Protein

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Genbank accession
AYD85523.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,89
Protein sequence
MDNLDNGLELLSGRLVVLFLTYDLALKASANFPAGTKVKVTNDPNPDLNGEYTWDGTKLVKTTNNTLEKAKEEAEKIVNDKIDNTLTKDKILDLISGEITESDLDQNLRQRIDEIESISPIIDKLKKDVKKSKEEVDEKVFFLNVDYQNLKEEVQNIQLQVDLDFQAIQDRIDQIQAEVDAKWLEVDQIRDDLTKEINDRVAAVREETEQRIEDVRKLNDGLTQEIIDRKDGDQKLYENIENYKVSNDDALANVREEVRVAVDTANASAEKVDSMDARVKVAEDNAGTALENSAAAVSKANAASDLASATAGRVDSMQADVVKALDDSGTALTNSATAIEQSQVAVDKANAAAESVTVLESKLNSKNATYRQDTAPTKDTHPNLTEGDLWINPSANNEQKRWNGTDWVDISDVRVGQNATAISELKTSVKEQDDKITAVSEKVTSLEATIGDMATSEALEQLKGTVTEQGDKIDANTEKLVALETTVGKNQEANAKALQDLTTRIEKDEDDIKANTSAITALDSTVNASLNAINITADMNLENDLIYYNSSSQNVVKSISESGTTRRVLTIGDNSSDDMAWMYPKAMLPYDPDVMYKVRAKLRRLSGDGAVYLGLVVKNSDKTQFVTSNNILSDNVSSSSYFADGVIPPLNEWVEYEWYIKGRASSSALLPPTYGGLGNPIQMQNATGYITPVFIANYSGLSGVVELAYMVLERAEAYKVISANANALTSLKTDVQKNTDGIQAMGEAITNVEASITNMDIGGQNHWTIWPIEPTQSDADNPYLSVQWLTESQEWIRTTLTKDVNSYHHSFDGLLIDLSYPIVIGELYTLTFEMRASKAITIAATTINFGTNVTYTDNSLTTDTEWKTYTITFPTKGTLTSKANQAFGLTLLKGHGWTTNDWYELRRIQMQKGNKATRYQKAQAGLVEGIKANSQAFNGLKATVEQQGEDIKSQGQAITGLKQEIADKASSQALSELKSTVEQQGESIRINTEAITSLKGVVDGKADADALNSLKITVQEQGETLLTQGQAITSVRATADLALNGKKTLIDLTALDPNLYYPVFIPVSTTGISEIEISPKLGDFQAPWSTHYSGSYSLGVRWTTRGHGWGAEAIDRVIEKFGYLWADQSPAMEINQRGEDSKEYIYLRGGTIYPFVTNQFADTPYLESNPVGVAFDQSKVPQSVNARVGANASAISSLDSKINIVGDKVDVNAQAITGLQAEIKDKASSEALNQLSVTVRDQGQLIDTQGQAITKVESKVDNLKVGTGNLLRNSSFSESLDQWAWNGQVESADFIAEYGIPSGQSKYLKMRVSTGGSGYYQGVPFVKQGEEVIFSIWARGETGNEVLRLLWEGHEAFADHQLTTSWARYTLKTKPVINAPNVVIYTVNAGTFHISSAQYERGNIVSDWHPNSEDMASARAVSLLNTKIDNVDNKVNIQAQAITDLRSDLNNKANAQALNELSTTVQEQGETIQSQGKVLTSVEATANRTSSQLGTTVSYMLYTFRNGASSITKTGLYKADGTRLEGVSRGLNVYLFAANGDFVSLRFFDTYGDIDNACNNMVAYLSDLPQNSFIAIAGCDNLGAVSWPSGPPKALRDHLRDVWGVAQSSVDKWQYNDIPIVICRKWGPKNSAIDKLYTSSINGDWYSLGITFIDGIPNDWGGDTSKTNIEANASAISTMNADVIKNRDDIRVNAEAITGLSGRIDGKADAQALSQLQITVKEQGETISSQGQAITQVQASADMALNGKKYVVDLTALDPNLYYPVFIPVSSGSGISEISVTASLDEYKAPWSSHGSGTYSLNVRWRVRGSGWGANSIEREILRFGYAWCGDQSPVIEISQQGEQSREYIYLRGGTQYPFYVNQYAGQPFTDLGNYGGVPYRTDLMPVTINAATQANASAVSTLNAKVDIVDGKATSAAESVTKLQTSSTAATYQLLRDSNKIREKPVGSNPYPFYSAVYDKALVVGKTYTLVYEAEFQSGGANSFFRPYFSGTQHFSETNQSFGRQVFVVKAQLWAQNTDAINFYIVGSQPDQDNSYAKVYWACLYEEDQPNPIKVWMPNTRENSAKLEVQGQSIDGLMTKWSVKADVNGYVSGVAMNNNGREANFIIRADTFAIAPPVGSGGGDVPKYGFVYQASAKTLPNGTVIPAGLYVDNLMLGEINAEKINANSLSAISANLGTFTSSNAKGTMTISGTDISVKDTNGVERIFIGL
