Protein

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UniProt accession
H8ZMD6 [UniProt]
Protein name
Structural protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
Protein sequence
MAKTGILGQSKPAATTNTLLYNAYVDSSASAALTISNDGTGAAYRVALKRYDQKFTLDASTYIFHPGDVVTNQVFTLDTPLPSGALTPGDTLTSDDAEKFALFDSVVIPDSTTIFVKSLGIKPVTLEGVTGTISIGDTLTAGTAPDTAIANVFDVYVVGSDTVVWIDTEVLSGTAGNFAEGDPLSAASGGSGTIKTGGLGTLENHFIFSTTTSGGTYSAYIQSSDYFEVFDDRTYRFDVADSSMTGLLFQLSDTAGGEFGPDGDFTATADNGTEYTAGKTVNGTAGQAGAYVQYALDGTTLSGTFFYYDGNTGTAANSSYGGTDATGNQRGIDITADVTFEQIRVYNVTGTWVNNIDLFELDGQSYTIEAQNSGKWGYVRDYYGTTLEVIRGLNSDKFVGTDQIGDSPKEAATRNFATISSVVVDRDATPDETYIVQDKTLAANTQDKLTSLVIGPGDELIVYSATENNTFNLVGFEDANTEITLTQFTG
Physico‐chemical
properties
protein length:490 AA
molecular weight: 51622,66370 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,10408
hydropathy:-0,14102

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-MbCM6
[NCBI] 		3126011 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Namakavirus > Namakavirus smbcm6
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFD02647.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JN371768 [NCBI]
CDS location
range 23377 -> 24849
strand +
CDS
ATGGCAAAAACAGGAATTTTAGGACAATCGAAACCCGCTGCAACGACAAATACGTTGTTGTATAATGCATATGTTGATTCATCTGCAAGTGCAGCATTAACAATTTCTAATGATGGCACTGGTGCAGCATATAGAGTTGCTCTAAAGAGATATGATCAAAAGTTTACTTTAGATGCAAGCACCTATATTTTTCATCCAGGTGATGTGGTAACTAATCAAGTCTTTACGTTAGATACCCCACTTCCATCAGGTGCATTAACTCCTGGAGACACATTGACCTCTGATGATGCAGAAAAATTTGCACTATTTGATTCTGTTGTTATTCCCGATTCTACTACAATCTTTGTAAAATCTCTGGGTATTAAACCTGTGACTCTAGAAGGTGTCACGGGAACAATCAGTATTGGCGATACTTTAACCGCAGGCACAGCACCAGACACTGCTATTGCTAATGTATTCGATGTTTATGTGGTTGGTAGTGATACTGTTGTTTGGATTGACACAGAAGTCTTAAGTGGCACCGCAGGAAACTTTGCAGAAGGTGATCCTTTATCTGCCGCTTCTGGTGGATCTGGCACAATTAAGACAGGTGGTCTTGGCACTTTAGAAAATCATTTCATCTTCTCTACTACAACCTCTGGTGGCACATATAGTGCATATATCCAATCTTCAGATTATTTTGAAGTTTTTGATGATAGGACTTACAGATTTGATGTTGCTGATAGCAGCATGACAGGTCTTCTTTTCCAACTATCTGATACTGCTGGTGGTGAGTTTGGTCCTGATGGGGATTTTACTGCTACTGCTGATAATGGCACAGAATATACTGCTGGTAAAACTGTTAATGGCACCGCAGGGCAAGCGGGTGCTTATGTGCAATATGCACTCGACGGCACAACACTTAGCGGCACATTCTTTTATTATGATGGTAATACTGGTACTGCAGCAAACTCTTCATATGGTGGCACTGATGCTACTGGAAACCAAAGGGGAATTGATATTACTGCGGATGTAACATTTGAGCAAATTCGTGTTTATAATGTTACTGGCACTTGGGTAAATAATATTGATCTCTTTGAATTAGATGGTCAATCTTATACCATTGAAGCACAAAACTCTGGTAAGTGGGGATATGTCAGAGATTATTATGGCACAACATTAGAAGTGATTCGTGGTTTGAATTCCGATAAATTTGTTGGTACTGATCAAATTGGGGATTCTCCTAAAGAAGCAGCGACAAGAAACTTTGCAACTATTAGCAGTGTTGTTGTTGATAGAGATGCAACACCTGATGAAACTTATATTGTGCAAGATAAAACTCTTGCTGCTAATACTCAAGATAAACTTACATCTCTTGTTATTGGTCCTGGAGATGAGTTAATTGTTTACAGTGCAACTGAGAATAACACATTCAACCTTGTTGGTTTTGAAGATGCCAACACTGAGATTACTCTCACCCAATTTACGGGTTAA
Genbank protein accession
AIX22584.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019063 [NCBI]
CDS location
range 23375 -> 24847
strand +
CDS
ATGGCAAAAACAGGAATTTTAGGACAATCGAAACCCGCTGCAACGACAAATACGTTGTTGTATAATGCATATGTTGATTCATCTGCAAGTGCAGCATTAACAATTTCTAATGATGGCACTGGTGCAGCATATAGAGTTGCTCTAAAGAGATATGATCAAAAGTTTACTTTAGATGCAAGCACCTATATTTTTCATCCAGGTGATGTGGTAACTAATCAAGTCTTTACGTTAGATACCCCACTTCCATCAGGTGCATTAACTCCTGGAGACACATTGACCTCTGATGATGCAGAAAAATTTGCACTATTTGATTCTGTTGTTATTCCCGATTCTACTACAATCTTTGTAAAATCTCTGGGTATTAAACCTGTGACTCTAGAAGGTGTCACGGGAACAATCAGTATTGGCGATACTTTAACCGCAGGCACAGCACCAGACACTGCTATTGCTAATGTATTCGATGTTTATGTGGTTGGTAGTGATACTGTTGTTTGGATTGACACAGAAGTCTTAAGTGGCACCGCAGGAAACTTTGCAGAAGGTGATCCTTTATCTGCCGCTTCTGGTGGATCTGGCACAATTAAGACAGGTGGTCTTGGCACTTTAGAAAATCATTTCATCTTCTCTACTACAACCTCTGGTGGCACATATAGTGCATATATCCAATCTTCAGATTATTTTGAAGTTTTTGATGATAGGACTTATAGATTTGATGTTGCTGATAGCAGCATGACAGGTCTTCTTTTCCAACTATCTGATACTGCTGGTGGTGAGTTTGGTCCTGATGGGGATTTTACTGCTACTGCTGATAATGGCACAGAATATACTGCTGGTAAAACTGTTAATGGCACCGCAGGGCAAGCGGGTGCTTATGTGCAATATGCACTCGACGGCACAACACTTAGCGGCACATTCTTTTATTATGATGGTAATACTGGTACTGCAGCAAACTCTTCATATGGTGGCACTGATGCTACTGGAAACCAAAGAGGAATTGATATTACTGCGGATGTAACATTTGAGCAAATTCGTGTTTATAATGTTACTGGCACTTGGGTAAATAATATTGATCTCTTTGAATTAGATGGTCAATCTTATACCATTGAAGCACAAAACTCTGGTAAGTGGGGATATGTCAGAGATTATTATGGCACAACATTAGAAGTGATTCGTGGTTTGAATTCCGATAAATTTGTTGGTACTGATCAAATTGGGGATTCTCCTAAAGAAGCAGCGACAAGAAACTTTGCAACTATTAGCAGTGTTGTTGTTGATAGAGATGCAACACCTGATGAAACTTATATTGTGCAAGATAAAACTCTTGCTGCTAATACTCAAGATAAACTTACATCTCTTGTTATTGGTCCTGGAGATGAGTTAATTGTTTACAGTGCAACTGAGAATAACACATTCAACCTTGTTGGTTTTGAAGATGCCAACACTGAGATTACTCTCACCCAATTTACGGGTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
c1d16082adb85b4b39baa0fc6fa5b5c4ce6ee9d44253846bb0f002a30fd252f0
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5196
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50