Protein

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Genbank accession
UPW39413.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,52
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQNYSNTRGYVRGFVVLYDNRLYQAINDIPSPAGNFNLGLWRAVRTDAQWITVSTGSYQLASGESISVNTAAGNDMDFTLPSSPVDGDTIVLADIGGKPGTVKVQINASVQSIVNFKGEQVRSVLMTHPKSQIVLVFSNRLWHMYLVDYGNKSTIVTPAAPYQAQANDFIIRRFTSAAPINITLPRNANNGDVINLVDLDKLNPLYHTIVKTFDDTTSIREVGTHIAEGRNFADALFIFDAASSLWRVWEGDQKSRLRIVRTDTVISPNEEILVFGANNASVSTVNLTLPTGILSGDTVKISLNYMRKGQTVKIKAASTDTIYSSVELLQFPKRSEYPPDADWVSVTELEFNGTTSYVPVIELAYIEEAGRNNYWIVQQNIPTVERVDSLNDTTRARVGVIALANQAQANVDLENSPAKEVAITPETLANRTATETRRGIAKTATTAQVNQDSTATFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGTDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTASATPAATRGTAGTNVYNKDTTTLTISPKALDQYKATSTQQGATILALESEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETDAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEALSGIAEIATQVEFDAGTDDTRISTPLKVKTHFDSSDRTGVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTQGNTQDLNLYEKNSYAISPYEFNRVLANYLPLKAKAADTELLDGLDSLQFIRRDIDQTVNGSLSLTKQLNLSAPLVSTSTGFFGGSVSANSTLTIANTDTAPRLIFEKGNQYATSSTENVSIRVFGNTFGSGADKTRATVFEVSDETSHHFYTQRNNLGNIQMNVNGGLTSVNLNATGNLTVTGTTTSTGSISSNGEIVSRSPIAFRAINGNYGFMIHNAGNSSYFVLTDSGNQSGTFNSLRPLTINNATGLVRLDNGVQITNGATITSGGLTVNSRIISSGSKTADLYTRKPTEGTVGFWSIDINDEATYTQFPGYWTRDAAGNRVQEIKYPGTLTQFGNSLNSLYQDWICYPTGANGGSIRYTRTWQRNKDAWTSFAMVFDSGNPPSPSDVGALPSDNAVIGNLTIRDFLRIGNVRIVPDPINKTVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1281 AA
molecular weight: 138363,15460 Da
isoelectric point:5,38751
aromaticity:0,07260
hydropathy:-0,30343

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–202
DC_1946 DC_1209
IPR048390
ATT
979–1093
IPR048390 IPR048391
UPW39413.1
1 1281
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-202 | STR 343-978 | ATT 979-1093 | STR 1094-1139 | ATT 1140-1229 | STR 1230-1269 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
UPW39413.1
1 1281
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 1079 1079 0,7285
Central domain 1080 1270 192 0,1862
C-terminal 1271 1281 10 0,9318
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-1079
Central
1080-1270
C-terminal
1271-1281

