTAACTGGGACGCTGGTACCCGAAATGGCCAGAACAAAAATACCGTTACCATGAAAGCATGGGGTAACTCATTTAACGCCGGTGGCGGTAATAGAGAAACTGTATTCGAAGTATCAGATTCACAAGGATATTATTTCTATGGCCAACGTACTAATCCGGCTTCCGGTGAAACTGTAGGCCCTATTAACTTCAAGTTCAACGGCTCTGTTGAAACAGGTCATTTTTCTAGTCTCGGAAATATAAGTGCATCCGGTACCGGTTCTTTTGGTGGCAATGTTACCATGACTAATGGCCTGTTTGTCCAAGGCGGCGCTTCAATTAGTGGCCAAGTTAAAATGGGTGGTACTGCTGACGCATTAAGAATTTGGAACGCTGAATATGGTTTGATTTTCCGTCGTTCAGAAACGGGTTCTTCTGCTTCATTCCATCTTATTCCTACCCTTCAAAACGCCGGTGAAAATGGTGGAATAAGCGACCTCCGTCCGTTGTCTATTAATTTAGCCAATGGTACCGTTATAATGGGGAATAAATCTACAGGTGGTCCACTTTTTACAGTCGACAACGTAAGTAAATTTGTCCAAACTGACTGTAGGTTGCGTGTTAATATGGATTCCGATGGTATTGTTTTGAATGCTTCATCTCAAGCAGCATCCAACTTTATCCAAGGACGTAAAGCAGACGTTACAAAATGGTATCTTGGTATTGGTGACGGCGGTAACGTTGTTCGTTTACATAACTATACTTATTCACATGGTATTGCATTAAACTCTGATACTGTTGATATAACCAAGCCTCTTAAAATAGGTTCTGATATTCGTATTGGTACAGATGGTAACATTACAGGCAGTTCTACCTTAGACAACTTTAAAAACCTGAATTCAACATTAGACCATAAAGTTAATATGGGCGGATGGTCGGGTGGTGCTACTACAGGTTGGTATAAATTTGCTACTGTAGAAATTCCGCAGTCAACAGGCACGGTATCTTTTAAAATATTTGGTGGTTCCGGATTTAATTTTAAAAGTTATGGTCAGGCTTCAATAGCTGAAATAATCCTTAGAACTGGTAATAATAACCCTAAAGGCCTTAATGCTACGTTGTGGAATAGGACTTCTGAAGCTATTTCCCAGATTGCTTCGGTTAATACAAGCGAAGATATCTATGATATTTACGTTTATTTGGGTGGATATTCTAATTCTTTAGTAGTAGAATATACATGCAGTAGCAATAGTAAAGTAACCGTAGTAGGTATGGATAGCGGCATCCAGCCTTTGGTAGAAACATTACCTGAAGGTCATATTGTAGGTAAATCTGTAAGAATGCTGAACAATATTGACGGAATGTTTGCTGCTGGTGAATCAGATATTGTTACTCGTGGTGAATATGTTACCAATAACCAAAAAGGTATGCGTATTAAATCTAAAGGTAATGATTTAGATTCTAATGCTGCTTTACTTAGAAACGACGGTGGAAGTTTTTATATTTTAGCTACAGATAAAAATACGACAGAAAAACCCGATGCGGCTAATGGTGATTGGAATGGCTTAAGACCTTTCTCTATTAATATGGCTGATGGTCGCGTTGGTATGAACCACGGTCTGAATATTACTGGTGGCGGATTAAACGTTACAGGTGGTAATACAAACCTTGGTAATATTACCTCTCGTGTAGTTTCTTCTGCACGTTCACCTGCAGGCTGGGCTGATAACTCAGATGCAATGAAACCTAAAATCACCTTTATGGCAGACCATGGTGATTTATCCAATTCAGGTAGTTATTATCCTATTGTCGGAGCGTGGAGTAACTATGGTTCAGCAGGTTATCGTCAGACCTTTGAGTTTGGTTGGGTTGGTTCTGGTACCACAGCTGGATGGCGTGATGGTATTATTCGTATACGTGGCGACAATGCTAATGGCCAACAAGCAAGATGGCGCTTTGTAATGGACGGTACTTTAGAGTGTCCAGGTAAAGTACTGCTACCACAAACAAGTGCCTTCGGTATTAACACAATAAACGGGTTTGGTGGTAACTCACTTGTAATTGGGGATAGCGATACTGGTTTTAGACAAGTTGGTGACGGTCTTTTAGAAGTTTGGACTAATGCTTCTCGCCGTATGCGATTCCAAGGTGGTGACACTTATTCAGATATGAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTGAAATCAAACTTCAAACCAATTGAAAACGCTCTTGAAAAGGTTGAACAGCTTGATGGTTTAATCTATGATAAAGCTGATTATATTGGTGGAGAGGTTGTTCACACTGAAGCAGGTGTTATTGCACAGAAATTGAATGAAGTATTACCTGAAGCTATTCGTGAAGTTGAAGATATCAAAGGTAATAAAGTTCTGACAGTTTCTACTCAGGCACAAGTTGCTCTATTAATTGAAGCAGTTAAAACTCTGTCGGCTAAAGTAAAAGAACTTGAAGCTAAGTTAAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
5acb301b25c00fd645dacd34fca16cbed98788270530d26c1f3d31b469774e0d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5149
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank