Protein

Genbank accession
QZI80337.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,77
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKIAGQRPAASVLAEGELAINLKDKTIFTKDDSGSVIELGLKYGGTIDGSLTVNGNIIGNLTGNAATATKLKTARKINGISFDGSKDITLTPSDINVNSTTFIKNNGELPTDANLDTYGPVEEYLGVWSKATSTNAQPANKFPEENAVGVLEVFVAGQFAGTQRYTTRYGNVYIRSLTATWNGVNGPWSVWRNIQSGTRPLSTTIDLNDLGGAEHFGLWRNSSNSIATFDRNFPEEGSSAQGLLEVYEGGNYSRTQRYTTRFGVVYTRCLAAAWDASAPKWGPWQQVGNVTPATFYDGDLNDFKTPGLYNILGTDAVINCPTGEGLPTVIVGLLEVKQRASGGAIFQKFTTAGTGATTRDRIFERAYTGGAWGTWNEVYTSYSLPITLGMGGIKTQLAELDWQTFDFVPGSMFSVPLNKIKNMPANMDWGTIDGNLVMFSVGPSEHTSTGRTVQVWRGTVSQTNYRYFVVRVFGNSGNRTCTVRRVVLEDGRHTWTAQQDFNGAVNFGAPTNFNSTVNLNNTTTFKTEVKFRSSNAFRMYAGNFGTIFRTYGENLYILSTNEDDQNGNYNTNRPFRYELRTGDVTLGGTSGANVLKLERDSLAATFSGDVNLSKGTLTFEAGGKQSRDYFRFNHWGDSNNARDNIIQLEDSKGVHFSTERTLATGAIKTKFFGEIESEGRLIIKRPGDSIVLSTTAGNALHIRGDVDGSGNWYIGKGGADNSLAFYSYATQAAVHITNNGEISLNPQNIAMVNVNRDRVHINGSGWIARQPGDWGNQWRVEAPIFVDHGYVSQDCYYPILKGRSVITNQGFVTAVDLGIRRVPNNWGQAIIRVGSAEASPAAGHPNAVFEFHYDGTFYSPGNGNFNDVYIRSDGRLKINKKELENGALEKVCRLKVYIYDKVKSIKDRSVIKREVGIIAQDLEKELPEAVSKVEVDGSDVLTISNSAVNALLIKAIQEMSEEIKELKTPFFTKIARKISKYFKF
Physico‐chemical
properties
protein length:995 AA
molecular weight: 109262,86950 Da
isoelectric point:8,63543
aromaticity:0,10452
hydropathy:-0,36683

