Protein

Genbank accession
UPW39413.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,52
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQNYSNTRGYVRGFVVLYDNRLYQAINDIPSPAGNFNLGLWRAVRTDAQWITVSTGSYQLASGESISVNTAAGNDMDFTLPSSPVDGDTIVLADIGGKPGTVKVQINASVQSIVNFKGEQVRSVLMTHPKSQIVLVFSNRLWHMYLVDYGNKSTIVTPAAPYQAQANDFIIRRFTSAAPINITLPRNANNGDVINLVDLDKLNPLYHTIVKTFDDTTSIREVGTHIAEGRNFADALFIFDAASSLWRVWEGDQKSRLRIVRTDTVISPNEEILVFGANNASVSTVNLTLPTGILSGDTVKISLNYMRKGQTVKIKAASTDTIYSSVELLQFPKRSEYPPDADWVSVTELEFNGTTSYVPVIELAYIEEAGRNNYWIVQQNIPTVERVDSLNDTTRARVGVIALANQAQANVDLENSPAKEVAITPETLANRTATETRRGIAKTATTAQVNQDSTATFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGTDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTASATPAATRGTAGTNVYNKDTTTLTISPKALDQYKATSTQQGATILALESEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETDAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEALSGIAEIATQVEFDAGTDDTRISTPLKVKTHFDSSDRTGVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTQGNTQDLNLYEKNSYAISPYEFNRVLANYLPLKAKAADTELLDGLDSLQFIRRDIDQTVNGSLSLTKQLNLSAPLVSTSTGFFGGSVSANSTLTIANTDTAPRLIFEKGNQYATSSTENVSIRVFGNTFGSGADKTRATVFEVSDETSHHFYTQRNNLGNIQMNVNGGLTSVNLNATGNLTVTGTTTSTGSISSNGEIVSRSPIAFRAINGNYGFMIHNAGNSSYFVLTDSGNQSGTFNSLRPLTINNATGLVRLDNGVQITNGATITSGGLTVNSRIISSGSKTADLYTRKPTEGTVGFWSIDINDEATYTQFPGYWTRDAAGNRVQEIKYPGTLTQFGNSLNSLYQDWICYPTGANGGSIRYTRTWQRNKDAWTSFAMVFDSGNPPSPSDVGALPSDNAVIGNLTIRDFLRIGNVRIVPDPINKTVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1281 AA
molecular weight: 138363,15460 Da
isoelectric point:5,38751
aromaticity:0,07260
hydropathy:-0,30343

