Protein

Genbank accession
XAL80169.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAITKIILQQMVTMDQNSITASKYPKYTVVLSNSISSITAGELTTAIESSKASAAAAKQSEINAKQSELNAKDSENEAEISATSSQQSATQSASSATASANSAKAAKTSETNAKASETAAKTSETNAKASETAAKTSETNANSSKTAAAASASAAKTSETNAAASASAAKTSETNANSSKTAAANSASAAKTSETNAKTSETNAAASATKAESVASGMRDSIGLGNSARDCPDISGNPSAYIGFMRIREGVPGWPSIADGEAYLTGVISVNDGSPSYTGIFQGWGTRSLYTYRWASNLGPQWTRHARKDEVNRLVQIPNDQTRLYAGNGTTYVEVGNNRAWGVYDSVLGKWKPLGIAQGGTGGITDTEARTNLRLGVNDSPQFANLNLVRSSDVATTAGGILQSILSDTSGTQRTRCRFYSELRGDDKAWGTIHLQKGDKNQYAGLNEDGDFSLNSGDFIGRRVKLSANFSYPVEITSAHPTIRFNETDRPANTPYYSFVFDGGNWRIQKDGYDGTKSSNAISYNYARDEIEIPNLKINAIATPVNLTQTKTNLQIPFTGLARWTDYTAPAGAEPKKYYPVIISHPLYYNGDFLVEVAMRTKSITGNEEPNCNAIHLWVRDAGWSDMGAAVFGHYFCYAKNENAILCVRGTDKGQYPHNAIYVRGDAFPIRLATTVGCIVTIPTSDWKPSTAADSPTYKWGISNSGEGIDLDTYGISNNLLDFTASATGFYCSDTYRNKYGDPYQVISANGTIQPANGVATYLDQDWNTQLTDGVNKFKPIAGQVNSPENGIVYAGFHTSFSERYATQLAGRNSRFWVRSIEAGENKEWLKLITATLAPKIPTDARDGFISDNAGDTSWAPSNGGGFQASYAENRIMQSWIDSAGRLYSRFLTTNQPTTSKTDVPWKSAAMLELDNRFTGNNTFIGDILCSASNPLTLKSANPTLSFVESDVDNSTYMFVADGGGFRLNRDNTGGAEIFNYSRSQNNLKFGVSSYFSLNTRFDQGWTSRGSVDVTTSGYSGIAIITTASTDSVGARNQFEVAPDNSFYLARRNRSNITGQWIINFPTAGGTLALSGTSDINYKTNIEEYDGIHSIENIKAMDLVTFVFKDDEKKRTRRGVIAQQIEQIDPTYVKHTYEPCGEPIVDDDGVVQGYTDTKERVVLDNNVLLLDALCAIKVLAQRDEEKTERINKLEKDVEDLKTVVEHLLTTMKNS
Physico‐chemical
properties
protein length:1214 AA
molecular weight: 131305,32110 Da
isoelectric point:5,57456
aromaticity:0,08814
hydropathy:-0,47175