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM-CHD2BS1
[NCBI]
2865804 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QZI80337.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ234027.1 [NCBI]
CDS location
range 64268 -> 67255
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAATTGCAGGTCAACGTCCTGCAGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAAAACAATTTTCACAAAAGATGACTCAGGTAGTGTTATAGAATTAGGTTTAAAATATGGAGGAACAATTGATGGTTCTTTAACTGTTAATGGAAATATAATTGGAAATTTAACAGGTAACGCTGCAACTGCAACGAAATTAAAAACAGCACGAAAAATTAATGGTATATCCTTTGATGGGTCAAAAGATATCACGCTAACTCCATCTGACATAAATGTCAATAGCACAACATTTATAAAAAATAATGGCGAATTACCTACTGATGCTAATTTAGATACGTATGGGCCTGTTGAAGAATATCTTGGAGTTTGGTCGAAAGCAACTTCAACCAACGCTCAACCAGCAAATAAATTTCCAGAAGAAAATGCTGTAGGTGTGCTAGAAGTATTTGTGGCCGGTCAATTTGCTGGTACTCAGAGATATACAACTAGATACGGAAATGTTTATATTCGTTCCTTGACTGCTACATGGAACGGAGTAAATGGTCCGTGGAGTGTGTGGCGAAATATTCAATCCGGTACTCGTCCACTGTCAACAACAATTGATCTTAATGATCTAGGAGGCGCTGAACACTTTGGTTTGTGGCGAAATAGTTCAAATTCCATTGCTACCTTTGACAGAAATTTCCCAGAAGAGGGGTCGTCAGCTCAAGGTCTTTTGGAAGTATATGAAGGTGGAAACTATTCTCGTACACAAAGATATACAACCAGATTTGGTGTTGTATATACTCGTTGTCTTGCTGCCGCGTGGGATGCTTCCGCGCCTAAATGGGGACCGTGGCAACAAGTCGGTAATGTCACACCAGCGACTTTCTATGATGGAGATCTGAATGATTTTAAAACTCCTGGGTTATATAATATTTTAGGCACTGATGCCGTTATTAACTGTCCTACCGGTGAAGGTTTGCCGACTGTTATTGTTGGTTTGCTGGAAGTTAAACAGCGTGCTTCTGGCGGTGCTATTTTCCAAAAATTTACTACTGCCGGAACGGGTGCAACTACTCGCGATCGTATTTTTGAGCGTGCATATACCGGTGGCGCGTGGGGTACATGGAACGAAGTATATACATCTTACTCTTTGCCAATTACTTTGGGTATGGGTGGTATTAAAACTCAATTAGCGGAGCTAGATTGGCAAACCTTTGATTTTGTCCCTGGTAGTATGTTTAGTGTTCCTTTGAACAAAATAAAGAATATGCCAGCAAATATGGATTGGGGGACGATTGACGGAAACCTGGTTATGTTTTCCGTTGGTCCTAGCGAACACACTAGCACAGGGCGTACTGTTCAGGTTTGGCGCGGTACTGTATCCCAGACAAACTACCGTTATTTTGTCGTTCGTGTGTTCGGTAATTCTGGAAATAGAACTTGCACAGTCCGCCGTGTTGTTCTTGAAGATGGTCGCCACACATGGACAGCTCAACAAGATTTTAATGGCGCAGTTAACTTCGGTGCTCCTACCAATTTTAACTCTACTGTTAACCTTAATAACACTACCACTTTTAAAACAGAAGTTAAATTTCGCTCATCTAATGCATTCCGTATGTATGCCGGAAATTTTGGTACAATTTTCCGTACTTATGGAGAGAATCTTTATATTCTTTCCACCAACGAAGATGATCAAAATGGAAACTATAATACAAATAGACCTTTCCGTTATGAATTGAGAACTGGTGATGTTACTTTAGGTGGTACTAGTGGTGCTAACGTTTTAAAATTAGAACGTGATTCTCTTGCTGCTACCTTTAGCGGTGATGTTAATTTAAGTAAAGGTACGCTGACGTTTGAAGCGGGTGGTAAGCAATCACGTGATTATTTCCGGTTTAATCATTGGGGTGATAGTAATAATGCGCGCGATAACATTATTCAGTTAGAAGACAGCAAAGGCGTTCATTTTTCCACTGAACGTACTTTAGCGACTGGTGCAATTAAGACTAAATTTTTTGGTGAAATTGAATCCGAAGGTAGATTGATTATTAAACGTCCGGGTGATTCTATTGTATTATCAACAACTGCTGGTAATGCTTTGCATATTCGTGGTGACGTAGACGGGAGTGGTAACTGGTATATTGGTAAGGGTGGTGCTGATAATTCGCTAGCATTTTATAGCTATGCTACTCAGGCGGCAGTACATATCACAAACAATGGTGAGATTTCGCTAAATCCACAAAATATCGCAATGGTTAACGTTAACCGCGATCGTGTACACATTAACGGTTCTGGATGGATTGCTAGACAACCGGGTGATTGGGGCAACCAATGGCGAGTAGAAGCACCAATATTCGTCGATCATGGTTATGTTTCACAGGATTGTTATTATCCGATTCTCAAAGGAAGAAGTGTAATCACCAATCAAGGGTTTGTAACTGCCGTCGATCTTGGTATTCGTCGTGTCCCTAACAATTGGGGGCAAGCAATTATTCGTGTTGGATCTGCGGAGGCATCACCAGCGGCTGGACACCCTAACGCGGTATTTGAATTTCATTACGACGGTACTTTCTATTCTCCTGGTAATGGTAACTTTAACGATGTGTATATTCGTTCCGATGGTCGTCTTAAGATTAATAAAAAAGAGCTAGAAAACGGAGCACTTGAAAAAGTATGTCGACTGAAAGTTTATATTTACGATAAAGTTAAGTCTATTAAAGACCGTAGTGTTATTAAACGTGAAGTTGGTATTATTGCTCAGGACCTTGAAAAGGAATTACCGGAAGCTGTATCTAAAGTTGAAGTTGATGGATCTGATGTTCTGACAATTTCTAACTCTGCTGTGAATGCTCTTTTAATTAAGGCTATTCAGGAAATGAGTGAAGAAATTAAAGAATTGAAAACTCCTTTCTTTACTAAAATTGCTCGCAAAATTAGTAAATATTTTAAATTCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
200b4d788574494fb5a0727c63fa6289a32fa2036b6d337025c0ebbc9bd0a7cd
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6536
Evidence 0,6536

Literature

Title Authors Date PMID Source
Naturally bred epsilon2 phages have an improved host range and effectivity in uropathogenic E. coli over their ancestor phages Saez,D., Loose,M., Mutti,M., Visram,Z., Hitzenhammer,E., Dippel,D., Tisakova,L., Schertler,S., Wittmann,J., Corsini,L. and Wagenlehner,F. 2020-05-19 GenBank