Protein

Genbank accession
YP_010247066.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,70
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQNGDYLQNGTFNLNGNMFVYAGKYIEFLPKTAGNGARWANQHLNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWQYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLVANGISAGTILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDFPNNNQAMFTARTDIDGNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGTGRMAVGMAEGLIVEPGILDIKTSSNTLSLRADGTVASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPTGSETVGPVVTQINGQLNARGSIITDGSLRVNGLSTLSGQVTMDNGLVLSGGGSITGQVKIGNTADAFRIYNAEYGAIFRRSEASLYIIPTLKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMITVDNDNKLVVVTSNSRISPNFRMQIGQSAYIDAECTDAVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGGSTGAIIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNVRIGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDAGLYPKLAAVYPSGSLPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASNTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQIQAGIPNNIFYDGYNSVGANANAKFTGTVNGATAGSNIAKTSSDGAHTHSWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1097 AA
molecular weight: 116501,24120 Da
isoelectric point:8,07803
aromaticity:0,08569
hydropathy:-0,38314

Domains

Domains [InterPro]
IPR051934
734–1097
IPR051934
SSF88874
838–969
SSF88874 SSF88874
IPR037053
845–898
IPR037053
IPR011083
850–897
IPR011083
YP_010247066.1
1 1097
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage HX01
[NCBI] 		1237364 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010247066.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_018855 [NCBI]
CDS location
range 116155 -> 119448
strand -
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCGGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAAATGGTGATTATTTACAAAACGGCACATTTAACCTCAATGGTAATATGTTCGTTTACGCCGGTAAGTATATTGAATTTTTACCTAAAACCGCTGGAAATGGTGCTCGTTGGGCCAACCAACATTTGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCGCTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCTGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCGGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCAGTATACTCCAACCGAAACGGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACGGGACGTAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGATGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGACAATGATACTGGTATTAAATGGGTTCGTGACGGGGTTATCGATTTAGTTGCGAATGGTATTTCTGCCGGCACTATTCTTAATAACGGTATTAACAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCCGGTTCTACCTGGGATTTTCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACCGCACGCACCGATATTGATGGTAATAATAACGGCGATGGTCAGACTCATATAGGTTATAGCAGCAATGCCAAGATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGGCTGTTGGCATGGCCGAAGGACTTATTGTTGAACCAGGAATTTTAGATATTAAAACTAGTTCAAATACATTAAGTTTGCGTGCTGATGGTACCGTCGCTTCTGTTCAAACGTTAAAGCTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGACGGCACTAAGCAAATCATGTGGGAAGGCGGTACTCGAGCAGGTCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCATCCGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGATATTATTTTTATTCACAGCGTGTGGCTCCAACCGGTTCAGAAACTGTGGGACCTGTTGTAACACAAATTAATGGACAACTGAATGCAAGAGGGAGCATTATCACCGATGGAAGTCTTAGAGTTAATGGATTAAGTACATTATCCGGACAAGTTACTATGGATAACGGGCTTGTTTTATCCGGCGGTGGTTCTATTACAGGTCAAGTTAAAATCGGTAATACCGCAGATGCTTTCCGTATTTACAATGCTGAATATGGAGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGCGTCTTTGTATATTATACCTACACTTAAAGATGCAGGTGAAAGTGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCGCTTAGTATTAGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGTCATTCTGTTACGTTAGGCGATGATGGTGCTGGTGGTAATATGATTACTGTGGACAACGATAACAAACTTGTTGTTGTTACTAGTAATAGTCGCATTTCTCCTAATTTCAGAATGCAGATAGGTCAGTCGGCGTACATTGATGCAGAATGTACTGATGCTGTTCGCCCAGCTGGAGCCGGTTCTTTTGCTTCACAAAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCTTTCTATATGAATATTGATAGAACAGATACAAGCACTTATGTTCCTATTGTGAAACAAAGATACGTTCAAAATAATAGTTGCTATTCTATTGGTACTTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCATTATCACGAAGGTGGCGATGGCGGTTCTACTGGCGCAATTATAAAGGATTTAGGTTGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTACTCTCCTGGTAAATTAGGCGCTGGTAATGTTCGTATTGGTACTGATGGTAATATCACCGGTGGTTCTGGCAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATTGTCTCAAGTTATCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTACGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGCTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCTGTGTATCCTTCCGGCTCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAACACGGATTTGGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGTAACCATAACCATACAGTGAGCGGTAATACTAGTTCCGCCGGTGCGCACCAACACGCGCGTTCAGGCCCTCAGATACAAGCCGGCATACCCAATAACATATTCTATGACGGATATAATAGTGTAGGTGCAAACGCCAACGCTAAATTCACTGGAACCGTGAATGGTGCTACTGCAGGGTCGAATATAGCCAAAACTTCTTCAGATGGTGCCCACACTCATAGTTGGTCAGGAACTACTAGCGCTACGGGTAACCATGCTCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATACGCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
a9546f62bfb58b23b32ba5184fceaf04cc24cf81a233f17971b8cce6e365de57
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2412
Evidence 0,2412
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete Genome Sequence of T4-Like Escherichia coli Bacteriophage HX01 Tang,F., Li,Y., Zhang,W. and Lu,C. 2012 23166268 GenBank