Domains

Domains [InterPro]
Coil
57–77
Coil IPR030392 Coil
IPR030392
1078–1190
IPR030392
XAL80169.1
1 1214
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage SCF
[NCBI] 		3143147 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XAL80169.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP735124.1 [NCBI]
CDS location
range 20464 -> 24108
strand +
CDS
ATGGCTATAACTAAAATAATCTTACAACAAATGGTCACTATGGACCAGAATAGCATAACTGCAAGCAAATATCCTAAGTATACAGTTGTGCTTTCTAATTCTATTAGCTCTATTACGGCAGGAGAACTAACTACTGCTATAGAATCCTCTAAAGCTTCTGCTGCAGCAGCTAAACAATCAGAGATTAATGCTAAACAGTCGGAACTAAACGCTAAAGACTCGGAGAATGAAGCGGAAATTTCCGCAACATCTTCCCAGCAGTCTGCAACTCAGTCTGCTTCTTCTGCTACTGCTTCTGCTAATAGTGCTAAAGCTGCTAAAACTTCTGAAACTAACGCAAAAGCTAGCGAGACAGCTGCAAAAACTTCAGAAACTAACGCAAAAGCTAGTGAAACCGCAGCTAAAACTTCTGAGACTAATGCTAATAGTAGCAAAACTGCTGCGGCTGCTTCTGCATCAGCTGCTAAAACTTCAGAAACTAATGCTGCAGCATCTGCTTCTGCGGCCAAAACCTCTGAAACTAACGCTAATAGTAGTAAAACTGCTGCTGCTAACAGTGCTAGTGCTGCTAAAACCTCAGAAACTAATGCTAAAACCTCAGAAACTAATGCGGCTGCTTCTGCTACTAAAGCTGAAAGTGTAGCTTCTGGTATGCGTGATTCCATAGGCCTGGGTAATTCAGCTCGTGATTGTCCAGATATTTCTGGTAATCCTTCTGCGTACATTGGTTTTATGCGTATTCGTGAAGGTGTACCTGGGTGGCCTTCTATTGCTGATGGAGAGGCATATTTAACTGGTGTTATTTCTGTTAATGATGGGTCTCCTTCCTACACTGGTATTTTTCAAGGGTGGGGTACTCGCTCATTATACACTTATCGTTGGGCAAGCAATCTAGGCCCTCAATGGACACGTCATGCTCGTAAAGATGAGGTAAATAGACTTGTACAGATACCAAATGATCAGACTAGATTATATGCCGGTAATGGTACTACGTACGTAGAGGTAGGAAATAATAGAGCTTGGGGTGTATATGACTCTGTGCTAGGTAAGTGGAAACCTCTTGGTATAGCTCAAGGAGGTACTGGTGGAATTACGGATACAGAGGCACGTACCAACCTGAGATTAGGAGTAAATGATAGCCCCCAGTTTGCAAATCTTAATCTTGTAAGATCTTCAGATGTAGCAACTACGGCAGGGGGTATTCTACAAAGCATCCTCAGTGATACGTCAGGGACGCAGAGGACACGCTGCCGCTTTTACTCAGAATTACGTGGTGACGATAAAGCATGGGGAACGATTCATCTTCAAAAAGGTGACAAAAATCAATATGCTGGATTAAACGAGGATGGAGACTTCTCTCTAAATAGTGGTGATTTTATTGGTAGAAGAGTAAAATTAAGTGCCAATTTTAGCTATCCAGTAGAAATAACAAGTGCTCATCCTACGATCAGATTCAACGAAACTGATCGTCCAGCAAACACACCTTACTACAGTTTTGTTTTTGATGGCGGTAATTGGCGTATCCAGAAAGACGGTTATGACGGTACAAAAAGTAGTAATGCTATTAGCTATAACTATGCAAGAGATGAAATAGAAATTCCAAATCTCAAGATTAATGCTATTGCCACCCCCGTAAACCTTACACAGACAAAAACAAACCTGCAAATACCATTTACTGGCTTAGCTCGTTGGACAGATTATACAGCTCCTGCTGGCGCAGAACCTAAAAAATACTATCCTGTAATTATAAGCCATCCATTATACTACAATGGTGATTTCCTTGTTGAAGTTGCTATGAGAACAAAATCTATAACTGGAAATGAGGAACCTAACTGTAACGCTATTCATTTATGGGTGAGAGATGCTGGATGGTCTGACATGGGTGCAGCAGTATTTGGTCACTATTTCTGCTATGCTAAAAACGAAAATGCTATCCTATGTGTTCGAGGTACTGATAAGGGTCAGTATCCTCATAATGCAATTTATGTTCGCGGAGACGCTTTTCCTATTAGGCTTGCTACAACTGTTGGTTGCATCGTAACCATACCTACGTCTGACTGGAAGCCTTCAACTGCAGCAGATAGTCCTACATACAAATGGGGTATCTCAAACTCAGGAGAGGGTATTGATCTTGATACCTACGGCATCAGTAATAATTTGCTTGATTTTACAGCAAGTGCGACGGGATTTTACTGCTCTGATACATATCGTAATAAGTATGGAGATCCTTACCAAGTAATATCAGCAAATGGCACTATCCAGCCAGCTAATGGAGTTGCAACATACTTAGACCAAGATTGGAACACTCAGCTTACAGATGGAGTAAATAAGTTTAAACCTATTGCTGGACAAGTAAACTCACCGGAAAATGGAATTGTTTATGCCGGTTTTCACACCAGTTTTAGTGAAAGATATGCTACTCAACTTGCAGGACGTAATTCCAGATTCTGGGTAAGAAGTATTGAAGCTGGGGAAAATAAAGAATGGTTAAAACTTATTACTGCTACATTAGCTCCTAAAATTCCTACAGATGCACGAGATGGTTTCATCAGTGATAACGCAGGAGATACCTCTTGGGCTCCTAGCAATGGTGGGGGTTTTCAGGCTAGTTATGCCGAAAACCGCATTATGCAGAGCTGGATTGATAGTGCTGGAAGATTATACAGCAGATTTCTAACAACTAATCAGCCTACAACTTCGAAAACGGATGTTCCCTGGAAAAGTGCTGCGATGCTAGAGCTGGATAACCGCTTTACTGGTAATAATACTTTTATTGGGGATATTTTATGTAGCGCTTCAAACCCACTTACTCTTAAGTCTGCAAATCCTACGTTATCCTTTGTGGAGTCCGACGTAGATAACTCCACATACATGTTTGTAGCAGATGGTGGTGGTTTTAGGCTTAATAGGGATAATACTGGAGGTGCGGAAATATTTAACTACAGCCGTTCCCAGAATAACCTTAAATTTGGAGTAAGTTCTTATTTTTCTCTAAACACTAGATTTGATCAGGGATGGACATCTAGAGGTTCTGTAGATGTAACTACTTCAGGGTATAGTGGCATTGCTATTATTACAACAGCCTCAACTGATAGTGTTGGTGCACGTAACCAATTTGAGGTTGCACCAGACAATAGTTTTTACTTAGCTCGACGTAATAGAAGTAACATTACTGGACAATGGATCATAAACTTCCCTACTGCTGGAGGTACTCTAGCACTTAGTGGTACATCGGATATTAACTACAAGACTAATATAGAAGAATATGACGGTATTCATTCCATAGAAAATATTAAGGCTATGGATCTTGTTACTTTTGTATTTAAGGATGATGAGAAAAAACGTACTCGCAGAGGGGTTATTGCTCAGCAGATTGAGCAGATAGATCCTACATACGTTAAACATACGTATGAACCATGTGGGGAACCCATTGTTGATGATGATGGGGTTGTTCAAGGGTATACTGATACGAAGGAAAGGGTTGTTCTAGATAATAATGTTCTTTTATTAGATGCGCTATGCGCTATAAAAGTATTAGCACAACGGGATGAGGAGAAAACCGAACGTATTAATAAACTTGAAAAAGATGTGGAAGATTTGAAAACTGTAGTAGAGCATCTATTGACTACTATGAAAAATAGTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
92368ee640917856f7527443499f213d6a730b7b851d4726671adefa2fbfbcf4
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5787
Evidence 0,5787
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Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization of a lytic phage that eliminates Salmonella Enteritidis from contaminated fresh produce Dapuliga,C.C. and Schmidt,S. 2020-12 — GenBank