Protein
View in Explore- Genbank accession
- QZI88427.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MATKIEVTKLNALDDNLVEGQKVIEIILGPTIGADTADLALAVAQAEAAQAAAELAEDNAKASELAALASEGAAQTAQTLAEVAEGNAKASEIAAQSSEDDAQISEDAAAASEAAALASQNAAAVSAAAALASENAAQSSEDDAQVSEDNAAASEVAAAASAAAALASENAAQSSEDDAQISEDAAAASAAAALASENAAQSSEDDAKVSEDAAAASAAAALTQANRAETEADRSETEADRAQTIADSMTTALVPRGDWDASTGAFPTPTLSPERADFYQISVAGTMTTNKPAGQDDLSVEVGDQLYWNVVIDVWYSIDNTDQVTSVDGKKGVVVIDKYTQAEADARFVNAAGDTMTGALTIEESVMLVGNTAADNYMELAQVYGSSYGFTFQHNNASTMTNLQGSTNQALVLGDVSANVTDVLLGVSLKEGAGAWTKRLELDGAGELYLGSGAAYRTFHENYHPNADKWTTSRTVTLTGDATGSFAIDGSADVSVSVVVEDDSHVHTDYLSNVATDLSNIMYGNIYASDEKPLIQLVGDDAYFGSHGRVGLQLASSSNPEWKTSTAAYKLFNESYHPNADTWTTARTITLTGDATGSFTMDGSSDESVEVTVVNDSHTHDTRYLKLAGGYMAGEITGPYSWVLNRTFVMIENETPQYLLLCLNAGGNNVNGEFILNRTSGNYQSANLNVVVSSGSSVSPYGTIVSVQSTQDDEEYRLVTVDYAGDSWVAIKYVGNSYPVTDPGLFSGRIQSSKAGSLTAVGAASITNEAPLRDATKFELNGQAIFHQGYHPNADKWTTSRTVTFTGDATGSLSLDGSSNESVTMTVVDDSHNHSYVNGTFEIRHANEQLKLVDTTDGNKWWMLDHQNGDLNFRYNGVSVTPALVIHETGNYVSAPSFSATTYLNLPIENVRTCNQADIRYNPVKGFEGHDGVEWGAIGGGGGVEWEATTGTSVVSETGAGYLVTEAGVTVVLPPTPDQGNTVGVGDYNGLNFEVTINPNGGKIMGLTEDFTFDTKNANIVFSYVDTTVGWILTQGFGESEAPQAIANKVIVTDAVGQSVISIPNNGSQTVDVWYNGLKLLRNDDYIVDEDLDTVTLTDPIDLSDDIVEVYAWNQALVLDTTDLLYHGTQMRKTIEGDGISLTEAIEARAPQPNLLINGDFVINQRQFAISSDVPIDGEFFVDRWFARNAIGGTNLCYSDFRNNTGMYTRMTHTGAAVSAYIGQRIEVMDWRPFVNTTASVEVSHSQDCVMSGVIHLRRVSDDTVLSSVFSNEVIVTPGLKTVVFTMEGLDISMVGSTECYAEFRIIYNNGGSIATPDGQYRFYTAKLESGLLATPFVPDSPQESLAKCQRYFYTTRGRTKSQIFGTATVSSTNDGTFQAGVPIPVPMRINKPALTQFGSFAIYGVSSTSGTKNETVTFTDGGSGAGVGFIDIIIQSTTVPTLLRGAVTLRGLNSSSWFNVDAEL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1465 AA molecular weight: 155135,31000 Da isoelectric point: 4,25652 aromaticity: 0,07782 hydropathy: -0,17065
Domains
Domains [InterPro]
Coil
Unmapped
39–66
Unmapped
39–66
DC_1451
STR
508–734
STR
508–734
1
1465
Architecture
STR 102-181 | STR 274-687 | ATT 688-1465
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Vibrio phage 294E48.1 [NCBI] |
2859322 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Vibrio crassostreae [NCBI] |
246167 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Vibrionales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QZI88427.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW824419.1
[NCBI]
CDS location
range 78468 -> 82865