Physico‐chemical
properties
protein length:2211 AA
molecular weight: 241312,59750 Da
isoelectric point:4,77308
aromaticity:0,07734
hydropathy:-0,37440

Domains

Domains [InterPro]
DC_0308
STR
22–958
DC_0308 DC_0338 DC_1746 IPR039477 DC_0338
Coil
Unmapped
60–84
Coil Coil Coil PTHR34491 DC_0839
IPR008979
STR
800–878
IPR008979 G3DSA:2.60.120.260
G3DSA:2.60.120.260
STR
800–922
G3DSA:2.60.120.260
AYD85523.1
1 2211
Architecture
STR
STR
STR
STR
STR
STR 22-958 | STR 964-1158 | STR 1164-1527 | STR 1529-1582 | STR 1601-2210 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage vB_AbaM_B09_Aci01-1
[NCBI] 		2315466 Uroviricota > Caudoviricetes > Saclayvirus >
Host Acinetobacter baumannii
[NCBI] 		470 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Moraxellales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AYD85523.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH800198 [NCBI]
CDS location
range 19035 -> 25670
strand +
CDS
ATGGATAATTTAGACAACGGTTTAGAGTTATTATCAGGTAGATTAGTAGTCTTATTTTTAACTTATGATTTGGCTTTGAAAGCTTCTGCTAATTTTCCAGCTGGAACCAAAGTCAAAGTAACCAATGACCCAAACCCTGATTTAAATGGTGAATACACTTGGGATGGAACAAAGTTAGTAAAAACTACAAATAACACACTTGAGAAGGCTAAAGAGGAAGCTGAAAAGATTGTCAATGACAAAATAGACAATACTTTAACTAAAGATAAGATTTTAGACCTTATCTCTGGTGAAATTACAGAAAGTGACTTAGATCAAAACTTAAGACAACGTATAGATGAGATTGAAAGTATTTCACCGATCATCGATAAGTTGAAGAAAGATGTGAAAAAATCTAAGGAAGAGGTGGATGAAAAAGTTTTCTTCTTAAATGTTGATTATCAGAATTTGAAAGAAGAAGTTCAGAATATCCAACTCCAAGTAGATTTAGATTTCCAAGCGATTCAAGATCGTATTGATCAGATTCAAGCTGAAGTTGACGCTAAATGGCTTGAAGTTGACCAAATTAGAGATGATTTAACAAAAGAAATTAATGATCGTGTTGCTGCTGTCCGTGAGGAAACAGAACAACGTATCGAAGATGTAAGAAAATTAAATGATGGTTTAACTCAAGAGATCATTGATCGTAAAGATGGTGATCAGAAGTTATATGAAAACATCGAAAACTATAAAGTGTCAAATGATGATGCTCTTGCTAACGTAAGAGAGGAAGTCAGAGTTGCCGTAGATACTGCCAATGCTTCTGCTGAAAAAGTAGATTCTATGGATGCCAGAGTTAAGGTTGCAGAGGACAATGCTGGAACTGCTTTAGAAAACTCTGCTGCTGCTGTTAGTAAAGCCAATGCTGCTTCTGATTTAGCTAGTGCAACTGCTGGTCGTGTCGATAGTATGCAAGCTGATGTAGTCAAAGCTCTTGACGACTCTGGTACAGCTCTTACAAACTCTGCTACAGCTATTGAGCAATCACAGGTTGCTGTTGATAAAGCTAATGCTGCTGCTGAGTCTGTTACTGTACTTGAATCGAAGCTTAACAGCAAGAATGCTACATACAGACAAGATACTGCACCAACAAAAGACACACACCCAAATTTAACTGAAGGTGATCTATGGATTAACCCTTCGGCTAACAATGAACAAAAACGCTGGAATGGTACTGACTGGGTTGACATCTCAGATGTTCGTGTAGGTCAGAATGCTACAGCTATCTCAGAGTTGAAAACCTCTGTAAAAGAGCAAGATGATAAAATCACTGCCGTTTCTGAGAAAGTAACGAGCCTTGAGGCAACGATAGGTGATATGGCTACCTCAGAGGCCCTTGAACAATTAAAGGGTACTGTAACTGAACAGGGTGACAAAATCGATGCCAATACAGAAAAGCTTGTAGCTCTTGAGACAACTGTAGGGAAGAATCAAGAAGCAAATGCTAAGGCTCTTCAAGATTTAACTACTCGAATCGAGAAAGATGAAGATGATATTAAGGCAAACACCTCAGCTATCACAGCATTGGATTCAACAGTAAATGCATCATTGAATGCAATCAACATCACAGCTGATATGAACCTTGAAAATGACTTGATATACTACAATAGTTCATCACAAAATGTTGTTAAGTCAATCTCTGAATCAGGTACAACAAGAAGGGTTTTAACTATTGGAGACAATAGTAGTGATGATATGGCTTGGATGTATCCAAAAGCCATGTTACCTTATGATCCAGATGTTATGTACAAGGTAAGAGCTAAATTAAGACGCTTATCTGGAGATGGTGCTGTTTACCTTGGATTAGTTGTTAAGAATAGTGATAAAACCCAATTTGTTACTTCTAACAACATATTATCAGATAATGTTTCTAGTTCATCTTATTTTGCTGATGGAGTCATTCCTCCATTAAATGAGTGGGTTGAATATGAGTGGTATATTAAAGGTAGAGCTTCTTCTAGCGCTCTTCTTCCACCTACATACGGTGGCTTAGGAAACCCTATCCAAATGCAGAACGCTACTGGATACATCACCCCTGTTTTTATTGCTAACTATTCAGGCTTATCTGGTGTTGTTGAACTTGCTTATATGGTATTAGAGAGAGCTGAAGCATACAAAGTTATTTCAGCAAATGCTAATGCGCTGACAAGTCTTAAAACAGATGTCCAGAAAAATACTGATGGCATTCAAGCAATGGGTGAGGCTATCACTAATGTTGAAGCTTCTATCACAAATATGGATATTGGTGGACAAAACCATTGGACTATTTGGCCTATTGAACCAACACAATCTGATGCTGATAATCCTTACCTTTCTGTACAATGGTTAACCGAGAGTCAGGAATGGATTAGGACTACACTCACAAAGGATGTAAATTCTTACCATCACTCTTTTGATGGTTTGCTGATTGATCTGAGCTATCCTATCGTTATTGGTGAGTTATACACACTGACATTTGAGATGAGAGCTTCTAAGGCAATCACTATTGCAGCTACCACAATCAACTTTGGTACTAATGTCACTTATACAGATAATAGCTTAACAACTGATACTGAATGGAAGACATACACAATCACATTCCCAACGAAAGGGACATTGACATCTAAGGCCAATCAAGCATTTGGTTTAACATTGCTTAAAGGTCATGGATGGACTACAAATGATTGGTATGAATTAAGACGTATCCAAATGCAAAAGGGTAACAAAGCTACTCGATACCAAAAAGCTCAAGCTGGACTGGTTGAAGGAATCAAAGCTAACTCTCAGGCATTTAATGGCTTAAAAGCTACTGTTGAACAGCAAGGTGAGGATATCAAGTCTCAAGGTCAAGCTATCACAGGGCTTAAGCAAGAAATTGCTGACAAAGCAAGTTCTCAAGCATTGTCAGAATTAAAGTCTACTGTCGAACAGCAAGGTGAGAGTATTCGTATTAATACCGAAGCAATTACATCATTAAAAGGTGTAGTTGATGGTAAAGCCGATGCAGATGCCTTGAATAGTTTAAAAATCACAGTTCAAGAGCAAGGTGAAACACTTTTAACTCAAGGTCAGGCGATTACTTCTGTTAGGGCGACAGCCGATCTTGCACTGAATGGTAAGAAAACTTTAATTGACTTAACAGCACTTGACCCTAATCTTTACTACCCCGTATTTATTCCTGTAAGTACAACAGGTATCTCAGAGATTGAGATTTCCCCAAAACTTGGAGATTTTCAAGCTCCTTGGTCCACACACTACAGTGGCTCATATTCACTTGGTGTTCGATGGACAACTCGTGGACATGGGTGGGGTGCAGAGGCAATTGATAGGGTTATTGAAAAATTTGGATATCTTTGGGCAGATCAGTCTCCAGCAATGGAAATTAACCAACGTGGTGAGGATTCGAAAGAATACATCTACTTACGTGGTGGTACAATTTACCCATTCGTGACAAACCAATTTGCTGATACTCCATATTTAGAAAGTAATCCTGTAGGTGTCGCTTTTGATCAAAGTAAAGTTCCACAATCAGTTAATGCTAGAGTAGGTGCAAATGCATCGGCTATTAGTAGTCTTGATTCTAAGATTAATATCGTAGGAGATAAGGTTGATGTTAATGCACAAGCTATCACAGGGTTACAAGCTGAGATAAAGGACAAAGCAAGTTCAGAAGCTTTAAATCAACTATCTGTAACAGTTAGAGATCAAGGTCAATTAATTGATACACAAGGTCAGGCGATTACAAAGGTTGAGTCTAAAGTTGATAATTTGAAGGTTGGTACAGGAAACTTACTTAGAAACTCATCTTTCTCTGAAAGTTTAGATCAATGGGCTTGGAATGGACAAGTTGAATCAGCTGATTTTATTGCAGAGTATGGTATTCCCTCTGGACAATCTAAGTACTTGAAAATGAGAGTTTCTACTGGAGGTTCTGGCTACTACCAAGGTGTTCCATTTGTCAAGCAAGGAGAAGAGGTTATCTTTTCTATTTGGGCAAGGGGTGAAACAGGTAATGAAGTTCTTAGACTACTTTGGGAAGGTCATGAAGCGTTTGCTGACCACCAACTTACAACAAGTTGGGCTAGGTATACGTTAAAGACTAAACCTGTAATCAATGCACCAAACGTTGTTATCTACACTGTTAATGCTGGTACTTTCCATATTTCAAGTGCTCAATATGAGCGAGGGAATATTGTTTCTGATTGGCACCCAAACAGTGAAGATATGGCATCGGCTAGAGCCGTTTCTCTGTTAAATACTAAGATTGATAATGTTGACAATAAAGTTAACATTCAAGCTCAAGCCATCACAGACTTGAGGTCTGACCTTAACAATAAGGCAAATGCTCAAGCTCTTAATGAGCTTAGCACCACAGTCCAAGAGCAAGGTGAGACGATTCAATCTCAAGGCAAAGTCTTGACATCTGTTGAGGCTACAGCGAATAGGACCTCAAGTCAACTTGGAACTACTGTTTCTTACATGCTATACACATTTAGGAATGGTGCTTCGTCAATTACCAAAACTGGTTTATACAAAGCTGATGGAACACGACTGGAAGGTGTTTCTCGTGGACTCAACGTCTATTTGTTTGCTGCTAATGGTGATTTTGTAAGTTTGAGATTCTTCGATACCTATGGTGATATAGATAATGCATGTAACAATATGGTTGCCTACTTATCTGACTTACCTCAGAACTCATTTATTGCAATTGCAGGGTGTGATAACCTTGGGGCAGTAAGCTGGCCTTCAGGTCCTCCAAAAGCATTAAGAGATCACCTTAGAGACGTATGGGGTGTTGCACAAAGCTCAGTAGATAAATGGCAATATAACGATATTCCAATAGTTATTTGTCGTAAATGGGGTCCTAAAAACTCTGCTATTGACAAGCTGTATACATCTAGTATTAATGGAGACTGGTACTCTTTGGGTATTACCTTCATTGATGGCATCCCTAATGATTGGGGTGGAGACACGTCAAAGACTAACATTGAAGCTAATGCTTCAGCCATCTCTACTATGAATGCCGATGTTATTAAAAACAGAGACGATATTAGAGTTAACGCTGAAGCAATTACAGGGTTGAGTGGTAGGATTGATGGTAAAGCAGATGCTCAAGCTTTAAGTCAATTACAAATCACAGTAAAAGAACAAGGTGAAACTATCTCATCTCAAGGTCAAGCTATCACTCAAGTTCAAGCCTCTGCTGACATGGCATTGAATGGTAAAAAATACGTCGTAGACTTAACTGCTCTTGACCCTAACCTTTACTATCCAGTGTTCATTCCAGTCTCATCTGGTAGTGGTATTTCAGAGATTTCGGTCACAGCTTCATTGGATGAATACAAAGCACCTTGGTCATCACATGGTTCAGGTACTTACTCACTAAACGTTAGGTGGAGAGTTAGAGGTAGTGGTTGGGGAGCAAACTCAATAGAAAGGGAAATCCTAAGATTTGGTTATGCTTGGTGTGGTGATCAGTCACCTGTAATCGAGATTAGCCAACAAGGAGAACAATCACGAGAGTATATTTACTTACGTGGTGGTACACAATACCCATTCTACGTTAACCAGTATGCTGGACAGCCATTCACTGACTTAGGAAATTATGGTGGTGTCCCATACCGTACTGACTTGATGCCAGTTACTATCAATGCTGCAACACAAGCTAATGCTTCTGCTGTTAGTACGTTGAACGCTAAGGTTGACATTGTAGATGGTAAAGCGACAAGTGCTGCTGAATCTGTTACTAAGCTTCAAACATCAAGTACAGCTGCAACATACCAGTTGTTAAGAGACTCGAATAAGATTAGGGAAAAGCCTGTAGGTTCTAACCCATATCCATTCTACTCAGCTGTATACGATAAAGCATTGGTTGTTGGTAAAACATACACCTTAGTTTATGAAGCAGAGTTCCAGTCAGGTGGTGCAAACAGTTTCTTTAGGCCATACTTCTCTGGAACTCAACATTTCAGTGAAACTAACCAAAGCTTTGGAAGACAGGTGTTCGTCGTGAAAGCTCAACTTTGGGCACAGAACACAGATGCAATTAACTTCTACATCGTTGGTAGTCAACCTGATCAAGACAACTCTTATGCGAAAGTATATTGGGCTTGTTTATATGAGGAAGATCAACCAAACCCAATTAAGGTGTGGATGCCTAACACCAGAGAGAACTCAGCTAAGCTTGAAGTTCAAGGCCAAAGTATTGATGGTTTGATGACTAAATGGTCTGTCAAAGCTGATGTGAATGGTTATGTCTCTGGTGTAGCAATGAACAACAATGGTAGAGAAGCTAACTTCATTATCAGAGCTGATACATTTGCTATTGCACCTCCTGTTGGTTCTGGCGGTGGTGATGTTCCTAAGTATGGGTTCGTATATCAAGCTAGTGCGAAGACATTACCTAACGGTACTGTTATTCCAGCTGGATTGTATGTTGACAACTTAATGCTTGGAGAGATTAACGCTGAGAAGATTAATGCTAATAGCTTAAGTGCTATCAGTGCTAACTTAGGTACATTCACAAGTTCAAACGCTAAAGGTACTATGACAATCTCTGGTACTGATATCTCAGTCAAGGATACAAATGGGGTTGAGCGTATTTTCATTGGATTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0ada1c71b2e17cbba219923d3b004820690e934e84d3962126162a0cf5f47525
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6188
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of five Acinetobacter baumannii phages from Abidjan, Cote d'Ivoire Essoh,C., Vernadet,J.-P., Vergnaud,G., Resch,G. and Pourcel,C. 2019-01-03 — GenBank