Protein
View in Explore- UniProt accession
- E3SL19 [UniProt]
- Protein name
- Baseplate wedge initiator
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MTDIKRVKISHLIESQIPEFINEESPLFKDFLEQYYISQEHQSGMVDLANNLAEYRKISAFNNESLVPSTTLTRAAFAGDSQILVTSTVGWPDTYGLLKIGNEIITYKSKTATSFDDCARGFSGIDQISKDDDAEFLQFNETDAAAHPNGSIVLNLSNLFLQTFFSKFKTEFLPGFENRNFISGTSVTNILTRAKDFYMSKGTDSSYQILFKLLYGEDIELLKPIDKTITPSANVYFKTKHILVENLFGGEPLQSIGNFLFQNVSGIGTVSASIYNVEYRPINQTDFFELSLDATSFDGTFQVPGKTKTLEIVGADSSTIVVDSTVGFGQSGSLLVRPTKGSNFVNVQYNDKTINQFLGVTGITTDLVFGADILENKLAYAYAGFGQTSLMQFRIVNVIDDADTSQSTNMQIGDNLKLLSFGKDLGQLPQFNNWIYNIPSSHNISNISQVNVNTFRINIFDSVVFYVDEVLVIRNQAGDTSLITIKDIEYDATNISKVFANTIVVQTATTIPSNPTVITKTVTKASHNSSYFPGVDDFPVGIQNSYLDKNEEFFYITSSGLPNYPIFATDNKVFVKSSPVEVVDGFGTPLLGGGFTYTLQSYDPAFTVGANTNQLLNHNYVTGDKIYWDNTTNSGINTGIYFVTAINQTDFYLSYSGSDVFAKKYIAVRTDTTGQFIYKSGWENKTLKNQKILRKYPNYKQKTLFDDKNQRQINNRAVGLLANGVELFPPTVFDEQIFHGDITEIKVTNSGKDYDVITGPPLIINDQQGSGAVGHVNVSGSFREVKLVTPGIGYQEKPKITVTGGNGTGAVLESNLVRGRIVANFKADGTSVDTFDESITFQTRHNFESGEGIIYDARGNTPIVNIVDGSTYYAGVINEKKIKLHRTPEDAKAGINTVNIGNISFGFHSLTTVSAKNTITKIYVKNSGSGYSNKKVIVQGRPTNGDVQSGISTSDDYVLAFNHKFNNGEIIEYSTDGTIASGLSTTTQYAVKVIDSNRFRLCDVGVTSQRNLVNYNKNKTTVIRGFGSGKHTFKYPPIVVNVESLSAIGSTTTIQPEFSPLVLGEIESVYLEEGGIGYGCTNIMDFHRRPDVGISTVVYQALLKPIIIDGSIVDVQILASGKGYREDSDIIIYSPTGDFADIRPVITGDKITGVRVLDGGIGYGSSDTTLDLQNRGKSAKFIANVREWKINQVQKNSAIISDEDSLLTKPSTNPAFQLQTIGIYPPQKLRFQLGDNIDSGNLETPNAFHSPILGYAYDGNPIYGPYGYQTPTGGAVRRLQSGYILDTTLRSGLRPPGFAFGYFTNDYLFDNSGDLDVHGGRYCVTPQYPDGTYAYFYSVDVDSSGVAKPKFPYLLGGSFKDTPIEENFVTFFNQDIDITERELTRNVAPYYLSYGNSDYDLIDDVKDALKQEFKVIKTKSAGISSVTIFSRGDGYKVDDLLELDNTGTDGTGANIVVGSVLGKDVESVQIGVTTFRGTELVKTKDTITGITSTPHEIANGESVILSGISTADFTEFNGVRKVSVITRTSGLAKYLDNVTNTGVSTSIFVTDVRGFAAGDIIGIGTEQMTITNIDERFSRFFVNRENYVGAAMTHTVGTNNIVLKPTKFSFPVGNSTVTRFTFENGTTFFNPQETVGVGSTGTHYDIPLTGLSTTTSQTIENRFVPQQRIYIKEHKFFTGQELNYNMGIGGTSLVWAKVSAGATSGVGTEVLVNDSKVYAINFEQDYIGLSTTGIPTTGDAIWFYNVASNSGFAHSFTTNFPKVTTKVERFFGEVGVSSAHGLLTGDVITLDALPQSAETVALRYDPVIAKVTTAKVGFTRTDFSADLTSLNIKDDDFQSGDKVVYYDNGNTIDGLINNETYFVLREDIDNIKLCKYKSDVFDSNPVAITSITTPSALNQSFIAKVNPPLEFITGNVITFDVSDQSLLDMKLDFYEDLNFNQRLDVNGTNDTGFNIIRDGITGNANATVKITTNTDWPRKTFYNLTPVVPSDSRKTYGTSDTEVTGRNNITFKNVVLKTDHEVIRKDDTTFTFNLKEKPTSPQRLISRVGVSTITYSTASKNARGPINSTKINFPGKGYTVLPRVIGFASTQGNDAIVKVSSPEIGQIDIIERIKDGFDYPTDPTLLPFLSVPAIVDISGIARMDEIQVVDGGTRYNQPPTLAVRGNDKVKIAATVKGGSVDKVDIIENAFEFSEPLSIITTNNSNGYDIDAITHSGTSVTVELLLDPQFNKPVTTGYATTDTKLPFDVGDKVFVENCRIKPASLANGEGNFNSSDYDFSFYTVTGVNTANATVTFNMGDAPGISTVTLGSYDDDFTLGSIVNFNDMAKFNMTIIDDAKFLSGEKVTSKKFEGFVSEGGWNGKISQLRLRDTIGTLNAGDTLVGEVSGLVGNVRDVNRFSVRTTLGVTRDKVTKNDMNVGILNDFSQRLSDNFYFQKFSYSIKSRLPYTTWKESVRSIVHPSGFLEFSDLIIESNSKNDAAALDLVNVGIAKSNNMKVKAVDTKVDLILNIDNEMYLGKRDNFAMVTEDDQLPNGSVQRIFFPEGRPIKSFILNKTNKVLNLDDISSGFNGAHDRTGTLVGSKQFSLSVGGEPVFKKSYNAAATANVDLALNIISIQNHNFQTGQTVILDTQGGSKIGIATTSHTTGTKDIIMAARSSGIGGSAMFENGYNVQIPGPVTGTAVTANPPGDQFRIYGFGNPDGGLPGISTRGTGARFQVKFDFDQTTGQCISTAVTLTIGGAGYFVGDNVSIAGTHLGGATPANDLTFPVTKVTGTRTGVQTSYLNVPSTNNGSGSGAVFNITRDGNLDVTDVQVVSGGTGYASTNVISIAGTYVGGSTPTDNIFLSPVELGTDVMPNELFVQKVDDVKFRISGLSTSLPFQFTGLGTGTHLLKVADPNKQALIMIDNIIQTPIKNKKLGVEVSDPVGPSDQGIAIGAGIGSLSKGDIIKMDDELVKINQIGDTTFVQARFALANSTVATDFYYDTNRVNSTVTRMDTTTATHDDNPPY
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 3007 AA molecular weight: 326949,71960 Da isoelectric point: 5,08001 aromaticity: 0,09810 hydropathy: -0,19827
Domains
Domains [InterPro]
DC_1555
ATT
5–248
ATT
5–248
IPR025924
STR
1249–1341
STR
1249–1341
1
3007
Architecture
ATT 5-248 | STR 694-884 | STR 1088-1415 | STR 2130-2547 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-SSM7 [NCBI] |
445686 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Lipsvirus > Lipsvirus ssm7 |
| Host |
Synechococcus sp. WH 8109 [NCBI] |
166314 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO98167.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071098
[NCBI]
CDS location
range 57561 -> 66584
strand +
strand +
CDS
ATGACAGATATTAAAAGAGTAAAGATATCTCATTTAATTGAGTCTCAGATTCCTGAGTTCATTAACGAAGAGTCTCCGCTGTTTAAGGACTTCTTAGAACAGTATTACATATCTCAGGAACACCAATCTGGTATGGTTGACTTGGCAAATAACCTTGCCGAGTACAGAAAGATTAGTGCGTTCAATAATGAAAGTCTAGTACCATCAACAACTCTTACTAGAGCTGCTTTTGCTGGTGACAGTCAAATATTAGTAACTTCAACAGTTGGTTGGCCAGATACTTATGGTTTGTTGAAGATTGGAAATGAAATTATAACTTACAAGAGTAAAACTGCTACATCTTTCGATGATTGTGCCAGAGGATTCAGTGGTATTGATCAAATATCAAAAGATGATGATGCAGAGTTTTTACAATTTAATGAAACGGATGCAGCTGCACATCCAAATGGATCTATAGTATTAAATTTAAGTAATCTATTCTTACAGACATTCTTTTCAAAATTCAAGACTGAATTTTTGCCTGGATTTGAAAATAGAAATTTTATTAGTGGAACATCTGTCACTAATATTCTTACTAGGGCAAAAGACTTCTATATGTCGAAGGGAACTGACTCTTCATATCAGATTCTTTTCAAACTTTTGTATGGCGAGGATATTGAACTCCTCAAACCGATTGATAAAACAATTACTCCATCTGCAAACGTATATTTCAAAACAAAACACATTTTAGTTGAGAACTTATTCGGTGGAGAACCATTACAATCTATTGGTAACTTTTTATTCCAAAATGTTTCTGGAATTGGTACTGTAAGTGCTTCTATCTACAATGTAGAGTACAGACCAATCAACCAAACCGATTTCTTTGAGTTATCATTGGATGCTACGTCATTTGATGGCACCTTCCAAGTGCCTGGTAAGACAAAAACACTTGAAATTGTTGGTGCTGATTCAAGTACCATTGTAGTTGACTCTACAGTTGGATTTGGACAGTCTGGAAGTCTTCTGGTTAGACCTACAAAGGGTTCTAACTTTGTAAACGTACAATATAACGATAAAACCATTAACCAGTTCCTAGGCGTTACTGGTATTACAACTGATTTGGTTTTTGGTGCTGATATTCTTGAAAACAAACTTGCATATGCTTATGCTGGTTTTGGTCAGACATCTTTGATGCAATTTAGAATTGTAAACGTCATTGATGATGCAGATACAAGTCAATCCACCAATATGCAAATTGGTGACAACCTAAAACTTCTTTCTTTCGGTAAAGATTTAGGGCAACTACCACAATTCAACAACTGGATCTATAATATTCCATCCAGTCACAATATTTCTAATATCAGTCAGGTAAACGTCAATACTTTCAGAATTAACATCTTTGATTCTGTTGTTTTCTACGTTGACGAAGTTTTGGTCATCAGAAACCAAGCTGGAGATACATCTCTCATTACAATCAAAGATATTGAGTATGATGCTACCAATATTTCTAAAGTTTTTGCAAATACGATTGTTGTTCAGACTGCCACAACAATTCCAAGCAATCCAACTGTAATTACAAAGACAGTTACTAAGGCATCTCATAACTCTTCATATTTCCCAGGCGTAGATGATTTCCCTGTTGGTATTCAGAATAGTTACTTAGATAAGAACGAAGAATTCTTCTATATTACTTCTTCTGGTCTACCTAACTATCCAATCTTTGCAACTGACAATAAGGTCTTTGTAAAAAGTTCCCCAGTTGAGGTTGTAGACGGTTTTGGGACACCTTTACTCGGTGGTGGGTTTACTTATACCCTCCAGTCCTATGACCCAGCGTTCACAGTCGGTGCAAACACCAATCAACTCCTAAATCACAACTATGTGACTGGTGATAAGATCTATTGGGACAATACAACCAATAGTGGCATCAACACTGGTATCTACTTTGTAACTGCCATCAACCAAACTGACTTCTACTTGTCATATAGTGGTTCTGACGTATTTGCGAAGAAATATATTGCTGTTAGAACTGATACTACTGGACAGTTCATCTATAAGTCAGGATGGGAGAACAAAACTCTTAAAAACCAGAAAATTCTTAGAAAGTATCCTAATTATAAACAGAAGACTTTATTTGACGACAAGAACCAAAGACAAATCAATAACAGAGCAGTTGGATTACTAGCAAACGGTGTTGAACTGTTTCCTCCTACTGTTTTTGACGAACAGATCTTCCATGGCGACATCACAGAGATTAAAGTCACAAATTCTGGTAAAGATTATGACGTTATCACAGGACCGCCACTCATCATTAACGATCAACAAGGATCTGGTGCTGTTGGTCATGTTAATGTGTCTGGATCCTTTAGAGAAGTTAAACTGGTTACTCCTGGCATCGGATATCAGGAAAAACCCAAGATTACTGTTACTGGTGGTAACGGAACTGGTGCCGTCCTTGAATCTAACTTGGTCAGAGGTCGTATTGTAGCTAACTTTAAGGCTGACGGTACATCTGTTGATACATTTGATGAAAGTATCACTTTCCAGACCAGACATAACTTTGAATCTGGAGAGGGTATCATTTATGATGCAAGAGGTAACACTCCTATCGTTAATATTGTTGATGGATCAACATATTACGCTGGTGTCATTAATGAGAAGAAGATTAAGTTACATAGAACACCCGAAGATGCTAAGGCTGGTATCAATACTGTAAATATCGGAAATATCAGTTTTGGTTTCCATAGTCTTACAACTGTATCTGCTAAAAATACAATTACTAAGATCTACGTTAAGAATTCTGGATCTGGTTATTCAAACAAGAAGGTTATCGTTCAAGGTAGACCTACTAACGGTGATGTGCAGTCAGGTATCAGCACATCAGACGATTATGTCCTTGCGTTTAATCATAAGTTCAATAATGGTGAGATTATTGAGTACTCAACAGATGGAACTATTGCAAGTGGCCTTTCTACAACCACACAGTATGCAGTTAAGGTAATTGACAGCAACAGATTTAGATTATGTGATGTTGGAGTCACCTCACAGAGGAATCTTGTTAATTACAACAAAAACAAGACAACTGTGATTCGTGGATTTGGTTCTGGTAAGCATACCTTTAAATATCCTCCGATTGTTGTTAATGTTGAAAGTTTATCTGCTATCGGTAGCACAACTACCATTCAACCTGAGTTTTCACCGTTAGTTCTTGGTGAAATCGAAAGTGTCTACTTAGAGGAAGGCGGTATTGGTTATGGTTGTACTAATATCATGGATTTCCATAGAAGACCTGATGTTGGTATCTCTACTGTTGTTTACCAAGCACTTCTCAAACCAATTATCATTGACGGATCGATTGTAGACGTTCAAATCCTTGCTTCTGGTAAAGGATACCGTGAAGACTCGGATATCATCATCTACAGTCCTACAGGAGACTTTGCAGACATCAGACCAGTCATTACTGGTGATAAGATTACTGGTGTAAGAGTTCTTGATGGTGGTATTGGTTATGGATCAAGCGATACTACACTTGATCTACAAAACAGAGGTAAATCTGCTAAGTTTATTGCAAATGTTCGTGAATGGAAGATTAACCAAGTTCAAAAGAACAGTGCTATCATTAGTGACGAAGATTCGCTACTCACTAAACCAAGTACGAACCCTGCCTTCCAATTACAGACAATCGGTATCTATCCTCCACAAAAACTTAGATTCCAACTTGGAGATAACATTGATTCGGGTAACTTAGAGACACCCAACGCTTTCCACTCTCCTATTCTTGGATATGCTTACGATGGCAACCCAATTTACGGTCCTTATGGATATCAGACTCCAACAGGGGGAGCTGTTAGAAGATTACAGTCAGGATACATTCTTGATACTACTCTGAGATCGGGTTTAAGACCCCCTGGCTTTGCCTTTGGGTATTTCACCAATGATTACCTCTTTGACAACTCTGGAGACCTTGACGTGCATGGTGGGCGCTATTGTGTGACTCCACAGTATCCAGATGGAACATATGCTTACTTCTACAGTGTAGATGTTGATTCCAGTGGTGTTGCTAAACCAAAATTCCCATATTTGCTTGGTGGATCATTTAAAGACACTCCTATCGAAGAAAACTTTGTAACTTTCTTCAATCAGGATATTGATATCACTGAAAGAGAACTTACAAGAAACGTAGCACCATATTATCTCTCATATGGTAATTCTGACTATGATTTGATTGATGATGTAAAAGATGCTTTAAAACAAGAGTTTAAAGTTATCAAAACAAAGAGCGCTGGTATTTCATCCGTAACTATCTTCTCTAGAGGTGATGGATACAAAGTTGATGACTTATTGGAACTCGATAATACTGGAACTGATGGAACTGGGGCAAATATTGTCGTTGGATCAGTTTTAGGTAAGGATGTTGAATCTGTACAGATTGGAGTTACCACTTTCCGTGGAACTGAGTTGGTTAAGACTAAAGATACCATTACTGGTATTACATCAACACCTCATGAGATTGCAAACGGTGAAAGTGTAATTTTAAGTGGTATCAGTACCGCTGACTTCACTGAGTTCAATGGTGTTCGTAAAGTTAGTGTTATTACAAGAACATCTGGTCTTGCTAAGTACTTAGATAACGTAACTAATACTGGTGTTAGCACTTCTATCTTCGTTACTGACGTAAGAGGATTTGCTGCTGGGGATATCATTGGTATTGGTACAGAACAGATGACCATTACCAATATTGATGAAAGATTCTCTAGATTCTTTGTAAACAGAGAAAATTACGTTGGTGCTGCAATGACTCATACAGTCGGCACTAATAACATTGTTTTAAAACCAACCAAGTTCTCTTTCCCTGTTGGCAACTCAACTGTTACTAGATTTACCTTTGAGAATGGCACTACCTTCTTTAATCCACAAGAAACAGTTGGTGTAGGTTCTACAGGAACACATTATGACATTCCTCTCACTGGATTAAGTACAACTACATCACAAACCATTGAAAACAGGTTTGTACCTCAACA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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
9b338d125d88050ec71a16e29ba97117113ed2e6d9d9c8fcd97396f47836a7a8
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50