Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_010247066.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,70
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQNGDYLQNGTFNLNGNMFVYAGKYIEFLPKTAGNGARWANQHLNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWQYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLVANGISAGTILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDFPNNNQAMFTARTDIDGNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGTGRMAVGMAEGLIVEPGILDIKTSSNTLSLRADGTVASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPTGSETVGPVVTQINGQLNARGSIITDGSLRVNGLSTLSGQVTMDNGLVLSGGGSITGQVKIGNTADAFRIYNAEYGAIFRRSEASLYIIPTLKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMITVDNDNKLVVVTSNSRISPNFRMQIGQSAYIDAECTDAVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGGSTGAIIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNVRIGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDAGLYPKLAAVYPSGSLPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASNTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQIQAGIPNNIFYDGYNSVGANANAKFTGTVNGATAGSNIAKTSSDGAHTHSWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1097 AA
molecular weight: 116501,24120 Da
isoelectric point:8,07803
aromaticity:0,08569
hydropathy:-0,38314

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1095
DC_0538
IPR051934
Unmapped
734–1097
IPR051934
SSF88874
STR
838–969
SSF88874 SSF88874
IPR037053
ATT
845–898
IPR037053
IPR011083
ATT
850–897
IPR011083
YP_010247066.1
1 1097
Architecture
STR
ATT
STR
STR 1-844 | ATT 845-898 | STR 899-1096 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_010247066.1
1 1097
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 180 180 0,3171
Central domain 181 379 200 0,6371
C-terminal 380 1097 717 0,7539
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-180
Central
181-379
C-terminal
380-1097

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage HX01
[NCBI] 		1237364 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010247066.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_018855 [NCBI]
CDS location
range 116155 -> 119448
strand -
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCGGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAAATGGTGATTATTTACAAAACGGCACATTTAACCTCAATGGTAATATGTTCGTTTACGCCGGTAAGTATATTGAATTTTTACCTAAAACCGCTGGAAATGGTGCTCGTTGGGCCAACCAACATTTGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCGCTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCTGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCGGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCAGTATACTCCAACCGAAACGGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACGGGACGTAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGATGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGACAATGATACTGGTATTAAATGGGTTCGTGACGGGGTTATCGATTTAGTTGCGAATGGTATTTCTGCCGGCACTATTCTTAATAACGGTATTAACAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCCGGTTCTACCTGGGATTTTCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACCGCACGCACCGATATTGATGGTAATAATAACGGCGATGGTCAGACTCATATAGGTTATAGCAGCAATGCCAAGATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGGCTGTTGGCATGGCCGAAGGACTTATTGTTGAACCAGGAATTTTAGATATTAAAACTAGTTCAAATACATTAAGTTTGCGTGCTGATGGTACCGTCGCTTCTGTTCAAACGTTAAAGCTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGACGGCACTAAGCAAATCATGTGGGAAGGCGGTACTCGAGCAGGTCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCATCCGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGATATTATTTTTATTCACAGCGTGTGGCTCCAACCGGTTCAGAAACTGTGGGACCTGTTGTAACACAAATTAATGGACAACTGAATGCAAGAGGGAGCATTATCACCGATGGAAGTCTTAGAGTTAATGGATTAAGTACATTATCCGGACAAGTTACTATGGATAACGGGCTTGTTTTATCCGGCGGTGGTTCTATTACAGGTCAAGTTAAAATCGGTAATACCGCAGATGCTTTCCGTATTTACAATGCTGAATATGGAGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGCGTCTTTGTATATTATACCTACACTTAAAGATGCAGGTGAAAGTGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCGCTTAGTATTAGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGTCATTCTGTTACGTTAGGCGATGATGGTGCTGGTGGTAATATGATTACTGTGGACAACGATAACAAACTTGTTGTTGTTACTAGTAATAGTCGCATTTCTCCTAATTTCAGAATGCAGATAGGTCAGTCGGCGTACATTGATGCAGAATGTACTGATGCTGTTCGCCCAGCTGGAGCCGGTTCTTTTGCTTCACAAAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCTTTCTATATGAATATTGATAGAACAGATACAAGCACTTATGTTCCTATTGTGAAACAAAGATACGTTCAAAATAATAGTTGCTATTCTATTGGTACTTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCATTATCACGAAGGTGGCGATGGCGGTTCTACTGGCGCAATTATAAAGGATTTAGGTTGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTACTCTCCTGGTAAATTAGGCGCTGGTAATGTTCGTATTGGTACTGATGGTAATATCACCGGTGGTTCTGGCAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATTGTCTCAAGTTATCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTACGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGCTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCTGTGTATCCTTCCGGCTCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAACACGGATTTGGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGTAACCATAACCATACAGTGAGCGGTAATACTAGTTCCGCCGGTGCGCACCAACACGCGCGTTCAGGCCCTCAGATACAAGCCGGCATACCCAATAACATATTCTATGACGGATATAATAGTGTAGGTGCAAACGCCAACGCTAAATTCACTGGAACCGTGAATGGTGCTACTGCAGGGTCGAATATAGCCAAAACTTCTTCAGATGGTGCCCACACTCATAGTTGGTCAGGAACTACTAGCGCTACGGGTAACCATGCTCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATACGCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a9546f62bfb58b23b32ba5184fceaf04cc24cf81a233f17971b8cce6e365de57
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2803
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete Genome Sequence of T4-Like Escherichia coli Bacteriophage HX01 Tang,F., Li,Y., Zhang,W. and Lu,C. 2012 23166268 GenBank