Protein
- Genbank accession
- QLA10723.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MADLTAIQFLRTATAGKLPTAAQLHEGALAINLADRTIYTKNAAGQIIDLGFGKGGSVNGSIDATGTVKAGKLETALADLATANITTLNVTNLNNTGLTNIANSLNIYGIFGDSNKRLTLTSVPGQTVPMNIRSEKDGSANNLVFEIGAAKLATMKLFDSPSSGYTGRFDINSYLYVDAPSQFNNTLYSRQSSVDYSIDALSPHVYSGSGDVNGLNYLLKTRAHTGSYIFHLLADGRAATLEGLALYHGDGPQHRMVTFGANYTSFANSISVGFSGVSSLGPASIALGASGTGFVLSNDAVHTMAGGASMANVSSGGVLTVLRSINTLGTGLAVNTSMIKANTDVDGNAIGDGVTHIGYKDAGGNIAHYFRGKAATNIDTHAGLIVNYDLLVKRNASISGVLNASTLTGSGSSTSYKGLTIENISAGWSYIELKALNAVAHIALKTEAADGAVANSLHLRPNGMPNGSLVIQPAGQMIHLNQYGSVSIGALNGQHAHFNTDRPQFYFYKDIVSGGNFFAEGGQKVFHQGFLPTAVQIGAVPSKGRIVYNYNSFLETGIYGVGGVGTNGPDNSMGYGSLIVATNLDVGLQILGGHNNDRLLFRGWTAYGGSWTPWCEVYHTGFKPTPNDIGAYTKAEVNSIAAGSASRPNDLGLMDLNVLYTPGIYYQGSNANTSLDRGYPVLLAGSLIVTQGAGQQQRYHVYNTNTIYTRSRYTGAWTDWVLQYNAQNKPTAADVGAISTTNGGISYGQIGGTGNSDLYTGAGIETRSSGAASPSIGFHKPGSYAGTLRMLNSTTFGFLNQDNSSYADLTVRNLTAVTQITGNGVYGSTAVGGGRLYAGYDSGIAGAISCSEWFRSSGNSGWASDTYGGGIWMQDSVWVRVYGDKKFYVSNASPDAIHTAGGVAANGSISSQSNITAVGDLSTQRNVGCTGDVYARSFYGNANIGGTGSAINCPGGIYSQGTNWLYGQIITNNNPINAGSGVITGNGSGLTGLTSGQVGLGNVPNTVHTTAANANTVVVRDGSGRVNAAGFSGNGSALTGLSWSNIVGRPADTTQWYTVHNSPGSGTQTIALPSAMVNHLVAGQMVKIRVWFNRSNSQRSERRMREMIIDGADGWAGVQWDVWIDVGWPGVSYCYVRNNVTNDVNLRNKISSQYSNITRFEYQLL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1165 AA molecular weight: 121989,00370 Da isoelectric point: 8,01331 aromaticity: 0,09013 hydropathy: -0,11785
Domains
Domains [InterPro]
cd19958
549–618
549–618
1
1165
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Shewanella phage Thanatos-2 [NCBI] |
2734809 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QLA10723.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT457553.1
[NCBI]
CDS location
range 122560 -> 126057
strand -
strand -
CDS
ATGGCAGATTTAACGGCTATTCAGTTCTTACGAACTGCAACAGCAGGAAAGTTACCCACCGCAGCTCAGTTGCATGAAGGTGCTTTGGCTATTAACTTAGCAGACAGGACAATTTATACAAAAAATGCTGCAGGCCAAATCATTGATTTAGGTTTCGGTAAAGGTGGATCAGTAAATGGAAGTATTGATGCCACAGGCACGGTAAAGGCTGGAAAATTAGAAACAGCTTTAGCTGATTTGGCTACAGCGAATATTACTACTTTAAATGTAACCAATTTAAACAATACAGGCCTTACAAACATTGCTAATAGTTTAAACATTTACGGTATATTTGGGGATAGTAATAAGAGACTGACATTGACTTCTGTCCCGGGTCAAACAGTTCCTATGAATATACGCTCAGAAAAAGATGGCTCAGCCAATAATCTTGTTTTTGAAATAGGGGCGGCTAAATTAGCAACAATGAAATTGTTCGACAGCCCTTCTTCAGGATATACAGGCAGATTCGATATTAATTCATATTTGTATGTTGATGCCCCGAGCCAATTTAATAATACACTATATTCTAGGCAATCTTCAGTAGATTATTCTATAGATGCTTTATCGCCACATGTTTATTCCGGCTCAGGAGATGTAAATGGATTAAACTATCTTCTTAAAACTAGGGCCCATACAGGTTCATACATTTTCCATCTTCTTGCTGATGGCCGAGCTGCAACATTAGAAGGACTAGCATTATACCATGGTGACGGCCCGCAACATAGAATGGTCACCTTCGGTGCAAACTATACCAGTTTTGCTAATAGTATTTCTGTAGGATTTAGCGGAGTAAGTTCATTAGGCCCGGCATCAATTGCTTTAGGTGCAAGTGGCACTGGATTTGTATTATCTAATGATGCGGTCCATACTATGGCCGGTGGCGCAAGTATGGCTAATGTTAGCTCTGGAGGGGTGTTAACTGTCCTAAGAAGTATTAATACATTAGGCACAGGATTGGCAGTAAATACTTCCATGATTAAGGCAAATACTGATGTTGATGGTAATGCTATTGGTGATGGTGTTACACATATTGGATATAAAGATGCTGGTGGTAATATTGCCCACTATTTCCGCGGCAAAGCAGCTACAAATATAGACACCCACGCAGGGTTAATAGTAAATTATGATTTATTGGTAAAACGTAATGCTAGTATTTCGGGTGTTTTAAATGCTAGTACTTTAACTGGTTCAGGAAGTTCTACTAGTTATAAAGGTTTAACAATAGAAAATATTAGTGCAGGTTGGTCATATATAGAGCTCAAAGCATTAAATGCCGTAGCTCATATTGCACTTAAAACAGAAGCAGCTGATGGTGCTGTGGCTAATAGTTTACATCTAAGACCTAACGGTATGCCGAACGGGTCTTTGGTTATTCAGCCTGCAGGCCAAATGATCCATCTGAACCAATATGGTAGTGTAAGTATTGGTGCATTAAATGGACAGCATGCACATTTTAATACAGACAGACCACAATTTTATTTCTATAAAGATATTGTAAGTGGTGGAAATTTCTTTGCCGAAGGCGGGCAAAAAGTATTTCACCAAGGATTTTTGCCAACAGCAGTACAAATAGGAGCTGTCCCTTCAAAAGGAAGAATAGTATATAATTATAATTCATTCTTAGAAACAGGTATATATGGGGTTGGGGGTGTAGGCACAAACGGTCCTGATAATTCTATGGGATATGGTTCGCTAATTGTAGCGACTAATCTGGACGTAGGATTACAAATACTTGGTGGTCATAATAACGATAGATTATTATTTAGAGGATGGACTGCTTATGGTGGCTCTTGGACCCCATGGTGTGAAGTATATCATACAGGCTTTAAACCTACACCAAATGATATTGGTGCATATACTAAAGCTGAAGTAAATTCTATAGCGGCTGGTTCTGCATCTAGGCCTAATGATTTAGGATTAATGGATTTAAATGTATTATATACCCCAGGAATATATTACCAAGGTTCTAATGCTAATACATCACTAGATAGAGGTTATCCTGTATTATTAGCCGGGTCTTTAATTGTCACACAAGGAGCAGGCCAACAACAAAGATACCATGTCTATAATACTAATACTATATACACAAGATCAAGATATACTGGTGCTTGGACTGATTGGGTGTTACAATATAATGCCCAGAATAAACCTACTGCTGCGGATGTAGGAGCTATATCTACAACTAATGGCGGCATTTCTTATGGTCAAATTGGTGGTACAGGCAATAGTGACCTATATACAGGAGCAGGTATTGAGACCCGTAGCTCAGGTGCTGCTTCGCCATCTATTGGATTCCATAAACCTGGATCTTATGCTGGCACTTTAAGGATGCTTAACTCTACTACATTTGGATTCTTGAACCAAGATAACAGTTCATATGCTGATCTAACTGTTAGAAATTTGACTGCAGTAACACAAATAACAGGTAATGGAGTGTACGGCTCCACTGCTGTTGGAGGTGGTCGTTTGTATGCTGGCTATGACTCTGGTATTGCAGGTGCTATATCATGCTCCGAATGGTTTAGAAGTTCAGGTAATAGTGGTTGGGCTAGTGATACCTATGGTGGTGGTATCTGGATGCAAGATAGTGTCTGGGTCAGGGTGTACGGTGACAAGAAATTCTATGTTTCTAATGCAAGCCCAGACGCAATCCATACTGCAGGCGGAGTTGCAGCAAATGGGTCTATATCCTCACAATCTAATATAACAGCCGTTGGAGATCTTTCTACCCAACGCAACGTAGGTTGTACTGGTGATGTGTACGCCAGAAGTTTCTATGGTAATGCTAATATAGGTGGTACTGGTAGTGCTATCAATTGCCCGGGCGGTATTTATAGCCAAGGTACTAATTGGTTATATGGTCAGATTATCACTAATAATAACCCTATTAATGCTGGTTCTGGTGTTATTACAGGTAATGGATCTGGGCTGACTGGCTTAACTTCCGGCCAAGTTGGTTTGGGTAATGTTCCTAACACAGTGCATACAACAGCGGCTAACGCTAATACTGTTGTTGTTCGTGATGGTTCTGGGCGGGTTAACGCTGCTGGGTTCAGTGGTAATGGTTCTGCGCTGACTGGCTTATCATGGAGCAATATCGTTGGTCGTCCGGCAGATACAACCCAATGGTATACTGTGCATAATAGTCCTGGTTCAGGAACTCAAACTATTGCTTTACCATCTGCAATGGTTAACCATTTAGTTGCAGGTCAAATGGTTAAAATTCGTGTTTGGTTTAACCGCAGTAACTCACAACGTTCTGAACGTAGAATGCGTGAAATGATTATTGATGGTGCAGACGGTTGGGCTGGTGTACAATGGGATGTATGGATCGATGTAGGTTGGCCTGGCGTATCGTACTGTTATGTTAGAAACAATGTGACTAATGACGTTAATTTACGAAACAAAATCAGTTCACAGTATAGCAACATCACACGGTTCGAGTATCAACTGCTATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
6bbf1ade6a969021c7ba7264876b241034cef65834b5cf77588199fa31a6c0a9
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Isolation and characterization of phage Thanatos infecting and lysing Shewanella oneidensis and promoting nascent biofilm formation | Kreienbaum,M., Doerrich,A.K., Brandt,D., Leonhard,T., Hager,F., Brenzinger,S., Hahn,J., Ruwe,M., Briegel,A., Kalinowski,J. and Thormann,K.M. | 2020-09-18 | — | GenBank |