strand -
strand -
CDS
ATGGCAACAAAAATAGAAGTAACCAAGCTTAATGCCTTAGATGACAATCTAGTAGAGGGTCAGAAGGTAATTGAGATCATACTTGGTCCGACTATCGGGGCAGACACAGCAGATCTAGCCCTTGCTGTTGCGCAAGCAGAAGCAGCACAGGCAGCTGCAGAGTTAGCGGAAGATAACGCTAAGGCCTCTGAACTTGCAGCGCTAGCATCAGAAGGTGCGGCACAAACAGCACAAACACTTGCAGAAGTGGCAGAAGGCAATGCTAAGGCATCCGAAATAGCTGCACAGAGCTCAGAAGATGATGCTCAAATATCAGAAGATGCGGCAGCAGCCTCTGAAGCGGCAGCGCTTGCGTCTCAAAACGCAGCAGCAGTATCAGCAGCAGCAGCCCTTGCTTCAGAAAACGCAGCACAAAGCTCAGAAGACGATGCTCAGGTGTCAGAAGACAACGCGGCAGCCTCAGAAGTAGCGGCAGCGGCATCAGCAGCTGCGGCACTTGCGTCAGAAAACGCAGCACAGAGCTCTGAGGATGATGCACAGATCTCCGAGGATGCAGCGGCAGCCTCAGCAGCAGCAGCACTTGCATCTGAGAATGCAGCGCAAAGCTCAGAAGACGATGCTAAAGTATCAGAAGATGCAGCAGCGGCATCCGCAGCGGCAGCACTAACTCAGGCAAACCGCGCAGAGACAGAAGCAGATCGCTCAGAAACAGAAGCGGATCGTGCTCAAACCATCGCAGATTCTATGACAACAGCTCTAGTTCCTCGCGGTGACTGGGATGCATCTACAGGAGCATTCCCTACACCTACACTATCTCCTGAACGAGCAGACTTCTATCAGATCTCCGTAGCAGGTACAATGACAACTAACAAGCCCGCTGGACAGGATGATCTATCAGTTGAAGTAGGTGACCAATTATACTGGAACGTTGTAATCGACGTTTGGTACTCAATAGACAACACAGACCAAGTTACTAGCGTAGATGGTAAGAAAGGTGTTGTTGTAATTGATAAATACACACAGGCTGAAGCAGACGCTCGCTTTGTAAACGCTGCAGGCGATACGATGACTGGCGCTTTAACTATCGAAGAAAGCGTAATGTTAGTGGGAAATACCGCGGCGGATAACTACATGGAACTTGCCCAAGTTTATGGTAGCTCTTACGGGTTTACTTTCCAACATAATAACGCATCCACTATGACTAACTTGCAGGGTTCAACCAACCAAGCACTAGTTCTAGGTGATGTTAGTGCAAATGTTACAGACGTGCTATTGGGGGTGTCCCTAAAAGAAGGTGCGGGTGCATGGACTAAGCGTCTTGAACTCGACGGAGCAGGTGAATTATACCTCGGCTCTGGTGCAGCATATAGAACTTTCCATGAAAACTACCACCCTAACGCAGACAAGTGGACAACCTCTCGTACAGTAACCCTTACAGGTGATGCTACTGGTAGCTTTGCTATTGATGGATCGGCAGATGTCTCAGTCTCCGTTGTTGTTGAGGACGACAGTCACGTCCACACGGATTACTTGAGTAATGTAGCAACCGACCTAAGTAACATTATGTATGGTAACATATATGCCTCCGACGAGAAGCCCCTAATACAACTAGTCGGGGATGACGCATATTTTGGGTCTCACGGCCGAGTAGGATTGCAACTGGCATCCTCGTCAAACCCAGAGTGGAAGACTTCAACAGCCGCCTACAAACTATTTAATGAGTCCTACCACCCTAACGCAGATACTTGGACTACTGCTAGAACAATTACTCTTACTGGTGATGCTACAGGTTCATTTACTATGGACGGTTCCTCTGATGAATCGGTAGAAGTTACAGTCGTTAATGACTCCCATACCCATGATACGCGTTACTTAAAACTAGCTGGTGGGTACATGGCCGGTGAGATTACAGGGCCTTACAGCTGGGTACTAAATCGCACTTTCGTTATGATTGAGAACGAGACTCCTCAGTACCTATTGCTATGTCTCAACGCGGGAGGCAACAATGTGAACGGTGAGTTCATACTGAATAGGACGTCTGGTAATTACCAGTCTGCTAACCTTAATGTTGTAGTCTCTTCTGGTTCTTCTGTATCGCCGTACGGTACTATAGTGTCCGTGCAATCTACCCAAGATGATGAAGAGTACAGGCTAGTAACAGTGGACTATGCAGGCGATAGTTGGGTAGCTATTAAGTACGTAGGCAACTCGTATCCTGTAACAGACCCTGGTCTATTCTCAGGGCGTATACAGTCTTCTAAAGCTGGTTCACTTACTGCTGTAGGTGCCGCGAGCATAACCAATGAAGCACCCCTAAGAGACGCTACTAAGTTCGAGTTAAATGGGCAGGCTATATTCCATCAAGGATACCACCCTAATGCAGATAAGTGGACTACATCTAGAACAGTTACATTCACCGGTGATGCAACAGGCTCACTGAGTTTAGATGGCTCTTCAAACGAATCTGTTACTATGACAGTTGTAGATGACTCACATAATCACAGCTATGTTAACGGTACATTTGAGATTCGCCACGCTAATGAGCAACTTAAGTTAGTGGATACTACAGATGGTAATAAATGGTGGATGCTAGATCACCAGAATGGTGACCTTAACTTCCGCTATAACGGAGTGTCAGTAACCCCTGCCCTAGTAATACATGAAACAGGTAATTACGTTAGTGCCCCTAGCTTTAGTGCTACAACCTACTTAAACCTACCTATAGAGAATGTCCGTACTTGTAATCAGGCAGATATTCGATACAACCCAGTCAAAGGCTTCGAAGGACACGACGGAGTAGAGTGGGGAGCTATTGGTGGTGGTGGTGGTGTTGAGTGGGAAGCAACCACAGGAACATCTGTAGTTTCAGAAACTGGCGCAGGCTATTTAGTTACAGAAGCCGGAGTTACAGTTGTACTTCCACCAACCCCAGATCAAGGTAATACTGTAGGTGTAGGTGATTACAACGGTCTTAACTTCGAAGTAACTATTAACCCTAACGGTGGTAAGATCATGGGGCTTACTGAAGATTTTACCTTTGATACCAAGAACGCTAACATAGTATTCTCTTACGTAGATACAACGGTTGGTTGGATCCTTACACAAGGTTTTGGTGAATCTGAAGCGCCACAGGCTATTGCTAACAAGGTTATAGTAACAGATGCAGTCGGACAGTCCGTTATCTCTATCCCAAATAATGGATCTCAGACGGTAGATGTATGGTATAATGGTCTTAAACTCCTACGCAACGACGACTACATCGTAGATGAGGACTTAGATACTGTTACGCTAACAGACCCTATAGACTTAAGTGATGATATAGTTGAGGTATACGCTTGGAATCAGGCTCTAGTACTAGATACTACTGATTTACTGTACCACGGTACGCAGATGCGTAAAACAATCGAGGGTGACGGTATTTCTCTTACAGAAGCTATTGAAGCCCGTGCTCCGCAACCAAATCTATTGATTAATGGTGACTTTGTTATCAACCAGCGTCAGTTTGCTATAAGTAGTGATGTTCCAATTGATGGGGAGTTCTTTGTTGACCGTTGGTTCGCTCGTAACGCAATAGGCGGTACTAACCTTTGTTACTCTGATTTCCGTAATAACACAGGTATGTATACTCGTATGACTCACACAGGAGCTGCAGTTAGCGCATACATTGGTCAAAGAATTGAAGTTATGGACTGGCGTCCGTTCGTAAATACAACAGCGTCTGTGGAAGTTAGTCACTCGCAAGATTGTGTCATGAGTGGTGTTATTCATCTTCGTCGGGTTTCTGATGATACTGTCCTTTCTTCTGTATTTAGTAATGAAGTTATCGTTACACCAGGGTTAAAGACAGTAGTGTTTACTATGGAAGGTTTAGACATCTCTATGGTGGGGTCTACAGAATGTTACGCAGAGTTCCGAATCATCTATAACAACGGAGGTAGCATCGCTACACCGGATGGTCAGTATCGTTTCTATACTGCTAAGTTGGAATCTGGTTTATTAGCTACACCATTTGTTCCGGACTCTCCTCAAGAGAGCCTGGCTAAGTGTCAGCGCTACTTCTACACAACTAGGGGCAGAACAAAGTCTCAAATATTCGGAACAGCTACCGTATCCAGTACTAACGATGGCACATTCCAAGCAGGCGTACCGATTCCTGTACCTATGCGAATTAATAAACCAGCACTTACTCAGTTTGGTTCTTTCGCTATTTACGGGGTTTCTTCTACGTCAGGTACTAAGAATGAGACAGTAACCTTTACAGACGGAGGCTCTGGGGCAGGTGTAGGTTTCATTGACATCATAATACAGTCTACTACAGTGCCTACCTTGTTAAGAGGTGCGGTAACGCTTAGGGGACTTAACTCAAGTTCGTGGTTTAATGTAGACGCGGAACTGTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
b40dae311e7818cff17f263c1ddaf6a9e296988a459349f2729cf31dd1d5375a
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50