Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_009134534.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,59
Protein sequence
MTTTQTFTSSTTYAIPSDAANVTYIIHGGKGGQGGPASTRVNTSGAAGARGQKISGTLTGVVGSTLTLTMGGNGSRCFGDSGANGGGGYWNGGRGGNNGSYDSESGWNAGGGGGGGGASAIRIGNTVLAGAGGGGGGACICYSGDTDAPGLTSSNINTSGGSNGAAGQNSGAAWNGGGGGAGGGFPGGTTGVFQAGYAYNAGNDGSGFGGAGGAGLYNPSYHRSASTLQTSSSGISFITISYDDQIVTEDFNWTTRSPQLDNIVGSQGSDPNNLWTTFLTNTNVGGNEPEGSTVIRSIEWKINFNNTGKQIFNTAVDDAADVYIDNVLQFSLNTYNTNTSLTTPNTITAGEHTIRIEHVSNGGPYGVAMDWTGYVPPAPPTVSLTATDYSTPPNNITSIYKGQSLRLTYSASIPTNGDAITANTFTANANGNVSNPIPSVGNSGVYFPAPTTTTTYTYTATNANGTSTANVTITVEDDFPVVTLTSDDADNTIISGGVPESVTLTWSATANTTISNTTMTGVTNPGTSGSVTVSPTSTTTYTFLATTATGTRTASVTITVNTRPVITLTSSTSTISAGQTVNLNWTTTGSANNIVWVSGTPAPTTGSGVINGSASVAPTNSQQYCVYASGPGGVSDAKCVSINVIQIDTSITDYDQSFSNDTTVNIPSYAINVSVDISAASGTNGGTDAGGASGPGGGGRRATFYFADYVARTFTLRLGNQGSSGFGCVAGSGAGTGGSSNVARGGNGGTSGPSGCSGGGGGGGGASGIYDSVKNGWVAIVGGGGGGGGASWNVSATGGTTGTGMNTGNVNSISNGNNGSACPTDGGGGGGGGGGATGGAGGNFGLDNNRGGAGGRGGQSAYDNSYCSFNYNSGSQNFGNGSARVRWNIGAPTIDSFTISPAPIIAGQSTRLTWTSTNSLTGSINNGVNAVTVPDSFVDVFPSDDTTYTLTVVGYGGLTDTDTVSIVVYIPPELILVLNSPSIIVNGSTNLSWSVTGDGDALYWVAGGITNTNLNSNVSLSPSVTTTYTGYVTGLGGVSPQTSIELIVYYPPTLIVDYPAVIDYGQQATIEYEGDYANTSVTLSATYNYDFVANTTDPITNLNVASSAEFGSNSSYGGVYNTNIVYNDRGPLSVTYVITATGNGGSTSEEFTVLINIDKTPDNMDIDETSDLFKDQDPVYTPETEVLSDMYYVDDIEIQVEVKSNLPILVDLNANQQWTKLRQIGTAPAVQGNSVGGNSMPTKPGVYYIKPRSLQTEAPLIAKSNLSAVEAAKLITCLSVIDETNNSYYNNQGNLNNVWQQNPPVIGGAVNDRRGFRTAFPYRTFYLLDPQGSGQSGIDVPTNFPGDPNAFGPIRVNRDEGNVGSRSDWFSICNFGSLPYGTIVSIWIDVSGSMRLSTVQASYDYFLTRCAAAGIEIVLSLSAAGERYIEGHIVYLPPSANFTAVDADGNTSNIEVISGSSVTLSWIVFGDVNTLSITPGVLNITPSFNDFVDSAVVNPTSDTTYILNANGPAGTTTRQITISVLIPPTISITSSQGASIINGNCTTLSWSISGDGNSVSWTQGGISNTNANSSAVVCPNDTTTYCAVASGPGGVSPETCIEITVYQNPTAGITAPGVIDYSVNFTIEYESQYANTSIQITPTYTYLNGTVVTGTTINRTAATSAEINGGASGTVSDTRANGTGVPITVPWNNFGPYQIDFVIVAAGTGGTAEDTARTIVNIDQTPDNFIVDETDDKLKDQDPVYTPETEILSEMYQINDIDIPVEIKADYPIKVDINKNDDWEDVRQI
Physico‐chemical
properties
protein length:1789 AA
molecular weight: 182995,82070 Da
isoelectric point:4,12284
aromaticity:0,08161