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1093
IPR048390 IPR048391
UPW39413.1
1 1281
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_ESCO47
[NCBI] 		2918870 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UPW39413.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OM386662 [NCBI]
CDS location
range 104551 -> 108396
strand -
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGACTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTTGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTACAGAATTATAGTAATACACGCGGATACGTGCGCGGGTTTGTTGTTCTTTATGATAACCGCTTATATCAAGCAATTAATGATATTCCTTCTCCGGCAGGTAATTTCAATTTAGGTCTGTGGCGTGCAGTTCGTACAGATGCACAGTGGATAACCGTTTCTACTGGGTCATATCAATTAGCATCAGGTGAATCGATTTCTGTTAATACAGCCGCCGGGAATGACATGGACTTCACTTTGCCTAGCTCTCCTGTTGATGGTGATACAATCGTTTTAGCGGATATTGGTGGCAAACCAGGCACAGTTAAAGTGCAAATCAACGCTTCAGTTCAGAGTATTGTGAACTTTAAAGGCGAACAGGTTCGTTCGGTTTTAATGACTCACCCTAAATCTCAGATTGTTTTAGTTTTCAGCAATCGTTTATGGCACATGTATCTTGTTGATTATGGTAACAAATCTACTATAGTAACTCCAGCGGCACCTTATCAGGCGCAAGCTAATGATTTTATTATTCGTCGTTTTACCAGTGCAGCTCCTATTAATATTACATTGCCACGCAACGCTAATAACGGTGACGTAATTAATCTCGTCGATTTGGATAAATTAAACCCTTTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACGACTTCTATCCGTGAAGTTGGGACACATATCGCTGAAGGTCGTAATTTTGCTGATGCTCTTTTTATTTTTGATGCAGCATCTAGTTTGTGGAGAGTATGGGAAGGTGACCAGAAATCACGACTGCGCATTGTACGAACTGACACCGTAATTAGCCCTAACGAAGAAATTCTCGTGTTTGGTGCTAACAATGCTTCAGTATCAACTGTGAATCTTACTCTTCCTACCGGAATTTTGAGTGGAGACACTGTTAAAATTTCATTAAACTATATGCGTAAAGGTCAAACGGTTAAAATTAAAGCCGCAAGTACCGATACAATTTATAGTAGTGTAGAACTTCTTCAGTTCCCTAAACGTTCAGAATATCCACCTGATGCCGATTGGGTTTCCGTTACAGAGTTAGAATTTAATGGGACTACTTCTTATGTTCCTGTAATTGAATTAGCTTATATCGAAGAAGCCGGTAGAAACAACTATTGGATTGTTCAACAAAACATACCGACTGTAGAACGTGTTGATTCATTAAATGATACTACTCGTGCTCGTGTAGGTGTTATTGCTTTGGCTAACCAAGCACAAGCAAATGTTGATTTAGAAAATTCTCCGGCTAAAGAAGTTGCAATTACCCCAGAGACATTAGCTAATCGTACAGCGACTGAAACTCGACGTGGTATTGCAAAAACTGCTACTACCGCTCAAGTTAATCAGGATTCTACTGCAACATTTGTTGATGATACAATTGTTACACCTAAGAAATTAAATGAGCGTACAGCGACTGAAACTCGTCGCGGTTTAGCAGAAATAGCTACTCAAGCAGAGACTGATGCTGGGACCGATGATACAACTATTATCACTCCTAAGAAATTACAGGCACGTCAGGGTTCAGAAACTCTATCAGGTATAGTTAAATATGTATCGACTGCTTCAGCTACTCCTGCTGCTACTCGTGGGACTGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAGACACAACTACGTTAACTATTTCGCCTAAAGCTCTCGATCAGTATAAAGCGACTTCTACTCAACAGGGTGCTACTATTCTGGCTCTTGAAAGTGAAGTAATTGCAGGTCAATCTCAAGCTGGTTATTCTCATGCTGTTGTCACCCCCGAAACTCTGCATAAGAAAACTTCTACAGACGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAGACTGATGCTGGGACTGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAAACGTTAAATGACAGGAAAGCTACAGAAGCTTTAAGTGGTATTGCAGAGATTGCAACTCAAGTTGAATTTGATGCTGGGACTGATGATACTCGAATTTCAACTCCCTTGAAAGTTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACTGGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTCGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACTTCTGAAGGTGTAATTAAAGTCGCCACCCAAGCAGAAACAGTTACTGGTACTTCAGCTAATACCGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAATGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCGATTCGCGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATCACTTTTGTTGGTAATGATACACAAGGCAATACTCAGGATCTAAACTTATACGAGAAAAATAGTTATGCTATTTCTCCTTATGAATTTAACCGTGTGCTTGCTAACTATTTACCATTGAAAGCAAAAGCCGCTGATACTGAGTTGTTAGATGGCCTGGATTCTCTTCAGTTTATCCGTAGAGATATCGACCAGACAGTTAATGGTTCTTTAAGTCTGACTAAACAATTGAACCTGAGTGCTCCTTTAGTATCTACAAGCACCGGATTCTTTGGTGGTTCAGTATCCGCAAATAGTACATTAACTATTGCTAATACCGATACTGCTCCGCGTCTAATTTTCGAAAAGGGAAATCAGTACGCCACAAGTTCAACAGAAAACGTTTCTATTCGAGTTTTTGGTAATACGTTTGGCAGCGGTGCTGATAAAACACGAGCTACAGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACAAGCCATCATTTCTATACTCAGAGAAATAATCTTGGCAATATCCAGATGAACGTTAATGGTGGATTGACATCCGTAAACCTTAATGCAACAGGTAATTTGACTGTGACAGGTACGACCACTTCTACCGGTTCTATTTCGTCTAATGGTGAAATTGTTTCTCGATCTCCTATAGCATTTAGAGCGATTAATGGTAACTACGGCTTTATGATTCATAACGCCGGAAATAGTTCATATTTCGTTTTAACCGATTCTGGTAATCAGTCTGGGACATTTAACTCATTACGCCCATTGACTATCAATAATGCTACAGGTCTGGTTAGATTAGATAACGGTGTACAGATAACAAATGGTGCTACTATTACTTCAGGTGGTTTAACTGTAAACAGTCGAATCATTTCTAGTGGCTCTAAAACGGCTGATCTTTATACTCGTAAACCTACCGAAGGCACGGTTGGATTCTGGTCTATCGATATTAATGATGAAGCGACATATACTCAGTTCCCAGGTTATTGGACTAGGGATGCTGCAGGTAATCGTGTTCAAGAAATTAAATATCCAGGCACATTAACCCAATTCGGTAATAGTTTAAATTCTCTTTATCAAGATTGGATTTGTTATCCGACAGGAGCTAATGGCGGTAGTATACGTTACACTAGAACCTGGCAGAGAAATAAAGATGCTTGGACGTCTTTTGCTATGGTGTTTGATAGTGGTAACCCACCTTCACCGTCAGATGTCGGTGCTCTGCCTTCAGATAACGCGGTAATTGGTAACCTTACTATTCGTGACTTCTTGCGTATAGGTAATGTTAGAATTGTTCCAGATCCAATTAATAAAACCGTTAAATTCGAATGGATTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
261654845c8adfc4895f94814461473a0730f0c904acb605aba94144d7a070ec
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5676
Evidence 0,5676
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Literature

Title Authors Date PMID Source
Avian Pathogenic Escherichia coli bacteriophages Nicolas,M., Trotereau,A. and Schouler,C. 2015-06 — GenBank