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_ESCO47
[NCBI] 		2918870 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UPW39413.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OM386662 [NCBI]
CDS location
range 104551 -> 108396
strand -
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGACTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTTGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTACAGAATTATAGTAATACACGCGGATACGTGCGCGGGTTTGTTGTTCTTTATGATAACCGCTTATATCAAGCAATTAATGATATTCCTTCTCCGGCAGGTAATTTCAATTTAGGTCTGTGGCGTGCAGTTCGTACAGATGCACAGTGGATAACCGTTTCTACTGGGTCATATCAATTAGCATCAGGTGAATCGATTTCTGTTAATACAGCCGCCGGGAATGACATGGACTTCACTTTGCCTAGCTCTCCTGTTGATGGTGATACAATCGTTTTAGCGGATATTGGTGGCAAACCAGGCACAGTTAAAGTGCAAATCAACGCTTCAGTTCAGAGTATTGTGAACTTTAAAGGCGAACAGGTTCGTTCGGTTTTAATGACTCACCCTAAATCTCAGATTGTTTTAGTTTTCAGCAATCGTTTATGGCACATGTATCTTGTTGATTATGGTAACAAATCTACTATAGTAACTCCAGCGGCACCTTATCAGGCGCAAGCTAATGATTTTATTATTCGTCGTTTTACCAGTGCAGCTCCTATTAATATTACATTGCCACGCAACGCTAATAACGGTGACGTAATTAATCTCGTCGATTTGGATAAATTAAACCCTTTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACGACTTCTATCCGTGAAGTTGGGACACATATCGCTGAAGGTCGTAATTTTGCTGATGCTCTTTTTATTTTTGATGCAGCATCTAGTTTGTGGAGAGTATGGGAAGGTGACCAGAAATCACGACTGCGCATTGTACGAACTGACACCGTAATTAGCCCTAACGAAGAAATTCTCGTGTTTGGTGCTAACAATGCTTCAGTATCAACTGTGAATCTTACTCTTCCTACCGGAATTTTGAGTGGAGACACTGTTAAAATTTCATTAAACTATATGCGTAAAGGTCAAACGGTTAAAATTAAAGCCGCAAGTACCGATACAATTTATAGTAGTGTAGAACTTCTTCAGTTCCCTAAACGTTCAGAATATCCACCTGATGCCGATTGGGTTTCCGTTACAGAGTTAGAATTTAATGGGACTACTTCTTATGTTCCTGTAATTGAATTAGCTTATATCGAAGAAGCCGGTAGAAACAACTATTGGATTGTTCAACAAAACATACCGACTGTAGAACGTGTTGATTCATTAAATGATACTACTCGTGCTCGTGTAGGTGTTATTGCTTTGGCTAACCAAGCACAAGCAAATGTTGATTTAGAAAATTCTCCGGCTAAAGAAGTTGCAATTACCCCAGAGACATTAGCTAATCGTACAGCGACTGAAACTCGACGTGGTATTGCAAAAACTGCTACTACCGCTCAAGTTAATCAGGATTCTACTGCAACATTTGTTGATGATACAATTGTTACACCTAAGAAATTAAATGAGCGTACAGCGACTGAAACTCGTCGCGGTTTAGCAGAAATAGCTACTCAAGCAGAGACTGATGCTGGGACCGATGATACAACTATTATCACTCCTAAGAAATTACAGGCACGTCAGGGTTCAGAAACTCTATCAGGTATAGTTAAATATGTATCGACTGCTTCAGCTACTCCTGCTGCTACTCGTGGGACTGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAGACACAACTACGTTAACTATTTCGCCTAAAGCTCTCGATCAGTATAAAGCGACTTCTACTCAACAGGGTGCTACTATTCTGGCTCTTGAAAGTGAAGTAATTGCAGGTCAATCTCAAGCTGGTTATTCTCATGCTGTTGTCACCCCCGAAACTCTGCATAAGAAAACTTCTACAGACGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAGACTGATGCTGGGACTGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAAACGTTAAATGACAGGAAAGCTACAGAAGCTTTAAGTGGTATTGCAGAGATTGCAACTCAAGTTGAATTTGATGCTGGGACTGATGATACTCGAATTTCAACTCCCTTGAAAGTTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACTGGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTCGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACTTCTGAAGGTGTAATTAAAGTCGCCACCCAAGCAGAAACAGTTACTGGTACTTCAGCTAATACCGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAATGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCGATTCGCGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATCACTTTTGTTGGTAATGATACACAAGGCAATACTCAGGATCTAAACTTATACGAGAAAAATAGTTATGCTATTTCTCCTTATGAATTTAACCGTGTGCTTGCTAACTATTTACCATTGAAAGCAAAAGCCGCTGATACTGAGTTGTTAGATGGCCTGGATTCTCTTCAGTTTATCCGTAGAGATATCGACCAGACAGTTAATGGTTCTTTAAGTCTGACTAAACAATTGAACCTGAGTGCTCCTTTAGTATCTACAAGCACCGGATTCTTTGGTGGTTCAGTATCCGCAAATAGTACATTAACTATTGCTAATACCGATACTGCTCCGCGTCTAATTTTCGAAAAGGGAAATCAGTACGCCACAAGTTCAACAGAAAACGTTTCTATTCGAGTTTTTGGTAATACGTTTGGCAGCGGTGCTGATAAAACACGAGCTACAGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACAAGCCATCATTTCTATACTCAGAGAAATAATCTTGGCAATATCCAGATGAACGTTAATGGTGGATTGACATCCGTAAACCTTAATGCAACAGGTAATTTGACTGTGACAGGTACGACCACTTCTACCGGTTCTATTTCGTCTAATGGTGAAATTGTTTCTCGATCTCCTATAGCATTTAGAGCGATTAATGGTAACTACGGCTTTATGATTCATAACGCCGGAAATAGTTCATATTTCGTTTTAACCGATTCTGGTAATCAGTCTGGGACATTTAACTCATTACGCCCATTGACTATCAATAATGCTACAGGTCTGGTTAGATTAGATAACGGTGTACAGATAACAAATGGTGCTACTATTACTTCAGGTGGTTTAACTGTAAACAGTCGAATCATTTCTAGTGGCTCTAAAACGGCTGATCTTTATACTCGTAAACCTACCGAAGGCACGGTTGGATTCTGGTCTATCGATATTAATGATGAAGCGACATATACTCAGTTCCCAGGTTATTGGACTAGGGATGCTGCAGGTAATCGTGTTCAAGAAATTAAATATCCAGGCACATTAACCCAATTCGGTAATAGTTTAAATTCTCTTTATCAAGATTGGATTTGTTATCCGACAGGAGCTAATGGCGGTAGTATACGTTACACTAGAACCTGGCAGAGAAATAAAGATGCTTGGACGTCTTTTGCTATGGTGTTTGATAGTGGTAACCCACCTTCACCGTCAGATGTCGGTGCTCTGCCTTCAGATAACGCGGTAATTGGTAACCTTACTATTCGTGACTTCTTGCGTATAGGTAATGTTAGAATTGTTCCAGATCCAATTAATAAAACCGTTAAATTCGAATGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
261654845c8adfc4895f94814461473a0730f0c904acb605aba94144d7a070ec
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5676
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Avian Pathogenic Escherichia coli bacteriophages Nicolas,M., Trotereau,A. and Schouler,C. 2015-06 — GenBank