hydropathy:-0,17267

Domains

Domains [InterPro]
DC_2069
STR
106–552
DC_2069 DC_2069 DC_2069
G3DSA:2.60.120.260
STR
291–376
G3DSA:2.60.120.260 DC_2069 DC_2069
YP_009134534.1
1 1789
Architecture
STR
STR
STR 106-751 | STR 778-1789
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014e
[NCBI] 		1493510 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Chalconvirus > Chalconvirus acg2014e
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009134534.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_026928 [NCBI]
CDS location
range 35331 -> 40700
strand +
CDS
ATGACAACTACTCAAACGTTTACTTCTAGCACTACATATGCTATTCCTTCGGATGCTGCTAATGTTACATATATTATTCATGGTGGTAAAGGTGGTCAGGGTGGTCCTGCCAGCACTCGTGTCAATACTAGTGGCGCTGCTGGTGCTAGAGGACAAAAAATATCTGGAACTTTAACTGGAGTTGTAGGTTCAACACTCACCTTAACGATGGGTGGCAATGGATCTAGATGTTTTGGAGATTCTGGCGCTAATGGTGGTGGTGGATATTGGAATGGTGGACGTGGTGGTAATAATGGTTCCTACGATAGTGAGAGTGGATGGAATGCTGGTGGAGGTGGCGGCGGTGGCGGTGCTTCTGCTATTCGTATTGGTAATACTGTATTAGCTGGTGCTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGCGTGTATTTGTTATAGTGGTGATACTGATGCTCCTGGACTAACATCTTCTAATATTAACACTAGTGGCGGATCTAATGGTGCTGCTGGACAGAATTCTGGTGCTGCATGGAATGGCGGCGGTGGTGGCGCTGGCGGGGGATTTCCTGGTGGCACGACGGGGGTTTTTCAAGCTGGATATGCCTACAACGCTGGTAATGATGGTAGCGGATTTGGTGGTGCTGGCGGTGCTGGATTGTACAATCCTTCATATCATCGTAGTGCTTCTACTCTACAAACTTCTAGTTCTGGTATTTCTTTTATTACAATTTCTTATGATGATCAAATTGTTACAGAAGATTTTAATTGGACCACTAGATCTCCCCAACTTGATAATATTGTAGGAAGTCAGGGGTCTGATCCAAATAACTTATGGACTACTTTTTTAACTAATACTAACGTGGGTGGTAATGAACCTGAAGGTAGTACTGTTATTAGATCAATTGAATGGAAAATTAATTTTAATAATACTGGAAAACAAATATTTAATACAGCTGTAGATGATGCTGCTGATGTATACATTGATAACGTACTTCAATTTTCACTCAACACTTATAATACTAACACTTCTTTAACTACACCAAACACAATTACTGCTGGTGAACATACTATACGGATTGAACATGTTAGTAATGGTGGACCATATGGTGTTGCAATGGATTGGACTGGATATGTACCTCCTGCACCACCAACAGTAAGTCTAACTGCAACTGATTATAGCACTCCACCAAATAATATTACTAGCATTTATAAAGGTCAAAGTCTGAGGCTTACATACTCTGCTTCTATCCCTACTAATGGCGATGCTATCACTGCTAATACCTTTACTGCTAATGCCAATGGAAATGTAAGTAATCCTATTCCTAGTGTGGGAAATAGTGGCGTATATTTTCCTGCCCCTACAACCACAACAACTTATACGTATACAGCAACTAATGCCAATGGGACATCTACCGCAAATGTAACAATTACAGTCGAAGATGATTTCCCAGTAGTAACTCTTACTTCGGATGATGCTGATAATACAATTATTTCTGGTGGAGTTCCTGAATCTGTAACACTTACGTGGTCTGCTACTGCAAATACTACTATTAGTAATACTACAATGACTGGTGTTACTAATCCTGGCACATCTGGCAGCGTAACAGTAAGTCCCACATCCACAACAACTTATACATTTTTAGCAACAACTGCTACTGGAACACGTACAGCAAGTGTAACTATTACCGTTAATACTAGACCAGTAATTACATTAACCTCAAGTACATCAACAATATCAGCAGGACAAACTGTTAATTTAAACTGGACTACAACTGGAAGTGCAAATAATATAGTTTGGGTTTCTGGCACACCTGCTCCTACAACTGGAAGTGGAGTTATTAACGGATCTGCATCGGTTGCTCCTACAAACTCACAGCAATATTGTGTTTATGCTTCTGGACCTGGTGGAGTTAGTGATGCTAAATGTGTTTCAATAAATGTTATACAGATAGACACTAGCATAACTGATTATGATCAATCATTTTCTAACGATACTACTGTTAATATTCCTTCTTATGCCATTAATGTTAGTGTAGATATCTCAGCTGCAAGTGGTACAAATGGAGGTACTGATGCTGGTGGTGCTTCTGGTCCTGGTGGCGGTGGAAGAAGGGCGACATTCTATTTTGCTGATTATGTTGCGAGGACATTTACTTTAAGATTGGGCAATCAAGGATCATCTGGATTTGGATGTGTTGCTGGTAGTGGAGCCGGAACAGGAGGAAGTTCTAATGTAGCTCGTGGAGGAAACGGTGGCACTTCTGGTCCTTCTGGATGCTCCGGTGGTGGTGGAGGTGGTGGAGGTGCCAGCGGCATTTACGACTCCGTTAAAAATGGTTGGGTTGCTATTGTAGGTGGCGGCGGTGGCGGTGGCGGTGCTTCATGGAATGTTAGTGCTACCGGTGGCACTACGGGAACAGGAATGAACACTGGAAATGTAAACAGTATTAGTAATGGTAATAACGGTTCTGCGTGCCCTACTGACGGCGGAGGCGGCGGTGGCGGCGGAGGTGGAGCTACTGGTGGCGCTGGAGGAAATTTTGGACTTGACAATAATAGAGGAGGTGCTGGTGGTCGTGGTGGACAATCTGCTTATGATAATAGTTATTGTAGTTTTAATTACAACTCTGGATCACAAAATTTTGGTAATGGATCTGCTAGAGTAAGATGGAATATAGGTGCGCCAACTATTGATAGTTTTACTATTAGTCCCGCACCTATTATTGCAGGGCAAAGCACAAGATTAACATGGACATCTACAAATTCTCTTACTGGTAGTATTAATAATGGTGTTAATGCAGTTACTGTTCCCGATAGTTTTGTCGATGTTTTCCCTAGTGATGACACAACATATACATTAACTGTTGTTGGTTATGGTGGTTTGACCGATACTGATACGGTATCTATTGTAGTCTACATCCCACCCGAACTTATTCTCGTTTTAAATAGTCCATCTATTATTGTTAATGGAAGTACAAATCTTTCTTGGAGTGTCACTGGAGATGGTGATGCTTTATATTGGGTTGCTGGTGGTATCACGAATACAAATTTAAACAGTAATGTATCTCTTAGTCCATCTGTTACTACAACTTATACTGGATATGTTACTGGTCTTGGTGGTGTTTCTCCACAAACATCTATAGAATTAATTGTATACTACCCTCCAACTTTAATTGTAGATTATCCTGCAGTAATTGATTACGGTCAGCAAGCAACAATTGAATATGAAGGAGATTATGCAAATACATCAGTAACATTGTCTGCTACTTACAATTATGATTTTGTTGCTAATACCACTGATCCTATTACAAATTTAAATGTAGCATCTTCTGCTGAATTTGGATCAAATTCTTCTTATGGTGGAGTTTATAATACAAATATTGTTTATAATGATAGAGGACCACTTAGTGTAACTTATGTTATTACTGCTACTGGTAATGGTGGATCAACGAGCGAAGAGTTTACAGTTTTAATTAATATTGACAAAACACCAGATAATATGGACATTGATGAGACTAGTGATCTATTTAAAGATCAAGATCCTGTCTATACACCAGAAACAGAAGTATTATCTGATATGTATTATGTTGATGATATTGAAATTCAGGTAGAAGTTAAATCAAATCTTCCTATACTAGTTGATTTAAATGCAAATCAACAATGGACTAAACTAAGACAAATTGGTACAGCACCAGCAGTTCAGGGAAATTCTGTAGGTGGCAATTCAATGCCAACAAAACCAGGAGTGTATTATATCAAACCAAGGTCTTTACAAACTGAAGCACCTCTAATTGCAAAATCTAACCTATCAGCGGTTGAAGCAGCAAAACTTATTACATGTCTTTCTGTTATTGATGAAACAAATAATAGTTATTATAATAATCAAGGCAATTTAAATAATGTGTGGCAGCAGAACCCGCCAGTTATTGGTGGCGCTGTAAATGATCGTAGAGGATTCAGAACAGCATTTCCATATAGAACATTTTATCTTTTGGATCCACAAGGTTCGGGACAGAGTGGTATTGACGTACCTACTAACTTCCCAGGTGATCCAAATGCATTTGGACCAATTCGTGTCAATCGTGATGAAGGAAATGTTGGTAGTAGATCTGATTGGTTTAGTATCTGTAATTTTGGTTCTCTGCCATATGGAACGATTGTTTCTATCTGGATTGATGTTTCTGGTTCAATGAGACTCTCCACAGTTCAAGCATCATATGATTATTTCTTGACACGTTGTGCTGCTGCTGGTATTGAGATTGTATTGAGTCTTAGTGCTGCTGGCGAAAGATATATTGAGGGTCATATTGTATATCTTCCCCCTAGTGCTAACTTTACAGCAGTAGATGCTGATGGAAATACCTCAAATATTGAAGTTATTTCAGGATCTTCTGTCACATTGAGTTGGATTGTATTTGGTGATGTCAACACTTTATCTATTACACCGGGAGTATTGAATATTACACCTTCTTTTAATGATTTTGTAGATTCTGCAGTAGTTAATCCTACATCAGATACAACATATATTTTAAATGCAAACGGTCCCGCTGGAACAACCACGAGACAAATTACTATCTCTGTATTAATTCCTCCTACTATTTCTATTACATCTAGTCAAGGAGCATCAATTATTAATGGCAATTGTACAACTCTTTCTTGGAGCATAAGTGGTGATGGAAATAGTGTTTCATGGACACAAGGGGGCATTTCAAATACAAATGCTAATAGTTCTGCTGTTGTGTGTCCTAATGACACCACAACATATTGCGCTGTTGCTAGTGGACCTGGTGGCGTCTCTCCAGAAACTTGTATTGAGATCACTGTATACCAAAACCCAACTGCTGGCATTACTGCTCCGGGAGTCATAGATTATAGTGTTAACTTCACTATTGAATATGAATCACAATATGCAAATACTAGTATTCAGATAACTCCAACATATACATATCTGAATGGAACTGTTGTAACAGGAACAACAATCAATAGAACTGCTGCAACTAGTGCAGAAATTAATGGTGGTGCTAGTGGAACTGTTAGTGATACTAGAGCAAATGGTACAGGTGTTCCAATTACAGTTCCTTGGAATAATTTTGGACCATATCAAATTGATTTTGTTATAGTAGCTGCAGGAACTGGTGGAACTGCTGAAGACACTGCGAGAACAATAGTCAATATAGATCAAACACCAGATAATTTTATTGTCGATGAAACTGATGATAAGTTAAAAGATCAAGATCCTGTCTATACACCAGAAACAGAAATTTTATCCGAGATGTATCAGATTAATGATATTGACATTCCTGTAGAAATTAAGGCAGATTACCCAATTAAGGTTGATATTAACAAGAATGATGATTGGGAGGACGTTAGACAAATCTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1eeeae0e60cd5e577fb172a05a5c7b084f9cd423aa8ca6085570a31762ed73a4
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7486
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank